CN105189534A - 一种小盐芥液泡膜钠氢反向转运蛋白nhx3及其编码基因与应用 - Google Patents

一种小盐芥液泡膜钠氢反向转运蛋白nhx3及其编码基因与应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了来源于小盐芥的液泡膜钠氢反向转运蛋白NHX3及其编码基因,以及其在培育耐盐性提高的转基因植物中的应用。

Description

一种小盐芥液泡膜钠氢反向转运蛋白 NHX3及其编码基因与应用 技术领域 本发明涉及植物蛋白及其编码基因与应用, 特别是涉及一个来源于小盐芥的液泡 膜钠氢反向转运蛋白 NHX3及其编码基因, 以及其在培育耐盐性提高的转基因植物中 的应用。 背景技术 盐胁迫是世界农业生产最重要的非生物逆境危害之一, 盐渍土壤通常以钠盐、 钙 盐或镁盐为主, 成为影响植物生长、 导致粮食和经济作物减产的主要因素。 世界上盐 碱土的面积约有 4亿公顷, 占灌溉农田的 1/3。 盐碱地在中国分布广泛, 现有盐碱地面 积约 0. 4亿公顷。 随着我国人口增加, 耕地减少, 盐碱地资源的开发利用有着极其重 要的现实意义。 而植物抗盐碱、 耐干旱能力的提高和适宜在盐碱地上生长并具有较高 经济和生态价值的植物种或品系的选育, 则是利用盐碱地经济、 有效的措施。 对绝大 多数农作物来说,大多数植物对盐碱、干旱的耐受性差,只能生长在氯化钠含量为 0.3% 以下的土壤上, 土壤中过量的 Na+会对植物体的正常的生长代谢产生毒害作用。 因此 如何在盐渍环境下提高作物产量就成为全世界农业生产中十分重要的问题。
植物的耐盐性是一个十分复杂的数量性状,其耐盐机制涉及从植株到器官、组织、 生理生化直至分子的各个水平。 各国的科学家也为此做了大量的工作, 并取得了很多 新进展, 特别在利用模式植物拟南芥来研究植物的耐盐分子机理方面, 使该领域的研 究有了突破性的进展 (Zhu JK. 2002. Salt and drought stress singal transduction in plants. Annu. Rev. Plant Biol. 53 : 1247-1273; Zhang ZL. 2011. Arabidopsis Floral Initiator SKB1 Confers High Salt Tolerance by Regulating Transcription and Pre-mRNA Splicing through Altering Histone H4R3 and Small Nuclear Ribonucleoprotein LSM4 Methylation. Plant Cell, 23 : 396-411 ) 。 高等植物细胞可通过多种途径感受外界环境中物化参数的变化, 从而将胞外的信号传递到胞内信号, 通过系列的信号传导最后将胁迫信号传递至细胞 核内激活转录因子。 被激活的转录因子再作用于功能基因, 启动逆境应答基因的表达 从而提高植物的耐逆性。 尽管研究者已从不同侧面开展了大量研究, 但由于其机制十 分复杂, 植物抗盐中的许多重要问题仍有待探索。 例如, 植物抗盐的关键因子仍未找 至 IJ ; 植物耐盐的分子机制并不十分清楚。 发明内容
本发明人利用 SSH (抑制差减杂交) 与 RACE ( cDNA末端快速扩增) 相结合的 方法克隆了小盐芥的一个液泡膜钠氢反向转运蛋白(本文命名为 NHX3 )的编码基因, 并测定了其 DNA序列。 并且发现通过转基因将其导入植株并使其表达后, 可显著改 善转基因植株的耐盐性, 而且这些性状可稳定遗传。
本发明第一方面提供小盐芥的一个液泡膜钠氢反向转运蛋白 NHX3 的编码基因 (本文命名为 7¾NH 5) , 其序列为 SEQ ID NO: 2。
本发明第二方面提供一种重组表达载体, 其含有本发明第一方面所述的基因, 其是通过将所述基因***到一种表达载体而获得的, 并且所述基因的核苷酸序列与 所述重组表达载体的表达控制序列可操作地连接; 优选地, 所述表达载体是 pCAMBIA2300; 优选地, 所述重组表达载体为附图 2 所示的 35S-ThNHX3-2300 载 体。
本发明第三方面提供一种重组细胞, 其含有本发明第一方面所述的基因或者本 发明第二方面所述的重组表达载体; 优选地, 所述重组细胞为重组农杆菌细胞。
本发明第四方面提供一种改善植物耐盐性的方法, 包括: 将本发明第一方面所 述基因或者本发明第二方面所述的重组表达载体导入植物或植物组织并使所述基因 表达; 优选地, 所述植物是拟南芥。
本发明第五方面提供一种制备转基因植物的方法, 包括: 在有效产生植物的条 件下培养含有本发明第一方面所述基因或者本发明第二方面所述的重组表达载体的 植物或植物组织; 优选地, 所述植物是拟南芥。
本发明第六方面提供本发明第一方面所述的基因、 本发明第二方面所述的重组 表达载体或者本发明第三方面所述的重组细胞用于改善植物耐盐性以及用于植物育 种的用途; 优选地, 所述植物是拟南芥。
本发明第七方面提供由本发明第一方面所述的基因编码的蛋白质, 其氨基酸序 列如 SEQ ID NO: 1所示。 附图说明
