CN105087789A - 一种检测血浆cfDNA中BCR和TCR免疫组库的方法 - Google Patents
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Abstract
Description
引物名称 | 引物序列(5’→3’) |
PCR2上游引物 | aatgatacggcgaccaccgagatctacactctttccctacacgacgctcttccgatct |
PCR2下游引物 | caagcagaagacggcatacgagatxxxxxxxxgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatct |
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---|---|
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Cited By (19)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN106119251A (zh) * | 2016-06-03 | 2016-11-16 | 刘鹏飞 | Bcr重链cdr3白血病致病序列及筛选方法和应用 |
CN106755410A (zh) * | 2016-12-23 | 2017-05-31 | 孙涛 | 一种基于高通量测序同时检测t细胞和b细胞免疫组库的方法 |
CN106957905A (zh) * | 2016-12-23 | 2017-07-18 | 孙涛 | 一种用于评估肿瘤免疫治疗效果的分子检测方法及引物组合物及试剂盒 |
WO2017173039A1 (en) * | 2016-03-30 | 2017-10-05 | Covaris, Inc. | Extraction of cfdna from biological samples |
CN107345242A (zh) * | 2016-05-12 | 2017-11-14 | 眭维国 | TCR β链互补决定区的处理方法 |
CN107523640A (zh) * | 2017-10-12 | 2017-12-29 | 厦门燕旭安生物科技有限公司 | 一种ctDNA精准测序的扩增子文库构建方法 |
CN107523563A (zh) * | 2017-09-08 | 2017-12-29 | 杭州和壹基因科技有限公司 | 一种用于循环肿瘤dna分析的生物信息处理方法 |
CN108070644A (zh) * | 2016-11-08 | 2018-05-25 | 国家卫生计生委科学技术研究所 | 一种妊娠高血压的诊断*** |
CN108624667A (zh) * | 2018-05-15 | 2018-10-09 | 佛山市第人民医院(中山大学附属佛山医院) | 一种基于二代测序的t细胞受体库分析方法及装置 |
WO2018209625A1 (zh) * | 2017-05-18 | 2018-11-22 | 北京吉因加科技有限公司 | 一种基于外周血无创性检测病灶免疫组库多样性的分析***及其用途 |
CN109161592A (zh) * | 2018-08-02 | 2019-01-08 | 深圳市人民医院 | 一种试剂盒和在IgA肾病中的应用 |
CN109554440A (zh) * | 2018-12-26 | 2019-04-02 | 山东艾克韦生物技术有限公司 | 多重引物组及利用该引物组基于高通量测序构建人类t细胞免疫组库的方法 |
CN109979528A (zh) * | 2019-03-28 | 2019-07-05 | 广州基迪奥生物科技有限公司 | 一种单细胞免疫组库测序数据的分析方法 |
CN110734958A (zh) * | 2019-10-13 | 2020-01-31 | 湖南大地同年生物科技有限公司 | 一种单分子标签免疫组库高通量测序文库构建方法 |
CN111599411A (zh) * | 2020-06-08 | 2020-08-28 | 谱天(天津)生物科技有限公司 | 一种检测血液bcr重链和轻链的引物及免疫组库方法、应用 |
WO2021043139A1 (zh) * | 2019-09-06 | 2021-03-11 | 深圳微伴生物有限公司 | 获得cfDNA标准品的引物组、PCR扩增阳性标准品及其制备方法、试剂盒及应用 |
CN113122618A (zh) * | 2021-03-09 | 2021-07-16 | 武汉弘康医学检验实验室股份有限公司 | 一种基于高通量测序精准检测t细胞免疫组库的方法及其引物体系 |
CN113150113A (zh) * | 2020-05-23 | 2021-07-23 | 湖南源品细胞生物科技有限公司 | 一种tcr富集克隆型及其获取方法与应用 |
CN113248593A (zh) * | 2020-05-23 | 2021-08-13 | 湖南源品细胞生物科技有限公司 | 一种tcr富集克隆型及其获取方法与应用 |
Citations (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102443624A (zh) * | 2010-10-11 | 2012-05-09 | 遵义医学院 | 一种高通量同时测序多样本cdr3受体库的方法 |
US20120309013A1 (en) * | 2009-12-09 | 2012-12-06 | Christophe Caux | Use of the Combinatorial Diversity of T-Lymphocyte Repertoire as a Prognostic Marker of Cancer |
CN103710454A (zh) * | 2013-12-31 | 2014-04-09 | 南方科技大学 | Tcr或bcr高通量测序的方法及利用标签序列矫正多重pcr引物偏差的方法 |
CN104264231A (zh) * | 2014-09-30 | 2015-01-07 | 天津华大基因科技有限公司 | 构建测序文库的方法及其应用 |
CN104293938A (zh) * | 2014-09-30 | 2015-01-21 | 天津华大基因科技有限公司 | 构建测序文库的方法及其应用 |
CN104673892A (zh) * | 2014-12-30 | 2015-06-03 | 南方科技大学 | 开发恒河猴t细胞免疫组库的引物组、高通量测序方法及应用 |
-
2015
- 2015-08-10 CN CN201510488029.3A patent/CN105087789B/zh active Active
Patent Citations (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20120309013A1 (en) * | 2009-12-09 | 2012-12-06 | Christophe Caux | Use of the Combinatorial Diversity of T-Lymphocyte Repertoire as a Prognostic Marker of Cancer |
