CN102094027B - 稻瘟病抗性基因Pi7及其应用 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种稻瘟病抗性基因Pi7及其应用。本发明提供了所述水稻稻瘟病抗性基因Pi7的核苷酸序列及其编码的氨基酸多肽序列,该序列包含有2个基因,都属于CC-NBS-LRR抗性基因家族的成员,且皆为组成型表达的基因。本发明还提供了该基因在转化水稻或其它植物培育抗病品种方面的应用以及根据该基因序列产生的分子标记在育种中的应用。

Description

稻瘟病抗性基因Pi7及其应用
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种水稻稻瘟病抗性基因Pi7的克隆及其应用。
背景技术
植物在生长的过程中,常常受到多种病原物的侵害,而植物则采取多种防御策略以保护自身,避免受其侵袭。植物中一个最重要的防御机理就是能够识别专性致病微生物的存在并启动自身的防御应答***。植物对病原菌的识别由抗病基因所介导。因此,对抗病基因产物结构进行分析与研究,是了解植物抗病机制的基础,对于其病害的预防和控制也具有重要的指导意义。
迄今为止,己经从植物中分离了80多个抗病基因。对这些抗病基因的结构和产物的研究发现,虽然寄主植物不同,所对应的病原物也有真菌、细菌、病毒和线虫等差异,但抗病基因的结构和产物却有许多共同的结构特征,如C-端存在富亮氨酸重复序列 (leucine-rich repeat, LRR), N-端存在核苷酸结合位点 (nucleotide binding site, NBS), 亮氨酸拉链 (leucine zipper, LZ), 卷曲螺旋结构域 (coiled-coil, CC), 跨膜结构域 ( transmembrane domain, TM) , 蛋白激酶 (protein kinase, PK), 以及果蝇Toll蛋白及哺乳动物白介素- 1受体 ( Toll and interleukin – 1 receptor, TIR) 等。根据它们所编码蛋白的结构特征, 可将抗病基因分为7类(Hammond-Kosack & Jones, 1997; Dangl & Jones 2001; Iyer & McCouch 2004)。
第一类,毒素还原酶类抗病基因。如玉米抗病基因Hm1,它是第1个被克隆的植物抗病基因,它控制对真菌Cochliobolus carbonum小种1的抗性。Hm1编码的解毒酶能钝化病原真菌所产生的HC毒素,而HC毒素是真菌Ccarbonum 小种1产生的致病因子,它决定该病菌只能感染玉米的某些基因型(Johal 等, 1992)。第二类,NBS-LRR类抗病基因。它们编码的蛋白近N端为NBS,而近C端则由LRR组成。如RPS2(Bent et al., 1994)、RPM1(Grant et al., 1995)、I2 (Simon et al., 1998); RPP5(Parker et al., 1997)、(Dodd et al., 2001)、L 6 (Lawrence et al., 1995)、Mla1 (Zhou et al., 2001)、Mla6 (Halterman et al., 2001);水稻的抗病基因如 Xa1(Yoshimura et al., 1998)、Pib(Wang et al., 1999)、Pita (Bryan et al., 2000)等。第三类,PK类抗病基因。如番茄Pto基因,其产物是一种位于细胞内的丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶,没有LRR结构域 (Martin et al., 1993)。第四类,LRR-TM 类抗病基因。番茄抗叶霉病不同生理小种的基因 Cf-2(Dixon et al., 1996)、Cf-4(Thomas et al., 1997)、Cf-5(Dixon et al., 1998)、Cf-9 (Jones et al., 1994),以及甜菜抗胞囊线虫的基因 Hs1 pro-1 (Cai et al., 1997) 等。第五类,LRR-TM-PK类抗病基因,以水稻抗白叶枯病基因 Xa21(Song et al., 1995)为代表。第六类,以拟南芥的 RPW8 为代表,其编码的蛋白仅含有完整的CC和NBS结构域( Xiao et al., 2001 )。第七类,以水稻的 xa5 基因为代表,其编码的蛋白为一个转录因子 (TFIIAγ) (Iyer & McCouch, 2004)。
编码NBS-LRR类抗病蛋白的抗病基因是植物抗病基因中最大的一类抗病基因,根据NBS-LRR类抗病蛋白N末端的结构特点,又可将该类基因分为两大类TIR-NBS-LRR和 CC-NBS-LRR(Meyers et al., 2002; Pan et al., 2000; Cannon et al., 2002; Richly et al., 2002)。TIR-NBS-LRR类抗病基因主要发现在双子叶植物,至今还没有在单子叶植物基因组中发现 (Bai et al., 2002; Meyers et al., 2002)。目前在单子叶植物中鉴定到的抗病基因主要编码CC-NBS-LRR类抗病蛋白,双子叶植物中也存在大量的CC-NBS-LRR类抗病基因,相对而言,单子叶植物中的CC-NBS-LRR类抗病基因比双子叶植物中的更丰富多样 (Cannon et al., 2002)。
研究表明,NBS、CC、TIR结构域可能参与信号传导(Hammond-Kosack & Jones 1997),尽管这类 R 蛋白不具有内在的激酶活性,但NBS可以激活激酶或G蛋白,NBS具有结合ATP或GTP以及水解酶活性(Traut et al., 1994)。TIR结构可能参与植物抗病防卫反应下游的信号传导(Jones et al., 1994)。最近的证据表明,亚麻的L族多样性选择也发生在TIR区域,这个区域与相应的LRR区域共进化形成特异性(Luck et al., 2000)。LRR结构域的功能主要涉及到蛋白质-蛋白质和与配体的相互作用(Jones & Jones, 1996; Kajava et al., 1998),据推测是抗病基因产物直接和病原菌无毒基因编码的产物或间接产物相互作用的部位(Bent, 1996; Baker et al., 1997)。Jia et al.(2000)通过酵母双杂交证明AVR-Pita编码的蛋白加工为一个176氨基酸的活性蛋白AVR-Pital76小种特异性的激发子,传递到植物细胞质特异地与Pita受体的LRD区域结合,从而激活细胞内Pita介导的防卫反应。当Pita中的Ala变为Ser后Av-rPita176不能与LRD结合,因而表现感病。这一结果直接证明了LRR结构域可能就是病原菌识别的区域;Pita与AvrPita的互作第一次从分子水平验证了水稻与稻瘟病菌的“基因对基因”关系。 
水稻是世界上最重要的粮食作物之一,约有一半以上的人口以稻米为主食。由病原真菌Magnapothe oryzae (无性态:Pyricularia oryzae) 引起的稻瘟病是对水稻生产危害最严重的病害之一,每年都造成严重的粮食损失。从环境保护与农业的可持续发展的观点来看,抗病品种的育成与利用是防治稻瘟病最安全有效的方法。但是,由于稻瘟病菌群体的多样性及易变性,加之人们缺乏对抗性基因的有效利用,以及对抗性机理缺乏充分的了解,以致抗病品种的感病化问题不但没有得到解决,反而因有效抗源基因的缺乏和抗病品种的短命化而成为育种学家最为棘手的问题。因此,发掘、鉴定和克隆抗病基因并合理地应用于抗病育种计划中,已成为农业科研中优先解决的重要问题。
随着分子生物学的快速发展,迄今,至少有80多个水稻稻瘟病主效抗性基因已经被报道,其中60个已经被分子定位。目前,除了水稻的第3染色体上还没有被鉴定到稻瘟病主效抗性基因之外,其余的11条染色体上均被鉴定到有主效抗性基因位点,并且有的染色体上含有多个稻瘟病抗性位点,而且有些基因位点的抗性基因是成簇存在的。目前,在稻瘟病抗性基因的克隆研究方面,正式报道的已有13个抗性基因,Pib (Wang et al., 1999),Pita (Bryan et al., 2000),Pi9 (Qu et al., 2006),Pid2 (Chenet al., 2006),Piz-tPi2 (Zhou et al., 2006b), Pi36 (Liu et al., 2007a),Pi37 (Lin et al., 2007),Pik-m (Ashikawa et al., 2008),Pit (Hayashi et al., 2009),Pi5 (Lee et al., 2009),Pid3 (Shang et al., 2009)和pi21 (Fukuoka et al., 2009)。
克隆抗病基因是对水稻抗性机理深入研究的前提,揭示水稻抗稻瘟病的分子机理可以更好地控制和降低稻瘟病菌对水稻的危害。同时,对克隆的抗病基因进行修饰和改造,可以人为地控制和增加植物的抗病性,拓宽植物的抗谱。这些方面是采用常规植物育种和改良技术所不能达到的。
发明内容
本发明的目的是提供一种水稻稻瘟病抗性基因和包含调控这个基因的启动子的DNA片段。
本发明的另一个目的是提供上述稻瘟病抗性基因所编码的蛋白质。
本发明的另一个目的是提供上述含有上述抗性基因的载体。
本发明的另一个目的是提供上述载体的宿主细胞。
本发明的另一个目的是提供上述基因在制备转基因植物中的应用。
本发明的进一步目的是提供上述抗性基因产生的分子标记及其在选育对稻瘟病具有抗病性的水稻中的应用。
本发明从水稻品种IRBL7-M中分离得到Pi7基因,包括2个编码NBS-LRR类蛋白的基因Pi7-1Pi7-2,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示,它们分别编码SEQ ID NO.3以及SEQ ID NO.4所示的氨基酸序列,结构如附图9和附图10所示。它们的蛋白都包含2个主要的结构域:NBS和LRR区域,其中Pi7-1 NBS结构域含有保守的kinase 1a:GLPGGGKTTVAR,kinase2:NKKYLIVIDDIW,kinase3a:DLGGRIIMTTRLNSI,GLPL:EDSPCYDIVNMCYGMPLALIW;Pi7-2 NBS结构域含有保守的kinase1a:VLSIVGFGGVGKTTIA,kinase2:LEQLLAEKSYILLIDDIW,kinase3a:GGRIIVTTRFQAV,GLPL:EQVPEEIWKICGGLPLAIV,RNBS-D:CLLYLSIFPKGWK,MHDV:KTFQVHDMVLEYI。而Pi7-1蛋白的C-末端为16个不完整的LRR重复,其亮氨酸含量为14.0%(图9);Pi7-2蛋白的C-末端为13个不完整的LRR重复,其亮氨酸含量为17.0%(图10)。
应当理解,在不影响蛋白活性的前提下(不在蛋白的活性中心),本领域技术人员可对SEQ ID NO.3或SEQ ID NO.4所示的氨基酸序列进行各种取代、添加和/或缺失一个或几个氨基酸获得具有同等功能的氨基酸序列。此外,考虑到密码子的简并性,例如可在其编码区,在不改变氨基酸序列的条件下,或在其非编码区在不影响蛋白表达的条件下,对编码上述蛋白的基因序列进行修改。因此,本发明还包含对编码上述蛋白的基因序列进行的替换、添加和/或缺失一个或多个核苷酸,具有与上述编码基因具有相同功能的核苷酸序列。本发明还包括基于所述基因的正义序列或反义序列,包括含有所述核苷酸序列或其片段的克隆载体或表达载体、含有所述载体的宿主细胞、含有所述核苷酸序列或其片段的转化的植物细胞和转基因植物。
本发明同样包括将Pi7抗性基因的主要结构部分有效地连接上合适的调节序列所形成的嵌合基因,以及在基因组中包含这种基因的植物和这种植物的种子。这种基因可以是天然的或是嵌合的。例如,将包含该基因的片段和一个组成型表达的启动子连接,该启动子可以在任何条件下和细胞发育的任何时期表达。这种组成型表达的启动子包括花椰菜花叶病毒的35S启动子等。另一方面,也可以将该基因和一个组织特异性表达的启动子或发育时期特异性表达的启动子或精确环境诱导的启动子连接,这些启动子称之为诱导型启动子。这样,环境的改变,发育时期的不同都可以改变该基因的表达。同样地,也可以将该基因的表达限定在某一个组织内,使由该基因诱导的抗病反应得到人为的控制。其中环境条件包含病原菌的攻击、厌氧条件和光等,组织和发育时期包括叶、果实、种子和花等。
本发明还进一步克隆得到所述基因的启动子,包含调控该基因的启动子的DNA片段分别如SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示。
根据本发明提供的Pi7基因序列信息(SEQ ID No.1和SEQ ID No.2),本领域技术人员可以通过以下方法容易地获得与Pi7等同的基因:(1)通过数据库检索获得;(2)以Pi7基因片段为探针筛选水稻或其它植物的基因组文库或cDNA文库获得;(3)根据Pi7基因序列信息设计寡核苷酸引物,用PCR扩增的方法从水稻或其它植物的基因组、mRNA和cDNA中获取;(4)在Pi7基因序列的基础上用基因工程方法改造获得;(5)用化学合成的方法获得该基因。
本发明提供的稻瘟病抗性基因Pi7具有重要的应用价值,其赋予植物对稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)所引起的病害产生特异性的抗病反应。其适用于对所有对该病原菌敏感的植物,这些植物包括单子叶植物和双子叶植物。应用之一是将所述的Pi7基因序列连接到任何一种植物转化载体,用任何一种转化方法将Pi7抗病基因导入水稻或其他植物细胞,可获得表达所述基因的转基因抗病品种,从而应用于生产。本发明所述的基因构建到植物转化载体中,可以对所述基因或其调控序列作适当的修饰,也可以在其转录起始密码子前用其它启动子取代所述基因原有的启动子,从而拓宽和增强植物对病原菌的抗性。