图 1是 Γ ΉΧ5基因的植物表达载体 (35S-ThNHX3-2300) 构建流程 (图 la-lb) 图 2是 7¾Λ¾Χ5基因的植物表达载体 (35S-ThNHX3-2300) 的质粒图。 图 3是转 ThNHJG基因的 T1代拟南芥植株的耐盐实验结果, Τΐβ表现出显著的 耐盐性, Tlf7、 TlflO的结果与其类似, 在此未示出。
图 4为利用反转录 PCR对 1\代转基因拟南芥植株和非转基因对照植株中 ΊΉΝΗΧ3 基因的转录水平进行分子水平检测的结果。 M为 DNA Ladder Marker ( DL2000 ) , 1-8 为耐盐 T1 代转基因拟南芥植株 (分别属于 Τ1β、 Tlf7、 TlflO 三个株系), 9 为 35S-ThNHX3-2300质粒 PCR阳性对照, 10-13为非转基因对照拟南芥植株。 具体实施方式 提供以下实施例, 以方便本领域技术人员更好地理解本发明。 所述实施例仅出 于示例性目的, 并非意在限制本发明的范围。
下面实施例中提到的未注明来源的限制性内切酶均购自 New England Biolabs公司。 实施例 1. 盐胁迫下小盐芥 SSH文库构建:
具体方法为:
按照 Clontech公司的 PCR-selectTM cDNA Subtraction Kit试剂盒说明书所示的方法 通过抑制差减杂交方法构建 SSH文库(抑制差减文库) 。 在实验过程中以盐处理的小 盐芥组织中提取的 mRNA作为样本(Tester) , 以未处理的小盐芥组织中提取的 mRNA 作为对照 (Driver) 。 具体步骤如下:
( 1 ) 供试材料:
小盐芥 ( TheUungieUa halophila, 购自中国内蒙古巴彦淖尔市乌兰布和沙漠绿色 植物园盐生植物繁育中心) 播种到灭菌的蛭石上, 在 22°C、 光周期 12 小时光照 /12 小时黑暗(光强 3000-4000 Lx)条件下培养, 每周浇 1/2MS液体培养基(含有 9.39 mM KN03 , 0.625 mM KH2P04, 10.3 mM NH4NO3, 0.75 mM MgS04, 1.5 mM CaCl2, 50 μΜ KI, 100 μΜ H3B03, 100 μΜ MnS04, 30 μΜ ZnS04, 1 μΜ Na2Mo04, 0.1 μΜ CoCl2, 100 μΜ Na2EDTA, 100 μΜ FeS04) 一次。 当植株直径达到 5-6cm时用于实 验。
( 2 ) 材料处理:
将供试植株分为 2组, 每组 4盆, 每盆 3株。 第一组为对照组, 正常地用 1/2MS 液体培养基浇灌; 第二组为盐处理组, 浇灌含有 300 mM NaCl的 1/2MS液体培养基。 将两组植物在 22°C、 光周期 12小时光照 /12小时黑暗(光强 3000-4000 Lx)条件下培 养处理 10天, 然后及时收集两组植株 (用蒸熘水洗净根部) , 用液氮迅速冷冻后, 于 -70°C冰箱中保存。
( 3 ) 总 RNA提取:
分别取对照组和盐处理组的小盐芥各 3.0 g, 用植物 RNA 提取试剂盒 (购自 Invitrogen)提取总 RNA。 用 HITACHI公司的紫外分光光度计 U-2001测定所得总 RNA 在 260 nm和 280 nm的吸光度值, OD26。/OD28。比值为 1.8-2.0, 表明总 RNA纯度较 高, 用 1.0%的琼脂糖凝胶电泳检测总 RNA的完整性, 28S条带的亮度约为 18S条带 的 2倍, 表明 RNA的完整性良好。 使用 Qiagen公司的 Oligotex mRNA纯化试剂盒(从 总 RNA中纯化 polyA+ RNA) 分离 mRNA。
( 4 ) 抑制差减杂交:
按 Clontech公司的 PCR-selectTM cDNA Subtraction Kit试剂盒说明书所示的方法进 行抑制差减杂交。 先将 Driver mRNA和 Tester mRNA分别反转录(反转录引物为试剂 盒所带的引物) , 得到双链 cDNA, 再以 2 Tester cDNA和 2 g Driver cDNA作为 起始材料进行差减杂交。 在 37°C水浴下分别将 Tester cDNA禾 P Driver cDNA用 Rsa I 酶切 1.5 小时, 然后将酶切后的 Tester cDNA 分成两等份, 连接上不同的接头, 而 Driver cDNA不连接头。 两种连有不同接头的 Tester cDNA分别与过量的 Driver混 合, 进行第一次正向差减杂交。 将两种第一次正向差减杂交的产物混合, 再与新变 性的 Driver cDNA进行第二次正向差减杂交, 通过两次抑制性 PCR扩增富集差异表达 基因的片段 (PCR进行前, 将第二次正向差减杂交产物进行末端补平) 。
( 5 ) 差减文库的构建与初步筛选、 克隆、 鉴定
