CN104530205B - 一种油菜抗菌肽BnLTP1及其应用 - Google Patents
一种油菜抗菌肽BnLTP1及其应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN104530205B CN104530205B CN201510050902.0A CN201510050902A CN104530205B CN 104530205 B CN104530205 B CN 104530205B CN 201510050902 A CN201510050902 A CN 201510050902A CN 104530205 B CN104530205 B CN 104530205B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- gene
- bnltp1
- eddie
- rape
- nltp1
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01N—PRESERVATION OF BODIES OF HUMANS OR ANIMALS OR PLANTS OR PARTS THEREOF; BIOCIDES, e.g. AS DISINFECTANTS, AS PESTICIDES OR AS HERBICIDES; PEST REPELLANTS OR ATTRACTANTS; PLANT GROWTH REGULATORS
- A01N63/00—Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing microorganisms, viruses, microbial fungi, animals or substances produced by, or obtained from, microorganisms, viruses, microbial fungi or animals, e.g. enzymes or fermentates
- A01N63/10—Animals; Substances produced thereby or obtained therefrom
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/70—Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Pest Control & Pesticides (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Botany (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Environmental Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Dentistry (AREA)
- Virology (AREA)
- Agronomy & Crop Science (AREA)
- Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
本发明公开了一种油菜抗菌肽BnLTP1及其应用。本发明提供了一种油菜抗菌肽BnLTP1,其序列为SEQ ID NO.2所示。通过overlap PCR方法完成该基因的人工合成,将合成的抗菌肽基因克隆到pET30a/His‑EDDIE‑GFP表达载体上并转化到大肠杆菌中进行体外表达,获得不增加任何多余氨基酸的抗菌肽产物。抑菌活性检测结果表明抗菌肽BnLTP1对细菌和真菌都具有较强的抑菌活性。离体叶片涂抹接菌实验证实BnLTP1能够显著增强植物对腐生营养型真菌:核盘菌、灰霉菌、稻瘟病菌的抗性。BnLTP1能够作为生防制剂用于菌核病、灰霉病以及稻瘟病的防治中,也可以作为抗性标记用于油菜抗病品种的选育。
Description
技术领域
本发明涉及基因工程和生物技术领域。具体涉及一种油菜抗菌肽BnLTP1及其应用。
背景技术
病原菌可引起包括人类,牲畜,作物和其他生物的严重病害,造成严重的经济损失。植物病原真菌是植物的重要病原菌,可引起80%以上的植物病害(张福丽,王占斌,王志英,几丁质酶在植物抗真菌病害中的作用,林业科技,2006,31(3):24-27),造成世界粮食作物减产约20%(Knight S.C.,Anthony V.M.,Brady A.M.,et al.Rationale andperspecti ves on the developmentof fungicides.Annu Rev Phytopathol,1997,35:349-372)。许多重要植物病害都是真菌造成的,如马铃薯晚疫病、稻瘟病、小麦白粉病、玉米大小斑病菌、大豆灰斑病、油菜菌核病等,每年都造成非常巨大的经济损失。另一方面,真菌在侵染植物的过程中,释放出来的代谢产物——真菌毒素(mycotoxin),对农作物以及人类的健康也造成极大的危害,如黄曲霉毒素(aflatoxin)等。
核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)属于子囊菌亚门、盘菌纲、柔膜菌目、核盘菌科、核盘菌属。是一种危害作物和蔬菜的世界性的重要的植物病原菌。核盘菌可以广泛地侵染很多单子叶和双子叶植物。核盘菌引起的菌核病是一种类似于灰霉的腐生营养型真菌,这种破坏性病源侵染超过400种植物,分布广泛。目前对菌核病的防治主要依靠化学农药,然而化学防治不仅成本高、污染环境,而且防效也不理想;同时,食品的安全性也受到严重影响。油菜是世界上重要的油料作物之一,菌核病造成油菜的根,茎和角果的腐烂,导致了巨大的产量损失。尽管菌核病严重威胁了农业生产,植物对核盘菌的寄主抗性的分子机制,我们依然知之甚少。暨今为止还没有发现完全免疫或者高抗的油菜栽培品种(Liu,S.,Wang,H.,Zha ng,J.,Fitt,B.D.,Xu,Z.,Evans,N.,Liu,Y.,Yang,W.,and Guo,X.2005.Invitro mu tation and selection of doubled-haploid Brassica napus lines withimproved resistance to S clerotinia sclerotiorum.Plant Cell Rep.24:133-144),因此,探究植物对这种病源的抗性机制,发现新的抗性基因具有深远意义。
灰霉菌(Botrytis cinerea),又称灰葡萄孢菌,是一种广寄主性的、能够引起200多种已知植物(如水果、蔬菜及花卉)灰霉病的坏死营养型病原真菌。其在空气中广泛分布,不仅能够侵染田间作物,同样会给植物的采后阶段造成巨大损失。灰霉菌能够在低温条件下(0℃)生长,靠产生大量的灰色分生孢子进行传播,与其它采后病原真菌相比,具有潜伏侵染和低温致病的优势。同时,其还具有繁殖快、遗传变异大和适合度高的特点。日常生活中遇到的果蔬放一段时间会长毛,多数就可能是受到了灰霉菌的侵染。灰霉病最初只是流行于欧洲和美洲,自20世纪80年代才开始在中国发生蔓延。由于温室和大棚种植技术的推广普及,作物灰霉病害严重,已成为蔬菜、花卉和林业苗培育基地生产的主要限制因素。截止2013年,世界上尚未发现有任何一种植物对灰霉菌产生抗性(陈琪,丁克坚,檀根甲,张晓伟,灰霉病菌菌株抗药性变异及其遗传性研究。2003华东植物病理学术研讨会暨江苏省植物病理学会第十次会员***论文集)。因此发现新的抗灰霉菌的基因具有深远的意义。
稻瘟病又名稻热病:俗称火烧瘟、嗑头瘟,稻瘟病是水稻四大重要病害之一,主要由病原真菌稻梨孢(稻瘟病菌P.oryzae)引起。可引起大幅度减产,严重时减产40%~50%,甚至颗粒无收水。世界各稻区均匀发生,其中以叶部、节部发生为多,发生后可造成不同程度减产,尤其穗颈瘟或节瘟发生早而重,可造成白穗以致绝产。主要为害叶片、茎秆、穗部。因为害时期、部位不同分为苗瘟、叶瘟、节瘟、穗颈瘟、谷粒瘟。苗瘟发生于三叶前,由种子带菌所致。病苗基部灰黑,上部变褐,卷缩而死,湿度较大时病部产生大量灰黑色霉层,即病原菌分生孢子梗和分生孢子。叶瘟在整个生育期都能发生。分蘖至拔节期为害较重。秧苗期发病后变成黄褐色而枯死,不形成明显病斑,潮湿时,可长出青灰色霉。在我国南、北方稻区都有不同程度发生,流行年份一般减产10-20%,严重的减产达40-50%,在水稻秧苗期和分蘖期发病,可使叶片大量枯死,严重时全田呈火烧状,有些稻株虽不枯死,但抽出的新叶不易伸长,植株萎缩不抽穗或抽出短小的穗,孕穗抽穗期发病、节瘟、穗颈瘟严重发生,可造成大量白穗或半白穗,损失极大(凌忠志,《稻瘟病研究论文集》,中国农业出版社)。
