CN105008385A - 一个盐芥myb类转录因子myb1-2及其编码基因与应用 - Google Patents
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Abstract
一个来源于盐芥的MYB类转录因子MYB1-2及其编码基因,以及其在培育耐旱性提高的转基因植物中的应用。
Description
个盐芥 MYB类转录因子 MYB 1-2及其编码基因与应用 技术领域 本发明涉及 MYB类转录因子及其编码基因与应用, 特别是涉及一个来源于盐 芥的 MYB类转录因子 MYB 1-2及其编码基因,以及其在培育耐旱性提高的转基因植 物中的应用。 技术背景 非生物胁迫, 如干旱、 盐渍、 极端温度、 化学污染和氧损伤等能够对植物的 生长发育造成严重的危害, 对作物产量造成极大损失, 其中干旱对作物产量的影 响, 在诸多自然逆境中占首位, 其危害相当于其它灾害之和, 是许多地区是农业 发展的瓶颈。 据统计, 世界干早、 半干旱地区占陆地面积的 34%; 我国干早、 半 干旱地区约占国土面积的 52%, 年受旱面积达 200-270万公顷 , 全国灌溉区每年 缺水约 300亿立方米, 因缺水而少收粮食 350-400亿公斤; 特别是我国主要产粮区 如华北、 东北和西北, 是我国缺水最严重的地区, 春旱频繁达到十年九遇。
由于植物的耐胁迫性大多属于数量性状, 现有可利用的种质资源匮乏, 采用 常规育种技术改良植物胁迫耐性的难度相当大,培育出真正的耐胁迫品种就尤为 困难。近年来, 随着对植物抗逆分子机理研究的不断深入和分子生物学技术的迅 猛发展, 抗逆研究已经从生理水平深入到分子水平, 促进了植物抗逆基因工程的 发展。 当植物在受到胁迫时会产生相应的应答反应, 来降低或消除给植株带来的 危害。植物的这种应答反应是一个涉及多基因、 多信号途径、 多基因产物的复杂 过程。 这些基因及其表达产物可以分为 3类: (1)参与信号级联放大***和转录控 制的基因及产物;(2)直接对保护生物膜和蛋白质起作用的基因及其表达产物; (3) 与水和离子的摄入和转运相关的蛋白质。近年来, 通过转基因技术提高植物对胁 迫耐受能力的研究, 以及对胁迫具有耐受能力的农作物、旱生植物和盐生植物的 研究都取得了显著的成果,对胁迫相关基因和信号转导***也有了更进一步的了 解 (Liu Q.1998. Two transcription factors, DREB 1 and DREB2,with an EREBP/AP2 DNA binding domain, separate two cellular signal transduction pathways in drought
and low temperature responsive gene expression, respectively, in Arabidopsis. Plant Cell, 10: 1391-1406; KANGJY.2002. Arabidopsis basic leucine zipper proteins that mediate stress responsive abscisic acid signaling。 Plant Cell, 14: 343-357; ABEH.2003.A rabid op sis AtMYC2 (bHLH) and AtMYB2(MYB) function as transcriptional activators in abscisic acid signaling. Plant Cell, 15: 63-78. ) 。
在植物抗逆反应体系中, 通过转录因子调控功能基因的表达, 是植物逆境应 答反应的关键环节。 作为植物体内最大的转录因子家族之一, MYB类转录因子 在植物抗逆胁迫过程中起着重要的作用。但就目前的研究状况而言, 由于其机制 十分复杂, 许多植物对逆境下的生物化学和生理学上的响应机制仍有待深入研 究。在抗逆应答基因的功能及表达调控方面的研究将对植物抗逆相关的信号传递 途径之间的联系以及整个信号传递网络***的研究提供重要的基础。 发明内容 本发明人利用 SSH (抑制差减杂交) 与 RACE ( cDNA末端快速扩增)相结 合的方法克隆了盐芥的一个 MYB类转录因子(本文命名为 的编 码基因的 DNA序列。 并发现将其导入受体植物后, 可显著改善转基因植株的耐 旱性, 而且这些性状可稳定遗传。
本发明第一方面提供盐芥的一个 MYB类转录因子 MYB1-2的编码基因(本 文命名为 Γ/ζ Β -2), 其序列为 SEQ ID NO: 2。
本发明第二方面提供一种重组表达载体, 其含有本发明第一方面所述的基 因, 其是通过所述基因***到一种表达载体而获得的, 优选地, 所述表达载体 是 pCAMBIA2300;并且所述基因的核苷酸序列与所述重组表达载体的表达控制 序列可操作地连接; 优选地, 所述重组表达载体为附图 2 所示的 rd29A-ThMYB 1-2-2300载体。
本发明第三方面提供一种重组细胞,其含有本发明第一方面所述的基因或者 本发明第二方面所述的重组表达载体;优选地,所述重组细胞为重组农杆菌细胞。
本发明第四方面提供一种改善植物耐旱性的方法, 包括: 将本发明第一方面 所述的基因或者本发明第二方面所述的重组表达载体导入植物或植物组织并使 所述基因表达; 优选地, 所述植物是烟草。