依照 pGEM-T Easy试剂盒(购自 Promega) 的说明书, 将所述第二次正向差减杂 交 cDNA片段的第二次抑制性 PCR扩增产物 (使用 QIAquick PCR Purification Kit纯 化, 购自 Qiagen) 与 pGEM-T Easy载体连接, 其具体步骤如下: 在 200 μΐ PCR管中 依次加入下列成分: 纯化第二次 PCR产物 3 μ1、2χΤ4连接酶缓冲液 5 μΚρΟΕΜ-Τ Easy 载体 1 μ1、 T4 DNA连接酶 1 μ1, 于 4°C连接过夜。 然后取 10 μΐ连接反应产物, 加入 到 100 μΐ大肠杆菌 JM109感受态细胞(购自 TAKARA) 中, 冰浴 30分钟、 42°C热休 克 60秒、 冰浴 2分钟, 然后加入 250 μΐ LB液体培养基(含有 1%胰蛋白胨(Tryptone, 购自 OXOID)、 0.5%酵母提取物 (Yeast Extract, 购自 OXOID ) 禾 P 1% NaCl (购自国 药))后置于 37°C摇床中, 以 225 rpm振荡培养 30分钟, 然后从中取 200 μΐ菌液接种 于含 50 μ§/ιη1氨苄青霉素、 40 g/mL X-gal( 5-溴 -4氯 -3-吲哚 -β-D-半乳糖苷)、 24 ^glmL IPTG (异丙基 -β-D-硫代吡喃半乳糖苷) 的 LB (同上) 固体培养板上 (X-gal和 IPTG 均购自 TAKARA), 37°C培育 18小时。 计数培养板中直径 >1 mm的清晰白色及蓝色 菌落, 随机挑取 450个白色菌落 (编号: Th-S001至 Th-S450) 。 将所挑取白色菌落 分别接种于 96孔细胞培养板 (CORNING) 中的含 50 g/ml氨苄青霉素的 LB液体培 养基中, 37°C培养过夜后加甘油至甘油终浓度为 20% (体积比), 然后于 -80°C保存备 用。 使用巢式 PCR 引物 Primer 1和 Primer 2R (来自 Clontech公司的 PCR-select™ cDNA Subtraction Kit试剂盒) 对所培养的菌液进行 PCR扩增验证, 得到 342个阳性 克隆, 然后将所有阳性克隆送英潍捷基 (上海) 贸易有限公司测序。
(6) 差异克隆的 cDNA测序分析:
将 DNA测序结果去除载体和不明确序列及冗余的 cDNA后, 共得到 301条有效 表达序列标签 (Expressed Sequence Tag, EST) (Unigene) 。 实施例 2小盐芥液泡膜钠氢反向转运蛋白编码基因 ThNHX3的克隆
将所述鉴定的小盐芥 SSH文库中编号为 Th-S173的克隆子去掉冗余 DNA后, 序列 为 SEQ ID No: 3, 序列分析表明该序列编码的蛋白属于液泡膜钠氢反向转运蛋白。 本文将 SEQ ID No: 3序列对应的全长编码基因命名为 ThNHX3, 其对应的蛋白命名 为 NHX3。
SEQ IDNo: 3:
ACGCAACAGT CCTGGCCAGT CGATAGGAGT GAGTTCGATA CTCCTTGGGC TTATTCTTCT
241 TGGAAACGCT ATCATGATCA CCAGCACCAT CAGTGTTGTT CTTTTCAGT
ThNHX3全长编码基因的克隆
根据已经获得的 SEQ ID No: 3序列, 设计如下两条特异性引物, 作为 3'RACE 的 5'端特异性引物。
ThNHX3 GSP1: SEQ ID No: 4:
TGGTCTGATG CGTGGGGCAGT G
ThNHX3 GSP2: SEQ ID No: 5:
CTTCAGGACA CACGAAGCTT CTT
实验步骤按试剂盒说明书操作 (3'RACE System for Rapid Amplification of cDNA Ends试剂盒购自 Invitrogen公司) 。
用 SEQ ID NO: 4与通用引物 AUAP (试剂盒自带) , 以盐处理组小盐芥提取的 mRNA反转录得到的 cDNA为模板进行第一轮 PCR扩增。 具体步骤如下:
50 μ1ΡΟ 反应体系: 5 μΐ 10xExBuffer、 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 2.0 μΐ cDNA 1.0 lExTaq (购自 TAKARA) 、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 4和 AUAP各 2.0 μΐ以及 35 μΐ双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5分钟, 33个循环 (94°C变性 30秒, 58°C退 火 30秒, 72°C延伸 1分钟) , 72°C延伸 10分钟。
将所得的 PCR产物用双蒸水稀释 50倍后取 2.0 μΐ作为模板, 用 SEQ ID NO: 5 与通用引物 AUAP进行第二轮 PCR扩增, 具体步骤如下:
50 μ1ΡΟ 反应体系: 5 μΐ 10xExBuffer、 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 2.0 μΐ稀释的第一 轮 PCR产物、 1.0 lExTaq、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 5和 AUAP各 2.0 μΐ以及 35 μΐ的双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5分钟, 33个循环(94°C变性 30秒, 58°C 退火 30秒, 72°C延伸 1分钟) , 72°C延伸 10分钟。