目前常用的病害防治措施,主要依靠化学农药,然而化学防治不仅成本高、污染环境,而且防效也不理想;同时,食品的安全性也会受到严重影响。随着社会的进步,人们越来越深刻地认识到长期大量使用化学农药对生态环境和人类健康的危害。生物防治可以有效地克服这些弊端,因而生物农药越来越受到人们的重视。
抗菌肽(antimicrobial peptides,AMPs)是一类具有抗菌活性的天然小分子蛋白,广泛存在于生物界,是机体非特异性免疫的重要组成部分,在体内体外均具有抗菌活性(Gordo n YJ,Romanowski EG,A Review of Antimicrobial Peptides and TheirTherapeutic Potential as Anti-Infective Drugs.Curr Eye Res.2005,30(7):505–515)。抗菌肽的广泛的生物学活性,对细菌真菌、原生动物、病毒和肿瘤等有很强的抑制作用,具有高效、环保、不使病原菌产生耐药性等优点使它在生物防治和医学上具有良好的应用前景(Gordon YJ,Romanowski E G,A Review of Antimicrobial Peptides and TheirTherapeutic Potential as Anti-Infective Dr ugs.Curr Eye Res.2005,30(7):505–515)。近年来已经成为植物抗病基因工程、养殖饲料添加剂,食品防腐剂、新兴医药等领域的研究热点,在疾病防治领域中是抗生素的理想替代品(Boman HG,Peptide antibioticsand their role in innateimmunity.Annu Rev Immuno1.1995,13:6l-92)。在农业生产过程中,用抗菌肽进行植保工作可以避免农用抗生素通过食物链的传递对人体产生的威胁。
按照氨基酸序列及二级结构,已发现的植物抗菌肽可以分为植物防御素(plantdefensins)、脂转移蛋白(1ipidtransfer proteins,LTPs),硫素(thionins),蜕皮素(snakins),橡胶蛋白类(hev ein-like),打结素类(knottin-like peptides),凤仙花素(IbAMP),和新近发现的荠菜素(she pherdins)、环肽(cyclotides)等(Hancock REW,Chapple DS,Peptide Antibiotics.Antimicrob Agent Chemother,l999,43(6):l3l7-l323)。抗菌肽基本上都具有一些共性,如:小分子量(<10KDa),阳离子表面、正电荷以及两亲性,这些特性使得抗菌肽能够和细胞膜绑定并能够***到细胞内部,大部分抗菌肽是通过破坏细胞膜从而使目标细胞死亡而达到杀菌目的。而另一些抗菌肽却能够通过细胞膜上的离子通道进入到细胞内部破坏细胞而不破坏细胞膜(Vogel PMHaHJ:Structure–function relationships of antimicrobial peptides.Biochem Cell Biol 1998,76:235-246.)。脯氨酸富集类抗菌肽(PRPs)的杀菌方式就是通过不破坏细胞膜,而是利用离子通道的方式进行的(L.Otvos J:The short proline-rich antibacterial peptide family.Cellular and Molecular Life Sciences 2002,59:1138-1150.)。大多数类型的植物源抗菌肽对动物和植物细胞都没有毒性(Murad AM.Pelegrini PB.Neto SM.NovelFindings of Defensins and their Utilization in Construction of TransgenicPlants.Transgenic Plant Journ al 2001(1):39-48)。与动物源抗菌肽相比,植物源抗菌肽更易于在作物中表达和调控,不容易被细胞内的蛋白酶降解。与其他杀菌剂相比,植物来源的抗菌肽对环境的影响更小,更友好,更具开发成为抗真菌生物制剂的潜力(HancockREW,Chapple DS,Peptide Antibi otics.Antimicrob Agent Chemother,l999,43(6):l3l7-l323)。如将Rs-AFPs等植物抗菌肽基因导入微生物中进行发酵,更容易克服对宿主的毒性作用而进行大量生产。
抗菌肽是一类对细菌、真菌等微生物有抑制或杀灭作用的小分子肽,它能被细菌、真菌或物理的、化学的刺激所诱导,甚至有些抗菌肽在植物体内能形成组成性的表达。它不仅能抗多种细菌,而且可以抑杀真菌、病毒等,可用于转化农作物、培养抗病品种,因而在植物育种基因工程领域中具有广阔的应用前景。首先在模式植物烟草与马铃薯抗青枯病研究中获得成功,随后在水稻白叶枯病菌和细条病菌苹果的梨火疫病,菊花、辣椒、茄子等作物的细菌、真菌病研究中均取得了一定效果。将萝卜抗菌肽基因(AFP)转基因到马铃薯中可获得晚疫病抗性等(任玉霞,陈凌娜,陈继峰,陈正华,马铃薯转萝卜抗菌肽基因植株的获得及抗晚疫病的初步鉴定,中国蔬菜2012(6):68-73)。
植物源抗菌肽都有广谱抗真菌或细菌活性,在一种植物中发现的抗菌肽可以有效的应用到其他多种植物中,如萝卜中来源的抗菌肽能够通过转基因的方法转到野罂粟、马铃薯和小麦中分别达到抗马铃薯晚疫病和小麦镰刀菌的效果(魏玉杰,张梅秀,常瑛,雒淑珍,陈凌娜,野罂粟花粉介导法转萝卜抗菌肽基因方法研究,甘肃农业科技2009(11):6-9;任玉霞,陈凌娜,陈继峰,陈正华,马铃薯转萝卜抗菌肽基因植株的获得及抗晚疫病的初步鉴定,中国蔬菜2012(6):68-73;Zhao Li,Miaoping Zhou,Zengyan,ZhangLi,juan Ren,Lipu Du,Boqiao Zhang,Huijun Xu,Zhiyong Xin,Expression of a radish defensin in transgenic wheat confers increased resistance to Fusarium graminearum andRhizoctonia cerea lis Funct Integr Genomics 2011,11:63–70)。抗菌肽作为新兴抗病基因资源,对改良水稻、大豆、棉花、油菜等作物对真菌病害的抗性有着重要意义。
抗菌肽因其独特的抗菌机理,广谱的抗菌性以及不易产生耐药性等特点,在各行各业中都有良好的应用前景,因此也已经受到越来多的关注,成为前沿领域的研究热点(Hancock REW,Chapple DS,Peptide Antibiotics.Antimicrob Agent Chemother,l999,43(6):l3l7-l323)。但是,目前植物来源的抗菌肽还很难真正应用到农业生产实践中。主要是因为目前鉴定的有功能的植物来源抗菌肽数量很少,从而在很大程度上限制了植物抗菌肽的应用。抗菌肽数据库中经过验证的抗菌肽基因目前达到1600多个,而植物抗菌肽仅有不到300个(htt p://ercbinfo1.ucd.ie/APPDb/)。被鉴定的植物来源抗菌肽基因数量少的主要原因如下:1、抗菌肽基因相对比较小,容易降解,且含量低,难以检测和鉴定;2、抗菌肽分子量小,分离纯化困难,提取步骤烦琐、得率低;3、体外表达纯化困难,导致难以开展体外抑菌活性检测来验证功能;4、缺乏高效的预测筛选方法;5、抗菌肽化学合成成本高,价格昂贵。如何高效的预测具有功能的新植物抗菌肽,实现其水平表达并降低成本成为目前抗菌肽研究与应用的瓶颈。