本发明提供的抗性基因的另一个应用是根据所述基因序列信息产生特异性的分子标记,包括但不限于SNP(单核苷酸多态)、SSR(简单序列重复多态)、RFLP(限制性内切酶长度多态)、CAPS(切割扩增片段多态)。用此标记可鉴定水稻或其它植物的抗性基因型,用于分子标记辅助选择育种,从而提高育种的选择效率。
本发明具有明显的优点和效果。将克隆的抗病基因转入感病的植物,有助于产生新的抗病植物。特别是可以用转化技术在植物中累加多个抗病基因,而不会产生传统育种技术中伴随出现的基因组中不良基因的连锁问题,并且可以缩短育种时间。抗病基因的克隆是克服传统育种中不能在植物种间转移抗病基因的问题的前提。
本发明能够进一步提供或应用基于上述DNA片段获得的抗病的转基因植株和相应的种子,以及用本发明的基因或基于该基因的重组体转化的植株或由这类植株获得的种子。可以用有性杂交的方式将本发明的基因转入其他的植株中。
附图说明
图1为水稻稻瘟病抗性基因Pi7的克隆策略图。先前有报导称Pi1(C101LAC)、Pi7(RIL29)以及Pik对来自菲律宾的多个稻瘟病菌菌株表现出相同的反应型(Tsunematsu et al. 2000, Breeding Science 50: 229-234);Pi1Pi7事实上是Pik的等位基因或与其完全相同的基因(Campbell et al. 2004, Phytopathology 94: 302-307)。结合本研究室对与上述Pik等位基因具有“基因对基因,gene-for-gene”相互作用的稻瘟病菌无毒基因定位、克隆的结果,从而推测Pi7可能就是Pik新的等位基因。因此,本发明以已公布的Pi7定位的信息(Campbell et al. 2004, Phytopathology 94: 302-307)为基础,构建该目的基因区域的电子物理图谱;采用与Pik等位基因之Pik-m (Ashikawa et al. 2008, Genetics 180: 2267–2276)和Pik(Zhai et al. 2010, New Phytologist DOI: 10.1111/j.1469-8317.2010.03462.x)相似的克隆策略来克隆该抗性基因。
图2为Pik簇等位基因对8个稻瘟病菌群体抗谱的比较。图中纵坐标为抗性频率,横坐标为8个稻瘟病菌群体(GD,广东;FJ,福建;HN,湖南;GZ,贵州;SC,四川;LN,辽宁;JL,吉林;HLJ,黑龙江)。5个Pik簇等位基因 (IRBLks-S, Pik-s; IRBLk-Ka, Pik; Tsuyuake, Pik-m; IRBLkp-K60, Pik-p; IRBL7-M, Pi7)。由此可以看出,Pi7对广东、湖南、贵州、四川和辽宁的稻瘟病菌群体表现较高的抗性。
图3为目的基因Pi7区域电子物理图谱的构建图。图3A:上述Campbell 等(2004)构建的Pi7区域粗略的遗传图谱;图3B:根据Pik-m (Ashikawa et al. 2008, Genetics 180: 2267–2276)和Pik (Zhai et al. 2010, New Phytologist DOI: 10.1111/j.1469-8317.2010.03462.x)的定位信息构建的Pi7Pik簇等位基因的整合物理图;图3C:选基因区域存在的4个BAC克隆;图3D:Pik基因候选区域(Zhai et al. 2010, New Phytologist 180: 2267–2276);图3E:Pi7基因位点在日本晴类型基因组上存在的具有NBS-LRR保守结构的6个抗病候选基因;图3F:Pi7基因位点在IRBL7-M/Tsuyuake类型基因组上存在的具有NBS-LRR保守结构的2个抗病候选基因。由此可以看出,在Pi7基因位点上存在两种类型的基因组,彼此之间存在很大的缺失/***;Pi7基因只有2个候选基因(Pi7-1和 Pi7-2)。
图4为水稻稻瘟病抗性基因Pi7 (由Pi7-1Pi7-2组成)之遗传互补T0植株的抗性鉴定实物图。图中实线箭头所指的是抗病植株,虚线箭头所指的是感病植株,说明抗性基因Pi7Pi7-1Pi7-2组成才能表现功能。
图5为水稻稻瘟病抗性基因Pi7遗传互补的部分T0转化体的选择标记HPT基因的PCR检测图。图中由左至右,泳道1、15:分子量标记DL2000;泳道2:空载体 (Vector),阳性对照;泳道3:转化受体品种Q1063,阴性对照;泳道4:供体品种IRBL7-M,阴性对照;泳道5-14:T0转化体。结果表明,所有抗病的转化体都检测到了选择性标记的PCR扩增产物,而感病的转化体没有检测到选择性标记的PCR扩增产物,说明抗病的转化体是由于转化构建体已经整合到了高感的受体品种Q1063的基因组中获得了表达而恢复了抗性。R:高抗;MR:中抗; MS:中感;S:感病。
图6为水稻稻瘟病抗性基因Pi7遗传互补后代基因型与表现型的共分离分析图。图中由左至右,泳道1、11:分子量标记DL2000;泳道2:空载体 (Vector),阳性对照;泳道3:转化受体品种Q1063,阴性对照;泳道4-10:T1转化系的分离后代。结果表明,在T1转化系的分离后代中,所有抗病的T1转化体都检测到了选择性标记的PCR扩增产物,而感病的T1转化体没有检测到选择性标记的PCR扩增产物,说明该T1转化系后代个体的基因型与表现型共分离,亦即转基因在其分离后代中已经稳定遗传表达。R:高抗;MR:中抗; S:感病。
图7为水稻稻瘟病抗性基因Pi7之RNA干涉(RNAi)F1植株的抗性鉴定实物图。图中HF4为供体品种IRBL7-M与Pik-h (是Pi7 高度同源的等位基因)之RNAi T1转化子 kh4i-11 遗传杂交的F1植株,其接种后的表现病为感病(S),说明Pi7的功能被Pik-h之RNAiT1转化子所含有的构建体而干涉(破坏)了;HF6为供体品种IRBL7-M与Pik-h 之RNAiT1转化子 kh4i-26 遗传杂交的F1植株,其接种后的表现病为感病,说明Pi7的功能被Pik-h之RNAiT1转化子所含有的构建体而干涉(破坏)了;图中HF10为含有Pia的品种Aichi Asahi与Pik-h Pia是与Pik-h/Pi7 位置不同的非等位基因)之RNAi T1转化子 kh4i-9 遗传杂交的F1植株,其接种后的表现型为抗病(R),说明Pia的抗性功能并没有被Pik-h之RNAiT1转化子所含有的构建体而干涉(破坏)了,因此,可作为非特异性RNA干涉的对照;IRBL7-M是Pi7的供体品种,其接种后的表现型为抗病(R),说明接种所用的稻瘟病菌株CHL381是合适的。
图8为水稻稻瘟病抗性基因Pi7之RNA干涉(RNAi)F1植株的分子鉴定实物图。图中由左至右,泳道M(两侧):分子量标记DL2000;泳道1:上述IRBL7-M,没有检测到RNAi构建体特异的分子标记(Hpt), 即不含有构建体; 泳道2:RNAi T1转化子 kh4i-11,检测到了RNAi构建体特异的分子标记(Hpt),即含有构建体; 泳道3:上述HF4之F1植株,含有构建体; 泳道4:RNAi T1转化子 kh4i-26,含有构建体; 泳道5、6:上述HF6之F1植株,含有构建体; 泳道7:上述Aichi Asahi,不含有构建体; 泳道8:RNAi T1转化子 kh4i-9,含有构建体; 泳道9、10:上述HF10之F1植株,含有构建体。以上结果说明,HF4和HF6之F1植株因为受到等位基因特异性的RNA干涉而使其含有的抗性基因(Pi7)的功能不表达;作为对照,HF10之F1植株因为受到的是非等位基因特异性的RNA干涉而使其含有的抗性基因(Pia)的功能正常表达。
图9为水稻稻瘟病抗性基因Pi7之组成基因Pi7-1的基因结构及序列图。图9A:图中浅色方框表示5’和3’-UTR;深色方框表示外显子;线条表示内含子;该基因编码区的启动子(ATG)和终止子(TAG)以及各个区域的大小(bp)亦标示于其中。图9B:图中CC结构域带下划线的黑体字表示形成CC motif的氨基酸,NBS区域带下划线的黑体字表示NBS中保守的氨基酸序列。下部分独立列出的氨基酸残基为C-末端LRR区域;带下划线的黑体字表示形成LRR区域的xLDL保守基序;LRR区域后面还带有一段CNL(C端非LRR区域)氨基酸序列。双下线标示的氨基酸序列为Pi7特异的氨基酸替换[substitution,与Pik簇的其他等位基因 (PikPik-sPik-pPik-m) 相比]。
图10为水稻稻瘟病抗性基因Pi7之另一组成基因Pi7-2的基因结构及序列图。图10A:图中浅色方框表示5’和3’-UTR;深色方框表示外显子;线条表示内含子;该基因编码区的启动子(ATG)和终止子(TAG)以及各个区域的大小(bp)亦标示于其中。图10B:图中CC结构域带下划线的黑体字表示形成CC结构的氨基酸,NBS区域带下划线的黑体字表示NBS中保守的氨基酸序列。下部分独立列出的氨基酸残基为C-末端LRR区域;带下划线的黑体字表示形成LRR区域的xLDL保守基序。双下线标示的氨基酸序列为Pi7特异的氨基酸替换[substitution, 与Pik簇的其他等位基因 (PikPik-sPik-pPik-m) 相比]。
图11为水稻稻瘟病抗性基因Pi7表达特性的定量RT-PCR检测图。左图为组成基因Pi7-1在不同的接种时间点(0 hr, 12 hr, 24 hr, 72 hr,120hr)的相对表达水平,由此可以看出,该基因的表达类型为,从12 hr—72 hr逐步上调,然后逐步下调。右图为另一个组成基因Pi7-2在不同的接种时间点的相对表达水平,由此可以看出,该基因的表达类型为,12 hr—24 hr逐步上调,然后逐步下调。由此还可以看出,该基因在接种对照(H2O)和接种病原菌之间表现明显不同的诱导型表达。2个基因都表现为组成型表达,因为接种之前和之后都能检测到2个基因的表达。图中纵坐标为相对表达水平,横坐标表示时间,单位为小时(h),斜纹框图为对照(接种之前),黑框图为接种对照(H2O),空白框图为病原菌接种。
图12为利用水稻稻瘟病抗性基因Pi7的特异性分子标记的基因型鉴定图。由此可以看出,2个特异性分子标记的组合使用能够将Pi7与其它几个等位基因区分开。图12A为标记T1-795G,该标记可以将抗性品种IRBL7-M的基因型(Pi7/Pi7)与抗性品种IRBLkp-K60(Pik-p/Pik-p)和感病受体品种龙粳24Q1063 (pi7/pi7)区分开;图12B为标记A2-1879G,该标记能将抗性品种IRBL7-M的基因型 (Pi7/Pi7) 与抗性品种IRBLk-Ka (Pik/Pik)、IRBLkm-Ts(Pik-m/Pik-m)、IRBLks-S(Pik-s/Pik-s)、感病受体品种Q1063 (pi7/pi7)、感病受体品种龙粳24 (pi7/pi7)区分开。图中,M:分子量标记DL2000。
具体实施方式
以下实施例进一步说明本发明的内容,但不应理解为对本发明的限制。在不背离本发明精神和实质的情况下,对本发明方法、步骤或条件所作的修改或替换,均属于本发明的范围。若未特别指明,实施例中所用的技术手段为本领域技术人员所熟知的常规手段。在本发明的实施例部分,我们阐述了Pi7基因的抗性特征、分离克隆、功能特征以及分子鉴定,分离的Pi7基因能够与适当的载体连接,转入植物体中,使该植物体带有一定的抗性。
实施例1  抗性基因Pik-h的抗性特征
为了比较和明确Pi7Pik 位点4个等位基因(PikPik-pPik-sPik-m)的抗谱,利用从广东(60个菌株),福建(40个),湖南(41个),贵州(60个), 四川(66个),辽宁(108个),吉林(60个)和黑龙江(63个)收集的总计498个菌株对上述5个等位基因的所持品种(分别是IRBL7-M, IRBLk-Ka, IRBLkp-K60, IRBLks-S和Tsuyuake)进行了抗谱比较分析。结果表明,Pi7对广东、湖南、贵州、四川和辽宁的稻瘟病菌群体表现较高的抗性,由此说明该基因可在上述地区使用(图2)。水稻品种 RBL7-M, IRBLk-Ka, IRBLkp-K60和 IRBLks-S 已在文献(Kobayashi et al. Development of new sets of international standard differential varieties for blast resistance in rice (Oryza sativa L.). JARQ, 2007,41: 31-37)中公开。水稻品种Tsuyuake已在文献(Wang et al. Characterization of rice blast resistance genes in the Pik cluster and fine mapping of the Pik-p locus. Phytopathology,2009,99: 900-905)中公开。
实施例2  水稻稻瘟病抗性基因Pi7的克隆策略及电子物理图谱的构建
先前的定位研究表明Pi7基因定位于与Pik簇基因相同的基因组区域(Campbell et al. Development of co-dominant amplified polymorphic sequence markers in rice that flank the Magnaporthe grisea resistance gene Pi7(t) in recombinanant inbred line 29. Phytopathology,2004,94: 302-307;图3A);本研究室的抗谱分析显示Pi7基因与Pik簇3个等位基因(除了抗性较弱的Pik-s之外)对大部分测试菌株表现出相同的抗性反应(图2);本研究室先前的研究表明,与Pi7相对应的无毒基因AvrPi7也是与Pik簇抗性基因对应的无毒基因AvrPik/km/kp是等位的。综合上述三方面的结果,依据植物病害***的“基因对基因”学说,推断Pi7应该也是Pik/km/kp的等位基因。因此,本发明采用了与本研究室克隆Pik等位基因相似的策略和方法,完成了Pi7目标区域电子物理图谱的构建(图1)。亦即,以水稻参考品种日本晴(Nipponbare)的序列信息为基础,通过生物信息学手段,把与Pi7连锁的标记(Campbell et al. 2004;图3A)以及与Pik基因共分离的标记(Zhai et al. 2010, New Phytologist DOI: 10.1111/j.1469-8317.2010.03462.x;图3B)进行物理位置整合,并由此构建了目的基因区域的重叠群图(图3C),以及电子物理图(图3D)。