回收第二轮 PCR 产物中片段约为 200 bp 的条带 (Gel Extraction Kit 购自 OMEGA), 并将其连接于 pGEM-T Easy载体, 然后转化到大肠杆菌 JM109感受态细 胞中 (具体方法同上), 并将转化后的菌液涂布于含 50 g/mL氨苄青霉素、 40 ^glmL X-gaK 24 g/mLIPTG的 LB固体培养基上进行筛选。 随机挑取 10个白色菌落分别接种 于含有 50 μ§/ιη1氨苄青霉素的 LB 液体培养基中, 37°C培养过夜后加甘油至终浓度 20% (体积比), -80°C保存备用。 用 SEQ ID NO: 5与通用引物 AUAP进行菌液 PCR 扩增验证, 得到 7个阳性克隆, 将 4个阳性克隆送至英潍捷基(上海) 贸易有限公司 测序, 获得该基因的 cDNA的 3'端。
根据已经获得的7¾^¾^5基因片段, 设计如下三条特异性引物, 作为 5'RACE的 3'端特异性引物。
ThNHX3 GSP3: SEQ ID No: 6:
CCAAATGGTT ACCTGTTTCT TC
ThNHX3 GSP4: SEQ ID No: 7:
CGACAAGAAC GAAAGAGGGA AC
ThNHX3 GSP5: SEQ ID No: 8:
GCCCAAGGAG TATCGAACTC AC
实验步骤按试剂盒说明书操作 (5'RACE System for Rapid Amplification of cDNA Ends试剂盒购自 Invitrogen公司) 。
用 SEQ ID NO: 7与通用引物 AAP (试剂盒自带) , 以盐处理组小盐芥提取的 mRNA反转录得到的 cDNA (反转录引物 SEQ ID NO: 6, dCTP加尾) 为模板进行第 一轮 PCR扩增, 具体步骤如下:
50 μ1 ΡΟ 反应体系: 5 μΐ 10xEx Buffer、 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 2.0 μΐ cDNA 1.0 l Ex Taq (购自 TAKARA)、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 7和 AAP各 2.0 μΐ以及 35 μΐ 的双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5分钟, 33个循环(94°C变性 30秒, 55 °C退 火 30秒, 72°C延伸 1分钟) , 72°C延伸 10分钟。
将所得的 PCR产物用双蒸水稀释 50倍后取 2.0 μΐ作为模板, 用 SEQ ID NO: 8 与引物 AUAP进行第二轮 PCR扩增, 具体步骤如下:
50 μ1 ΡΟ 反应体系: 5 μΐ 10xEx Buffer、 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 2.0 μΐ稀释的第一 轮 PCR产物、 1.0 l Ex Taq、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 8和 AUAP各 2.0 μΐ以及 35 μΐ的双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5分钟, 33个循环 (94°C变性 30秒, 58 °C 退火 30秒, 72°C延伸 1分钟) , 72°C延伸 10分钟。
回收第二轮 PCR 产物中片段约为 1100 bp 的条带 (Gel Extraction Kit 购自
OMEGA), 并将其连接于 pGEM-T Easy载体, 然后转化到大肠杆菌 JM109感受态细 胞中 (具体方法同上), 并将转化后的菌液涂布于含 50 g/mL氨苄青霉素、 40 ^glmL X-gaK 24 g/mL IPTG的 LB固体培养基上进行筛选。 随机挑取 10个白色菌落分别接种 于含有 50 μ§/ιη1氨苄青霉素的 LB 液体培养基中, 37°C培养过夜后加甘油至甘油终浓 度为 20% (体积比), -80°C保存备用。 用 SEQ ID NO: 8与引物 AUAP进行菌液 PCR 扩增验证(反应体系及反应条件同上) , 得到 7个阳性克隆, 选取其中 4个克隆送至 英潍捷基 (上海) 贸易有限公司测序, 获得该基因的 cDNA的 5'端。 所得的 5'RACE 产物克隆测序后, 将其与上述 3'RACE产物测序结果以及 SEQ ID No: 3序列进行拼接, 获得 ThNHX3全长 cDNA序列 SEQ ID No: 9。
SEQ ID No: 9: 361
42 1
4 81
54 1
601
661
72 1
781
84 1
901
961
102 1
1081
114 1
12 01
1261
132 1
13 81
144 1 TACTGGAAAA CCAATTCTAC 根据 SEQ ID NO: 9序列设计一对引物如下:
SEQ ID No: 10:
ATGGCTTTGG GATTAAACAC AAT
SEQ ID No: 11:
CTAGCCGAAA TCTGTATAAA TGAG 通过 SEQ ID NO: 10和 SEQ ID NO: 11来克隆 ΊΉΝΗΧ3全长编码基因。