由本发明申请人中国农业科学院油料作物研究所负责、中国农科院蔬菜所、深圳华大基因研究院、华中农业大学、湖南大学、西南农业大学、江苏农科院、四川农科院、青海大学,并吸收英、澳、美、法等国相关研究机构科研人员合作完成了甘蓝和油菜的全基因组测序和分析,甘蓝和油菜基因组部分结果论文已发表(Shengyi Liu,Yumei Liu,XinhuaYang,Ch aobo Tong,David Edwards,Isobel A.P.Parkin,Meixia Zhao,Jianxin Ma,Jingyin Yu,Shu nmou Huang,Xiyin Wang,Junyi Wang,Kun Lu,Zhiyuan Fang,IanBancroft,Tae-Jin Yan g,Qiong Hu,XinfaWang,Zhen Yue,Haojie Li,Linfeng Yang,Jian Wu,Qing Zhou,Wa nxin Wang,Graham J.King,J.Chris Pires,Changxin Lu,ZhangyanWu,Perumal Sampath,ZhuoWang,Hui Guo,Shengkai Pan,Limei Yang,JiumengMin,Dong Zhang,Dianchuan J in,Wanshun Li,Harry Belcram,Jinxing Tu,Mei Guan,Cunkou Qi18,Dezhi Du1,Jiana Li,Liangcai Jiang,Jacqueline Batley,AndrewG.Sharpe,Beom-Seok Park,Pradeep Ruperao,Feng Cheng,Nomar Espinosa Waminal YinHuang,Caihua Dong,LiWang,Jingping Li,Z hiyong Hu,Mu Zhuang,Yi Huang,JunyanHuang,Jiaqin Shi,Desheng Mei,Jing Liu,T ae-Ho Lee,Jinpeng Wang,Huizhe Jin,Zaiyun Li,Xun Li,Jiefu Zhang,Lu Xiao,Yongmi ng Zhou,Zhongsong Liu,Xuequn Liu,Rui Qin,Xu Tang,Wenbin Liu,YupengWang,Yang yong Zhang,Jonghoon Lee,Hyun HeeKim,France Denoeud,Xun Xu,Xinming Liang,Wei Hua,Xiaowu Wang,Jun Wang,BoulosChalhoub&Andrew H.Paterson.The Bras sica oleracea genome reveals theasymmetrical evolution of polyploid genomes.2014.Natu re Communication.5:3930.;Chalhoub B,Denoeud F,Liu S,Parkin IA,Tang H5,Wang X,Chiquet J,etc.Plantgenetics.Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassic a napusoilseed genome.Science.2014,22;345(6199):950-3.)。白菜、甘蓝以及甘蓝型油菜全基因组测序信息已经建立可供申请人查询的数据库http://www.ocri-genomicls.org/bolbase(C heng F,Liu S,Wu J,Fang L,Sun S,Liu B,Li P,Hua W,Wang X:BRAD.thegenetic s and genomics database for brassica plants.BMC Plant Biol,2011,11:136;Jingyin Yu,Meixia Zhao,Xiaowu Wang,Chaobo Tong,Shunmou Huang,SadiaTehrim,Yumei Liu,We i Hua and Shengyi Liu.Bolbase:a comprehensive genomicsdatabase for Brassica oleracea.BMC Genomics,2013,14:664)。通过使用生物信息学分析手段,利用上述资源,可进行基因的预测和分析,获得大批量的与已知抗菌肽有类似序列结构特征的预选基因,从中筛选感兴趣的基因,是快速发掘基因的一个捷径。而抗菌肽本身基因长度小,可以利用PCR人工合成技术,低成本快速合成,不需要cDNA序列做模板进行克隆等工作,可以大大加快获得抗菌肽的速度并且降低研究难度。
申请人利用甘蓝型油菜组织转录组测序数据,开发出一个预测分析潜在新抗菌肽基因的方法,获得抗菌肽新基因BnLTP1。该基因是属于转脂蛋白类抗菌肽(LTPs),这类抗菌肽序列结构中含有偶数个半胱氨酸,能够形成分子内二硫键,从而起到稳定抗菌肽结构的作用,LTP在植物防御机制中起重要作用,它能被病原菌诱导而过量表达,并能抑制病原菌的生长和诱导植物***抗性的产生(谢万钦,王喆,李翠凤,植物转脂蛋白的抗病机制研究进展,自然科学进展。2006,16(8):928-932),实验表明它既有抗细菌活性也具有抗真菌活性。结合基因工程方法和利用一个新型具有自剪切功能的抗菌肽体外表达载体pET30a/His-EDD IE-GFP(Tao Ke,Su Liang,Jin Huang,Han Mao,Jibao Chen,Caihua Dong,Junyan Huan g,Shengyi Liu,Jianxiong Kang,Dongqi Liu,Xiangdong Ma,A novel PCR-based method for high throughput prokaryotic expression of antimicrobialpeptide genes.BMC Biotechno l 2012,12:10.),本研究实现了BnLTP1在大肠杆菌中的融合表达、复性、自剪切和纯化,获得了具有生物活性的BnLTP1蛋白产物。用管碟法(蒋惠岚.管碟法测定抗生素效价的影响因素及控制方法.中国兽药杂志.2011,(08)23-36),以大肠杆菌、藤黄八叠球菌为革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌的标准菌株,以酵母菌作为真菌的指示菌对纯化的BnLTP1蛋白开展抑菌活性检测,发现BnLTP1基因能有效抑制细菌(大肠杆菌和藤黄八叠球菌)和真菌(酵母、核盘菌、灰霉菌、稻瘟病菌)的生长。本研究为利用生物信息手段和基因工程技术大规模鉴定新植物来源抗菌肽奠定了基础,提供了一种新的途径。此外BnLTP1可作为生物试剂喷施于植物表面提高植物对真菌病害的抗性,同时,还可以作为一个新分子标记用于辅助抗病育种,还可以作为一个新基因源用于植物基因工程,以培育抗病转基因植物。
发明内容
本发明的目的是在于提供了一个具有对真菌和细菌抑菌活性的油菜抗菌肽BnLTP1,其序列为SEQ ID NO.2所示。该抗菌肽共93个核苷酸,编码31个氨基酸,其中4个半胱氨酸形成两个分子内二硫键,对于稳定抗菌肽的结构起到了重要的作用。该抗菌肽可以增强植物对腐生营养型真菌核盘菌、灰霉菌以及稻瘟病菌的抗性。
本发明的另一个目的在于提供了油菜抗菌肽BnLTP1对应的核苷酸序列,优选序列为S EQ ID NO.1和SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。
本发明还有一个目的在于提供了油菜抗菌肽BnLTP1基因的合成方法,方法简单。利用DNAWorks软件工具,通过密码子优化设计引物序列,采用Overlap-PCR技术合成BnLTP1基因序列。
本发明的再一个目的是在于提供了油菜抗菌肽BnLTP1的制备方法,采用猪瘟病毒蛋白突变体EDDIE为融合蛋白;在包涵体蛋白纯化、复性后,EDDIE重新正确折叠,恢复其自剪切能力,在特异位点Cys168和169处把C端融合的抗菌肽剪切下来,从而获得不增加任何多余氨基酸的抗菌肽产物。
本发明的最后一个目的在于提供了油菜抗菌肽BnLTP1在制备抗菌药物中的应用,该抗菌肽可以同时对藤黄八叠球菌,大肠杆菌,酵母菌,核盘菌,灰霉菌及稻瘟病菌产生良好的抑制效果,并能增强植物对腐生营养型真菌核盘菌、灰霉菌以及稻瘟病菌的抗性,同时还可以应用于生物防治和抗病育种。