本发明第五方面提供一种制备转基因植物的方法, 包括: 在有效产生植物的 条件下培养含有本发明第一方面所述的基因、本发明第二方面所述的重组表达载 体的植物或植物组织; 优选地, 所述植物是烟草。
本发明第六方面提供本发明第一方面所述的基因、本发明第二方面所述的重 组表达载体或者本发明第三方面所述的重组细胞用于改善植物耐旱性以及用于 植物育种的用途; 优选地, 所述植物是烟草。
本发明第七方面提供由本发明第一方面所述的基因编码的氨基酸序列, 如 SEQ ID NO: 1所示。 附图说明 图 1是 ThMYBl-2的植物表达载体 (rd29A- ThMYB 1-2-2300 ) 的构建流程。 图 2是 ThMYBl-2的植物表达载体 (rd29A- ThMYB 1-2-2300 ) 的质粒图。 图 3是 Γ Λ¾ -2 Το代转基因烟草植株 (图中, TQC3 ; 右, TQC9 )和作为对照 的非转基因烟草植株 (图左, CK) 的耐旱模拟实验结果。
图 4是利用反转录 PCR对 T1代转基因烟草植株和非转基因对照植株中 Γ Λ¾ -2基因在转录水平进行分子水平检测的验证结果。 M为 DNA Ladder Marker ( DL2000 , TakaRa) , 1-4为非转基因对照烟草植株, 5-20为耐旱效果显 著的转基因烟草 TQ代植株, 21-24为耐旱效果不显著的转基因烟草 TQ代植株。 具体实施方式 下面结合非限制性实施例对本发明进行进一步说明。
下面实施例中提到的未注明来源的限制性内切酶均购自 New England Biolabs公司。 实施例 1、 干旱胁迫下盐芥 SSH文库构建:
具体方法为:
按照 Clontech公司的 PCR-selectTM cDNA Subtraction Kit试剂盒说明书所示 的方法通过抑制差减杂交方法构建差减文库 (SSH文库)。 在实验过程中以生长
过程中干旱处理的盐芥幼苗叶子的 mRNA作为样本 (Tester), 以未处理的盐芥 幼苗的叶子的 mRNA作为对照 (Driver)。 具体步骤如下:
( 1 ) 供试材料:
盐芥种子(中国内蒙古巴彦淖尔市乌兰布和沙漠绿色植物园盐生植物繁育中 心购买)播种到灭过菌的蛭石上, 在 25 °C、 光周期 16小时光照 /8小时黑暗 (其 中光照时光强 2000-3000 Lx)条件下培养,每周浇 1/2MS培养基(9.39 mM KN03, 0.625 mM KH2P04, 10.3 mM H4N03, 0.75 mM MgS04, 1.5 mM CaCl2, 50μΜ ΚΙ, 100μΜ Η3ΒΟ3, 100 M MnSO4, 30 M ZnSO4, 1μΜ Να2Μο04, Ο. ΙμΜ CoCl2, ΙΟΟμΜ Na2EDTA, 10(^M FeSO4) —次。 当苗株直径达到 5-6 cm时用于实验。
(2) 材料处理:
将供试幼苗分为 2组, 每组 4盆, 每盆 1株。 第一组为对照组, 在 25 °C、 周期 16小时光照 /8小时黑暗条件下培养, 正常用 1/2MS浇灌。 第二组为干旱 处理组, 25 °C、 周期 16小时光照 /8小时黑暗条件下培养, 停止浇灌, 处理 10 天, 然后及时剪取两组幼苗叶片, 用液氮迅速冷冻后, 于 -70°C冰箱中保存。
( 3 ) 总 RNA提取:
分别取对照组和干旱处理组的盐芥叶子 0.5 g, 用植物 RNA提取试剂盒 (Invitrogen) 提取盐芥的总 RNA。 用 HITACHI公司的紫外分光光度计 U-2001 测定总 RNA在 260 nm和 280 nm的吸光度值, OD260/OD280比值为 1.8-2.0,表明 总 RNA纯度较高, 用 1.0%的琼脂糖凝胶电泳检测总 RNA的完整性, 28S条带 的亮度约为 18S条带的 2倍, 表明 RNA的完整性良好。 使用 Qiagen 公司的 Oligotex mRNA纯化试剂盒 (从总 RNA中纯化 polyA+ RNA)分离 mRNA。
(4) 抑制差减杂交:
按 Clontech公司的 PCR-selectTM cDNA Subtraction Kit试剂盒说明书所示的 方法进行抑制差减杂交。 先将 Driver mRNA和 Tester mRNA分别反转录, 得到 双链 cDNA, 再以 2 Tester cDNA和 2 μg Driver cDNA作为起始材料进行差减 杂交。在 37°C水浴下分别将 Tester cDNA和 Driver cDNA用 Rsa I酶切 1.5小时, 然后将酶切后的 Tester cDNA分成两等份, 连接上不同的接头, 而 Driver cDNA 不连接头。 两种连有不同接头的 Tester cDNA分别与过量的 Driver cDNA混合, 进行第一次正向差减杂交。 将两种第一次差减杂交的产物混合, 再与新变性的
Driver cDNA进行第二次正向差减杂交,然后通过两次抑制性 PCR扩增差异表达 的片段, 使其得到富集。
为了增加获得表达序列标签(Expressed sequence tag, EST) (unigene)的有效 性, 避免基因无酶切位点及所获得序列在非翻译区, 本实验用 Rsal、 Haelll按上 述步骤对 Tester cDNA和 Driver cDNA进行酶切并先后进行两次正向差减杂交和 两次抑制性 PCR扩增,最后合并两组正向差减杂交 cDNA片段的第二次 PCR产 物。
( 5 ) cDNA差减文库的构建与初步筛选、 克隆及鉴定