采用 TAKARA的 PrimeSTAR HS DNA聚合酶, 以上述盐处理组小盐芥的 cDNA 为模板进行 PCR反应。 50 μΐ PCR反应体系: 10 μΐ 5xPS Buffer、 3 μΐ 2.5 mM 的 dNTP 2.0 μΐ cDNA 1.0 μΐ PrimeSTAR HS DNA聚合酶、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO:
10和 SEQ ID NO: 11各 2.0 μΐ以及 30 μΐ的双蒸水。 PCR反应条件: 94 °C预变性 5分 钟, 33个循环 (94°C变性 30秒, 58°C退火 30秒, 72 °C延伸 2分钟) , 72°C延伸 10 分钟。
PCR扩增产物加 A尾: PCR产物中加入 2.5倍体积的无水乙醇, -20°C放置 10分 钟, 离心, 去上清, 晾干, 然后用 21 μΐ双蒸水溶解所得沉淀。 然后向其中加入 2.5 μΐ ΙΟχΕχ Buffer 0.5 μΐ 5 mM的 dATP、 1.0 lExTaq。 反应条件: 70°C反应 30分钟。 将 得到的约 1400 bp的 DNA片段回收(Omega回收试剂盒), 并将其连接至 pGEM T-easy 载体上得到 ThNHX3-pGEM质粒, 然后将连接产物转化到大肠杆菌 JM109感受态细 胞中 (方法同上),并将转化后的菌液涂布于含 50 g/mL氨苄青霉素、 40 g/mLX-gal、 24 g/mLIPTG的 LB固体培养基上进行筛选。 随机挑取 10个白色菌落分别接种于含有 50 μ§/ιη1氨苄青霉素的 LB液体培养基中, 37°C培养过夜后加甘油至终浓度 20% (体 积比) , -80°C保存备用。 用 SEQ IDNO: 10与 SEQ ID NO: 11进行菌液 PCR 扩增 验证(反应体系及反应条件同上) , 得到 5个阳性克隆, 选取其中 4个阳性克隆送至 英潍捷基 (上海) 贸易有限公司测序, 所得序列为 SEQ ID NO: 2, 其编码的蛋白质 的氨基酸序列为 SEQ IDNO: 1。
NHX3蛋白的氨基酸序列: SEQ ID NO: 1
1 ALGLNT LE KSETLLGSDH
21 ASVVS NLFV ALLCACIVLG
41 HLLGKTRW N ESITALIIGS
61 CTGIVILLIS EGKSSRILVF
81 SEDLFFIYLL PPIIFNAGFQ
101 VKKKHFFRNF TI LFGAIG
121 TLISFVIISL GAIHFLEK N
141 IGDLTISDYL AIGAIFSATD
161 SVCTLQVLKQ EETPLLYSLV
181 FGEGVVNDAT SVVLFNAIQR
201 FDLTHINSAI ALEFAGNFFY
221 LFILSTALGV AAGLLSAFVI
241 KKLYFESHAT NREVAL LL
261 AYLSY LAEL FHLSSILTVF
281 FCGIV SHYT WHNVTDKSKI
301 TTRHTFAALS FLAEIFIFLY
321 VG DALDIEK WDVVRNSPGQ
341 SIGVSSILLG LILLGRAAFV
361 FPLSFLSNLT KSSTDERIDW
381 KKQVTIWWAG L RGAVS AL
401 AYNQFTTSGH TKLLGNAI I
421 TSTISVVLFS TVVRLKRFSP
441 NRVCVLIYTD FG
ThNHX3基因的核苷酸序列 SEQ ID NO: 2 61
121
181
241
301
361
421
481
541
601
661
721
781
841
901
961
1021
1081
1141
1201
1261
1321 AACCGGGTTT GCGTCCTCAT TTATACAGAT TTCGGCTAG 实施例 3 ΊΉΝΗΧ3基因植物表达载体构建
选择植物双元表达载体 pCAMBIA2300 (购自北京鼎国昌盛生物技术有限责任公 司) 作为植物表达载体, 用 Pnos启动子替换 ΝΡΤΠ基因含双增强子的 35S启动子, 以降低 ΝΡΤΠ蛋白在植物中的表达。 选择 35S启动子及 Tnos终止子分别作为 ThNHJG 基因的启动子和终止子, 构建流程图如图 1所示。
用引物 SEQ ID NO: 12和 SEQ ID NO: 13以植物表达载体 pBI121质粒(购自北 京华夏远洋科技有限公司) 为模板扩增 Pnos, 采用 TAKARA的 PrimeSTAR HS DNA 聚合酶。 50 μΐ PCR 反应体系: 10 μΐ 5xPS Buffer 3 μΐ 2.5 mM 的 dNTP、 1.0 μΐ pBI121质粒、 1.0 μΐ PrimeSTAR HS DNA聚合酶、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 12和 SEQ ID NO: 13各 2.0 μΐ以及 31 μΐ的双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5分钟, 33个循环(94°C变性 30秒, 56°C退火 30秒, 72°C延伸 30秒), 72 °C 延伸 10分钟。 通过 EcoRI、 Bglll酶切将所得的 PCR产物按试剂盒说明 (Promega, T4 连接酶试剂 盒) 连接到 pCAMBIA2300获得 pCAMBIA2300-l。