为了完成上述目的,本发明采用如下技术方案:
为了获得本发明,申请人对油菜(甘蓝型油菜Brassica napus)基因组中抗菌核病的相关基因以及现有的抗菌肽数据库进行了深入全面的分析比对和预测,结果发现了一个新的转脂蛋白类抗菌肽基因,通过对该基因的体外合成和诱导表达、蛋白纯化后进行了活性分析,发现该基因不仅具有抗细菌活性还具有抗真菌活性。本发明开发了一个增强植物对真菌抗性的BnLTP1基因,BnLTP1基因表达的抗菌肽在抑菌活性试验中不仅具有抗细菌活性还有抗真菌活性(包括酵母、核盘菌、灰霉菌和稻瘟病菌),预示着该基因在油菜抗菌核病、大豆灰斑病和水稻稻瘟病育种中具有相当的应用前景。
油菜抗菌肽基因BnLTP1的获得:
目前申请人实验室已开展了油菜叶片,角果的表达谱测序,获得大量ESTs数据信息。同时通过白菜、甘蓝和油菜和全基因组测序项目,构建了它们的基因组序列信息库(http://www.ocri-genomicls.org/bolbase)。利用这些序列信息与专门的抗菌肽数据库,如ANTIMIC(Brahmachary M,Krishnan SPT,Koh JLY,et al.ANTIMIC:a database ofantimicrobial sequences.Nucleic Acids Research,2004,32:D586-D589,以下相同),APD(Wang Z,Wang GS.APD:the Antimicrobial Peptide Database.Nucleic AcidsResearch,2004,32:D590-D592,以下相同)APPDB(http://ercbinfo1.ucd.ie/APPDb/,以下相同),PhytAMP(H ammami R,Hamida JB,Vergoten G,et al.Phytamp:a databasededicated to plant antimic robial peptides.Nucleic Acids Res.2009,37:D963-D968,以下相同)等进行BLAST比对(核苷酸相似度>90%即Identity>90%),获得大批量的与已知抗菌肽序列有类似结构特征的预选基因。随后对这些预选基因的蛋白序列(VectorNTI10)和二级结构结构(nnpredict:ht tp://www.cmpharm.ucsf.edu/nomi/nnpredictpredictionprotein,以下相同)进行预测和分析,从而建立蛋白质三维结构图,利用二级结构和功能对所筛选出的抗菌肽进行蛋白质家族的分类建库,从而最终获得潜在的新抗菌肽基因。编号为EV53256,命名为BnLTP1。基因BnL TP1核苷酸序列为SEQ ID NO.3所示,抗菌肽BnLTP1的氨基酸序列为SEQ ID NO.2所示。一种体外合成油菜BnLTP1基因的制备方法,步骤如下:油菜BnLTP1基因的密码子优化与体外合成
根据BnLTP1基因的DNA序列,设计引物序列,共合成引物6条覆盖BnLTP1全长的引物,分别为BnPEV53256_1,BnPEV53256_2,BnPEV53256_3,BnPEV53256_4,backbo neF和backboneR。引物序列如表1所示,
表1overlap PCR引物序列
采用Overlap-PCR技术获得BnLTP1基因全长。PCR反应体系如下:总的反应体系为50μL,内含:10×Taq buffer(含MgCl2)10μl,1.5mmol/L dNTP(10mmol/L)4μl,引物backboneF1和backboneR各加入1μl(浓度为10mmol/L),引物BnPEV53256_1,BnPEV53256_2,BnPEV53256_3和BnPEV53256_4各加入1μl(浓度为2mmol/L),Taq(5U/μl)1μl,ddH2O 33μl。反应条件为94℃5分钟,94℃1分钟,58℃1分钟,72℃2分钟30秒,25个循环,72℃后延伸10分钟,扩增大小为116bp。(序列包括SEQ ID NO.1所示序列及和载体上匹配的各10个碱基。)
PCR产物经鉴定测序,测序正确的即为优化后的抗菌肽BnLTP1基因,其序列为SEQID NO.1所示。
抗菌肽BnLTP1的制备方法,包括以下步骤:
1)融合表达载体EDDIE-BnLTP1的构建
采用反向PCR技术,将BnLTP1基因连接到表达载体pET30a/His-EDDIE-GFP上。具体为利用30abackbone-F:TGAGATCCGGCTGCTAACAAAGCCC和30abackbone-R:GCAGCTGGTCACCCACAGCG引物,通过反向PCR扩增,将pET30a/His-EDDIE-GFP载体线性化。将回收到的pET30a/His-EDDIE-GFP线性化载体片段与通过Overlap-PCR扩增回收得到的BnLTP1全长DNA片段,同时转化大肠杆菌XL10-Gold菌株,通过体内定点同源重组,将BnLTP1基因连接到表达载体pET30a/His-EDDIE-GFP上,获得目的基因融合表达载体EDDIE-BnLTP1。
2)抗菌肽BnLTP1体外诱导表达与分离纯化
将测序正确融合表达载体EDDIE-BnLTP1质粒,用热激法转化到BL21(DE3)感受态细胞中,获得EDDIE-BnLTP1融合表达工程菌BL21(DE3)/pETNB。利用常规方式在LB液体培养基中培养并诱导蛋白表达,获得的菌体破碎离心,上清纯化后,即得目的蛋白抗菌肽BnLTP1,其序列为SEQ ID NO.2所示。
油菜抗菌肽BnLTP1在制备抗菌药物中的应用,包括将该抗菌肽直接制备成抗菌药物,对细菌和真菌都具有较强的抑菌活性;将其喷施在植物叶片表面,可增强植物的抗菌性,特别是提高植物对对核盘菌、灰霉菌、稻瘟病菌等真菌病害的抗性,将BnLTP1基因利用分子生物学的手段在油菜或其他植物中过表达,制备可抗真菌和细菌的转基因植物。
本发明与现有技术相比,具有以下优点和效果:
1.本发明利用白菜、甘蓝和油菜和全基因组测序和转录组测序数据的序列信息与专门的抗菌肽数据库进行比对和预测分类分析,成功获得一个新的转脂蛋白类抗菌肽LTPs-Bn LTP1。为利用生物信息学手段和基因工程技术大规模鉴定新植物源抗菌肽奠定了基础,提供了一种新的途径。
2.利用Overlap-PCR技术在体外人工合成该基因,大大降低了获得BnLTP1的技术难度和成本。
3.为解决抗菌肽异源表达的诸多问题,本发明采用了一种新的融合表达抗菌肽的方法,采用猪瘟病毒蛋白突变体EDDIE为融合蛋白,以包涵体形式在大肠杆菌BL21中高效表达抗菌肽,以减少抗菌肽对宿主的毒性作用。在包涵体蛋白纯化、复性后,EDDIE重新正确折叠,恢复其自剪切能力,在特异位点Cys168和169处把C端融合的抗菌肽剪切下来,从而获得不增加任何多余氨基酸的抗菌肽产物。该方法不需要添加任何化学物质和酶来去掉融合标签,对宿主无毒性,纯化过程简单,剪切后可直接用来检测对病原菌的抗菌活性,最高目标产量可以达到12g/L。
4.管碟法和叶片表面喷施接种试验结果均表明原核表达纯化的抗菌肽BnLTP1可以有效抑制细菌和核盘菌、灰霉菌和稻瘟病菌三种病原真菌的生长,可有效提高植物对它们的抗性。
5.由于BnLTP1基因来源于油菜,它还可以作为抗性标记用于油菜抗病品种的选育,或者作为基因工程的候选基因用于转基因育种。
附图说明
图1为表达载体pET30a/His-EDDIE-GFP模式图。
图2为抗菌肽BnLTP1三维结构模拟图。
图3为EDDIE-BnLTP1载体构建琼脂糖凝胶电泳检测图。
图3中A:overlap PCR合成BnLTP1基因的琼脂糖凝胶检测;M:100bp DNA Marker;1-2:Overlap PCR合成BnLTP1基因;
图3中B:表达载体EDDIE-BnLTP1电泳检测;M:1kb DNA Marker;1:重组载体pET30a-EDDIE-BnP;2:空载体pET30a/His-EDDIE-GFP;
图3中C:BnLTP1基因PCR检测;M:DL2000DNA Marker;1:阳性对照;2:阴性对照;3-5:BnLTP1重组子。
图4BnLTP1蛋白的表达纯化SDS-PAGE电泳检测。