依照 pGEM-T Easy试剂盒(购自 Promega的试剂盒)产品说明书所示方法, 将上述合并的正向差减杂交 cDNA片段的第二次 PCR扩增产物(使用 QIAquick PCR Purification Kit纯化, 购自 Qiagen)与 pGEM-T Easy载体连接, 其具体步骤 如下: 用 200 μΐ PCR管依次加入下列成分: 纯化的正向差减杂交 cDNA片段的 第二次 PCR产物 3 μ1,2χΤ4连接酶缓冲液 5 l,pGEM-T Easy载体 1 μ1,Τ4 ϋΝΑ 连接酶 Ι μΐ , 于 4°C连接过夜。 然后取 10 连接反应产物, 加入到 100 感 受态大肠杆菌 JMI09(购自 TAKARA)中, 冰浴 30分钟、 热休克 60秒、 冰浴 2分 钟, 另加 250 L LB培养液( 1% Tryptone购自 OXOID, 0.5%酵母提取物(Yeast Extract, 购自 OXOID), 1% NaCl (购自国药)) 后置 37°C摇床中, 以 225转 /分 钟振荡培养 30分钟, 然后从中取 200 μL·菌液涂布于含 50 g/mL氨苄青霉素、 40 g/mL X-gal ( 5-溴 -4氯 -3-吲哚- β -D-半乳糖苷)、 24 g/mL IPTG (异丙基- β -D-硫代吡喃半乳糖苷) (X-gal/IPTG购自 TAKARA) 的 LB (同上) 固体培养平 板上, 37°C培育 18小时。 计数培养板中直径 > l mm的清晰白色及蓝色菌落数, 随机挑取 330个白色菌落 (编号: Th-D001至 Th-D330)。 将所挑取的白色克隆分 别接种于含有 50 g/mL 氨苄青霉素的 LB 液体培养基的 96 孔细胞培养板 (CORNING)中, 37°C培养过夜后加甘油至终浓度 20% (体积), 于 -80°C保存备 用。对所培养的菌落克隆以巢式 PCR引物 Primer 1和 Primer 2R ( Clontech公司 的 PCR-selectTM cDNA Subtraction Kit试剂盒自带)进行菌液 PCR扩增验证,得 到 272个阳性克隆, 然后将所有阳性克隆在送英潍捷基(上海)贸易有限公司测 序。
( 6) 差异克隆的 cDNA测序分析:
将 DNA测序结果去除载体和不明确序列及冗余的 cDNA后, 共得到 167条
表达序列标签 (Expressed sequence tag, EST) (Unigene)。 经 BlastN发现其中 112条 EST在 GenBank中有同源序列 (蛋白同源性 50%以上), 29条 EST功能 未知或者为假定蛋白, 另有 35条 EST未获得同源匹配, 推测可能是处于 3 '、 5, 末端非翻译区的较短序列。 实施例 2 盐芥 MYB类转录因子编码基因 ThMYBl-2的克隆
将所述鉴定的盐芥 SSH文库中来自菌落 Th-D118的克隆子去掉冗余 DNA 后, 序列为 SEQ ID No: 3, 序列分析表明该序列的编码的氨基酸序列与 MYB 类转录因子具有较高的同源性, 本文将克隆子 Th-D118 编码的全长基因命名为 ThMYBl-2, 对应的蛋白命名为 ΜΥΒ1-2。
SEQ ID No: 3
1 GACTGAGATG GATTAATTAC CTTCGTCCTG ATCTCAAACG TGGAAACTTC TCTGATGAAG
61 AAGACCAAGT CATCATCAAA CTCCATAGCT TGCTCGGCAA CAAATGGTCA TTGATCGCTG 121 GAAGATTACC AGGAAGAACA GATAATGAAA TCAAAAACTA TTGGAACACT CATATTAAAA 181 GAAAGCTTCT TAGCCATGGA ATCGATCCAC AAACTCATCG TCCGGTTAAA GATTCCGTCG 241 CCGTTACTGA TTCCAAAACG GTTCCGTCTC CGTTAACACA CGCTCACCAA AACGGCGCCG 3 01 TTGAATACTC TTTCTCCGTT AGACCTAAGA AGGAAATTTC CTCCGATAAC GGCGCTTCCA 361 CAAGCGGCAC GACGACCGAT GAGGATCTCC AGCAGAACGG CGATTGTTAC TACAGTGATG 421 ATTCACGAGA CACAGAGCTG AATCTGGAGT TAACTCTCGG GTCCGGGTCA ACTTCGTGGG 481 TTGGGTCGGA TCGGGTAGTG AGAGCTGGGT TATCGGCAGA TTCGAAGCCG TGGCGGGATC 541 CGGTGACCGC GGTGGTGGCG GCGCGTTTGT CGTTGTTGTA AGAATTGCTA AACGGCAAAA 601 ATCCCCTTTA ACAAAATATC AAAA
ThMYBl-2全长基因的克隆
已经获得的 ThMYBl-2基因片段( SEQ ID NO:3 ), 已经有终止密码子 TAA, 只需要做 5 ' RACE。
根据已经获得的 ThMYBl-2基因片段(SEQ ID NO:3 ),设计三条特异性引物, 作为反转录引物及 5'RACE的 3 '端特异性引物。
ThMYBl-2 GSP1 : SEQ ID NO: 4:
CTTGTGGAAGCGCCGTTATC
ThMYBl-2 GSP2: SEQ ID NO: 5:
CAACGGCGCCGTTTTGGTG