SEQ ID NO: 12
GCACGAATTC ggcgggaaac gacaatctga
SEQ ID NO: 13
ATCCAGATCTAGATCCGGTGCAGATTATTTG
用引物 SEQ ID NO: 14和 SEQ ID NO: 15以 pBI121质粒为模板扩增 Tnos, 采 用 TAKARA 的 PrimeSTAR HS DNA 聚合酶。 50 μΐ PCR 反应体系: 10 μΐ 5 xPS Buffer 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 1.0 μΐ pBI121质粒、 1.0 μΐ PrimeSTAR HS DNA聚合 酶、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 14和 SEQ ID NO: 15各 2.0 μΐ以及 31 μΐ的双蒸水。
PCR反应条件: 94°C预变性 5分钟, 33个循环 (94°C变性 30秒, 58 °C退火 30秒, 72°C延伸 30秒) , 72°C延伸 10分钟。 通过 Kpnl、 EcoRI酶切将所得的 PCR产物连 接 (Promega T4 连接酶试剂盒) 到 pCAMBIA2300-l获得 pCAMBIA2300-2。
SEQ ID NO: 14:
AAGGGTACCGAATTTCCCCGATCGTTCAAA SEQ ID NO: 15:
TCAGAATTCCCAGTGAATTCCCGATCTAGTA 用引物 SEQ ID NO: 16和 SEQ ID NO: 17以 pCAMBIA2300质粒为模板扩增 35S 启动子。 采用 TAKARA的 PrimeSTAR HS DNA聚合酶。 50 μΐ PCR反应体系: 10 μΐ 5 xPS Buffer 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 1.0 μΐ pCAMBIA2300质粒、 1.0 μΐ PrimeSTAR HS DNA聚合酶、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 16和 SEQ ID NO: 17各 2.0 μΐ以及 31 μΐ 双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5分钟, 33个循环 (94°C变性 30秒, 58 °C退火 30秒, 72°C延伸 30秒) , 72°C延伸 10分钟。 通过 HindIII、 Sail酶切将所得的 PCR 产物连接 (连接方法同上) 到 pCAMBIA2300-2获得 pCAMBIA2300-3。 SEQ ID NO: 16:
ACTAAGCTTTAGAGCAGCTTGCCAACATGGTG SEQ ID NO: 17:
TGAGTCGACAGAGATAGATTTGTAGAGAGAGACT 用引物 SEQ ID NO: 18和 SEQ ID NO: 19扩增 7¾NHX5编码基因的全长序列(模 板是实施例 2所获得阳性 ThNHX3-pGEM质粒) , 采用 TAKARA的 PrimeSTAR HS DNA聚合酶。 50 μΐ PCR反应体系: 10 μΐ 5 xPS Buffer 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 1.0 μΐ ThNHX3-pGEM质粒、 1.0 μΐ PrimeSTAR HS DNA聚合酶、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 18和 SEQ ID NO: 19各 2.0 μΐ以及 31 μΐ双蒸水。 PCR反应条件: 94 °C预变性 5 分钟, 33个循环 (94°C变性 30秒, 58 °C退火 30秒, 72 °C延伸 2分钟) , 72°C延伸 10 分钟。 通过 Sal I、 BamH I 酶切将所得的 PCR 产物连接 (连接方法同上) 到 pCAMBIA2300-3 , 经验证后获得植物表达载体 35S-ThNHX3-2300 (图 2 ) 。
SEQ ID NO: 18
ACTGTCGAC ATGGCTTTGG GATTAAACAC AAT SEQ ID NO: 19
ACTGGATTC CTAGCCGAAA TCTGTATAAA TGAG 实施例 4 35S-ThNHX3-2300表达载体转化农杆菌
农杆菌 LBA4404 (购自 Biovector Science Lab, Inc) 感受态细胞的制备: 将农杆 菌 LBA4404在含 50 g/ml利福平和 50 g/ml链霉素的 LB固体培养基上划单斑接种, 28 °C培养 1至 2天。 挑取单菌落接种于 5 ml含 50 μ§/ιη1利福平和 50 μ§/ιη1链霉素的 LB液体培养基中, 28 °C下摇动培养过夜 (约 12-16小时) 至 OD6。。值为 0.4, 形成种 子菌液。 取 5 ml培养活化后的菌液 (1 :20的比例) 接种于 100 ml含 50 μ§/ιη1利福平 和 50 μ§/ιη1链霉素的 LB液体培养基中, 28 °C摇动培养 2-2.5小时至 OD6。。=0.8。 冰浴 菌液 10分钟, 每隔 3分钟摇匀一次, 令所述细菌均匀进入休眠状态。 于 4°C下 4000 g 离心 10分钟, 弃上清液; 加入 1 ml冰预冷的 10% (体积比)甘油重悬浮菌体, 4°C下 4000 g离心 10分钟, 收集沉淀; 用冰预冷的 10% (体积比)甘油重复洗 3-4次; 然后 加入适量冰预冷的 10% (体积比) 甘油重新悬浮细菌沉淀, 即制得 LBA4404感受态细 胞, 以 40 μΐ/管将其分装, 于 -70°C保存备用。
