CN103468829A

CN103468829A - 一种检测乙肝病毒核酸试剂盒

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Publication number: CN103468829A
Application number: CN2013104461943A
Authority: CN
Inventors: 韩勇军; 刘琪琦; 林晓云; 李洪强; 李洪生
Original assignee: Beijing Puli Naite Bio Technology Co ltd; Institute of Radiation Medicine of CAMMS
Current assignee: Beijing Puli Naite Bio Technology Co ltd; Institute of Radiation Medicine of CAMMS
Priority date: 2013-09-25
Filing date: 2013-09-25
Publication date: 2013-12-25
Anticipated expiration: 2033-09-25
Also published as: CN103468829B

Abstract

本发明涉及一种检测乙肝病毒核酸试剂盒。该试剂盒包括样本处理液A，样本处理液B，内标，PCR反应液A，PCR反应液B，阴性质控品，阳性质控品，定量参考品等。该试剂盒PCR反应液A中包含一对寡核苷酸探针，其中荧光探针序列是：5′-FAM-ATCACCACCATCTGGTTTCACCCGGAC-P-3′，淬灭探针序列是：5′-GAAACCAGATGGTGGTGA-Dabcyl-3′，将此探针应用到荧光定量PCR的方法中对样本中的乙型肝炎病毒核酸进行定性定量检测,具有高灵敏度、高特异性、操作简单、检测速度快的特点。鉴于以上优势，上述试剂盒可广泛应用于乙型肝炎病毒感染的辅助诊断。

Description

一种检测乙肝病毒核酸试剂盒

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种用于检测乙肝病毒核酸试剂盒。

背景技术

乙型肝炎病毒（HBV）感染是导致肝硬化和干细胞癌的主要原因之一。HBV感染者血浆（清）中HBV核酸是了解肝内HBV复制水平、HBV感染诊断、疗效监控和指导用药的重要指标，准确灵敏的定量检测血清中HBV核酸对乙型肝炎治疗效果的监测具有极其重要意义。目前，荧光定量PCR法检测HBV核酸现是检测乙肝病毒复制最常用的手段。

尽管我国HBV核酸定量试剂质量得到很大改进，但多数试剂的灵敏度、准确度及重复性等与进口优质试剂相比，仍存在较大差距。国际主流HBV核酸定量试剂，如Roche定量试剂的检测下限为12～20IU/ml。而目前我国市场上主流的国产HBV核酸定量检测下限一般为500～1000IU/ml，不能满足临床诊断需求。

发明内容

针对上述不足，本发明的目的在于提供一种基于复合探针技术的实时荧光PCR技术检测乙型肝炎病毒核酸的试剂盒。

为了实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

本发明提供一对寡核苷酸探针，其荧光探针序列是：5′-FAM-ATCACCACCATCTGGTTTCACCCGGAC-P-3′；淬灭探针序列是：5′-GAAACCAGATGGTGGTGA-Dabcyl-3′。

本发明还提供了一种检测乙肝病毒核酸的试剂盒，该试剂盒包括含有上述寡核苷酸探针的PCR反应液A。

上述PCR反应液A还包括用于监测体系的内标探针，该内标探针序列是：5′-HEX-TCCATTACACGTGAACGATTCCCCA-TAMRA-3′。

上述PCR反应液A还包括含有Mg2+，dATP，dCTP，dGTP，dTTP，dUTP，甲酰胺，Tris-HCl，KCl，Tween20的PCR反应缓冲液；靶基因正向引物、反向引物；内标的正向引物、反向引物。