图4中A:融合蛋白EDDIE-BnLTP1诱导表达的SDS-PAGE分析;M:小分子量蛋白Marker;0:对照菌沉淀,1-4:EDDIE-BnLTP1沉淀。
图4中B:EDDIE-BnLTP1复性后SDS-PAGE电泳分析;M:小分子量蛋白Marker;1,2:EDDIE-BnLTP1复性后8小时SDS-PAGE分析。
图5:BnLTP1抗菌肽对细菌和真菌的抑菌活性分析;
A:大肠杆菌;B:藤黄八叠球菌;C:酵母菌:毕赤酵母GS115;D:核盘菌;E:稻瘟病菌;F:灰霉菌。图中0为对照液体,1为人工合成抗菌肽,2为体外表达纯化抗菌肽。
图6BnLTP1抗菌肽油菜离体叶涂抹后接种核盘菌后抑菌作用图。
第一排:经过抗菌肽BnLTP1涂抹的叶片;
第二排:未经处理的正常油菜叶片作为对照。
具体实施方式
根据以下实施例,可以更好的理解本发明,但所述的实施例是为了更好的解释本发明,而不是对本发明的限制。本发明所用试剂如未特别说明,均来源于商业渠道,所述技术方案,如未特别说明,均为本领域的常规方案。
实施例1:
油菜抗菌肽基因BnLTP1的预测和结构分析
利用发明人实验室构建的白菜、甘蓝和甘蓝型油菜的基因组和转录组序列信息数据库(h ttp://www.ocri-genomicls.org/bolbase)与专门的抗菌肽数据库,如ANTIMIC(前面已述),APD(前面已述),APPDB(前面已述),PhytAMP(前面已述)等进行BLAST比对(核苷酸相似度>90%即Identity>90%),获得大批量的与已知抗菌肽序列有类似结构特征的预选基因。随后对这些预选基因的蛋白序列(Vector NTI10)和二级结构结构(前面已述)进行预测和分析,从而建立蛋白质三维结构图,利用二级结构和功能对所筛选出的抗菌肽进行蛋白质家族的分类建库,从而最终获得编号为EV53256的新抗菌肽基因。命名为BnLTP1。BnLTP1基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.3所示,抗菌肽BnLTP1的氨基酸序列为SEQ ID NO.2所示。
BnLTP1抗菌肽含有31个氨基酸,其中4个半胱氨酸形成两个分子内二硫键。蛋白结构预测(前面已述)显示BnLTP1的二级结构主要呈现螺旋结构(80%)含有少量的无规卷曲(20%)。这种蛋白结构决定了它所发生的抗细菌和抗真菌的作用模式主要是通过一种破坏细胞膜的滚筒机制来达到抑菌的作用(Balaji Ramanathan EGD,Christopher R.Ross,Frank Blecha:Cathelicidins:microbicidal activity,mechanisms of action,androles in innate imm unity.Microbes and Infection 2002,4:361-372;Boman HG AB,Boman A:Mechanisms of action on Escherichia coli of cecropin P1and PR-39,twoantibacterial peptides from pig intestine.Infection and immunity 1993,61:2978-2984;T.Cabras RL,F.Secundo,G.Noc ca,S.Conti,L.Polonelli:Structural andfunctional characterization of the porcine proline–rich antifungal peptideSP-B isolated from salivary gland granules.Journal of Peptide Sc ience 2008,14:251-260.)。三级结构预测结果显示,BnLTP1形成了6个α螺旋结构,其中N端开始形成连续的5个α螺旋,在C端形成第6个α螺旋。这种结构有利于它和细菌或真菌的细胞膜结合进而破坏细胞膜的完整性(图2)。
实施例2:
油菜BnLTP1基因的密码子优化与体外合成
由于抗菌肽在生物体内存在时间短,难以捕捉,用常规的PCR技术很难从油菜cDNA中扩增,而将整个抗菌肽全部人工合成则价格昂贵。为了降低获得抗菌肽的成本,本发明根据根据BnLTP1基因的DNA序列,利用DNAWorks软件工具(http://mcl1.ncifcrf.gov/dnaworks/,Hu F,Ke T,Li X,Mao PH,Jin X,Hui FL,Ma XD,Ma LX.Expression and Purification of an Antimicrobial Peptide by fusion with elastin-like polypeptidesin Escherichia coli.Appl Biochem Biotechnol.2010,160(8):2377-87),通过密码子优化(Ke T,Liang S,Huang J,Mao H,Chen J,Dong C,Liu S,Kang J,Liu D,Ma X:A novelPCR-based m ethod for high throughput prokaryotic expression of antimicrobialpeptide genes.BMC Biot echnol 2012,12:10.)设计引物序列,共合成引物6条覆盖BnLTP1全长的引物(上海英俊公司合成引物),分别为BnPEV53256_1,BnPEV53256_2,BnPEV53256_3,BnPEV53256_4,backboneF和backboneR。引物序列如表1所示,黑体部分表示与载体pET30a/His-EDDI E-GFP(载体为本实验室参照柯涛文献构建而成,Ke T,Liang S,Huang J,Mao H,Chen J,Dong C,Liu S,Kang J,Liu D,Ma X:A novel PCR-based methodfor high throughpu t prokaryotic expression of antimicrobial peptidegenes.BMC Biotechnol 2012,12:10.)同源的部分,其余为基因特异性引物。采用Overlap-PCR技术(Zhu D,Zhong X,Tan R,Che n L,Huang G,Li J,Sun X,Xu L,Chen J,Ou Y,ZhangT,Yuan D,Zhang Z,Shu W,Ma L:High-throughput cloning ofhuman liver completeopen reading frames using homolo gousrecombination in Escherichia coli.AnalBiochem 2010,397(2):162-167)获得BnLTP1基因全长。
PCR反应体系如下:引物为表1所示,总的反应体系为50μL,内含:10×Taq buffer(含MgCl2)10μl,1.5mmol/L dNTP(10mmol/L)4μl,引物backboneF1和backboneR各加入1μl(浓度为10mmol/L),引物BnPEV53256_1,BnPEV53256_2,BnPEV53256_3和B nPEV53256_4各加入1μl(浓度为2mmol/L),Taq(5U/μl)1μl,ddH2O 33μl。反应条件为94℃5分钟,94℃1分钟,58℃1分钟,72℃2分钟30秒,25个循环,72℃后延伸10分钟,扩增大小为116bp(图3)。PCR产物经1.0%琼脂糖凝胶电泳检测,凝胶回收试剂盒纯化回收后,连接到pMD18-T载体,热激法转化XL10-Gold菌株的感受态细胞,涂布于含有氨苄青霉素50μg/mL的LB固体培养基平板上,37℃培养过夜,挑选白斑6个,采用M13引物:5‘TGTAAAACGACGGCCAGT3’和5‘CAGGAAACAGCTATGACC3’,做菌落PCR检测。扩增产物大小为200bp,1.0%琼脂糖凝胶电泳检测大小正确后。将PCR检测大小正确的菌斑接种到含氨苄青霉素50μg/mL的液体LB培养基,37℃下200r/min振荡培养过夜,小量碱法提取质粒,1.0%琼脂糖凝胶电泳检测质粒DNA大小正确后(为400bp),采用KpnⅠ/BamH I酶切对质粒进行双酶切,37℃过夜,1.0%琼脂糖凝胶电泳检测。将检测正确的阳性重组克隆命名为pMD18-BnLTP1,将pMD18-BnLTP1送上海英骏公司进行测序,分析结果,得到优化后的抗菌肽BnLTP1基因全长序列,其序列为SEQ IDNO.1所示。