ThMYB 1 -2 GSP3: SEQ ID NO: 6:
CTTTCTTTTAATATGAGTGTTC
实验步骤按试剂盒说明书操作 ( 5, RACE System for Rapid Amplification of cDNAEnds试剂盒购自 Invitrogen公司)。
用 SEQ ID NO: 5与 5'通用引物 AAP (试剂盒自带), 以干旱处理组叶子提 取的 mRNA逆转录的 cDNA (反转录引物 SEQ ID NO:4)为模板进行第一轮 PCR 扩增, 具体步骤如下:
50 μΐ PCR反应体系: 5 μΐ ΙΟ Εχ Buffer, 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP, 2.0 μΐ mRNA 反转录的 cDNA, 1.0 μΐ Ex Taq (Ex Taq购自 TAKARA)、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 5和 AAP各 2.0 μ1, 以及 35 μΐ的双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5分 钟, 33个循环 (94°C变性 30秒, 55°C退火 30秒, 72°C延伸 2分钟), 72°C延伸 10分钟。
所得的 PCR产物用双蒸水稀释 50倍后取 2.0 μΐ作为模板,用 SEQ ID NO: 6 与 3'端引物 AUAP进行第二轮 PCR扩增, 具体步骤如下:
50 μΐ PCR反应体系: 5 μΐ ΙΟ Εχ Buffer, 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP, 2.0 μΐ稀释 的第一轮 PCR产物, 1.0 l Ex Taq、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 6和 AUAP各 2.0 μ1, 以及 35 μΐ的双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5分钟, 33个循环后(94 °C 变性 30秒, 58°C退火 30秒, 72°C延伸 2分钟), 72°C延伸 10分钟。 回收第二次 PCR产物中约为 600 bp大小的条带 (Gel Extraction Kit购自 OMEGA), 并将其 连接于 pGEM-T Easy载体, 然后转化到大肠杆菌 JM109感受态细胞中 (具体方 法同上), 并在含 50 g/mL氨苄青霉素的 LB固体培养基上进行筛选。 随机挑取 10个白色菌落于含有 50 g/mL氨苄青霉素的 LB液体培养基中培养, 37°C培养 过夜后加甘油至终浓度 20% (体积), -80°C保存备用。 SEQ ID NO: 6与 3'端引 物 AUAP进行菌液 PCR扩增(反应体系及反应条件同上), 得到 3个阳性克隆, 送英潍捷基 (上海) 贸易有限公司测序测序, 获得该基因的 cDNA的 5'端。
所得的 5'RACE产物克隆测序后, 与克隆子 Th-D178测序结果拼接, 获得 SEQ ID NO: 17:
1 AGAAAGGAAG AAGGTTACCT ACCAAATCCC CACACACAAC ACAGCAAAGC ACAGCCTCTC
61 CCTCTCATAT AATCACATGT ATGGGTACCA ACTTGGTCAA AAAGTCACCA CCTTTTATAT
121 TAACCCAAAC TCTCCTCACA TATTGCGTCC TTCTTCTCTT TCTCTCCATA CACACACACA
181 CACATACCAT CTTCTTCACC ATGGGAAGGT CTCCTTGTTG CGAGAAAGCC CACACAAACA 241 AAGGAGCTTG GACCAAAGAA GAAGACCAAC GTCTCGTCGA TTACATCCGT AACCACGGCG
3 01 AAGGTTGCTG GCGTTCTCTT CCCAAATCAG CAGGATTGTT GCGATGTGGT AAAAGTTGTA
361 GACTGAGATG GATTAATTAC CTTCGTCCTG ATCTCAAACG TGGAAACTTC TCTGATGAAG
AAGACCAAGT CATCATCAAA CTCCATAGCT TGCTCGGCAA CAAATGGTCA TTGATCGCTG GAAGATTACC AGGAAGAACA GATAATGAAA TCAAAAACTA TTGGAACACT CATATTAAAA GAAAGCTTCT TAGCCATGGA ATCGATCCAC AAACTCATCG TCCGGTTAAA GATTCCGTCG CCGTTACTGA TTCCAAAACG GTTCCGTCTC CGTTAACACA CGCTCACCAA AACGGCGCCG TTGAATACTC TTTCTCCGTT AGACCTAAGA AGGAAATTTC CTCCGATAAC GGCGCTTCCA CAAGCGGCAC GACGACCGAT GAGGATCTCC AGCAGAACGG CGATTGTTAC TACAGTGATG ATTCACGAGA CACAGAGCTG AATCTGGAGT TAACTCTCGG GTCCGGGTCA ACTTCGTGGG TTGGGTCGGA TCGGGTAGTG AGAGCTGGGT TATCGGCAGA TTCGAAGCCG TGGCGGGATC CGGTGACCGC GGTGGTGGCG GCGCGTTTGT CGTTGTTGTA AGAATTGCTA AACGGCAAAA ATCCCCTTTA ACAAAATATC AAAA