其中，所述PCR反应液中的靶基因扩增的引物的是：

正向引物5′-CGTCTCGAGCAACTATACTGT-3′

反向引物5′-CACCGGTCGTGCACAGTATC-3′。

其中，所述监测体系的内标引物是：

正向引物5′-GCCTTTCATTGGCATGACCACCTTTCAT-3′

反向引物5′-AGCCAGTCGTCATAATCGCATT-3′。

上述用于检测乙型肝炎病毒核酸的试剂盒还包括样本处理液A，样本处理液B，内标，PCR反应液B，阴性质控品，阳性质控品，定量参考品。

其中，所述样品处理液A是7%PEG6000；

样品处理液B包含NaOH，TritonX-100，NP40，Tris-HCL；

PCR反应液B包含Taq酶和UNG酶；

阴性质控品是正常血清；

阳性质控品是含HBV核酸的重组DNA片段；

定量参考品是含HBV核酸的重组DNA片段；

内标质控品是含荧光素酶的重组DNA片段。

本发明的另一个目的是上述试剂盒在快速检测乙型肝炎病毒上的应用。

上述应用，包括下列步骤：

1）用样本处理液A和B进行阴、阳性质控品以及利用磁珠法分离待测样本的DNA。

2）将提取的DNA加入到含有PCR反应液A和PCR反应液B的PCR反应管中，进行PCR扩增，使用荧光定量PCR检测仪进行检测。

本发明与现有技术相比，具有下列优点：

1）高灵敏度，最低检测浓度为50IU/ml；

2）全封闭反应，提取病毒DNA后，直接用于PCR检测，避免了污染发生；

3）检测速度快，整个过程不超过2小时；

4）操作简单，可控性强，可进行大批量样品检测，有利于产业化；

5）PCR反应体系中加有内标，具有防止假阴性等优点。

6）加有防污染体系，具有防止产物污染的作用。

可见，该试剂盒通过对样本中的乙型肝炎病毒核酸进行定性定量检测,由于其具有高灵敏度、高特异性、操作简单、检测速度快的特点，可广泛应用于乙型肝炎病毒感染的辅助诊断。

附图说明

图1是显示工作标准品扩增曲线。其中，（1）是各标准品扩增曲线，（2）是各标准品线性相关关系图。

图2是显示阴性质控品品质鉴定图。其中，（1）说明检测过程中没有乙型肝炎病毒核酸的污染,实验过程能正常扩增，（2）内标质控品扩增曲线，说明检测体系有效扩增。

图3是显示阳性质控品扩增曲线。图示扩增曲线为S型曲线，说明检测体系有效扩增了乙型肝炎病毒核酸。

具体实施方式

以下实施例用于进一步说明本发明，但不应理解为对本发明的限制。在不背离本发明精神和实质的前提下，对本发明所作的修饰或者替换，均属于本发明的范畴。

实施例1：一种检测乙肝病毒核酸试剂盒的组装

本发明的试剂盒由以下部分组成：样本处理液A，样本处理液B，内标，PCR反应液A，PCR反应液B，阴性质控品，阳性质控品，定量参考品。

上述试剂盒各部分的组分与配比如下：

样品处理液A：7%PEG6000。

样品处理液B：含有NaOH，TritonX-100，NP40，1MTris-HCL(PH8.0)。

PCR反应液A：含有Mg²⁺，dATP，dCTP，dGTP，dTTP，dUTP，甲酰胺，Tris-HCl，KCl，Tween20的PCR反应缓冲液；靶基因和内标的正向引物、反向引物；寡核苷酸探针和内标探针、灭菌水。

PCR反应液B：包含Taq酶和UNG酶；

阴性质控品：正常血清；

阳性质控品：含HBV脱氧核糖核酸的重组DNA片段；

定量参考品：含HBV脱氧核糖核酸的重组DNA片段；

内标质控品：含荧光素酶的重组DNA片段。

该试剂盒，上述组分的量为：

样品处理液A：5.0mlx2管；样品处理液B：1.3mlx2管；PCR反应液A：1.4mlx1管；PCR反应液B：60ulx1管；阴性质控品：400ulx1管；阳性质控品：400ulx1管；①～④定量参考品：各400ulx1管；内标质控品：100ulx1管。

实施例2：一种检测乙肝病毒核酸试剂盒方法的建立

1、样本采集

本试剂盒适用于血清或血浆样本。采集血清：取受检者静脉血2ml，收集于无菌离心管中，室温放置不超过4小时，3000rpm离心20分钟，吸取血清转入另一无菌离心管中备用；采集血浆：取受检者静脉血2ml于含有抗凝剂的无菌离心管中（禁止使用肝素抗凝），室温放置不超过4小时，3000rpm离心20分钟，分离血浆，转入无菌离心管备用。