实施例3:融合表达载体EDDIE-BnLTP1的构建
根据柯涛报道的方法,采用反向PCR技术,将BnLTP1基因连接到表达载体pET30a/His-EDDIE-GFP上。利用30abackbone-F:TGAGATCCGGCTGCTAACAAAGCCC和30abackbon e-R:GCAGCTGGTCACCCACAGCG引物,通过反向PCR扩增,将pET30a/His-EDDIE-GF P载体线性化。具体反应体系如下:采用50μL体系,其中pET30a/His-EDDIE-GFP质粒1μl(50ng/μl)为模板模板,10×Taq buffer(含MgCl2)5μl,1.5mmol/L dNTP(10mmol/L)4μl,5’引物30abackbone-R2μl(10μmol/L),3’引物30abackbone-F 2μl(10μmol/L),Taq酶(5U/μl)1μl,ddH2O 31μl。反应条件为94℃下5分钟,94℃30分钟,60℃30秒,72℃6分钟,25个循环,72℃后延伸10分钟,PCR产物大小为6kb。经1.0%琼脂糖凝胶电泳检测大小正确后,用凝胶回收试剂盒回收6kb大片段。将回收到的pET30a/His-EDDIE-GFP线性化载体片段与实施方案二中通过Overlap-PCR扩增回收得到的BnLTP1全长DNA片段,同时转化大肠杆菌XL10-Gold菌株(购于Strategene公司),通过体内定点同源重组,将BnLTP1基因连接到表达载体pET30a/His-EDDIE-GFP上。具体方法如下:按照pET30a/His-EDDIE-GFP线性化载体片段:50ng的BnLTP1全长DNA片段=3:1的比例混合样品,用热激法转化XL10-Gold菌株的感受态细胞后,在含有卡那霉素(50μg/mL)的固体LB培养基平板上筛选,利用载体上(图1)的GFP绿色荧光蛋白标签在紫外光照射下筛选不发光的阳性克隆,提取质粒,经1.0%琼脂糖凝胶电泳检测大小正确(图3中B),送上海英骏生物公司测序。测序后序列正确的为目的基因融合表达载体EDDIE-BnLTP1。
实施例4:
抗菌肽BnLTP1体外诱导表达与分离纯化
将测序正确的融合表达载体EDDIE-BnLTP1质粒,用热激法转化到BL21(DE3)感受态细胞中,获得EDDIE-BnLTP1融合表达工程菌BL21(DE3)/pETNB。将转化后菌液吸取5μl在在含有卡那霉素(50μg/mL)的固体LB培养基平板上划线,37度培养24小时后从卡那霉素抗性平板上挑取挑单菌落。将挑取的单菌落接种于10毫升终浓度为(50ug/mL卡那霉素)的LB培养液中,在37℃振荡培养过夜,以1:100的比例转接至1000毫升LB液体培养基中,37℃振荡培养3小时左右,用分光光度计检测LB液体培养基在600nm下光吸收值为0.6左右时,在上述LB液体培养基中加入终浓度为1mM的IPTG。在37℃下震荡继续培养6h进行诱导表达,用台式离心机(前面已述)室温下以5000r/min的速度离心15min,倒掉上清,收集菌体沉淀。
将上步收集的菌体用破菌缓冲液,在冰浴下用超声波细胞粉碎机超声破菌5min,接着在4℃条件下用离心机以5000r/min的转速离心15min,收集包涵体沉淀。将包涵体沉淀用10毫升洗涤缓冲液在4℃条件下清洗两次,每次2分钟。在4℃条件下用离心机以12000r/min转速离心20min,再次收集沉淀。用SDS-PAGE电泳检测包涵体中目的蛋白的表达水平(图4)。图4中(A)的结果表明在IPTG的诱导作用8小时后,BnLTP1在包涵体沉淀中大量表达。
以体积比1:10的比例将上面收集的包涵体沉淀溶于尿素变性缓冲液中,在室温下用振荡器震荡2小时,于4℃用离心机以12000r/min转速离心20min,取上清。取1ml Ni-NTA琼脂糖凝胶预装柱,加入10ml平衡缓冲液平衡将预装柱在室温下平衡30分钟,以5000r/min的速度于4℃用离心机离心5min,去除离下的溶液,收集预装柱。然后取包涵体蛋白上清10ml样品以0.5ml/min的速度上样至Ni-NTA琼脂糖凝胶预装柱中,下方用2毫升离心管分管收集预装柱中流下的溶液,每管收集2毫升。随后用15ml洗涤缓冲液以1-2ml/min的流速洗去未吸附的样品。下方用2毫升离心管分管收集预装柱中流下的溶液,每管收集2毫升。然后用5ml洗脱缓冲液以1-2ml/min的流速洗脱与Ni-NTA特异性结合的EDDIE-BnLTP1融合蛋白,下方用2毫升离心管分管收集预装柱中流下的溶液,每管收集2毫升。最后用5ml平衡缓冲液平衡柱子,加入1毫升20%乙醇以备下次使用。将收集的所有溶液用SDS-PAGE电泳检测目的蛋白的含量和纯度,取纯度最好,浓度最高的一管做复性实验(图4中A中泳道4的样本)。
取上步电泳检测后最好的图4A中泳道4的蛋白溶液2毫升,快速加入100毫升复性缓冲液,在室温放置6小时,Tricine-SDS-PAGE电泳检测融合蛋白EDDIE-BnLTP1的自剪切效果,结果如图4中B所示:获得了融合蛋白发生自剪切之后剩余的不含任何多余氨基酸的BnLTP1抗菌肽。利用Nanodrop-2000测定复性后抗菌肽的蛋白含量,浓度为12mg/ml。
实施例5:
BnLTP1抗菌肽抑菌活性测定
分别以藤黄八叠球菌(Micrococcus luteus)为革兰氏阳性菌代表,大肠杆菌(Escherichia coli)为革兰氏阴性菌代表,酵母菌(Pichia pastoris GS115)作为真菌的指示菌,以管碟法作为检测抗菌肽BnLTP1抑菌活性的标准方法。
具体方法如下:在每一个牛津杯中加入200微升浓度约为3毫克每毫升的人工纯化好的抗菌肽BnLTP1溶液或者化学合成的抗菌肽BnLTP1溶液,在37度环境下培养12-16个小时后,通过测定抑菌圈大小来计算BnLTP1抗菌肽的抗菌活性。共进行3次实验,每次实验进行3次技术重复。
结果如图5中(a)和表2所示,加有表达纯化抗菌肽的牛津杯和人工合成抗菌肽的牛津杯周围都出现大的抑菌圈,而对照部分没有明显的抑菌圈出现。体外表达纯化抗菌肽BnLTP1对大肠杆菌、藤黄八叠球菌和毕赤酵母的平均抑菌圈直径都在1厘米以上,表现出高效的抑菌能力。
发明人还对BnLTP1抗菌肽对核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)、灰霉菌(Botrytis cine rea)以及稻瘟病菌(Pyricularia oryzae)三种植物病原真菌的抑菌活性进行了鉴定。选择完好的核盘菌菌核,先用10毫升75%酒精浸泡1分钟,再用10毫升0.1%HgCl2中浸泡消毒8-10分钟,随后用无菌水10毫升冲洗3-5次。把灭菌菌核切去两端,中间部分切成绿豆大小,切面朝下,接种于PDA平板。通常每粒菌核接一板,一次接种8-9板。于22℃静置培养3-4天,当菌丝即将铺满平板时,用打孔器沿菌丝外缘打孔,取菌丝块,用于再次接种。将用打孔器取出的菌丝块置于一个新的PDA平板上正中间位置,使含有菌丝的一面接触PDA平面。
灰霉菌和稻瘟病菌的菌丝块分别浸泡在50%甘油溶液中,保存于-80℃超低温冰箱。保存的菌丝块可以直接在PDA平板上进行培养。灰霉菌需22℃培养约48小时而稻瘟病菌需26℃培养48小时,待菌丝扩展至约1cm时,同样在菌丝块的上下左右各放置一个牛津杯,分别加入人工纯化好的抗菌肽或化学合成的抗菌肽(两种方法得到的抗菌肽的效果相同),复性液作为对照。继续培养48小时,观察抑菌活性情况。结果如图5所示,与对照相比,加有抗菌肽的牛津杯周围真菌菌丝生长受到阻止,无法越过牛津杯,而对照部分菌丝则能够顺利越过牛津杯到达培养皿的边缘。抗菌肽BnLTP1的抑菌直径和抑菌率的计算结果见表2。结果显示体外表达纯化的抗菌肽BnLTP1几乎可以完全以及核盘菌菌丝的生长(图5D),对灰霉菌和稻瘟病菌的也有很好的抑菌效果,在90%以上(图5E,F)。
表2体外表达纯化抗菌肽BnLTP1抑菌活性
实施例6:
BnLTP1抗菌肽在植物抗病中的应用