根据 SEQ ID NO: 17序列设计一对引物如下:
ThMYBl-2F: SEQ ID NO: 7:
ATGGGTACCAACTTGGTC
ThMYBl-2R: SEQ ID NO: 8:
TTACAACAACGACAAACGCGC
通过 SEQ ID NO:7和 SEQ ID NO: 8来克隆 ThMYBl-2全长。
采用 TaKaRa的 PrimeSTAR HS DNA聚合酶,以干旱处理组盐芥叶子提取的 mRNA反转录的 cDNA为模板进行 PCR反应。 50 μΐ PCR反应体系: 10 μΐ 5xPS Buffer, 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP, 2.0 μΐ cDNA, 1.0 μΐ PrimeSTAR、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 7和 SEQ ID NO: 8各 2.0 μ1, 以及 30 μΐ的双蒸水。 PCR反应条件: 94 °C预变性 5分钟, 33个循环 (94°C变性 30秒, 54°C退火 30秒, 72°C延伸 2 分钟), 72 °C 延伸 10分钟。
PCR扩增产物加 A尾: PCR产物加 2.5倍体积的无水乙醇, -20°C放置 10 分钟, 离心, 去上清, 晾干, 用 21 μΐ双蒸水溶解。 加入 2.5 μΐ ΙΟχΕχ Buffer, 0.5 μ1 5 ιηΜ的 dATP , 2.5 μΐ ΙΟχΕχ Taq。 反应条件: 70°C反应 30分钟。 将得到约 850 bp的 DNA片段回收 (Omega回收试剂盒), 连接至 pGEM T-easy载体上, 转化 JM109(方法同上), 随机挑取 10个白色菌落于含有 50 g/mL氨苄青霉素的 LB 液体培养基中培养, 37°C培养过夜后加甘油至终浓度 20% (体积), -80°C保 存备用。 SEQ ID NO: 7与 SEQ ID NO: 8进行菌液 PCR扩增 (反应体系及反应 条件同上), 得到 4个阳性克隆, 送至英潍捷基 (上海) 贸易有限公司测序, 序 列为 SEQ ID NO: 2。根据该核苷酸序列,可知该基因编码的 ThMYBl-2蛋白氨基 酸序列如 SEQ ID NO: l所示。
MYB 1-2转录因子的氨基酸序列: SEQ ID NO: l
1 MGTNLVKKSP PFILTQTLLT
21 YCVLLLFLS I HTHTHTIFFT
41 MGRSPCCEKA HTNKGAWTKE
61 EDQRLVDYIR NHGEGCWRSL
81 PKSAGLLRCG KSCRLRWINY
101 LRPDLKRGNF SDEEDQVI IK
121 LHSLLGNKWS LIAGRLPGRT
141 DNEIK YWNT HIKRKLLSHG
161 IDPQTHRPVK DSVAVTDSKT
181 VPSPLTHAHQ NGAVEYSFSV
201 RPKKEISSDN GASTSGTTTD
221 EDLQQNGDCY YSDDSRDTEL
241 NLELTLGSGS TSWVGSDRW
261 RAGLSADSKP WRDPVTAWA
281 ARLSLL*
ThMYBl-2 编码基因的核苷酸序列: SEQ ID NO: 2
1 ATGGGTACCA ACTTGGTCAA AAAGTCACCA CCTTTTATAT TAACCCAAAC TCTCCTCACA
61 TATTGCGTCC TTCTTCTCTT TCTCTCCATA CACACACACA CACATACCAT CTTCTTCACC
121 ATGGGAAGGT CTCCTTGTTG CGAGAAAGCC CACACAAACA AAGGAGCTTG GACCAAAGAA 181 GAAGACCAAC GTCTCGTCGA TTACATCCGT AACCACGGCG AAGGTTGCTG GCGTTCTCTT
241 CCCAAATCAG CAGGATTGTT GCGATGTGGT AAAAGTTGTA GACTGAGATG GATTAATTAC
3 01 CTTCGTCCTG ATCTCAAACG TGGAAACTTC TCTGATGAAG AAGACCAAGT CATCATCAAA
361 CTCCATAGCT TGCTCGGCAA CAAATGGTCA TTGATCGCTG GAAGATTACC AGGAAGAACA
421 GATAATGAAA TCAAAAACTA TTGGAACACT CATATTAAAA GAAAGCTTCT TAGCCATGGA 481 ATCGATCCAC AAACTCATCG TCCGGTTAAA GATTCCGTCG CCGTTACTGA TTCCAAAACG
541 GTTCCGTCTC CGTTAACACA CGCTCACCAA AACGGCGCCG TTGAATACTC TTTCTCCGTT
601 AGACCTAAGA AGGAAATTTC CTCCGATAAC GGCGCTTCCA CAAGCGGCAC GACGACCGAT