CN102443624A (zh) * | 2010-10-11 | 2012-05-09 | 遵义医学院 | 一种高通量同时测序多样本cdr3受体库的方法 |
CN103710454A (zh) * | 2013-12-31 | 2014-04-09 | 南方科技大学 | Tcr或bcr高通量测序的方法及利用标签序列矫正多重pcr引物偏差的方法 |
CN104264231A (zh) * | 2014-09-30 | 2015-01-07 | 天津华大基因科技有限公司 | 构建测序文库的方法及其应用 |
CN104293938A (zh) * | 2014-09-30 | 2015-01-21 | 天津华大基因科技有限公司 | 构建测序文库的方法及其应用 |
CN104673892A (zh) * | 2014-12-30 | 2015-06-03 | 南方科技大学 | 开发恒河猴t细胞免疫组库的引物组、高通量测序方法及应用 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
HARLAN ROBINS: "Immunosequencing: applications of immune repertoire deep sequencing", 《CURRENT OPINION IN IMMUNOLOGY》 * |
付钰等: "免疫组库的临床应用", 《国际免疫学杂志》 * |
Cited By (26)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2017173039A1 (en) * | 2016-03-30 | 2017-10-05 | Covaris, Inc. | Extraction of cfdna from biological samples |
US10781439B2 (en) | 2016-03-30 | 2020-09-22 | Covaris, Inc. | Extraction of cfDNA from biological samples |
CN107345242A (zh) * | 2016-05-12 | 2017-11-14 | 眭维国 | TCR β链互补决定区的处理方法 |
CN106119251A (zh) * | 2016-06-03 | 2016-11-16 | 刘鹏飞 | Bcr重链cdr3白血病致病序列及筛选方法和应用 |
CN108070644B (zh) * | 2016-11-08 | 2021-06-29 | 国家卫生计生委科学技术研究所 | 一种妊娠高血压的诊断*** |
CN108070644A (zh) * | 2016-11-08 | 2018-05-25 | 国家卫生计生委科学技术研究所 | 一种妊娠高血压的诊断*** |
CN106755410B (zh) * | 2016-12-23 | 2019-12-06 | 孙涛 | 一种基于高通量测序同时检测t细胞和b细胞免疫组库的方法 |
CN106755410A (zh) * | 2016-12-23 | 2017-05-31 | 孙涛 | 一种基于高通量测序同时检测t细胞和b细胞免疫组库的方法 |
CN106957905A (zh) * | 2016-12-23 | 2017-07-18 | 孙涛 | 一种用于评估肿瘤免疫治疗效果的分子检测方法及引物组合物及试剂盒 |
CN106957905B (zh) * | 2016-12-23 | 2020-12-04 | 孙涛 | 一种用于评估肿瘤免疫治疗效果的分子检测方法及引物组合物及试剂盒 |
WO2018209625A1 (zh) * | 2017-05-18 | 2018-11-22 | 北京吉因加科技有限公司 | 一种基于外周血无创性检测病灶免疫组库多样性的分析***及其用途 |
US20200199650A1 (en) * | 2017-05-18 | 2020-06-25 | Geneplus-Beijing | Analysis system for peripheral blood-based non-invasive detection of lesion immune repertoire diversity and uses of system |
CN107523563A (zh) * | 2017-09-08 | 2017-12-29 | 杭州和壹基因科技有限公司 | 一种用于循环肿瘤dna分析的生物信息处理方法 |
CN107523640A (zh) * | 2017-10-12 | 2017-12-29 | 厦门燕旭安生物科技有限公司 | 一种ctDNA精准测序的扩增子文库构建方法 |
CN108624667A (zh) * | 2018-05-15 | 2018-10-09 | 佛山市第人民医院(中山大学附属佛山医院) | 一种基于二代测序的t细胞受体库分析方法及装置 |
CN109161592A (zh) * | 2018-08-02 | 2019-01-08 | 深圳市人民医院 | 一种试剂盒和在IgA肾病中的应用 |
CN109554440A (zh) * | 2018-12-26 | 2019-04-02 | 山东艾克韦生物技术有限公司 | 多重引物组及利用该引物组基于高通量测序构建人类t细胞免疫组库的方法 |
CN109979528A (zh) * | 2019-03-28 | 2019-07-05 | 广州基迪奥生物科技有限公司 | 一种单细胞免疫组库测序数据的分析方法 |
CN109979528B (zh) * | 2019-03-28 | 2021-06-25 | 广州基迪奥生物科技有限公司 | 一种单细胞免疫组库测序数据的分析方法 |
WO2021043139A1 (zh) * | 2019-09-06 | 2021-03-11 | 深圳微伴生物有限公司 | 获得cfDNA标准品的引物组、PCR扩增阳性标准品及其制备方法、试剂盒及应用 |
CN110734958A (zh) * | 2019-10-13 | 2020-01-31 | 湖南大地同年生物科技有限公司 | 一种单分子标签免疫组库高通量测序文库构建方法 |
CN113150113A (zh) * | 2020-05-23 | 2021-07-23 | 湖南源品细胞生物科技有限公司 | 一种tcr富集克隆型及其获取方法与应用 |
CN113248593A (zh) * | 2020-05-23 | 2021-08-13 | 湖南源品细胞生物科技有限公司 | 一种tcr富集克隆型及其获取方法与应用 |
CN111599411A (zh) * | 2020-06-08 | 2020-08-28 | 谱天(天津)生物科技有限公司 | 一种检测血液bcr重链和轻链的引物及免疫组库方法、应用 |
CN111599411B (zh) * | 2020-06-08 | 2023-04-14 | 谱天(天津)生物科技有限公司 | 一种检测血液bcr重链和轻链的引物及免疫组库方法、应用 |
CN113122618A (zh) * | 2021-03-09 | 2021-07-16 | 武汉弘康医学检验实验室股份有限公司 | 一种基于高通量测序精准检测t细胞免疫组库的方法及其引物体系 |
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