2、核酸提取

1）取阴性对照加入到样品处理液A中，加入比例为1：49，按需加入；取阳性对照加入到样品处理液A中，加入比例为1：49，按需加入；取定量参考品加入到样品处理液A中，加入比例为1：49，按需加入；待用。

2）用带滤芯吸嘴吸取100μl样品处理液A至离心管中，向此离心管中加入100μl待测样本。

3）盖上管盖，振荡混匀，13000rpm离心10分钟（离心时固定离心管方向）。

4）吸弃上清（沉淀不明显，需在离心管底部沉淀对侧吸上清，应一次性吸尽上清，避免搅动或碰到沉淀）。

5）向上述离心管中加入50μl样品处理液B，充分振荡混匀，低速（2000rpm）离心数秒后，100℃干浴或沸水浴10分钟，立即放入-20℃冰箱，放置5min。

6）轻轻将珠子悬浮1min，5000rpm离心2分钟，弃上清。

7）加入50μlddH₂O，震荡混匀，13000rpm离心2分钟，取上清为PCR反应模板（上清如不立即使用，需置-20℃保存，重新使用时需13000rpm离心1分钟）。

3、PCR试剂准备

1）取试剂盒中PCR反应液A、PCR反应液B室温融化后，低速（2000rpm）离心数秒。

2）根据待扩增样本数，每人份按照PCR反应液A:B=26.5:0.5的比例配制PCR混合液，并按27μl/管分装至PCR反应管中，将装有PCR混合液的反应管移至样本处理区。

4、加样

用带滤芯的吸嘴分别取已处理好的样本、阴性对照、阳性对照、工作标准品，标为①～④上清各3μl分别加到装有PCR反应液的PCR反应管中。盖上管盖，离心数秒后移至扩增检测区。

5、PCR扩增检测

1）将PCR反应管放入荧光PCR扩增仪中进行扩增。

2）循环参数设定，具体见表1：

表1：荧光定量PCR循环数

3）仪器检测通道选择：FAM为HBV扩增信号，HEX为内标扩增信号。

6、结果分析

根据各类仪器的软件进行分析，得到各标本的HBV核酸检测结果。

阈值设定原则以阈值线刚好超过正常阴性对照曲线（无规则的噪音线）的最高点为准。基线选取6～10或6～15个循环区域。

7.结果判断

1）对于5×10¹IU/ml≤HBV核酸≤5×10⁸IU/ml的样本，报告相应的测定结果。

2）对于HBV核酸＞5×10⁸IU/ml的样本，所测结果仅供参考，报告上注明＞5×10⁸IU/ml。若需精确定量，可根据所测结果，将该样本用阴性血清稀释至5×10⁸IU/ml以下后复测。

3）对于1×10¹IU/ml≤HBV核酸＜5×10¹IU/ml的样本，所测结果仅供参考，报告上注明＜5×10¹IU/ml或定量结果仅供参考。

4）对于HBV扩增阴性的样本（HBV核酸检测值为0IU/ml），如内标结果为阳性则报告上注明＜5×10¹IU/ml或低于试剂盒检测下限。如内标结果为阴性则应对该样本进行复测。

实施例3：一种检测乙肝病毒核酸试剂盒中质控品的使用

乙型肝炎病毒核酸检测试剂盒中质控品包括工作标准品、阳性质控品、阴性质控品和内标，用于临床试验中质量控制，操作方法同待检样本。

质量控制标准如下：

工作标准品的检测结果应在定量范围内，且标准曲线的相关系数|r|≥0.98，结果见图1，图示扩增曲线为S型曲线，梯度正常，线性相关性好。

阴性质控品测定结果为阴性（HBV核酸检测值为0IU/ml），且内标结果为阳性，结果见图2，图示扩增曲线为较平直的折线，与荧光检测阈值线没有交点，曲线不呈S型，且内标结果呈阳性,说明检测过程中没有乙型肝炎病毒核酸的污染,实验过程能正常扩增。

阳性对照的测定结果为阳性，且Ct值小于35（HBVDNA检测值为5×10²～5×10⁴IU/ml，结果见图3，图示扩增曲线为S型曲线，说明检测体系有效扩增了乙型肝炎病毒核酸。

以上要求须在同一次实验中同时满足，否则，本次实验视作无效，需重新进行。

实施例4：一种检测乙肝病毒核酸检测试剂盒应用

本次试验选择疑似乙型肝炎病毒感染者、HBV引起的肝癌、肝炎后肝硬化患者，非乙型肝炎感染的其它肝炎病毒感染者、健康人群作为研究对象，总计完成204例有效样本试验，标本类型为血清，使用市面上现存的检测试剂盒作为对照试剂进行对比检测，对于对照试剂盒与本发明的试剂盒检测结果阴阳性判断不符的病例，采用金标准测序方法进行复核检测。

结果：175例阳性组样本，29例阴性组样本，本发明试剂盒与对照试剂盒检测结果揭盲对比，1例样本本发明试剂盒与对照试剂盒检测结果不符。经统计分析，两种试剂阳性符合率为100%，阴性符合率为96.6%，总符合率为99.5%。McNemar卡方检验结果显示本发明试剂盒和对照试剂盒检测结果不一致部分的差别无统计学意义（χ2=1，P=1.000﹥0.05）。Kappa一致性检验结果显示，待考评试剂盒和对照试剂盒检测结果一致性极好（Kappa=0.980，Z=13.995，P﹤0.0002）。相关性分析结果表明本发明试剂盒与对照试剂盒具有显著相关性（相关系数R2=0.9709，回归方程为：y=1.0412x-0.1734）。对检测结果不一致的1例样本使用金标准测序方法进行复核，复核结果表明该例样本结果与本发明试剂检测结果相符。

以上结果表明本发明的乙肝病毒核酸检测试剂盒（PCR荧光探针法）与常规检测方法建立试剂盒的检测结果在统计学上无显著差异，两种试剂检测结果的一致性极好，在乙型肝炎病毒核酸检测功能上等效。可见，本发明提供的试剂盒用于乙型肝炎病毒感染的辅助诊断。

Claims

1.一对寡核苷酸探针，其特征在于，荧光探针序列是：5′-FAM-ATCACCACCATCTGGTTTCACCCGGAC-P-3′；淬灭探针序列是：5′-GAAACCAGATGGTGGTGA-Dabcyl-3′。

2.含有权利要求1所述的寡核苷酸探针的检测试剂。

3.一种检测乙肝病毒核酸试剂盒，其特征在于，包括含有权利要求1所述的寡核苷酸探针的PCR反应液A。

4.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，上述PCR反应液A还包括用于监测体系的内标探针。

5.根据权利要求4所述的试剂盒，其特征在于，上述内标探针序列是：5′-HEX-TCCATTACACGTGAACGATTCCCCA-TAMRA-3′。

6.根据权利要求3～5任一项所述的试剂盒，其特征在于，上述PCR反应液A还包括含有Mg2+，dATP，dCTP，dGTP，dTTP，dUTP，甲酰胺，Tris-HCl，KCl，Tween-20的PCR反应缓冲液；靶基因正向引物、反向引物；内标的正向引物、反向引物。

7.根据权利要求6所述的试剂盒，其特征在于，所述PCR反应液中的靶基因扩增的引物的是：

正向引物5′-CGTCTCGAGCAACTATACTGT-3′

反向引物5′-CACCGGTCGTGCACAGTATC-3′。

8.根据权利要求6所述的试剂盒，其特征在于，所述监测体系的内标引物是：

正向引物5′-GCCTTTCATTGGCATGACCACCTTTCAT-3′

反向引物5′-AGCCAGTCGTCATAATCGCATT-3′。

9.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，还包括样本处理液、内标质控品、PCR反应液B、阴性质控品、阳性质控品、定量参考品的其中一种或多种。

10.根据权利要求9所述的试剂盒，其特征在于，所述样品处理液包括处理液A和处理液B，其中处理液A是7%PEG6000；处理液B包含NaOH，TritonX-100，NP40，Tris-HCL；PCR反应液B包含Taq酶和UNG酶；阴性质控品是正常血清；阳性质控品是含乙肝病毒核酸的重组DNA片段；定量参考品是含乙肝病毒核酸的重组DNA片段；内标质控品是含荧光素酶的重组DNA片段。