转化农杆菌: 在冰上融化所述的 LBA4404感受态细胞, 向 40 μΐ的感受态细胞中 加入 1 μΐ实施例 3获得的质粒 35S-ThNHX3-2300, 混匀后冰浴约 10分钟。 将冰浴后 的感受态细胞和 35S-ThNHX3-2300 质粒的混合物用微量移液器转移到冰预冷的 0.1 cm规格的电击杯 (购自 Bio-Rad) 中, 轻敲使悬浮液到达电击杯底部 (注意不要有气 泡) 。 将所述电击杯放到电击室的滑道上, 推动滑道将电击杯放至电击室基座电极 处。 将 MicroPulser (购自 Bio-Rad) 的程序设置为 "Agr", 电击一次。 立即取出电击 杯, 加入 28°C预热的 200 μΙ ίΒ培养基。 快速而轻柔的用微量移液器将感受态细胞打 匀。 将悬浮液转入 1.5 ml的离心管, 在 28°C下 225 rpm摇动培养 1小时。 取 100-200 μΐ的菌液涂布于相应的抗性筛选培养基平板上(LB固体培养基, 含 50 g/ml利福平、 50 μ§/ιη1链霉素、 50 μ§/ιη1卡那霉素) , 28°C培养。 筛选阳性转化克隆, 并将其菌液 于 -70°C保存备用。 实施例 5 受体材料拟南芥培养
选择吸水性好, 土质松软的蛭石配合营养土 (1 : 1 ) 作为拟南芥种植土壤。 使用 直径 9 cm的花盆, 每盆播种 20-30颗拟南芥种子(哥伦比亚型, 来自美国俄亥俄州立 大学的拟南芥生物资源中心) 。 播种以后在花盆上罩上薄膜, 给植株的生长提供一个 湿润的环境。 恒温 22°C, 光照强度 3500-4000 k, 光照周期为 12小时黑暗、 12小时 光照培养, 每 7天浇灌一次 1/2MS液体培养基。 培养 30天后, 每盆保留 4-5棵植株, 光照周期调整为 8小时黑暗、 16小时光照培养,待大部分植株都抽苔之后, 在花序基 部剪掉整个主苔, 去其顶端优势, 约 1周后在腋芽部位长出 4-6个新生侧苔, 待侧苔 花序形成花蕾并部分开花或形成 1-2个角果时, 便可用于转化。 实施例 6 拟南芥花浸转化
将实施例 4获得的已转化 35S-ThNHX3-2300表达载体的 LBA4404农杆菌菌液接种 至含有 50μ§/ιη1卡那霉素 (kan) 的 LB液体培养基中培养过夜, 第二天早上按 1 :50 接种至含 50μ§/ιη1卡那霉素的新的 LB培养基 (1L) 中, 培养约 8个小时, 至农杆菌 液 OD6。。在 1.0到 1.2之间。 室温 5000 rpm离心 5分钟, 弃上清, 将农杆菌沉淀悬浮 于浸染培养基里( 1/2MS液体培养基,并含有 5%蔗糖;用 KOH调至 pH5.7; 0.02%Silwet L-77) 中, 使 OD6QQ在 0.8左右。 将实施例 5制备的用于转化的拟南芥的上部缓缓、 螺旋式浸入含所述农杆菌的浸染培养基内, 轻轻顺时针晃动, 约 2分钟, 用透明塑料 罩盖严以保持湿度, 放入温室过夜。 24小时后移去塑料透明罩, 用水浇透。 之后 2-3 周, 保证植株水分充足。 当植株停止开花, 第一个果荚成熟变黄时, 用纸袋套住, 当 纸袋内的所有果荚变黄后, 停止浇水, 1-2周干燥后收取种子, 进行转化子筛选, 同 时取未经转化处理的拟南芥果荚作为对照。 实施例 7 拟南芥转基因阳性转化子的筛选 种子消毒: 先用 70%乙醇浸泡 10 分钟, 并不时地使种子悬浮; 然后用无菌水洗四 次, 并不时地使种子悬浮。 然后, 将处理后的种子均匀涂布在含 50 μ§/ιη1卡那霉素的 1/2MS固体筛选培养基表面上(一块 150 mm直径的平皿最多播种 1500粒种子), 4°C春 化 2天, 然后在恒温 22°C、光照强度 3500-4000 k、光照周期为 12小时黑暗 /12小时光照 条件下培养 7-10天。 转基因种子在所述筛选培养基上萌发 2周以后, 将能够萌发并正常 生长的植株转入土壤继续培养。剪取所述能够在筛选培养基上正常生长的每株植物的 1-2 个叶片,提取其 DNA作为模板,用 SEQ ID NO: 18和 SEQ ID NO: 19作为引物进行 PCR 检测(反应体系及条件同上), 去除 PCR阴性植株, 收集 PCR阳性植株的种子分别编号 ( T0fl-T0£20) 并保存。 实施例 8 过表达 ΊΉΝΗΧ3的转基因拟南芥 T1代植株的种植
选择吸水性好, 土质松软的蛭石配合营养土(1 : 1 )作为拟南芥种植土壤。 TOfl-TOGO 的每种转化子及非转基因对照拟南芥种子各播种 2盆(每盆播种 20-30颗种子)。 播种以 后在花盆上罩上薄膜, 给植株的生长提供一个湿润的环境。 恒温 22°C, 光照强度 3500-4000 lx, 光照周期为 12小时黑暗、 12小时光照培养, 每 7天浇灌一次 1/2MS液体 培养基。 培养 25天后, 每株剪取 1-2个叶片并提取其 DNA作为模板, 用 SEQ ID NO: 18和 SEQ ID NO: 19作为引物进行 PCR检测 (反应体系及条件同上)。 去除 PCR阴 性植株, 每盆保留 7-8棵 PCR阳性苗, 继续培养 10天后, 每盆保留大小较一致的 5-7 棵转基因拟南芥或非转基因对照拟南芥苗进行耐盐实验。 实施例 9 过表达 ThNHX3的转基因拟南芥 T1代植株的耐盐实验
将实施例 8 中转基因拟南芥、 对照拟南芥各保留一盆植株不作处理, 正常浇灌 1/2MS液体培养基, 同时各取一盆植株浇灌含有 150 mM NaCl的 1/2MS液体培养基, 恒温 22°C、 光照强度 3500-4000 k、 12小时光培养 /12小时暗培养循环, 14天后观察 实验结果。 T1代转基因植株 (T0代转基因植株的种子长成的植株) 的耐盐性鉴定表 明, T1代转基因植株 Τ1β、 Tlf7、 TlflO三个株系表现出显著的耐盐性 (见图 3, 以 Τΐβ例, Tlf7、 TlflO的结果与其类似, 在此未示出) 。 实施例 10 在转录水平上验证 7¾Λ¾Χ5基因的表达
将实施例 9中耐盐好的 T1代转基因植株中随机选取 8棵 (分别属于上述 Τ1β、 Tlf7、 TlflO三个耐盐株系), 实施例 9中对照植株随机选取 4棵, 各剪取盐(150 mM NaCl)处理 14天的叶片 0.05 g, 用植物 RNA提取试剂盒(Invitrogen)提取总 RNA。 紫外分光光度测定所得总 RNA在 260 nm和 280 nm的吸光度值, 计算各个 RNA浓 度。 依照 Invitrogen反转录试齐 [J盒 Superscript III Reverse Transcriptase所示方法进行反 转录, 取 1 总 RNA作为模板, 反转录引物为 SEQ ID NO: 11。 使用引物 SEQ ID NO: 10和 SEQ ID NO: 20扩增 ThNHX3片段, 检测其转录情况。
采用 TAKARA的 PrimeSTAR HS DNA聚合酶, 以上述反转录所得的 cDNA为模 板进行 PCR反应。 50 μΐ PCR反应体系: 10 μΐ 5 xPS Buffer 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP、 2.0 μΐ cDNA 1.0 μΐ PrimeSTAR HS DNA聚合酶、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 10和 SEQ ID NO: 20各 2.0 μΐ以及 30 μΐ的双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5分钟, 32个循 环 (94°C 变性 30秒, 58 °C退火 30秒, 72°C延伸 1分钟) , 72°C延伸 10分钟。
PCR产物电泳结果如图 4所示: M为 DNA Ladder Marker ( DL2000, 购自深圳瑞 真生物技术有限公司), 1-8为耐盐 T1代转基因拟南芥植株(分别属于 Τ1β、 Tlf7、 TlflO三个株系) , 9为 35S-ThNHX3-2300质粒 PCR阳性对照, 10-13为非转基因对 照拟南芥植株。 图中所示条带大小与阳性对照的大小一致 (约为 750 bp ) 。 结果表 明, 耐盐 T1代转基因拟南芥植株中 7¾Λ¾Χ5均有显著转录, 非转基因对照拟南芥植 株中没有 ThNHJG的转录。
SEQ ID NO: 20: CGATTAGTAG CGTGACTTTC GAA

Claims (9)

  1. 权 利 要 求 书
    1. 小盐芥的一个液泡膜钠氢反向转运蛋白, 其序列为 SEQ ID NO: 1。
  2. 2. 编码权利要求 1的液泡膜钠氢反向转运蛋白的基因,其序列为 SEQ ID NO: 2。 3. 一种重组表达载体,其是通过将权利要求 2所述的基因***到一种表达载体而 获得的, 并且所述基因的核苷酸序列与所述表达载体的表达控制序列可操作地连接, 优选地, 所述表达载体是 pCAMBIA2300。
  3. 4. 权利要求 3所述的载体, 其为附图 2所示的 35S-ThNHX3-2300载体。
  4. 5. 一种重组细胞,其含有权利要求 2所述的基因或者权利要求 3或 4所述的重组 表达载体; 优选地, 所述重组细胞为重组农杆菌细胞。
  5. 6. 一种改善植物耐盐性的方法, 包括: 将权利要求 2所述的基因或者权利要求 3 或 4所述的重组表达载体导入植物或植物组织并使所述基因表达; 优选地, 所述植物 是拟南芥。
  6. 7. 一种制备转基因植物的方法,包括: 在有效产生植物的条件下培养含有权利要 求 2所述的基因或者权利要求 3或 4所述的重组表达载体的植物或植物组织。
  7. 8. 权利要求 7所述的方法, 其中所述植物是拟南芥。
  8. 9. 权利要求 2所述的基因、权利要求 3或 4所述的重组表达载体或者权利要求 5 所述的重组细胞用于改善植物耐盐性以及用于植物育种的用途。
  9. 10. 权利要求 9所述的用途, 其中所述植物是拟南芥。
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