为了检测抗菌肽BnLTP1作为生防制剂用于提高植物对真菌病害的抗性的潜力,发明人在植物(拟南芥、油菜)叶片表面喷施一定浓度的人工表达纯化抗菌肽溶液,随后接种上述三种病原真菌,36小时后测定病斑大小。具体方式如下:
取生长5周的拟南芥叶片以及5叶期油菜叶片,在叶片表面均匀涂抹一层浓度为5ng/μl人工表达纯化后的抗菌肽BnLTP1。按照实施例5中所述方法,在PDA平板上分别培养核盘菌、灰霉菌和稻瘟病菌菌丝,当菌丝即将铺满平板时,用打孔器沿菌丝外缘打孔,取菌丝块,用于油菜叶片接种,用打孔器沿菌丝外缘打孔,取菌丝块,用于拟南芥叶片接种。用注射器针头将打孔器取出的菌丝块置于拟南芥和油菜叶片正中间,使含有菌丝的一面接触叶片表面。同时在未涂抹抗菌肽的拟南芥和油菜叶片上也按照上述方法同样接种核盘菌、灰霉菌和稻瘟病菌菌丝快作为对照,在22℃、湿度90%条件下培养36小时观察感病情况,并测定各个叶片上的病斑大小。结果如图6和表3,表4所示,涂抹抗菌肽的拟南芥叶片和油菜叶片与未涂抹的拟南芥和油菜叶片相比,接种核盘菌、灰霉菌和稻瘟病菌36小时后的病斑面积都显著减小。如没有涂抹抗菌肽BnLTP1拟南芥叶片接种核盘菌36小时后菌斑面积扩展到3.04cm2,而涂抹抗菌肽BnLTP1拟南芥叶片的平均菌斑面积为0.62cm2,只有对照叶片菌斑面积的20%。同样在油菜叶片表面涂抹抗菌肽BnLTP1后接菌36小时后的菌斑面积也只有对照的18%左右。说明在拟南芥和油菜叶表面涂抹抗菌肽有效的抑制了核盘菌的扩展,提高了植物对核盘菌的抗性。灰霉菌和立枯丝核菌的接种试验也得到类似的结果(表3,表4)。呈现极显著差异。这说明在植物叶片喷施抗菌肽BnLTP1有显著抑制核盘菌、灰霉菌、和稻瘟病菌侵染扩散的作用,有效的提高了植物对这三种病原真菌的抗性。
表3拟南芥叶片接种36小时后病斑面积(单位:cm2)
编号 | 对照 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 |
核盘菌 | 3.04 | 0.55 | 0.65 | 0.58 | 0.49 | 0.67 | 0.6 | 0.7 | 0.72 |
灰霉菌 | 4.86 | 0.95 | 1.17 | 1.36 | 1.05 | 1.38 | 1.20 | 1.11 | 1.22 |
稻瘟病菌 | 2.75 | 0.56 | 0.76 | 0.722 | 0.65 | 0.79 | 0.44 | 0.61 | 0.72 |
表4油菜叶片接种36小时后病斑面积(单位:cm2)
编号 | 对照 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 |
核盘菌 | 6.21 | 1.12 | 0.98 | 1.25 | 1.26 | 1.35 | 0.97 | 0.85 | 1.1 |
灰霉菌 | 8.89 | 2.59 | 2.67 | 2.65 | 2.87 | 2.98 | 2.96 | 2.98 | 2.49 |
稻瘟病菌 | 5.24 | 2.05 | 2.14 | 2.03 | 2.01 | 2.23 | 2.14 | 2.18 | 1.94 |
本发明的抑菌活性检测结果表明BnLTP1对细菌(大肠杆菌、藤黄八叠球菌)真菌(酵母菌、核盘菌、灰霉菌、稻瘟病菌)都具有较强的抑菌活性。离体叶片涂抹接菌实验证实BnLTP1能够增强植物对腐生营养型真菌:核盘菌、灰霉菌、稻瘟病菌的抗性。BnLTP1能够作为生防制剂用于菌核病、灰霉病和稻瘟病的防治中。可通过基因工程技术提高BnLTP1的表达水平能够增强植物对核盘菌、灰霉菌和稻瘟病菌的抗性,也可以作为抗性标记用于油菜抗病品种的选育。
SEQUENCE LISTING
<110> 中国农业科学院油料作物研究所
<120> 一种油菜抗菌肽BnLTP1及其应用
<130> 一种油菜抗菌肽BnLTP1及其应用
<160> 9
<170> PatentIn version 3.1
<210> 1
<211> 96
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
atggcgctga cctgcggcac cgtgaacagc aatgtggcgc cgtgcattgg ctatattacc 60
caggggggac cgctgcccgg agcgtgctgc accggc 96
<210> 2
<211> 31
<212> PRT
<213> 油菜
<400> 2
Ala Leu Thr Cys Gly Thr Val Asn Ser Asn Val Ala Pro Cys Ile Gly
1 5 10 15
Tyr Ile Thr Gln Gly Gly Pro Leu Pro Gly Ala Cys Cys Thr Gly
20 25 30
<210> 3
<211> 93
<212> DNA
<213> 油菜
<400> 3
gctctgacct gtggcaccgt taacagcaac gtggcaccgt gcattggcta cataacccaa 60
ggtggaaccc ttcccggagc gtgctgcacc ggt 93
<210> 4
<211> 48
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
cgctgtgggt gaccagctgc ggcgctgacc tgcggcaccg tgaacagc 48
<210> 5
<211> 54
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 5
cccccctggg taatatagcc aatgcacggc gccacattgc tgttcacggt gccg 54
<210> 6
<211> 54
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 6
ggctatatta cccagggggg accgctgccc ggagcgtgct gcaccggcta aagc 54
<210> 7
<211> 54
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 7
gggctttgtt agcagccgga tctcagctat tcagtttgct ttagccggtg cagc 54
<210> 8
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 8
tgagatccgg ctgctaacaa agccc 25
<210> 9
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 9
gcagctggtc acccacagcg 20
Claims (10)
1.一种分离的蛋白质,其序列为SEQ ID NO.2所示。
2.权利要求1所述的蛋白质对应的基因。
3.根据权利要求2所述的基因,其序列为SEQ ID NO.1所示。
4.根据权利要求2所述的基因,其序列为SEQ ID NO.3所示。
5.权利要求1所述的蛋白质或权利要求2所述的基因在制备抗菌药物中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述的抗菌药物为抗核盘菌药物、抗灰霉菌药物、抗稻瘟病菌药物、抗大肠杆菌药物、抗藤黄八叠球菌药物或抗毕赤酵母药物。
7.权利要求1所述的蛋白质或权利要求2所述的基因在增强植物对腐生营养型真菌抗性用的应用,所述的真菌为核盘菌、灰霉菌或稻瘟病菌。
8.权利要求1所述蛋白的制备方法,包括以下步骤:
1)融合表达载体EDDIE-BnLTP1的构建
利用30abackbone-F: TGAGATCCGGCTGCTAACAAAGCCC和30abackbone-R:GCAGCTGGTCACCCACAGCG引物,通过反向PCR扩增,将pET30a/His-EDDIE-GFP载体线性化;将回收到的pET30a/His-EDDIE-GFP线性化载体片段与SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列,同时转化大肠杆菌XL10-Gold菌株,通过体内定点同源重组,将BnLTP1基因连接到表达载体pET30a/His-EDDIE-GFP上,获得目的基因融合表达载体EDDIE-BnLTP1;