661 GAGGATCTCC AGCAGAACGG CGATTGTTAC TACAGTGATG ATTCACGAGA CACAGAGCTG
721 AATCTGGAGT TAACTCTCGG GTCCGGGTCA ACTTCGTGGG TTGGGTCGGA TCGGGTAGTG 781 AGAGCTGGGT TATCGGCAGA TTCGAAGCCG TGGCGGGATC CGGTGACCGC GGTGGTGGCG
841 GCGCGTTTGT CGTTGTTGTA A 实施例 3 ThMYBl-2基因植物表达载体构建
选择植物双元表达载体 pCAMBIA2300 (购自北京鼎国昌盛生物技术有限责 任公司) 作为植物表达载体, 用 Pnos启动子替换 ΡΤΠ基因含双增强子的 35S 启动子, 以降低 ΡΤΠ蛋白在植物中的表达。选择诱导型启动子 rd29A及终止子 Tnos作为 基因的启动子和终止子。 构建流程图如图 1所示
用引物 SEQ ID NO: 9和 SEQ ID NO: 10, 以植物表达载体 pBI121 (购自北 京华夏远洋科技有限公司)为模板扩增 Pnos,采用 TaKaRa的 PrimeSTAR HS DNA 聚合酶。 50 μΐ PCR反应体系: 10 μΐ 5xPS Buffer, 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP, 1.0 μΐ
PBI121 , 1.0 ^ PrimeSTAR 10 μΜ的引物 SEQ ID NO:9和 SEQ ID NO: 10各 2.0 μ1, 以及 31 μΐ的双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5分钟, 33个循环 (94°C 变性 30秒, 56°C退火 30秒, 72°C延伸 30秒), 72°C延伸 10分钟。 通过 EcoRI、 Bglll酶切后将所得 PCR产物连接到 pCAMBIA2300 (Promega, T4连接酶试 剂盒) 获得 pCAMBIA2300-l。
SEQ ID NO: 9 :
GCACGAATTCATACAAATGGACGAACGGAT SEQ ID NO: 10:
ATCCAGATC AGATCCGGTGCAGATTATTTG
用引物 SEQ ID NO: 11和 SEQ ID NO: 12以 pBI121为模板扩增 Tnos, 采用
TaKaRa的 PrimeSTAR HS DNA聚合酶。 50 μΐ PCR反应体系: 10 μΐ 5xPS Buffer, 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP, 1.0 μΐ pBI121, 1.0 μΐ PrimeSTAR、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 11和 SEQ ID NO: 12各 2.0 μ1, 以及 31 μΐ的双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变 性 5分钟, 33个循环(94°C变性 30秒, 58°C退火 30秒, 72°C延伸 30秒), 72 °C 延伸 10分钟。通过 Sacl、 EcoRI酶切连接到 pCAMBIA2300-l (Promega T4连接 酶试剂盒) 获得 pCAMBIA2300-2
SEQ ID NO: 11:
AAGGAGCTCGAATTTCCCCGATCGTTCAAA
SEQ ID NO: 12:
TCAGAATTCCCAGTGAATTCCCGATCTAGTA
用引物 SEQ ID NO: 13和 SEQ ID NO: 14以拟南芥(哥伦比亚型, 购自美国 俄亥俄州立大学的拟南芥生物资源中心(www.arabidopsis.org) ) DNA为模板扩 增拟南芥 rd29A启动子 (参考 Zeng J" et L. 2002, Preparation of total DNA from"recalcit rant plant taxa", Acta Bot. Sin., 44(6): 694-697中的方法提取拟南芥 DNA) 0采用 TaKaRa的 PrimeSTAR HS DNA聚合酶。 50 μΐ PCR反应体系: 10 μΐ 5xPS Buffer, 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP, 1.0 μΐ拟南芥 DNA, 1.0 μΐ PrimeSTAR、 10 μΜ 的引物 SEQ ID NO: 13和 SEQ ID NO: 14各 2.0 μ1, 以及 31 μΐ的双蒸水。 PCR 反应条件: 94°C预变性 5分钟, 33个循环 (94°C变性 30秒, 58°C退火 30秒, 72°C延伸 30秒), 72°C延伸 10分钟。 通过 HindIII、 Pstl酶切后将所得 PCR产
物连接到 (连接方法同上) pCAMBIA2300-2获得 pCAMBIA2300-3
SEQ ID NO: 13:
ACTAAGCTTCCTTCTTGACATCATTCAATTTTA SEQ ID NO: 14:
TGACTGCAGTCCAAAGATTTTTTTCTTTCCAATAG
用引物 SEQ ID NO: 15和 SEQ ID NO: 16扩增 ThMYBl-2 (模板是实施例 2 所获得 ThMYBl-2, 采用 TaKaRa的 PrimeSTAR HS DNA聚合酶。 50 μΐ PCR反 应体系: 10 ^ 5xPS Buffer, 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP, 1.0 μΐ ThMYBl-2-pGEM, 1.0 μΐ PrimeSTAR、 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 15和 SEQ ID NO: 16各 2.0 μ1, 以及 31 μΐ的双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5分钟, 33个循环 (94°C变性 30 秒, 58°C退火 30秒, 72°C延伸 2分钟), 72°C延伸 10分钟。 通过 Pstl、 Sad酶 切后将所得 PCR产物连接到(连接方法同上) pCAMBIA2300-3, 获得植物表达 载体 rd29A-ThMYB 1-2-2300。
SEQ ID NO: 15:
TGACTGCAGATGGGTACCAACTTGGTC SEQ ID NO: 16:
AAGGAGCT TTACAACAACGACAAACGCGC 实施例 4 rd29A- ThMYB 1-2-2300表达载体转化农杆菌
农杆菌 LBA4404 (购自 Biovector Science Lab, Inc) 感受态细胞的制备: 提 前 1-2天将农杆菌 LBA4404在含 50 g/ml利福平和 50 g/ml链霉素的 LB固体 培养基上划单斑接种, 28°C培养 1至 2天。 挑取单菌落接种于 5 ml含 50 μ§/ιη1 利福平和 50 g/ml链霉素的 LB液体培养基中, 28°C下摇动培养过夜 (约 12-16 小时) 至 OD600值为 0.4, 形成种子菌液。 取 5 ml培养活化后的菌液 (1 :20的 比例)接种于 100 ml含 50 g/ml利福平和 50 g/ml链霉素的 LB液体培养基中, 28°C摇动培养 2-2.5小时至 OD6(K)=0.8。冰浴菌液 10分钟,每隔 3分钟摇匀一次, 使细菌均匀进入休眠状态。 于 4°C下 4000 g离心 10分钟, 弃上清液; 加入 1 ml 冰预冷的 10% (体积) 甘油重悬浮菌体, 4°C下 4000 g离心 10分钟, 收集沉淀; 用冰预冷的 10% (体积)甘油重复洗 3-4次; 加入适量冰预冷的 10% (体积)甘
油重新悬浮细菌沉淀,即制得 LBA4404感受态细胞,以 40 μΐ/管将其分装,于 -70°C 保存备用。
转化农杆菌:在冰上融化 LBA4404感受态细胞, 向 40 μΐ的所述感受态细胞 中加入 1 μΐ实施例 3中所得的阳性 rd29A-ThMYB 1-2-2300质粒, 混匀后冰浴约 10分钟。 将感受态细胞和 rd29A-ThMYBl-2-2300质粒的混合物用微量移液器转 移到冰预冷的电击杯中,轻敲使悬浮液到达底部,注意不要有气泡。将电击杯(购 自 Bio-Rad) 放到电击室的滑道上, 推动滑道将电击杯放至电击室基座电极处。 使用 0.1 cm的电击杯的时候, MicroPulser (购自 Bio-Rad) 的程序设置为 "Agr", 电击一次。立即取出电击杯, 加入 28°C预热的 LB培养基。快速而轻柔的用微量 移液器将感受态细胞打匀。 将悬浮液转入 1.5 ml的离心管, 在 28°C, 以 225 rpm 培养 1小时。 取 100-200 μΐ的菌液涂布与相应的抗性筛选培养基平板上 (LB固 体培养基, 含 50 μ§/ιη1利福平、 50 μ§/ιη1链霉素、 50 g/ml卡那霉素), 28°C培 养。 筛选阳性转化克隆, 并将其菌液于 -70°C保存备用。 实施例 5 利用农杆菌介导的叶盘转化法获得转基因烟草
用 75%酒精浸泡烟草种子(国家烟草中期库,获取单位:中国农科院烟草所, 库编号 I5A00660) 30秒, 用灭菌双蒸水洗两次。 再用 0.1%升汞浸泡 8分钟, 用 灭菌双蒸水洗两次, 完成表面灭菌。 将表面灭菌的烟草种子置于 MS ( 18.78 mM KN03, 1.25 mM KH2P04, 20.6 mM H4NO3, 1.5 mM MgS04, 3.0 mM CaCl2, 50 μΜ ΚΙ, 100 μΜ Η3ΒΟ3, 100 M MnSO4, 30 M ZnSO4, 1 μΜ Να2Μο04, 0.1 M CoCl2, 100 μΜ Να2ΕϋΤΑ, 100 M FeSO4, 7.4 g/L琼脂, 蔗糖 30 g/L) 上于 无菌条件下发芽, 制备无菌苗。 取无菌苗叶片剪成 5 mmx5 mm大小的叶盘, 用 处于对数生长期的含表达载体 rd29A-ThMYB 1-2-2300 的农杆菌浸染叶盘 10分 钟, 吸干菌液, 在黑暗条件下共培养 2天 (MS培养基)。 将叶片转到分化培养 基 (MS+1 mg/L细胞***素 (BA) +0.1 mg/L萘乙酸 (NAA) +50 mg/L卡那霉 素 +500 mg/L头孢霉素)上, 光周期 10小时光照 /14小时黑暗(其中光照时光强 2000-3000 Lx ) 条件下培养 45 天左右, 待芽长大后切下转移到生根培养基 (MS+50 mg/L卡那霉素 +500 mg/L头孢霉素)中培养 30天左右, 待根系发达后 将小苗转入仅加有 500 mg/L头孢霉素的 MS培养基上进行编号保存。
取获得的转基因烟草叶片, 提取 DNA (同实施例 3中拟南芥 DNA提取方 法),用 SEQ ID NO: 7和 SEQ ID NO: 8 ( 50 μΐ PCR反应体系: 5 μΐ ΙΟ Εχ Buffer, 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP, 2.0 μΐ DNA, 1.0 μΐ Ex Taq 10 μΜ的引物 SEQ ID NO: 9 禾口 SEQ ID NO: 10各 2.0 μ1, 以及 35 μΐ的双蒸水。 PCR反应条件: 94°C预变性 5 分钟, 33个循环(94°C 变性 30秒, 55 °C退火 30秒, 72°C 延伸 2分钟), 72 °C 延伸 10分钟), PCR鉴定, 保存阳性植株进行编号 Tod-ToC^ 实施例 6 过表达 ThMYBl-2转基因烟草 TQ的耐旱模拟实验及功能鉴定 将灭过菌的蛭石用 1/2MS培养基浸透。 Tod-ToC^及对照烟草组培苗分别移 栽至蛭石上, 25 °C、 10小时光培养 /14小时暗培养循环, 每 5天浇一次 1/2MS , 壮 苗培养 15天之后, 进行干旱胁迫实验, 转基因烟草、对照烟草干旱 14天 (不浇水), 25 °C、 10小时光培养 /14小时暗培养循环。 TQ代转基因植株 (TQ代转基因植株的 种子长成的植株)的抗旱性鉴定表明,对照植株都萎蔫严重,而 TQC2、 T0C3 ToC7、 T0C9 T0Cio T0Cii TQC14七个株系共 29棵烟草中有 20棵能够正常生长, 显著出 明显的耐旱性 (参见图 3, 以 T。C3、 T。C9为例, T。C2、 T。C7、 T0Cio T。CU、 T0C14 的结果与 TQC3、 TQC9类似, 在此未示出)。 实施例 7 在转录水平上验证 Γ Λ¾ -2基因表达 分别取对照烟草、 不显著耐旱转基因烟草 TQ代植株、 显著耐旱转基因烟草 TQ代植株 (生长状况良好) 干旱 14天的叶子 0.05g, 用植物 RNA提取试剂盒 (Invitrogen) 提取总 RNA。 用 HITACHI公司的紫外分光光度计 U-2001测定总 RNA在 260 nm和 280 nm的吸光度值, 计算各个 RNA浓度。 依照 Invitrogen反 转录试齐 LI盒 Superscript III Reverse Transcriptase所示方法进行反转录 (.2\ag总 RNA作为模板,反转录引物 SEQ ID NO: 8)。通过 SEQ ID NO:7和 SEQ ID NO: 8 扩增 ThMYB 1 -2, 检测 MYB 1 -2蛋白相对表达情况。采用 TaKaRa的 PrimeSTAR HS DNA聚合酶,以反转录的 cDNA为模板进行 PCR反应。 50 μΐ PCR反应体系: 10 μΐ 5xPS Buffer, 3 μΐ 2.5 mM的 dNTP, 2.0 μΐ cDNA, 1.0 μΐ PrimeSTAR、 10 μΜ 的引物 SEQ ID NO: 7和 SEQ ID NO: 8各 2.0 μ1, 以及 30 μΐ的双蒸水。 PCR反应 条件: 94°C预变性 5分钟, 29个循环 (94°C变性 30秒, 55 °C退火 30秒, 72°C 延伸 1分钟), 72 °C 延伸 10分钟。产物电泳结果如图 4所示: M为 DNALadder
Marker (DL2000, 购自深圳瑞真生物技术有限公司), 1-4为对照烟草, 5-20为 显著耐旱转基因烟草 TQ代植株, 21-24为不显著耐旱转基因烟草 TQ代植株。 图 中所示条带大小与 ThMYBl-2 的大小一致 (约 900bp)。 结果表明对照烟草没有 检测到外源基因 ThMYBl-2的转录信号, 显著耐旱转基因烟草 TQ代植株中外源 基因 ThMYBl-2 的转录较强, 不显著耐旱转基因烟草 TQ代植株中外源基因 ThMYBl-2转录很弱或没有转录。
Claims (9)
- 权 利 要 求 书1. 盐芥的一个 MYB类转录因子, 其序列如 SEQ ID NO: 1所示。
- 2. 编码权利要求 1的 MYB类转录因子的基因, 其序列为 SEQ ID NO: 2。 3. 一种重组表达载体,其是通过将权利要求 2的基因***到一种表达载体 而获得的,并且所述基因的核苷酸序列与所述表达载体的表达控制序列可操作地 连接, 优选地, 所述表达载体是 pCAMBIA2300。
- 4. 权利要求 3的重组表达载体, 其为附图 2所示的 rd29A-ThMYB 1-2-2300 载体。
- 5. 一种重组细胞, 其含有权利要求 2的基因或者权利要求 3或 4的重组表 达载体; 优选地, 所述重组细胞为重组农杆菌细胞。
- 6. 一种改善植物耐旱性的方法, 包括: 将权利要求 2所述的基因或者权利 要求 3或 4的重组表达载体导入植物或植物组织并使所述基因表达; 优选地, 所 述植物是烟草。
- 7. 一种制备转基因植物的方法, 包括: 在有效产生植物的条件下培养含有 权利要求 2所述的基因或者权利要求 3或 4的重组表达载体的植物或植物组织。
- 8. 权利要求 7所述的方法, 其中所述植物是烟草。
- 9. 权利要求 2所述的基因、 权利要求 3或 4所述的重组表达载体或者权利 要求 5所述的重组细胞用于改善植物耐旱性以及用于植物育种的用途。
- 10. 权利要求 9所述的用途, 其中所述植物是烟草。
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