实施例3  水稻稻瘟病抗性基因Pi7候选基因的注释及序列分析
为了确定Pi7的候选基因,申请人利用日本晴的参考序列,通过3种基因预测软件RiceGAAS (http://ricegaas.dna.affrc.go.jp) 、Gramene (http://143.48.220.116/resources/)和Softberry的FGENESH (http://www.softberry.com) 对目的基因区域进行了基因预测及注释分析,初步确定了Pi7的候选抗性基因为6个核苷酸结合位点和富亮氨酸重复(nucleotide binding site - leucine-rich repeat, NBS-LRR)的候选基因(Pi71-NPPi72-NPPi73-NPPi74-NPPi75-NP,和Pi76-NP)。
对6个候选基因进行基于基因特异性标记的存在/缺失(presence/absence, P/A)分析,结果表明,与Pik簇3个等位基因一样,在日本晴参考序列存在的4个候选基因(Pi71-NPPi72-NPPi73-NPPi74-NP)在Pi7所持品种IRBL7-M中是不存在的(图3E,3F)。因此,Pi7的候选抗性基因只有Pi7-1Pi7-2,下一步将通过以下的基因功能互补实验确认其功能。
实施例4  水稻稻瘟病抗性基因Pi7的遗传互补实验及转化子的鉴定
先前的研究表明,Pik簇的2个等位基因Pik-m (Ashikawa et al. 2008, Genetics 180: 2267–2276)和Pik (Zhai et al. 2010, New Phytologist DOI: 10.1111/j.1469-8317.2010.03462.x)都是由2个紧密连锁的基因组成的。因此,利用高保真酶phusion结合长片段PCR(long-range PCR, LR-PCR)技术,以IRBL7-M的总DNA为模板,根据或参考Liu et al. (2007, Genetics, 176: 2541-2549)和Zhai et al. (2010, New Phytologist DOI: 10.1111/j.1469-8317.2010.03462.x)描述的实验方法和程序,将上述2个候选基因作为一个整体基因进行了扩增、克隆,然后进行了基于遗传互补的功能获得性实验(图1)。结果表明,在遗传互补后代中获得了功能互补的转化体(表1;图4)。
扩增、克隆Pi7-12的引物为:
正向引物:TTTTGGCGCGCCGGTGCGGGAAGAAGACGGGATAAAGA
反向引物:TTTTGGCGCGCCGCCGACGATAGCAACCGACAGGAGTG
利用转化载体中的潮霉素基因(Hpt)标记对转化体进行了PCR检测。检测结果证明目的基因片段已经导入抗病转化体中,而没有导入感病转化体中(图5)。
表1. Pi7 2个组成基因的遗传互补实验分析结果
自各个构建体的T0植株接种对 Pi7无毒性的菌株CHL346。 R, 抗病; MR,中抗; MS,中感; S,感病。
b 功能互补成功率(%)为R+MR/R+MR+MS+S*100%
上述遗传互补的实验结果表明,候选基因Pi7-12就是Pi7的功能基因。水稻品种Q1063以及生物材料载体pCAMBIA1300已在文献(Lin et al.2007, Genetics 177: 1871-1880)中公开;水稻品种Longjing 24(龙粳24)已在文献(Zhai et al. 2010, New Phytologist DOI: 10.1111/j.1469-8317.2010.03462.x)中公开。
为了进一步确认转基因构建体在转化后代的遗传稳定性,选择部分的转化后代T1株系,进行了抗性表现型/抗性基因型的共分离分析(图6)。结果表明,抗性表现型与抗性基因型完全共分离。亦即,转基因构建体在转化后代中能够稳定遗传、表达。
实施例5  水稻稻瘟病抗性基因Pi7基于Pik等位基因RNAi植株杂交后代的抗性及分子鉴定
为了进一步确认Pi7的功能,以及Pi7是否就是Pik 簇新的等位基因,申请人进行了基于Pik 等位基因(Pik-h)RNAi 之T1转化子杂交后代的功能丧失性实验(图1)。结果表明,Pik 等位基因RNAi纯合稳定的2个植株(kh4i-11和kh4i-26)与供体品种IRBL7-M的杂交F1植株都表现Pi7抗性功能的丧失。亦即,Pi7的抗性功能由于被Pik 等位基因RNAi 之T1转化子所含有的构建体而干涉(破坏)了(图7中HF4和HF6)。作为非特异性RNA干涉的对照,含有Pia的品种Aichi Asahi与Pik-h Pia是与Pik-h/Pi7 位置不同的非等位基因)之RNAi T1转化子 kh4i-9 遗传杂交的F1植株,其接种后的表现型仍为抗病(图7中HF10),说明Pia的抗性功能并没有被Pik-h之RNAiT1转化子所含有的构建体而干涉(破坏)。IRBL7-M是Pi7的供体品种,其接种后的表现型为抗病,说明接种所用的稻瘟病菌株CHL381是合适的。
为了确认杂交后代抗性功能的丧失是否与RNAiT1转化子所含有的构建体相关,对上述3个杂交组合的亲本及其后代进行了基于构建体特异性分子标记的分子鉴定。结果表明,特异性RNA干涉的后代(HF4和HF6)抗性表现型与其分子标记基因型相关(图8 之泳道3、5、6),而非特异性RNA干涉的后代(HF10)抗性表现型与其分子标记基因型不相关(图8 之泳道9、10)。
实施例6  Pi7基因的结构
 采用移步法对Pi7的DNA序列进行了测定。利用RACE技术,获得了Pi7的全长cDNA序列并对其进行了测序。Pi7基因DNA长度为16.9 kb (包含Pi7-1Pi7-2),其中,Pi7-1的全长cDNA序列为3723 bp,含有一个3429 bp的开放读码框,5’和3’非翻译区分别为104 bp和190 bp。通过比较基因组DNA和cDNA序列,发现该基因的开放读码框含有2个内含子和3个外显子(图9 A)。另一个组成基因Pi7-2的全长cDNA为3690 bp,含有一个3066 bp的开放读码框,5’和3’非翻译区分别为380bp和244bp。通过比较基因组DNA和cDNA序列,发现该基因的开放读码框含有1个内含子和2个外显子,而在5’非翻译区内含有一个内含子(图10 A)。
实施例7  Pi7抗性蛋白的结构
Pi7基因包含的2个组成基因编码的蛋白序列如序列表中Pi7 SEQ ID No.3和Pi7SEQ ID No. 4所示。
Pi7-1基因编码1个由1142个氨基酸残基组成的蛋白多肽,分子量为126.60 KD,等电点为6.46。利用COIL分析表明该蛋白多肽具有CC (coiled-coil) 结构域。Pi7-1蛋白属于NBS-LRR蛋白,NBS结构域中保守的kinase 1a (GLPGGGKTTVAR)位于该多肽的第290个氨基酸残基;kinase 2(NKKYLIVIDDIW)位于该多肽的第376个氨基酸残基;kinase 3a (DLGGRIIMTTRLNSI)位于该多肽的第402个氨基酸残基, GLPL (EDSPCYDIVNMCYGMPLALIW) 位于该蛋白多肽461个氨基酸残基。而该蛋白的C-端的610-960个氨基酸残基为16个不完整LRR重复,其亮氨酸含量为14.0%,其C末端还有个非LRR结构(CNL)的氨基酸序列(图9 B)。图中双下线标示的氨基酸序列为Pi7基因特异性的氨基酸替换(substitution),该位点与下述另一个组成基因的基因特异性氨基酸替换位点结合起来,可以鉴别Pi7基因与其他等位基因(Pik, Pik-m, Pik-p, Pik-s)的不同(详见实施例9)。
Pi7-2基因编码1个由1021个氨基酸残基组成的蛋白多肽,分子量为114.57 KD,等电点为8.64。利用COIL分析表明该蛋白多肽没有CC结构域,但是利用更为强大的预测工具Paircoil2分析发现有CC结构域。Pi7-2蛋白属于NBS-LRR蛋白,NBS结构域中保守的kinase 1a (GFGGVGKTTIA)位于该多肽的第211个氨基酸残基;kinase 2(KSYILLIDDIW)位于该多肽的第330个氨基酸残基;kinase 3a (GGRIIVTTRFQAV)位于该多肽的第358个氨基酸残基, GLPL (EQVPEEIWKICGGLPLAIV)位于该多肽的第415个氨基酸残基,RNBS-D(CLLYLSIFPKGWK)位于该多肽的第488个氨基酸残基,MHDV(KTFQVHDMVLEYI)位于该多肽的第553个氨基酸残基。而该蛋白的C-末端的610-960个氨基酸残基为13个不完整LRR重复,其亮氨酸含量为17.0%(图10B)。图中双下线标示的氨基酸序列为Pi7基因特异性的氨基酸替换(substitution),该位点与上述另一个组成基因的基因特异性氨基酸替换位点结合起来,可以鉴别Pi7基因与其他等位基因(Pik, Pik-m, Pik-p, Pik-s)的不同(详见实施例9)。
实施例8  Pi7基因的表达特性分析
利用定量RT-PCR技术对Pi7基因的表达模式进行了分析。在抗病品种IRBL7-M接种后不同的时间点(0 hr, 12 hr, 24 hr, 72 hr, 120h)上采集叶片并提取其总RNA,利用反转录试剂盒SuperScriptTM Reverse Transcriptase II进行反转录cDNA第一条链的合成。RT-PCR的引物为,
RRT5F:GAAGCTCTGATCAACGGTATTCC,
RRT5R:TCTTTGATCATCTTCGGGATACG;
RRT17F:TGAACTTCCACGATTGGATCCAC,
RRT17R:ACATGGTTCTTGAATACATCATGTC 。
定量RT-PCR使用CFX96 Real-time PCR检测***和SYBR Premix Ex Taq试剂盒(宝生物公司),操作按照试剂盒说明进行。图11(左)为组成基因Pi7-1在不同的接种时间点的相对表达水平,由此可以看出,该基因的表达类型为,从12 hr—72 hr逐步上调,然后逐步下调。图11(右)为另一个组成基因Pi7-2在不同的接种时间点的相对表达水平,由此可以看出,该基因的表达类型为,12 hr—24 hr逐步上调,然后逐步下调。由此还可以看出,该基因在接种对照(H2O)和接种病原菌之间表现明显不同的诱导型表达。2个基因都表现为组成型表达,因为接种之前和之后都能检测到2个基因的表达。
实施例9  Pi7基因序列在分子标记辅助选择育种中的应用
如实施例7所述,在Pi7基因的2个组成基因中分别存在一个基因特异性的氨基酸替换位点,利用这2个位点分别开发基因特异性的分子标记Pi7-SNP-1 (Pi7-SNP-1F: GCAGGTCAGCCAAGCAAT,Pi7-SNP-1R:CAACCGTTGTTTTGCCTCC,扩增产物用限制性内切酶MseI进行酶切)和Pi7-SNP-2 (Pi7-SNP-2F: CGTGGAAGTTCAACAAAAGG,Pi7-SNP-2R:CAGCACCTGTATTATCCCAT,扩增产物用限制性内切酶NdeI进行酶切),二者结合既可用于鉴别Pi7基因与其他等位基因(Pik, Pik-pPik-m, Pik-s)的不同(扩增产物的酶切效果不同;图12之泳道1与泳道2-5比较),也可在杂交后代用于鉴定Pi7位点上的各种基因型,即Pi7/Pi7pi7/pi7的植株(酶切效果不同;图12之泳道1与泳道6-7比较)。这些信息可在分子标记辅助选择育种过程中加以应用,以提高育种的目的性和效率。
实施例10  遗传转化Pi7基因产生的抗性植株的应用
Pi7基因克隆到pCAMBIA1300等植物转化载体,导入EHA105等农杆菌菌株中,用于转化感病的水稻品种Longjing 24(龙粳24)及Q1063,共获得了285株转化植株,其中155株表现抗性反应(表1)。这说明可以用Pi7基因转化水稻感病品种,经过自交、纯化选择等一系列育种程序之后,即可产生抗病品种而应用于生产中。
序列说明
SEQ ID NO. 1 & 2是Pi7-1Pi7-2的核苷酸序列;SEQ ID NO. 3 & 4是SEQ ID NO. 1 & 2的编码产物;SEQ ID NO. 5 & 6是带有启动子的Pi7-1Pi7-2核苷酸序列。SEQ ID NO. 7 & 8是用来扩增Pi7-12的引物对;SEQ ID NO. 9 & 10和SEQ ID NO. 11 & 12分别是引物对RRT5F、RRT5R和RRT17F、RRT17R;SEQ ID NO. 13 & 14是引物对Pi7-SNP-1F和Pi7-SNP-1R;SEQ ID NO. 15 & 16是引物对Pi7-SNP-2F和Pi7-SNP-2R;SEQ ID NO. 17~26分别是Pi7-1的kinase 1a、kinase 2、kinase 3a、GLPL序列以及Pi7-2的kinase 1a、kinase 2、kinase 3a、GLPL、RNBS-D、MHD序列。
序列表
<110>  华南农业大学
<120>  稻瘟病抗性基因Pi7及其应用
<130>  *********
<160>  22   
<170>  PatentIn version 3.5
 
 
<210>  1
<211>  9101
<212>  DNA
<213>  稻属水稻(Orysa sativa L.)
 
<220>
<221>  5'UTR
<222>  (1)..(104)
 
<220>
<221>  CDS
<222>  (105)..(668), (819)..(1387), (4160)..(6455)
 
<220>
<221>  3'UTR
<222>  (6456)..(6645)
 
<400>  1
aaccttgctc taattacact cggagtcgga gagtcaggag gtgagagagt agcactcaac        60
gcaaaagggg atcggccgag ccgccgatcg aggcgcgagt agggatggag gcggctgcca       120
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acgatgcggc gtgcaaggat ggcttgattg cggaggtccg ggagctgtcc tacgacctgg       360
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tcggtgagct caaggcaaga gttgaggagc atgtctccaa tcgcttctct gactggaagc       480
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ggagcaatga tgcttcacga tggcgcaagc gaaaaccgca tttcccgctc agaaaaacag       660
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atagccctca agatcattaa aaatatgtca tgttctttta ccttcataac aaccagtatc      2400
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ggcctatgtc ctaggtggcc atggctgact gcaaggagat atatttcttg caacggaaat      3120
tttcattgca aaagctgaaa atcgttgcga tatgtaccta ttgtgacata attgaatcca      3180
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aaaggggtcg tctggtcagg aggtggattg cggaaggatt tgtgtcggaa gagaaagaag      4740
cagaaggtta ctttggcgag cttattaaca gaggatggat tacgcagcac ggagacaaca      4800
acagttataa ttactatgag atccaccccg tgatgctggc cttcctgaga tgcaagtcca      4860
aggagtacaa ttttttaaca tgcttgggtc tgggatctga tactagtact agtgcatcct      4920
ccccaaggtt gattcgccgg ctgtctcttc agggggggta tccagtggac tgcttgtcaa      4980
gcatgagtat ggatgtgtca cacacttgca gccttgtcgt ccttggtgac gtggcgcgac      5040
ccaagggaat ccccttctat atgtttaagc gcttgcgagt gttggacctt gaagataata      5100
aggatataca ggattctcat ctgcagggca tatgtgaaca gttaagcctc agagtgaggt      5160
accttggtct caagggaacg cggatccgaa agctccctca ggagatgagg aagctgaagc      5220
atttggagat tttgtatgtg gggagcactc ggatcagtga acttccgcaa gagattggag      5280
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agatacggga gctgcagcat ctgcacactc tggacgtgag gaacactcca atcagtgagc      5400
tcccgccgca ggttggcaag ctgcagaatc tcaagattat gtgcgtgagg agcactgggg      5460
ttagggagct cccaaaggag attggggagc tgaatcatct acagactctg gacgtgagaa      5520
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ttgccggtga cagtggcgat ggcgtgcggt tgcccgaagg cgtctgcgaa gctctgatca      5640
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caactctaca tgatactcaa aactgatttc ttacctccct ttgattgtag aaaaaacatg      6600
ggaagtttgg aggatttcaa tcctatgaaa aggactttga gaaacaaatt acggaatcct      6660
atcttttcct ttaaaagata tataatagaa aatcctatag agatttttat aggaaagtta      6720
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cacctaatca ggggcggttc tagtgggtgg tccaggtgat ccctggacca ccctaaaatt      6840
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aagttcaaag gtcagtagac atttcttgtt ggttttttgc aatgttgccc tatgcagtag      7380
tgagtagtca gtactcagta gtagtgctag tgaaaaattt ctgccttgag tgtagtgaaa      7440
agcaagctga gaaatagcat gtgtgacaaa ttattaaatg atggtttaat cacatctatt      7500
gagcgggtta ttttctctca agttagcaaa gaagacatta tgcataattt catgtctata      7560
tatgaacgga gagtagaaaa gaagtagggt tttgtaatct tctacttatc tattataaga      7620
tatttgaatg attatgttct aactttcgta acttcaaatt tagatgttgg ttttaagcaa      7680
gttgtgatgt tgtgagatat attgctacat ttcaattata tttttattat ttttgacaca      7740
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tagactttta gatacgaatg tgaacaaacg tcctcatcaa tcttgcctgc tgataaagca      8460
accgcagcta ccacgcacta tgcagggatc gatcgatcga tggatggaca tattattact      8520
caacaaagta gaggcattaa tccgcttgca gactaatcag attcaggcga cagcacgcgg      8580
ctgctgattc atcagatggc attgcttcaa attgttcgct ttcaccatgc cctgcaccat      8640
gcatcattta gatatttatt ttactgtact catagtaatt aaccactgaa aattcactct      8700
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acgccaccag cagcggcggc gcaggcggca gctgctccac gcagctgtac tcgcactcgt      8880
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acgacgagac gccgacgatg ttctgcttcc tcaggctgtt c                          9101
 
 
<210>  2
<211>  7630
<212>  DNA
<213>  稻属水稻(Orysa sativa L.)
 
<220>
<221>  5'UTR
<222>  (1)..(1232)
 
<220>
<221>  CDS
<222>  (1233)..(2224), (2389)..(4462)
 
<220>
<221>  3'UTR
<222>  (4463)..(4706)
 
<400>  2
ggcctccgcc caaaagcctc acccccaagg ccccaatctt cccaccgcgc cgctgtcccc        60
cccccccccc ccccccccaa tcttctggcc tggccagctc tggtcggagg agggttcagt       120
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cgtcgcaact tgcaaataaa aaggttcaga tcggaaaatg gaaataccgt acacagtagt       360
ctatagagaa tcgactagta tttcctgact gtaagtaagg aagttgtagg taccatgttc       420
tgatgattat ctttgaagct tggaggggga caaaaagttg ggagagaaac aagaatgtat       480
ttgttcactt gattgggggc agtaggtaaa atctcagcgt taggaatttg cacctcttta       540
ttaagtttga ctaaatttat agaaaaaaat tagcaacact taaaacacca aattagtttc       600
attgaatcca acattgaata tattttgata atatgtttac tttgtgttca aaatgttact       660
atatttttct ataaatttga tcaaatttca ataagtttga ctagaaaaaa aagtcaaacc       720
gacttataat atgaatataa atggagggag tagattataa attatcttta ttataatact       780
ttgagtgtac aaacgaatga ataaagttta caaagttgaa aagttatttt taaatactat       840
tccgataaac ctgtatatag agaacttgtg aaaaaaaaca ccgtttgaaa tgtgtctgtg       900
ataatctata agaggaacgg ggcctaaata tattcctttt ttcctacgaa aatgcaagaa       960
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tcacaagccc tcagatcatt ggtataaagg agcctgtggg gatgaagacg gtcatggagg      1800
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tcaatagtat tctgagtcaa gtcagcaatc aggagcaggg cagcagcaca acaattagtg      2040
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ccactctaaa tctaatgttt atttccttct atacacagca caactccatc ttttgaatgg      2340
gttttatttt tctcacttgt gctcattttt tttttatcat ctctgcagtt atatcctctt      2400
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cttattcaat acaagtattt gtgaatcaaa gataagaaaa gatagcaaca aagtagacga      2640
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tgctaatgag aagcaagggt taacccagga aagagttgca gaggcatact ttaatcaact      3000
cacaagaagg aacttagtac gtcccatgga gcatggcagc aatgggaagg taaaaacgtt      3060
tcaagttcat gacatggttc ttgaatacat catgtccaaa tcaatcgaag agaattttat      3120
tactgtggtt ggtggacact ggcagatgac tgcaccaagc aataaagtcc gtcgactgtc      3180
gatgcaaagc agtggatcca atcgtggaag ttcaacaaaa ggcctgaact tggctcaagt      3240
gagatcactg acggtgtttg ggaacctgaa ccatatgcca ttccattcat tcaactatgg      3300
gataatacag gtgctggatc ttgaggactg gaagggtttg aaagagagac atatgacgga      3360
gatatgtcaa atgcttttac tcaagtattt gagcatccga cgaacagaaa tttccaaaat      3420
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cccgtcgcct caaggaaaaa caaaggagcc cgcaaagaaa ggattcttat cccaagaaaa      3660
aggtaaaggc gcaatgaaag cactccgtgt actgtcaggg attgagattg ttgaggaatc      3720
atcagaagta gctgcaggcc ttcatcagtt gacagggcta aggaagcttg ccatatacaa      3780
gctcaatata acaaagggtg gtgatacctt caaacaatta cagtcctcca ttgagtacct      3840
tggcagctgt ggtctgcaga ctctggccat caatgatgag aattctgaat ttatcaactc      3900
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aacagttctt aggactgaaa ctttggagat cctccacatt ttaccttcat tgttttccct      4080
caccttcgcc ttttcactta gtgcagcgaa gcaggatcag gacataataa aggacatcct      4140
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tcttaagctg cttcgcttct ttgcaccttt agtgccgaag ctcagctttt tggacaagaa      4260
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atagaagtgg tgaaagttca agtttagttg agttgatcac cttctgcatg cattgttgca      7500
gccgagtagg attttagggc tctagccttc tgcagacata tctcagcgtc tctccagatt      7560
gagagactgg agtacaggtt tgcaagtcct tgccatattt caaactcact tacactgtca      7620
ttctgtccct                                                             7630
 
 
<210>  3
<211>  1142
<212>  PRT
<213>  稻属水稻(Orysa sativa L.)
 
<400>  3
Met Glu Ala Ala Ala Met Ala Val Thr Ala Ala Thr Gly Ala Leu Ala
1               5                   10                  15     
Pro Val Leu Val Lys Leu Ala Ala Leu Leu Asp Asp Gly Glu Cys Asn
            20                  25                  30          
Leu Leu Glu Gly Ser Arg Ser Asp Ala Glu Phe Ile Arg Ser Glu Leu
        35                  40                  45             
Glu Ala Val His Ser Leu Leu Thr Pro Asn Ile Leu Gly Arg Met Gly
    50                  55                  60                  
Asp Asp Asp Ala Ala Cys Lys Asp Gly Leu Ile Ala Glu Val Arg Glu
65                  70                  75                  80 
Leu Ser Tyr Asp Leu Asp Asp Ala Val Asp Asp Phe Leu Glu Leu Asn
                85                  90                  95     
Phe Glu Gln Arg Arg Ser Ala Ser Pro Phe Gly Glu Leu Lys Ala Arg
            100                 105                 110        
Val Glu Glu His Val Ser Asn Arg Phe Ser Asp Trp Lys Leu Pro Ala
        115                 120                 125            
Ala Ser Leu Pro Pro Ser Ser Val His Arg Arg Ala Gly Leu Pro Pro
    130                 135                 140                
Pro Asp Ala Glu Leu Val Gly Met Asp Lys Arg Met Glu Glu Leu Thr
145                 150                 155                 160
Lys Leu Leu Glu Gln Gly Ser Asn Asp Ala Ser Arg Trp Arg Lys Arg
                165                 170                 175    
Lys Pro His Phe Pro Leu Arg Lys Thr Gly Leu Lys Gln Lys Ile Val
            180                 185                 190        
Ile Lys Val Ala Met Glu Gly Asn Asn Cys Arg Ser Lys Ala Met Ala
        195                 200                 205            
Leu Val Ala Ser Thr Gly Gly Val Asp Ser Val Ala Leu Val Gly Asp
    210                 215                 220                
Leu Arg Asp Lys Ile Glu Val Val Gly Tyr Gly Ile Asp Pro Ile Lys
225                 230                 235                 240
Leu Ile Ser Ala Leu Arg Lys Lys Val Gly Asp Ala Glu Leu Leu Gln
                245                 250                 255    
Val Ser Gln Ala Lys Lys Asp Val Lys Glu Thr Thr Pro Met Leu Ala
            260                 265                 270        
Pro Val Lys Ser Ile Cys Glu Phe His Lys Val Lys Thr Val Cys Ile
        275                 280                 285            
Leu Gly Leu Pro Gly Gly Gly Lys Thr Thr Val Ala Arg Glu Leu Tyr
    290                 295                 300                
Asp Ala Leu Gly Thr His Phe Pro Cys Arg Val Phe Val Ser Val Ser
305                 310                 315                 320
Pro Ser Ser Ser Pro Ser Pro Asn Leu Thr Lys Thr Leu Ala Asp Ile
                325                 330                 335    
Phe Ala Gln Ala Gln Leu Gly Val Thr Asp Thr Leu Ser Thr Ser Tyr
            340                 345                 350        
Gly Gly Ser Gly Thr Gly Arg Ala Leu Gln Gln His Leu Ile Asp Asn
        355                 360                 365            
Ile Ser Ala Phe Leu Leu Asn Lys Lys Tyr Leu Ile Val Ile Asp Asp
    370                 375                 380                
Ile Trp His Trp Glu Glu Trp Glu Val Ile Arg Lys Ser Ile Pro Lys
385                 390                 395                 400
Asn Asp Leu Gly Gly Arg Ile Ile Met Thr Thr Arg Leu Asn Ser Ile
                405                 410                 415    
Ala Gly Lys Cys His Thr Asp Asp Asn Asp Val Phe Val Tyr Glu Val
            420                 425                 430        
Gly Asp Leu Asp Asn Asn Asp Ala Leu Ser Leu Ser Trp Gly Ile Ala
        435                 440                 445            
Thr Lys Ser Gly Ala Gly Asn Arg Ile Gly Thr Gly Glu Asp Ser Pro
    450                 455                 460                 
Cys Tyr Asp Ile Val Asn Met Cys Tyr Gly Met Pro Leu Ala Leu Ile
465                 470                 475                 480
Trp Leu Ser Ser Ala Leu Val Gly Glu Ile Glu Glu Leu Gly Gly Ala
                485                 490                 495    
Glu Val Lys Lys Cys Arg Asp Leu Arg His Ile Glu Asp Gly Ile Leu
            500                 505                 510        
Asp Ile Pro Ser Leu Gln Pro Leu Ala Glu Ser Leu Cys Leu Gly Tyr
        515                 520                 525             
Asn His Leu Pro Leu Tyr Leu Arg Thr Leu Leu Leu Tyr Cys Ser Ala
    530                 535                 540                
Tyr His Trp Ser Asn Arg Ile Glu Arg Gly Arg Leu Val Arg Arg Trp
545                 550                 555                 560
Ile Ala Glu Gly Phe Val Ser Glu Glu Lys Glu Ala Glu Gly Tyr Phe
                565                 570                 575    
Gly Glu Leu Ile Asn Arg Gly Trp Ile Thr Gln His Gly Asp Asn Asn
            580                 585                 590        
Ser Tyr Asn Tyr Tyr Glu Ile His Pro Val Met Leu Ala Phe Leu Arg
        595                 600                 605            
Cys Lys Ser Lys Glu Tyr Asn Phe Leu Thr Cys Leu Gly Leu Gly Ser
    610                 615                 620                
Asp Thr Ser Thr Ser Ala Ser Ser Pro Arg Leu Ile Arg Arg Leu Ser
625                 630                 635                 640
Leu Gln Gly Gly Tyr Pro Val Asp Cys Leu Ser Ser Met Ser Met Asp
                645                 650                 655    
Val Ser His Thr Cys Ser Leu Val Val Leu Gly Asp Val Ala Arg Pro
            660                 665                 670        
Lys Gly Ile Pro Phe Tyr Met Phe Lys Arg Leu Arg Val Leu Asp Leu
        675                 680                 685            
Glu Asp Asn Lys Asp Ile Gln Asp Ser His Leu Gln Gly Ile Cys Glu
    690                 695                 700                
Gln Leu Ser Leu Arg Val Arg Tyr Leu Gly Leu Lys Gly Thr Arg Ile
705                 710                 715                 720
Arg Lys Leu Pro Gln Glu Met Arg Lys Leu Lys His Leu Glu Ile Leu
                725                 730                 735    
Tyr Val Gly Ser Thr Arg Ile Ser Glu Leu Pro Gln Glu Ile Gly Glu
            740                 745                 750        
Leu Lys His Leu Arg Ile Leu Asp Val Arg Asn Thr Asp Ile Thr Glu
        755                 760                 765            
Leu Pro Leu Gln Ile Arg Glu Leu Gln His Leu His Thr Leu Asp Val
    770                 775                 780                
Arg Asn Thr Pro Ile Ser Glu Leu Pro Pro Gln Val Gly Lys Leu Gln
785                 790                 795                 800
Asn Leu Lys Ile Met Cys Val Arg Ser Thr Gly Val Arg Glu Leu Pro
                805                 810                 815    
Lys Glu Ile Gly Glu Leu Asn His Leu Gln Thr Leu Asp Val Arg Asn
            820                 825                 830        
Thr Arg Val Arg Glu Leu Pro Trp Gln Ala Gly Gln Ile Ser Gln Ser
        835                 840                 845            
Leu Arg Val Leu Ala Gly Asp Ser Gly Asp Gly Val Arg Leu Pro Glu
    850                 855                 860                
Gly Val Cys Glu Ala Leu Ile Asn Gly Ile Pro Gly Ala Thr Arg Ala
865                 870                 875                 880
Lys Cys Arg Glu Val Leu Ser Ile Ala Ile Ile Asp Arg Phe Gly Pro
                885                 890                 895    
Pro Leu Val Gly Ile Phe Lys Val Pro Gly Ser His Met Arg Ile Pro
            900                 905                 910        
Lys Met Ile Lys Asp His Phe Arg Val Leu Ser Cys Leu Asp Ile Arg
        915                 920                 925             
Leu Cys His Lys Leu Glu Asp Asp Asp Gln Lys Phe Leu Ala Glu Met
    930                 935                 940                
Pro Asn Leu Gln Thr Leu Val Leu Arg Phe Glu Ala Leu Pro Arg Gln
945                 950                 955                 960
Pro Ile Thr Ile Asn Gly Thr Gly Phe Gln Met Leu Glu Ser Phe Arg
                965                 970                 975    
Val Asp Ser Arg Val Pro Arg Ile Ala Phe His Glu Asp Ala Met Pro
            980                 985                 990        
Asn Leu Lys Leu Leu Glu Phe Lys  Phe Tyr Ala Gly Pro  Ala Ser Asn
        995                 1000                 1005            
Asp Ala  Ile Gly Ile Thr Asn  Leu Lys Ser Leu Gln  Lys Val Val
    1010                 1015                 1020            
Phe Arg  Cys Ser Pro Trp Tyr  Lys Ser Asp Ala Pro  Gly Ile Ser
    1025                 1030                 1035            
Ala Thr  Ile Asp Val Val Lys  Lys Glu Ala Glu Glu  His Pro Asn
    1040                 1045                 1050            
Arg Pro  Ile Thr Leu Leu Ile  Asn Ala Gly Tyr Lys  Glu Ile Ser
    1055                 1060                 1065            
Thr Glu  Ser His Gly Ser Ser  Glu Asn Ile Ala Gly  Ser Ser Gly
    1070                 1075                 1080            
Ile Asp  Thr Glu Pro Ala Gln  Ala Gln His Asp Asn  Leu Pro Ala
    1085                 1090                 1095            
Val Arg  Asp Asp Tyr Lys Gly  Lys Gly Ile Leu Leu  Asp Gly Arg
    1100                 1105                 1110            
Cys Pro  Thr Cys Gly Arg Ala  Thr Lys Ile Glu Glu  Glu Thr Gln
    1115                 1120                 1125            
Asp Arg  Val Ala Asp Ile Glu  Ile Gln Thr Glu Thr  Thr Ser
    1130                 1135                 1140        
 
 
<210>  4
<211>  1021
<212>  PRT
<213>  稻属水稻(Orysa sativa L.)
 
<400>  4
Met Glu Leu Val Val Gly Ala Ser Glu Ala Thr Met Lys Ser Leu Leu
1               5                   10                  15     
Gly Lys Leu Gly Asn Leu Leu Ala Gln Glu Tyr Ala Leu Ile Ser Gly
            20                  25                  30         
Ile Arg Gly Asp Ile Gln Tyr Ile Asn Asp Glu Leu Ala Ser Met Gln
        35                  40                  45              
Ala Phe Leu Arg Asp Leu Ser Asn Val Pro Glu Gly His Ser His Gly
    50                  55                  60                 
His Arg Met Lys Asp Trp Met Lys Gln Ile Arg Asp Ile Ala Tyr Asp
65                  70                  75                  80 
Val Glu Asp Cys Ile Asp Asp Phe Ala His Arg Leu Pro Gln Asp Ser
                85                  90                  95     
Ile Ser Asp Ala Lys Trp Ser Phe Leu Leu Thr Lys Ile Tyr Glu Leu
            100                 105                 110        
Trp Thr Trp Trp Pro Arg Arg Val Ile Ala Ser Asn Ile Ala Gln Leu
        115                 120                 125            
Lys Val Arg Ala Gln Gln Ile Ala Asp Arg Arg Ser Arg Tyr Gly Val
    130                 135                 140                
Asn Asn Pro Glu His Leu Asp Ser Ser Ser Ser Ala Arg Thr Arg Ala
145                 150                 155                 160
Val Asn Tyr Glu Ile Ala Glu Tyr Gln Val Thr Ser Pro Gln Ile Ile
                165                 170                 175    
Gly Ile Lys Glu Pro Val Gly Met Lys Thr Val Met Glu Glu Leu Glu
            180                 185                 190        
Val Trp Leu Thr Asn Pro Gln Ala Glu Asn Gly Gln Ala Val Leu Ser
        195                 200                 205            
Ile Val Gly Phe Gly Gly Val Gly Lys Thr Thr Ile Ala Thr Ala Leu
    210                 215                 220                
Tyr Arg Lys Val Ser Asp Lys Phe Gln Cys Arg Ala Ser Val Ala Val
225                 230                 235                 240
Ser Gln Asn Tyr Asp Gln Gly Lys Val Leu Asn Ser Ile Leu Ser Gln
                245                 250                 255    
Val Ser Asn Gln Glu Gln Gly Ser Ser Thr Thr Ile Ser Glu Lys Lys
            260                 265                 270        
Asn Leu Thr Ser Gly Ala Lys Ser Met Leu Lys Thr Ala Leu Ser Leu
        275                 280                 285            
Leu Arg Gly Asn Cys Ile Cys Gln Pro Glu Asn Asp Gly Asn Pro Asp
    290                 295                 300                
Asn Thr Pro Ile Arg Leu Gln Glu Thr Thr Asp Asp Asp Gln Asn Pro
305                 310                 315                 320
Arg Lys Leu Glu Gln Leu Leu Ala Glu Lys Ser Tyr Ile Leu Leu Ile
                325                 330                 335    
Asp Asp Ile Trp Ser Ala Glu Thr Trp Glu Ser Ile Arg Ser Ile Leu
            340                 345                 350        
Pro Lys Asn Asn Lys Gly Gly Arg Ile Ile Val Thr Thr Arg Phe Gln
        355                 360                 365            
Ala Val Gly Ser Thr Cys Ser Pro Leu Glu Thr Asp Arg Leu His Thr
    370                 375                 380                
Val Asp Phe Leu Thr Asp Asp Glu Ser Gln Asn Leu Phe Asn Thr Ser
385                 390                 395                 400
Ile Cys Glu Ser Lys Ile Arg Lys Asp Ser Asn Lys Val Asp Glu Gln
                405                 410                 415     
Val Pro Glu Glu Ile Trp Lys Ile Cys Gly Gly Leu Pro Leu Ala Ile
            420                 425                 430        
Val Thr Met Ala Gly Leu Val Ala Cys Asn Pro Arg Lys Ala Cys Cys
        435                 440                 445             
Asp Trp Ser Lys Leu Cys Lys Ser Leu Phe Pro Glu Gln Glu Thr Pro
    450                 455                 460                
Leu Thr Leu Asp Gly Val Thr Arg Ile Leu Asp Cys Cys Tyr Asn Asp
465                 470                 475                 480
Leu Pro Ala Asp Leu Lys Thr Cys Leu Leu Tyr Leu Ser Ile Phe Pro
                485                 490                 495    
Lys Gly Trp Lys Ile Ser Arg Lys Arg Leu Ser Arg Arg Trp Ile Ala
            500                 505                 510        
Glu Gly Phe Ala Asn Glu Lys Gln Gly Leu Thr Gln Glu Arg Val Ala
        515                 520                 525            
Glu Ala Tyr Phe Asn Gln Leu Thr Arg Arg Asn Leu Val Arg Pro Met
    530                 535                 540                
Glu His Gly Ser Asn Gly Lys Val Lys Thr Phe Gln Val His Asp Met
545                 550                 555                 560
Val Leu Glu Tyr Ile Met Ser Lys Ser Ile Glu Glu Asn Phe Ile Thr
                565                 570                 575    
Val Val Gly Gly His Trp Gln Met Thr Ala Pro Ser Asn Lys Val Arg
            580                 585                 590        
Arg Leu Ser Met Gln Ser Ser Gly Ser Asn Arg Gly Ser Ser Thr Lys
        595                 600                 605            
Gly Leu Asn Leu Ala Gln Val Arg Ser Leu Thr Val Phe Gly Asn Leu
    610                 615                 620                
Asn His Met Pro Phe His Ser Phe Asn Tyr Gly Ile Ile Gln Val Leu
625                 630                 635                 640
Asp Leu Glu Asp Trp Lys Gly Leu Lys Glu Arg His Met Thr Glu Ile
                645                 650                 655    
Cys Gln Met Leu Leu Leu Lys Tyr Leu Ser Ile Arg Arg Thr Glu Ile
            660                 665                 670        
Ser Lys Ile Pro Ser Lys Ile Gln Lys Leu Glu Tyr Leu Glu Thr Leu
        675                 680                 685            
Asp Ile Arg Glu Thr Tyr Val Arg Asp Leu Pro Lys Ser Ile Val Gln
    690                 695                 700                
Leu Lys Arg Ile Ile Ser Ile Leu Gly Gly Asn Lys Asn Thr Arg Lys
705                 710                 715                 720
Gly Leu Arg Leu Pro Gln Glu Lys Ser Lys Lys Pro Ile Lys Asn Pro
                725                 730                 735    
Ser Pro Gln Gly Lys Thr Lys Glu Pro Ala Lys Lys Gly Phe Leu Ser
            740                 745                 750        
Gln Glu Lys Gly Lys Gly Ala Met Lys Ala Leu Arg Val Leu Ser Gly
        755                 760                 765            
Ile Glu Ile Val Glu Glu Ser Ser Glu Val Ala Ala Gly Leu His Gln
    770                 775                 780                
Leu Thr Gly Leu Arg Lys Leu Ala Ile Tyr Lys Leu Asn Ile Thr Lys
785                 790                 795                 800
Gly Gly Asp Thr Phe Lys Gln Leu Gln Ser Ser Ile Glu Tyr Leu Gly
                805                 810                 815    
Ser Cys Gly Leu Gln Thr Leu Ala Ile Asn Asp Glu Asn Ser Glu Phe
            820                 825                 830        
Ile Asn Ser Leu Gly Asp Met Pro Ala Pro Pro Arg Tyr Leu Val Ala
        835                 840                 845            
Leu Glu Leu Ser Gly Lys Leu Glu Lys Leu Pro Lys Trp Ile Thr Ser
    850                 855                 860                
Ile Thr Thr Leu Asn Lys Leu Thr Ile Ser Val Thr Val Leu Arg Thr
865                 870                 875                 880
Glu Thr Leu Glu Ile Leu His Ile Leu Pro Ser Leu Phe Ser Leu Thr
                885                 890                 895    
Phe Ala Phe Ser Leu Ser Ala Ala Lys Gln Asp Gln Asp Ile Ile Lys
            900                 905                 910         
Asp Ile Leu Glu Asn Asn Lys Leu Asp Ser Asp Gly Glu Ile Val Ile
        915                 920                 925            
Pro Ala Glu Gly Phe Lys Ser Leu Lys Leu Leu Arg Phe Phe Ala Pro
    930                 935                 940                 
Leu Val Pro Lys Leu Ser Phe Leu Asp Lys Asn Ala Met Pro Ala Leu
945                 950                 955                 960
Glu Ile Ile Glu Met Arg Phe Lys Asp Phe Glu Gly Leu Phe Gly Ile
                965                 970                 975    
Glu Ile Leu Glu Asn Leu Arg Glu Val His Leu Lys Val Ser Asp Gly
            980                 985                 990        
Ala Glu Ala Ile Thr Lys Phe Leu  Val Asn Asp Leu Lys  Val Asn Thr
        995                 1000                 1005            
Glu Lys  Pro Lys Val Phe Val  Asp Gly Ile Val Thr  Ala
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gccaataata ctgcactgca ttcgcagact cgttgactga ctcgtggtca tgccgtttct       120
ccctaatatt tcctccgtcc tttaatataa tattaaagtc tttaatatta tacttgtact       180
actccctcca ttataaaata taagtcataa ccacccctaa cccaaacacc aagaaaataa       240
ttattattat cttgtagttt agaacatcct aataaataca atgcatgcat ccaatagaat       300
cagagagcat gaataataat ttaataaaaa agaggtcata gttaattgcc tatatgcatg       360
catgccttat attatgaaac atctaagaaa agtggttgtg ccttatatta tggaatagag       420
ggagtcctat ttaaccattt atcttatttt aaaaaaatta tgcaaataat aaaaataaaa       480
agttgtgctt aaaagatttt agataataaa ataagtaaaa gaaaattaaa taataatttt       540
caaacttttt tttaataaaa cgaaggatcg tactccctcc attctaaatt gatctacgta       600
tttcataggt acaccaagac caagaaaaac taataactct ttcatattat atttactcta       660
acaacaaact caatgcatgc atcatcccca atatttccta gccaatagca aatcaagata       720
ttgcatgtgg gttataaata cttgtgtgca tggaagcatg catcaatgtc catttactcc       780
aatgcacaca aataacgaat agacttaata aatgaacaca aatatataga tcatttagga       840
ataacctaaa aaaactatat atagatcaat ttagaatgaa gggagtacaa agtaaaatgt       900
taaaatacct tatattagag aacaaacgaa ctaattatgt gaaagcagtt ctctaaccca       960
ttgcgagagg accgagaaaa ataccaccac tttaagagca gttacaatag caggctataa      1020
gccaactgca aacatatttt aaggagataa ataaggagag agaagggtag cgggctatag      1080
atttgtagcc aactgtagca cagactccaa gacacagtgt gtatgacagg tgggaccagg      1140
tattaatagt atagtacttg tatgaataag ctattagatt ggctataaat aaattgaagc      1200
tactacttgg ctgtactgtt aaccttgctc taattacact cggagtcgga gagtcaggag      1260
gtgagagagt agcactcaac gcaaaagggg atcggccgag ccgccgatcg aggcgcgagt      1320
agggatggag gcggctgcca tggccgtaac cgcagccacg ggggccttgg cgcccgtgct      1380
agtgaagctg gccgctttgc tggacgacgg ggagtgcaat cttctggagg ggagccggag      1440
cgacgcagag ttcatcagat ccgagctgga ggccgttcat tctctcctca ccccaaatat      1500
cttggggagg atgggggatg acgatgcggc gtgcaaggat ggcttgattg cggaggtccg      1560
ggagctgtcc tacgacctgg atgatgccgt cgacgacttc ttggagctca atttcgagca      1620
gcgaagaagc gcaagccctt tcggtgagct caaggcaaga gttgaggagc atgtctccaa      1680
tcgcttctct gactggaagc taccggcggc gagccttccg ccgtcgtcgg tacaccgccg      1740
agctggcttg ccgccaccag atgcagagct ggtggggatg gacaaacgta tggaagagct      1800
caccaaattg ctggaacaag ggagcaatga tgcttcacga tggcgcaagc gaaaaccgca      1860
tttcccgctc agaaaaacag ggctaaaggt acggttggat ctcgattctt cacaaatata      1920
gcttcctccg atagcagtgc caatgaattt gtttacttct ctcttgattc tttaatttgg      1980
aagtactgta taacaaacat ggagggatcg tcatttaact taattttttt tgttgcagca      2040
aaaaatcgtg atcaaggttg ccatggaggg caataattgc cgttcaaaag caatggcttt      2100
agttgcgagc actggaggag tggactcggt tgcgctcgta ggtgatctaa gagacaagat      2160
agaggtggtc ggttatggca ttgaccccat caagctgatc tccgcgctcc ggaagaaggt      2220
gggcgatgcg gagttgctgc aggtcagcca agcaaaaaaa gatgtgaagg agacgacgcc      2280
gatgcttgcg ccggtgaaat ccatatgtga atttcacaag gtcaaaacag tttgcatcct      2340
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gcacttccca tgccgggttt tcgtgtcagt ctctccaagt tctagtccca gtcccaatct      2460
cacaaagact cttgcagaca ttttcgctca agcacaacta ggagtaaccg atacacttag      2520
cacaccatat ggtgggagtg ggaccgggag agctcttcaa caacatctca tcgacaacat      2580
atcagctttc ctcctcaaca aaaagtaagc aatatcttat atctcttatc tagcttgtcc      2640
ttaatccggc ttcccaaatt aaagtgaaca ggctatatgt ccatataatg ttgggttttt      2700
ttttttctgt cctcgatgag gtatatatca agatatgcca aacttttttt aattagcgtt      2760
actttattct acctagtaaa tagatacaga aatggggcag gcccctcctt tgtgacaggc      2820
caatggtttt atgatgtgga aacaactccc ttatcactga agctcttgct attactcgtg      2880
atggtactga tcttgcaaag gcttgcagta tttgtaaatc cacagggagt ggtcatcttt      2940
ttttttttaa gataatgaat agaaatctgg cctctatata gaaagccaaa ggttacacaa      3000
gtgcatacac tccaaatctc aaagctgaga aacacgaaaa acaaacgacc aaaaagaaaa      3060
gacgataaga ttaagtttca agcttttcct ccttgcttca gaaaacaggg aaatgcagag      3120
ctagcccgct cttcccctgc catgccctct cactgccatt gcaactacca caaaagctcc      3180
cctgtttcgc cgtgagcgaa gggaggggat ggaactagtc tgctgctttg ttgtcgccaa      3240
gcactggttt catgctgccc aaacaaccta tgccccgcta gcgataacga gtctgttgcc      3300
gccatgctgt tgtcgctgga gagcacttgt cgctgctcag ctatgtgtta agtaagctac      3360
taacaatctc tccattctct tgtagactgc ttataaaaga ttgtacttca actttttatt      3420
aatgaaatag agttcctgcc ttacaacaac aagaacgaga gagagagaga gagccaatat      3480
cacgagttag cactgtgaag acttcctgac tgttatgtct tcaagaacag tataaaagca      3540
tttgccacta taaaaatatg atagccctca agatcattaa aaatatgtca tgttctttta      3600
ccttcataac aaccagtatc acaaatatga aaacatttaa aggaaaatca gtatttgcca      3660
tttatgtaaa gaaaaactag actagaactc tgggctttta ttttagtgca cactgtatac      3720
atgtgtgttc tttgacgtat atacttgata ttttttcaaa aacttttggg ggcatatctg      3780
taacccatgc cccatgcatc caaagtagta gtgagacaac tttcgtatca atggacatgt      3840
ggcattaaat ttaatcccaa tatttgttct ctcgaagtcc tgaacatata attggacaaa      3900
attatataat ttaattaggc caattgagcc atatatacac acactataag aaacttctac      3960
aaaacaaaca ttcgctcctt ttaggttttg accagtctat acatgaacca gccaacggtg      4020
tgctggtctg actataaatg tttttttaga gagtaaaggc accttccagt acctctctcg      4080
aggacagtaa aaacacccat gctttaaggt tatgaacaac aaagcataga acaaccacaa      4140
gaaaaaaaaa aacaactaga acaagttctg gaactagtta gggattcggg aagccattgc      4200
ttgctggctt gggacaagct atgcctgcca ttggactatg gtggagactg ggcataaagg      4260
atctcaatct cttggagatt ggcctatgtc ctaggtggcc atggctgact gcaaggagat      4320
atatttcttg caacggaaat tttcattgca aaagctgaaa atcgttgcga tatgtaccta      4380
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gcaatgattt tccgatggtt gcataaaaag gtgctattac aatggttttg cattgctatt      4500
gcaacaactt gatatgtcat aggtatttat tgcaacagtt tgtaccatgc tgcaataaga      4560
tttcgcaaca cagacctatt cattaaatag cctatttcca cacattcatt tttgtggcaa      4620
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gcagtaactt attagcacat ttaatttttt actaaattta tattgattca actatttcaa      4740
catcattcaa tacagtaaat actggaaaat gcaagcaatc tccaaaaatt caccaataag      4800
agaaacgaat taaatcatat acacaattat ttcacaccgt acagtgcact taagtgtagg      4860
aaatataatg ctatatacat ttccaaccct caatacaggt tctgtaaata atgaaaagaa      4920
acatcaattt gatttcttga ccggtccctc tgagacacac agtgctttcc tcagcaacat      4980
cgttgccgat ctatgtaact tgtaaactcc ttgtgcttaa taaattctgg ccagggttac      5040
ttcagcctgc atggcgaaaa aaaagaactt gttagggaga tcgcaaacaa atgttagctg      5100
ccccatttct tctctactga ccataaaagc tctaggatca ggtcatgaaa acaatgccgt      5160
cagaccggaa atactcaaga ttcagaacac gactcctagg aactgcaagt ttaaatttca      5220
acaaaagcaa aatacaacca gatgacaaac taatatatat cagctgactg ttcatctcaa      5280
gtggactcac atctgtgaaa ttgttagttc tatgcatata tgctaatgta atactaatat      5340
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atactattaa tacctggtcc cacctgtcat acacactgtg tcttggagtc tgtgctacag       180
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tttgcagttg gcttatagcc tgctattgta actgctctta aagtggtggt atttttctcg       300
gtcctctcgc aatgggttag agaactgctt tcacataatt agttcgtttg ttctctaata       360
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acccacatgc aatatcttga tttgctattg gctaggaaat attggggatg atgcatgcat       600
tgagtttgtt gttagagtaa atataatatg aaagagttat tagtttttct tggtcttggt       660
gtacctatga aatacgtaga tcaatttaga atggagggag tacgatcctt cgttttatta       720
aaaaaaagtt tgaaaattat tatttaattt tcttttactt attttattat ctaaaatctt       780
ttaagcacaa ctttttattt ttattatttg cataattttt ttaaaataag ataaatggtt       840
aaataggact ccctctattc cataatataa ggcacaacca cttttcttag atgtttcata       900
atataaggca tgcatgcata taggcaatta actatgacct cttttttatt aaattattat       960
tcatgctctc tgattctatt ggatgcatgc attgtattta ttaggatgtt ctaaactaca      1020
agataataat aattattttc ttggtgtttg ggttaggggt ggttatgact tatattttat      1080
aatggaggga gtagtacaag tataatatta aagactttaa tattatatta aaggacggag      1140
gaaatattag ggagaaacgg catgaccacg agtcagtcaa cgagtctgcg aatgcagtgc      1200
agtattattg gcctccgccc aaaagcctca cccccaaggc cccaatcttc ccaccgcgcc      1260
gctgtccccc cccccccccc cccccccaat cttctggcct ggccagctct ggtcggagga      1320
gggttcagtt ccatgggtgc gccccctgcc catccctcca cttctacttt cgtcttgaga      1380
tctcgccgtt tctgatctcc ttgccatggc aaccagttga tttggctgcc aagatcgtcc      1440
gtgctttgca aaggtgaaca atctttttct tcttgggctt tcactttgtt gtgttaatag      1500
actcagcgcc gtcgcaactt gcaaataaaa aggttcagat cggaaaatgg aaataccgta      1560
cacagtagtc tatagagaat cgactagtat ttcctgactg taagtaagga agttgtaggt      1620
accatgttct gatgattatc tttgaagctt ggagggggac aaaaagttgg gagagaaaca      1680
agaatgtatt tgttcacttg attgggggca gtaggtaaaa tctcagcgtt aggaatttgc      1740
acctctttat taagtttgac taaatttata gaaaaaaatt agcaacactt aaaacaccaa      1800
attagtttca ttgaatccaa cattgaatat attttgataa tatgtttact ttgtgttcaa      1860
aatgttacta tatttttcta taaatttgat caaatttcaa taagtttgac tagaaaaaaa      1920
agtcaaaccg acttataata tgaatataaa tggagggagt agattataaa ttatctttat      1980
tataatactt tgagtgtaca aacgaatgaa taaagtttac aaagttgaaa agttattttt      2040
aaatactatt ccgataaacc tgtatataga gaacttgtga aaaaaaacac cgtttgaaat      2100
gtgtctgtga taatctataa gaggaacggg gcctaaatat attccttttt tcctacgaaa      2160
atgcaagaag tattgcctaa tatattgata gagctgaagt tttaaagtaa aatgaaacat      2220
ttgcatgagg cagcactgga caaaaagcgc ttgtgaaaaa aatatgttcc aaatattatt      2280
aattcattca tggtatggtc tttattttca ttttcccccc ttatccatgg gcaggacacg      2340
gaaattctca gcaggttcgc gcttgatctg aactgtctgt ggctcatact ctcttgtgct      2400
tgcaacagct gaaagttgca gtgagaagta cagagaacaa gatggagttg gtggtaggtg      2460
cttccgaagc caccatgaaa tctctcttgg gcaagctggg caatcttcta gcccaggagt      2520
atgctctcat cagcggtatc cgtggtgaca tccagtacat caatgacgag cttgccagca      2580
tgcaggcctt cctccgtgat ctcagcaacg tgccagaggg tcacagtcat ggccaccgga      2640
tgaaggactg gatgaagcag atccgagaca tcgcctatga tgttgaggac tgtatcgatg      2700
actttgccca ccgcctccct caggattcca tcagcgatgc caaatggtcc ttcctactca      2760
caaaaatcta tgaactatgg acatggtggc cacgtcgtgt gattgcttcc aacattgccc      2820
aactcaaggt acgggcacaa cagatcgcag atcgacgtag tagatacgga gtgaacaacc      2880
cagaacacct tgacagtagc agcagtgcca ggacccgtgc tgtcaattac gaaattgctg      2940
agtatcaggt cacaagccct cagatcattg gtataaagga gcctgtgggg atgaagacgg      3000
tcatggagga gcttgaggtt tggttaacta atcctcaagc tgaaaatggg caagctgttc      3060
tgtccatagt cggttttgga ggtgtgggaa agactaccat tgccacagca ttgtacagaa      3120
aagtcagtga taaatttcag tgccgggcat cagtagctgt gtctcagaac tatgaccaag      3180
gcaaagtcct caatagtatt ctgagtcaag tcagcaatca ggagcagggc agcagcacaa      3240
caattagtga gaaaaagaac ctcacctcag gcgctaagag catgttgaag acagccctgt      3300
cactgctcag aggtaattgt atatgtcagc cagaaaatga tggaaaccct gataatacac      3360
caatcaggct gcaggaaaca acggacgatg atcaaaaccc cagaaaactg gaacagctcc      3420
tggccgaaaa gaggtacctt tttttgtaaa taaaattgct ttgcttatct gtaaattaac      3480
ttactcatcc cactctaaat ctaatgttta tttccttcta tacacagcac aactccatct      3540
tttgaatggg ttttattttt ctcacttgtg ctcatttttt ttttatcatc tctgcagtta      3600
tatcctcttg attgatgaca tttggtctgc cgaaacatgg gagagtatca gatcgatttt      3660
gcctaaaaat aataaaggcg gtagaataat agtgactaca agatttcaag ctgttggttc      3720
aacatgctcc cctcttgaaa ctgatcgttt gcatacagtt gattttctca ccgatgacga      3780
gtcccaaaac ttattcaata caagtatttg tgaatcaaag ataagaaaag atagcaacaa      3840
agtagacgag caagtccctg aggaaatatg gaaaatatgt gggggattgc ctttggccat      3900
agtcaccatg gctggtcttg tcgcctgcaa cccaaggaaa gcctgctgcg attggagtaa      3960
actttgcaaa tcattatttc cagagcaaga aactcctctt accctcgatg gtgttacaag      4020
gatactggat tgttgttaca atgatttgcc tgcggatctg aagacttgct tattgtactt      4080
gagtatattt ccgaagggtt ggaaaattag taggaaacgt ttgtcccggc gatggatagc      4140
tgaaggtttt gctaatgaga agcaagggtt aacccaggaa agagttgcag aggcatactt      4200
taatcaactc acaagaagga acttagtacg tcccatggag catggcagca atgggaaggt      4260
aaaaacgttt caagttcatg acatggttct tgaatacatc atgtccaaat caatcgaaga      4320
gaattttatt actgtggttg gtggacactg gcagatgact gcaccaagca ataaagtccg      4380
tcgactgtcg atgcaaagca gtggatccaa tcgtggaagt tcaacaaaag gcctgaactt      4440
ggctcaagtg agatcactga cggtgtttgg gaacctgaac catatgccat tccattcatt      4500
caactatggg ataatacagg tgctggatct tgaggactgg aagggtttga aagagagaca      4560
tatgacggag atatgtcaaa tgcttttact caagtatttg agcatccgac gaacagaaat      4620
ttccaaaatt ccctccaaga ttcagaaact tgagtacttg gaaactcttg acataaggga      4680
gacatatgtc agggacctgc ctaagtcaat agtccagcta aaacggatca ttagcatact      4740
tggagggaat aaaaacacac ggaaggggct gaggttgcct caagaaaaaa gtaagaagcc      4800
aattaaaaac ccgtcgcctc aaggaaaaac aaaggagccc gcaaagaaag gattcttatc      4860
ccaagaaaaa ggtaaaggcg caatgaaagc actccgtgta ctgtcaggga ttgagattgt      4920
tgaggaatca tcagaagtag ctgcaggcct tcatcagttg acagggctaa ggaagcttgc      4980
catatacaag ctcaatataa caaagggtgg tgataccttc aaacaattac agtcctccat      5040
tgagtacctt ggcagctgtg gtctgcagac tctggccatc aatgatgaga attctgaatt      5100
tatcaactca ctgggcgaca tgcccgcgcc tccaagatat cttgtcgccc ttgagctgtc      5160
tggcaagttg gagaagctac ccaagtggat caccagcatc actactctca acaagctaac      5220
catatctgta acagttctta ggactgaaac tttggagatc ctccacattt taccttcatt      5280
gttttccctc accttcgcct tttcacttag tgcagcgaag caggatcagg acataataaa      5340
ggacatcctt gagaataata aattggacag tgatggggaa atcgtcattc cagctgaagg      5400
attcaagagt cttaagctgc ttcgcttctt tgcaccttta gtgccgaagc tcagcttttt      5460
ggacaagaat gcaatgccag cactcgaaat cattgaaatg cggtttaaag acttcgaagg      5520
tctatttggc atcgaaatcc ttgaaaatct ccgtgaggtg catctcaaag ttagtgatgg      5580
ggcagaagca ataaccaagt tccttgtaaa tgatttgaag gttaatactg agaaaccaaa      5640
agtatttgtt gatggcatcg tcactgcatg agaagtaaaa ttgctgcaaa tcggagaact      5700
taccaatcat ctgaggcttc ccctctatta ttactctctt agaatatatt gttattattg      5760
ctcaccttgc aaaataaaat agggatggca tagcatattg ctacaacgta ccatggttcc      5820
atcatagttg atttcacttg tcattacagt gtctgttcag ttgtgttttc tattaataaa      5880
agggagatct ccgcaagaaa ccattattat acttatattc ggttattgaa ctctataaat      5940
gatgggattg ctatatttat ggtgccacaa tttccatgag tgcggtattt ttttttctag      6000
cagttggctg gtgttaagat ttgtgctgcc attgctcctc tattattggt gcccaaaatt      6060
acgctttgca ctatgttcac agttgtaaaa cttacctaaa tttcgtgtat tagtactgta      6120
atgttgtgat tttcgcgtcc agttatattt ttttctttgc cagaagtttg atttcaaggt      6180
atatctggta agcttcagcc ggattcgtta agtttttagt ttaatcagct aaacttttaa      6240
cagtatgcat gcactagttt ctcccgttat cttatccaat ataattaatg ggctaattgg      6300
atctatgcca ttacaaacat ggcaagattc agaaaaatgc tactacaatt tgtctattca      6360
tagctgtgct agtgaaattt tacaaaattg gaaccgtgct attgatatca cgttttccat      6420
ccatcttttc ttttttttcc ttttcttctt tatcccgtct tcttcccgca ccgacgagag      6480
gcgagtggcg gcgggaccgg caagcgatgg caggacctcg gcagctcagt ggtggcagcg      6540
gcaaaaggga aaggggaagg ggtaggagag aacctggccc gccgacgcaa gcatgttggt      6600
cgtcgtcttc cccgaggagc ttgagcagtg gcaatggtag aggaatccaa ggaggccgag      6660
gaggttgagc ggcactaatg gtagaggatg ccgaggaggt cgagcatcag cgagcttgcc      6720
ctgggtgggc gagtgaggga gagctctccc aagtgtctgc gaagctctca tcttcgtttt      6780
cctcatcccc actttgctcc tcttccacta ctgctgttga agctagcggc cctctctcac      6840
cagatctggg cggagctcaa gcgaggcgcc accaccgacg atggagcttc gcgtggaccc      6900
cacagcctca cccgattgcc atccctccta ccctcatcac tccatctcca agcccaaatc      6960
ccacctcccc caccggctcc tcctcctcag cccctgccgt ggcagccgag gccaccgatg      7020
ggccaaccct caacatcgtc tcgaagcagc tccgcgcact gtggaagaag cacaaccaaa      7080
tcctccagat ggaggagtcg ctcactggcg ggaggaagct gaacaaggag caggaggagg      7140
tgctccgatc caagcccatc gtcatcgcgc tcattgatga gctcgagcgg atgcgtgccc      7200
tgctcgccga cgccctcgcc gaggagctct cctcctgccc cgccccttcc ctatctgtca      7260
ctccctcctc ctccacctcc tccggcgctg atttgtccgt caaggatctc ctcacgctca      7320
tctacttcgg ctccctcttc gacgtcaagt cgcagatcga gttcgtcacc accatgctcg      7380
cacgctaagg agctagactg atgcatcacc tacgactatg tccgtccttg ccgcagcacg      7440
acttgctacg gtcccgcctc acgccccgtc gctcgccggt cccgccgcca cttgcttctc      7500
atcggtgcgg gaagaagatg ggagaaagaa ggaagaaaac gggaaaaaaa gagatggatg      7560
aaaaacgtga cagcaatagc acggttccaa tttcgtaaaa tttcaatggc accgctacga      7620
atagaagaat tgtagtagca tttttctgaa tcaacatatt tgtaatggca tggatccaat      7680
aaaccccaaa tttattttat gccaatacaa atattggcaa ctggtgtcat taacgtataa      7740
atgggtcgcc tacataaaac cttccgcgtc cttcttggtt gaacaggtaa ttaattgcaa      7800
ccattttctg aaaaaattga ctggaagtct gaaaccgtcc ctgctactcc ctgaatgctt      7860
tagttcaatc tctatgaagc tccatccaaa caaaatctcc agatgatatt tcattaaaaa      7920
catcatgtcc agaactgtcc agtatccaag aatggctatg atcttttctg aattctggac      7980
tcgggactta tattacatgt atcaaatcca gttattttct ggagctacac cagatgaaat      8040
caccaagtaa aacaattata taaggatggt gagttgttaa ttaattacag ctttgataga      8100
ccactctgtt tgttaatgcc tgacaagagt tcacaaagaa aaaaatacac aggattacaa      8160
aactttttag atactatctg atgtgtgtta attctctcaa atactatgta cctgaacaaa      8220
caagagagaa catgttgtga attgtgatct cctcatgcga gtgacctgaa actctctaca      8280
gggtcagact cctcaagcat cactgcagcc tggaaacaat cagcagcatc attgatcctc      8340
ccatcattcc tgtgaactct ccctaaatga agccaagcca tcctgttcgt aggctcaatt      8400
ctcagtgcat cagagaggaa gcatctcgct gcagggagat accttgaccc ttgcttgcag      8460
agaagtgcac caatggccac cttggatgga acatgctcta gctctatcga gaatgcgttg      8520
acgtaggcag ccagtgcctc cttgttctga tctcgcgcct cgagcatgaa acctgaactt      8580
atagcatcca cgagtcagat tttgatgttg aattcagttg aatgcagaga attgtcatgt      8640
tagtgttaca tagaagtggt gaaagttcaa gtttagttga gttgatcacc ttctgcatgc      8700
attgttgcag ccgagtagga ttttagggct ctagccttct gcagacatat ctcagcgtct      8760
ctccagattg agagactgga gtacaggttt gcaagtcctt gccatatttc aaactcactt      8820
acactgtcat tctgtccct                                                   8839
 
 
<210>  7
<211>  38
<212>  DNA
<213>  人工序列
 
<400>  7
ttttggcgcg ccggtgcggg aagaagacgg gataaaga                              38
 
 
<210>  8
<211>  38
<212>  DNA
<213>  人工序列
 
<400>  8
ttttggcgcg ccgccgacga tagcaaccga caggagtg                               38
 
 
<210>  9
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工序列
 
<400>  9
gaagctctga tcaacggtat tcc                                                23
 
 
<210>  10
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工序列
 
<400>  10
tctttgatca tcttcgggat acg                                                23
 
 
<210>  11
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工序列
 
<400>  11
tgaacttcca cgattggatc cac                                                23
 
 
<210>  12
<211>  25
<212>  DNA
<213>  人工序列
 
<400>  12
acatggttct tgaatacatc atgtc                                              25
 
 
<210>  13
<211>  18
<212>  DNA
<213>  人工序列
 
<400>  13
gcaggtcagc caagcaat                                                      18
 
 
<210>  14
<211>  19
<212>  DNA
<213>  人工序列
 
<400>  14
caaccgttgt tttgcctcc                                                     19
 
 
<210>  15
<211>  20
<212>  DNA
<213>  人工序列
 
<400>  15
cgtggaagtt caacaaaagg                                                    20
 
 
<210>  16
<211>  20
<212>  DNA
<213>  人工序列
 
<400>  16
cagcacctgt attatcccat                                                    20
 
 
<210>  17
<211>  12
<212>  PRT
<213>  稻属水稻(Orysa sativa L.)
 
<400>  17
 
Gly Leu Pro Gly Gly Gly Lys Thr Thr Val Ala Arg
1               5                   10         
 
 
<210>  18
<211>  12
<212>  PRT
<213>  稻属水稻(Orysa sativa L.)
 
 
<400>  18
Asn Lys Lys Tyr Leu Ile Val Ile Asp Asp Ile Trp
1               5                   10     
 
 
<210>  19
<211>  15
<212>  PRT
<213>  稻属水稻(Orysa sativa L.)
 
<400>  19
 
Asp Leu Gly Gly Arg Ile Ile Met Thr Thr Arg Leu Asn Ser Ile
1               5                   10                  15
 
 
<210>  20
<211>  20
<212>  PRT
<213>  稻属水稻(Orysa sativa L.)
 
<400>  20
 
Glu Asp Ser Pro Cyc Tyr Asp Ile Val Asn Met Cys Tyr Gly Met Pro Leu Ala Leu
Ile
1               5                   10                  15 
 
 
<210>  21
<211>  16
<212>  PRT
<213>  稻属水稻(Orysa sativa L.)
 
<400>  21
 
Val Leu Ser Ile Val Gly Phe Gly Gly Val Gly Lys Thr Thr Ile Ala
1                5                   10                 15
 
 
<210>  22
<211>  18
<212>  PRT
<213>  稻属水稻(Orysa sativa L.)
 
<400>  22
 
Leu Glu Gln Leu Leu Ala Glu Lys Ser Tyr Ile Leu Leu Ile Asp Asp Ile Trp
1               5                   10                  15
 
 
<210>  23
<211>  13
<212>  PRT
<213>  稻属水稻(Orysa sativa L.)
 
<400>  23
 
Gly Gly Arg Ile Ile Val Thr Thr Arg Phe Gln Ala Val
1               5                   10
 
 
<210>  24
<211>  20
<212>  PRT
<213>  稻属水稻(Orysa sativa L.)
 
<400>  24
 
Glu Gln Val Pro Glu Glu Ile Trp Lys Ile Cys Gly Gly Leu Pro Leu Ala Ile Val
1               5                   10                  15
 
 
<210>  25
<211>  13
<212>  PRT
<213>  稻属水稻(Orysa sativa L.)
 
<400>  25
 
Cys Leu Leu Tyr Leu Ser Ile Phe Pro Lys Gly Trp Lys
1               5                   10
 
 
<210>  26
<211>  13
<212>  PRT
<213>  稻属水稻(Orysa sativa L.)
 
<400>  26
Lys Thr Phe Gln Val His Asp Met Val Leu Glu Tyr Ile
1               5                   10

Claims (8)

1.稻瘟病抗性基因Pi7,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.根据权利要求1所述的稻瘟病抗性基因Pi7,其特征在于其编码的氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示。
3.权利要求1或2所述稻瘟病抗性基因Pi7的cDNA序列。
4.权利要求1或2所述稻瘟病抗性基因Pi7编码的蛋白质。
5.由权利要求1或2所述稻瘟病抗性基因Pi7或权利要求3所述cDNA序列与启动子构建的表达盒。
6.含有权利要求1或2所述稻瘟病抗性基因Pi7或权利要求3所述cDNA序列的表达载体。
7.权利要求1或2所述稻瘟病抗性基因Pi7、权利要求3所述cDNA序列、权利要求4所述蛋白质、权利要求5所述表达盒或权利要求6所述表达载体在制备转基因植物中的应用。
8.权利要求1或2所述稻瘟病抗性基因Pi7、权利要求3所述cDNA序列、权利要求4所述蛋白质、权利要求5所述表达盒或权利要求6所述表达载体在提高水稻抗稻瘟病抗性中的应用。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102732511A (zh) * 2012-03-08 2012-10-17 华南农业大学 稻瘟病抗性基因Pi7功能特异性分子标记Pi7FNP及其方法与应用
CN102732531B (zh) * 2012-03-23 2013-10-09 南京大学 一种水稻稻瘟病抗性基因RMg7或RMg8或RMg9及其应用
CN102747090B (zh) * 2012-07-02 2014-06-11 中山大学 水稻抗病基因OsLYP4及其应用
CN103409433A (zh) * 2013-08-12 2013-11-27 江苏省农业科学院 一个水稻稻瘟病广谱抗病新等位基因pi21t及其抗性应用
CN103421841B (zh) * 2013-08-15 2015-04-15 中国农业大学 水稻Os74蛋白及其应用
CN104404052B (zh) * 2014-09-11 2017-01-25 南京大学 一种水稻稻瘟病抗性基因RMg39及其应用
CN104293799B (zh) * 2014-09-11 2017-05-17 南京大学 一种水稻稻瘟病抗性基因RMg38及其应用
CN104372011B (zh) * 2014-09-11 2017-01-11 南京大学 一种水稻稻瘟病抗性基因RMg41及其应用
CN104845977B (zh) * 2014-12-22 2017-04-19 广东省农业科学院植物保护研究所 稻瘟病抗性基因Pi50及其制备方法与应用
CN106480051B (zh) * 2015-08-24 2020-06-19 中国种子集团有限公司 重组核酸片段RecCR010113及其检测方法
CN109280082B (zh) * 2018-10-19 2019-06-11 云南省农业科学院农业环境资源研究所 一种稻瘟病抗性基因Pi57及其编码蛋白与应用
CN113122649A (zh) * 2021-04-09 2021-07-16 武汉科技大学 一种用于筛选抗稻瘟病Pik位点新等位基因的引物和方法
CN113744800B (zh) * 2021-06-09 2022-06-24 华南农业大学 一套具有包容性且精准鉴别并挖掘稻瘟病Pik抗病等位基因家族的技术体系及应用和分子标记
CN113789403B (zh) * 2021-09-02 2022-09-06 华南农业大学 一组三套具有包容性且精准鉴别并挖掘稻瘟病Pid抗病基因家族等位基因的技术体系
CN116640774B (zh) * 2023-06-14 2024-02-09 江苏省农业科学院 水稻稻瘟病抗性基因Pik-W25及其应用

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1844393A (zh) * 2006-03-06 2006-10-11 华南农业大学 水稻稻瘟病抗性基因Pi37及其应用

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1844393A (zh) * 2006-03-06 2006-10-11 华南农业大学 水稻稻瘟病抗性基因Pi37及其应用

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Campbell MA et al.Debelopment of co-dominant amplified polymorphic sequence markers in rice that flank the magnaporthe grisea resistance gene Pi7(t) in recombinant inbred line 29.《Phytopathology》.2004,第94卷(第3期),302-307.
Debelopment of co-dominant amplified polymorphic sequence markers in rice that flank the magnaporthe grisea resistance gene Pi7(t) in recombinant inbred line 29;Campbell MA et al;《Phytopathology》;20040331;第94卷(第3期);302-307 *
冯淑杰 等.稻瘟病菌新无毒基因AvrPi7的遗传及物理作图.《科学通报》.2007,第52卷(第3期),283-290.
稻瘟病菌新无毒基因AvrPi7的遗传及物理作图;冯淑杰 等;《科学通报》;20070228;第52卷(第3期);283-290 *

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