2)抗菌肽BnLTP1体外诱导表达与分离纯化
将测序正确融合表达载体EDDIE-BnLTP1质粒,用热激法转化到BL21(DE3)感受态细胞中,获得EDDIE-BnLTP1融合表达工程菌BL21(DE3)/pETNB;利用常规方式在LB液体培养基中培养并诱导蛋白表达,获得的菌体破碎离心,上清纯化后,即得目的蛋白抗菌肽BnLTP1,其序列为SEQ ID NO.2所示。
9.权利要求1所述的蛋白质或权利要求2所述的基因在制备同时抑制藤黄八叠球菌,大肠杆菌,酵母菌,核盘菌,灰霉菌及稻瘟病菌药物中的应用。
10.利用overlap PCR方法合成权利要求3所述基因序列的引物:
BnPEV53256_1:CGCTGTGGGTGACCAGCTGCGGCGCTGACCTGCGGCACCGTGAACAGC;
BnPEV53256_2:CCCCCCTGGGTAATATAGCCAATGCACGGCGCCACATTGCTGTTCACGGTGCCG;
BnPEV53256_3:GGCTATATTACCCAGGGGGGACCGCTGCCCGGAGCGTGCTGCACCGGCTAAAGC;
BnPEV53256_4:GGGCTTTGTTAGCAGCCGGATCTCAGCTATTCAGTTTGCTTTAGCCGGTGCAGC;
backboneF:TGAGATCCGGCTGCTAACAAAGCCC;
backboneR:GCAGCTGGTCACCCACAGCG。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201510050902.0A CN104530205B (zh) | 2015-01-30 | 2015-01-30 | 一种油菜抗菌肽BnLTP1及其应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201510050902.0A CN104530205B (zh) | 2015-01-30 | 2015-01-30 | 一种油菜抗菌肽BnLTP1及其应用 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN104530205A CN104530205A (zh) | 2015-04-22 |
CN104530205B true CN104530205B (zh) | 2017-12-01 |
Family
ID=52845868
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201510050902.0A Active CN104530205B (zh) | 2015-01-30 | 2015-01-30 | 一种油菜抗菌肽BnLTP1及其应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN104530205B (zh) |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN103710370A (zh) * | 2013-08-13 | 2014-04-09 | 浙江省农业科学院 | 一种利用抗菌肽融合表达提高转基因植物抗病性的方法 |
-
2015
- 2015-01-30 CN CN201510050902.0A patent/CN104530205B/zh active Active
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN103710370A (zh) * | 2013-08-13 | 2014-04-09 | 浙江省农业科学院 | 一种利用抗菌肽融合表达提高转基因植物抗病性的方法 |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
抗菌肽基因BnPCD842895克隆表达及活性检测;黄金等;《中国油料作物学报》;20130829;第35卷(第4期);第358页左栏第1-2段,第358页右栏第1.3-1.4节,第359页第1.5-1.7节,第361页第2.5节,第362页右栏第4节,图1,表1 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN104530205A (zh) | 2015-04-22 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN101284876B (zh) | 融合蛋白Penharpin及制备方法和用途 | |
Jingyuan et al. | A novel pepper (Capsicum annuum L.) WRKY gene, CaWRKY30, is involved in pathogen stress responses | |
CN106834336A (zh) | 一种哈茨木霉酸性蛋白酶p6281的异源表达及纯化方法 | |
CN105861517A (zh) | 一种三七抗菌肽基因PnSN1及其应用 | |
CN111171123A (zh) | 一种植物免疫激活蛋白PsPII1及其应用 | |
CN100389124C (zh) | 无诱导表达基因工程菌株及构建方法和应用 | |
CN104530204B (zh) | 一种油菜抗菌肽BnPRP1及其应用 | |
EA012569B1 (ru) | Пептид насекомых, обладающий противогрибковой и/или антибактериальной активностью, и способы его применения | |
CN109134625B (zh) | 一种菠萝泛菌蛋白激发子hcp及其功能 | |
CN108017698B (zh) | 一种大蒜抗菌肽ar117及其应用 | |
CN110066322A (zh) | 一种Bt蛋白Cyt2-like及其基因和应用 | |
CN106929516A (zh) | 黄瓜CsDIR16基因及其在降低植物霜霉威农药残留中的应用 | |
CN104530206B (zh) | 一种油菜抗菌肽BnCRP1及其应用 | |
CN104530205B (zh) | 一种油菜抗菌肽BnLTP1及其应用 | |
CN1693468A (zh) | 植物多功能活性和广谱抗性细胞信号因子HarpinEccs的高效分泌表达和应用 | |
CN110358778A (zh) | SlDALR2基因在提高番茄细菌性叶斑病抗性中的应用 | |
JP2012246227A (ja) | 土壌病害防除剤、及びこの防除剤を用いた土壌病害防除方法 | |
CN109305996A (zh) | 禾谷镰刀菌分泌型蛋白激发子FgHrip1及其应用 | |
CN110035662A (zh) | 二元杀虫cry毒素 | |
CN106818885A (zh) | 一种酸性蛋白酶在制备抑制病原菌制剂中的应用 | |
CN102408475B (zh) | 一种Bt蛋白Cyt1Da1、其编码基因及应用 | |
CN112940135A (zh) | 融合蛋白、其氨基酸序列、编码核苷酸序列、制备方法和应用 | |
RU2352580C1 (ru) | Пептид, обладающий антифунгальной активностью | |
CN109134629A (zh) | 灰霉菌分泌型蛋白激发子BcXyl1及其应用 | |
CN111138518B (zh) | 细菌转位子组分蛋白及其截短体的表达和应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
C06 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
C10 | Entry into substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |