CN101792790A - 动物源细菌耐药性的分析方法及实现所述分析方法的*** - Google Patents
动物源细菌耐药性的分析方法及实现所述分析方法的*** Download PDFInfo
- Publication number
- CN101792790A CN101792790A CN200910236970A CN200910236970A CN101792790A CN 101792790 A CN101792790 A CN 101792790A CN 200910236970 A CN200910236970 A CN 200910236970A CN 200910236970 A CN200910236970 A CN 200910236970A CN 101792790 A CN101792790 A CN 101792790A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- resistance
- animal derived
- bacterium
- data
- derived bacterium
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Images
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明涉及一种动物源细菌耐药性的分析方法,以及用于实现所述分析方法的***。所述***包括互联网、具备浏览器的客户端和服务器,所述服务器能够接受来自客户端传送的动物源细菌数据和检索请求,然后进行检索匹配,并把检索结果返回客户端。
Description
【技术领域】
本发明涉及数据分析处理方法,特别是一种用于分析动物源细菌对兽药的耐药性的方法。
【背景技术】
动物源细菌一旦产生耐药性,就意味着抗生素失去了应有的效果或作用,影响动物感染性疾病的治疗,危害动物健康。更为严重的是耐药性病原菌和耐药基因还会污染环境,从餐桌传递给人类,影响人类疾病的治疗效果。所以,动物源细菌耐药性问题还涉及到公共卫生问题,一旦任其发展,后果不可想象。
早在90年代中期,发达国家包括欧洲和美国等就意识到这个问题,成立了国家耐药性监测***。2000年1月WHO组建沙门氏菌全球监测网,对沙门氏菌、志贺氏菌等人类病原菌进行流行病学追踪和耐药性监测。通过监测细菌耐药性,掌握动物源细菌耐药性的流行动态,才能为决策部门提供基础数据,规范抗菌药的使用,控制细菌耐药性。
目前,我国动物源细菌耐药性是世界上最严重的国家之一,因此对耐药性的监控是一项必不可少的任务。取得耐药性监测基础数据,通过统计分析,才能提出合理的用药指导方针,指导养殖场合理使用抗生素;才能进一步预防耐药菌和耐药基因的扩散,保证动物性食品安全。
现阶段,我国兽医临床的耐药性统计分析主要靠人工统计,对耐药性各项指标(包括但不限于细菌的分离率、耐药率、多重耐药率、耐药谱)的分析,由于没有专门的分析软件或分析***,只能靠office excel办公软件及人工计算,统计操作繁琐,通常要花费大量时间和人力、物力,最后才能汇总上报到中国兽医药品监察所。有时候可能因数据过多还会出现错误。特别是不同年代细菌的耐药性分析,如果没有数据库储藏大量历史数据则难以实现。所以我国的动物源细菌耐药性监测***中监测数据的规范化统计分析和及时处理、上报是一项亟待解决的问题。
【发明内容】
[要解决的技术问题]
本发明的目的是解决现有的动物源细菌耐药性没有专门的规范化分析***,只能人工计算、整理,和监测数据不能及时统计分析和上报的问题,提供一种能够对动物源细菌耐药性的各项指标进行分析、判断的方法。本发明还提供能够实现上述分析、判断方法所用的***。
[技术方案]
为了实现上述目的,本发明提供一种动物源细菌耐药性的分析方法,所述分析方法包括以下步骤:
(1)采集动物源细菌,获得采集数据,所述细菌包括从不同地区、不同动物种类身上获得的的不同动物源细菌;
(2)对步骤(1)所得的动物源细菌进行耐药性测试,获得所述动物源细菌对药物的耐药性数据,所述耐药性测试包括:①纸片扩散法药敏试验;②肉汤稀释法药敏试验;所述耐药性数据包括:①用纸片扩散法药敏试验测得的所述动物源细菌的抑菌圈直径;②用肉汤稀释法药敏试验测得的所述动物源细菌的最小抑菌浓度。
(3)建立动物源细菌耐药性数据库,所述数据库包括所述动物源细菌的采集数据和耐药性数据;
(4)当需要对外来的动物源细菌耐药性数据进行分析时,首先获取所述外来的动物源细菌的采集数据,然后在步骤(3)所述数据库中进行检索,得到对应的动物源细菌,输出检索结果的其它数据部分,所述其它数据部分包括该动物源细菌的耐药性数据和检索条件以外的采集数据;
(5)对于步骤(4)的输出结果,
若:耐药性数据数值≥肉汤稀释法判断标准的耐药折点或耐药性数据数值≤纸片扩散法判断标准的耐药折点,判断该外来的动物源细菌的耐药性为耐药;
若:耐药性数据数值≤肉汤稀释法判断标准的敏感折点或耐药性数据数值≥纸片扩散法判断标准的敏感折点,判断该外来的动物源细菌的耐药性为敏感;
若:耐药性数据数值在肉汤稀释法或纸片扩散法判断标准的中介范围内,判断该外来的动物源细菌的耐药性为中介。
在本发明范围中,步骤(2)所述的耐药性测试的方法和判断标准优选地依据《动物源细菌抗微生物药物敏感性试验执行标准》(美国临床和实验室标准协会主编和出版,M31-A3,2008)和《抗微生物药物敏感性试验执行标准》(美国临床和实验室标准协会主编和出版,M100-S18,2008)中记载的方法。而细菌分类优选地参考陆承平编著的《兽医微生物学》(陆承平主编.兽医微生物学.第四版.中国农业出版社,2007)(第四版)。根据上述标准,药物一共分为16类48种,细菌分为13类21种,药敏实验方法包括纸片扩散法药敏试验和微量肉汤稀释法药敏试验,判断标准包括纸片扩散法和微量肉汤稀释法的耐药折点、敏感折点和中介。在本发明所述方法和***的使用过程中,随着执行标准的更新,可相应更新所述测试方式。
优选地,步骤(1)所述动物源细菌包括从猪、鸡、鸭、牛、羊、猫或狗身上采集的肠道杆菌:大肠杆菌、沙门氏菌、猪霍乱沙门氏菌;巴氏杆菌:多杀性巴氏杆菌、溶血曼海姆菌;放射杆菌属:胸膜肺炎放射杆菌;链球菌:α溶血性链球菌、β溶血性链球菌、无乳链球菌、缺乳链球菌、***炎链球菌;葡萄球菌:金黄色葡萄球菌、中间葡萄球菌;肠球菌:粪肠球菌;嗜血杆菌:睡眠嗜组织菌、流感嗜血杆菌;李斯特菌属;假单胞菌属:绿脓杆菌;变形杆菌属:奇异变形杆菌;肺炎链球菌;博德特菌属:支气管炎博德特菌;弯曲杆菌属:空肠弯曲菌、结肠弯曲菌;也可能包括从猪、鸡、鸭、牛、羊、猫或狗身上采集的其它细菌。
更优选地,步骤(1)所述的采集数据包括动物源细菌的采样人、采样日期、采样地点、来源动物的养殖场、样品来源、动物健康状况、动物生长期、采样部位、样品数量、测试方法、细菌名称、测试用药、饲料添加用药、治疗用药、细菌的保存状态。
在本发明范围内,步骤(2)所述药物包括16类共48种药,分别是氨基糖苷类:阿米卡星、庆大霉素、大观霉素、卡那霉素、链霉素;安沙霉素类:利福平;β-内酰胺/β-内酰胺酶抑制剂复合物:阿莫西林/克拉维酸、替卡西林/克拉维酸;β-内酰胺类/青霉素类:氨苄西林、苯唑西林、青霉素、替卡西林;β-内酰胺/其他类复合物:青霉素/新生霉素;碳氢霉烯类:亚胺培南;头孢菌素类:头孢噻吩、头孢唑林、头孢泊肟、头孢噻呋、头孢西丁、头孢曲松;氟喹诺酮类:达氟沙星、恩诺沙星、二氟沙星、马波沙星、奥比沙星、氧氟沙星、环丙沙星、萘啶酸、诺氟沙星;叶酸代谢途径抑制剂:复方新诺明、磺胺异恶唑、甲氧苄啶;糖肽类:万古霉素;可林胺类:克林霉素、吡利霉素;大环内酯类:红霉素、替米考星、土拉霉素、阿奇霉素、克拉霉素、替利霉素;氯霉素类:氯霉素、氟苯尼考;截短側耳素类:泰妙菌素;四环素类:四环素、强力霉素;多粘菌素类:多粘菌素B、多粘菌素E。
本发明还提供一种能够实现上述动物源细菌耐药性的分析方法的***,该***包括互联网、能够实现B/S架构具备浏览器的客户端和服务器,其中,所述服务器至少包括:
(1)动物源细菌耐药性数据库,所述数据库包括存储了动物源细菌的采集数据和耐药性数据;
(2)用于录入所述数据库的数据的装置;
(3)用于接收来自客户端通过互联网传送的来自客户端的动物源细菌的采集数据和检索请求的装置;
(4)用于将所述来自客户端的动物源细菌的采集数据和所述动物源细菌耐药性数据库中的数据进行检索匹配的装置;
(5)于读取检索匹配得到的耐药性数据结果的装置;
(6)通过检索结果,判断所述来自客户端的动物源细菌是否具有耐药性的装置,其中判断依据为:
①耐药性数据数值≥肉汤稀释法判断标准的耐药折点或耐药性数据数值≤纸片扩散法判断标准的耐药折点,判断该外来的动物源细菌的耐药性为耐药;
②耐药性数据数值≤肉汤稀释法判断标准的敏感折点或耐药性数据数值≥纸片扩散法判断标准的敏感折点,判断该外来的动物源细菌的耐药性为敏感;
③耐药性数据数值在肉汤稀释法或纸片扩散法判断标准的中介范围内,判断该外来的动物源细菌的耐药性为中介;
(7)用于将检索匹配判断结果通过互联网输出至所述客户端的装置。
优选地,所述服务器还包括用于记录每一个客户端的检索请求的历史记录的装置。
在本发明范围内,B/S架构即Browser/Server(浏览器/服务器)结构,是随着Internet技术的兴起,对C/S(Client/Server,客户机/服务器)结构的一种变化、改进的结构。在这种结构下,用户界面完全通过WWW浏览器实现,一部分事务逻辑在前端实现,但是主要事务逻辑在服务器端实现,形成所谓3-tier结构(即3层结构。在该结构***中,将***整体分为客户层(用户界面)、应用层(商用逻辑)和数据层(数据库)。在客户端只留下用户界面,其余均装于服务器上。客户端只受理用户的操作与表示应用层的处理结果。另一方面,将应用软件部分与客户端分离,安装于服务器上,当商用逻辑发生变更时,只须变更服务器端的应用软件,无需更新***整体。也就是说,在服务器端实现的是数据的储存和分析功能)。B/S结构利用不断成熟和普及的浏览器技术实现原来需要复杂专用软件才能实现的强大功能,并节约了开发成本。具体到本发明中,由***前端实现的事务包括采样表的录入(录入的内容包括但不限于:采样时间、地区、养殖场名称、动物来源、动物健康状况、采样部位、采样数、养殖场抗菌药使用情况、分离的菌株种类、菌株数量和编号以及药敏试验结果)、数据审核上报和数据分析结果展示(包括不同地区、不同时间、不同动物、不同细菌的耐药率比较分析、耐药谱比较分析、多重耐药率比较分析以及细菌血清型分析和数据溯源等的结果显示)两大部分。B/S结构的开发属于本领域技术人员已经掌握的、无需创造性劳动即可重复实现的操作,在本申请中不再赘述。
【有益效果】
对于服务器端,通过对数据的录入、整理和审核,使***具有能够作为分析基础的数据库。通过对数据库的管理,能够实现查看、分析各地的动物源细菌的相关数据,以便及时了解不同地区动物源细菌耐药情况,将基础数据提供给行政、管理部门,在各项方针政策的制定起到参考。
对于用户端,只要获得外来的动物源细菌的采集数据,通过本***即可自动获得该动物源细菌的耐药性数据,在实验、临床、用药等各个方面均可起到参考作用,也可作为全国或局部地区的统计、评估数据。本***的用户无需再对外来的动物源细菌逐一进行重复的分析实验即可获得耐药性数据。由于采用B/S架构设计,本发明的***特别适用于实验条件不便利的地区,只需一台能够联网的计算机,即可使用本发明提供的方法和***。
【附图说明】
图1:本数据库模块及功能;
图2:本数据库的实施方式示意图;
图3:2008年不同动物大肠杆菌分离率示意图(表1);
图4:2008年不同动物大肠杆菌耐药率示意图(表2);
图5:2008年不同养殖场动物源大肠杆菌耐药率示意图(表3);
图6:2008年不同血清型鸡源大肠杆菌耐药率示意图(表4);
图7:2008年不同地区鸡源大肠杆菌耐药率示意图(表5);
图8:不同年代鸡源大肠杆菌耐药率示意图(表6);
图9:不同年份鸡源大肠杆菌耐药率示意图(表7);
图10:2008年不同月份鸡源大肠杆菌耐药率示意图(表8);
图11:2008-2009年不同细菌耐药率示意图(表9);
图12:2008年东北地区鸡源大肠杆菌耐药谱(表10);。
图13:2008年东北地区不同动物大肠杆菌多重耐药率示意图(表11)。
【具体实施方式】
通过下面给出的本发明具体实施例可以进一步清楚地理解本发明,但这些实施例不是对本发明保护范围的限制。本发明的保护范围应当由权利要求书确定。
一、设置服务器端的数据库结构
(1)设置样品来源数据。包括监测工作中常规的食品动物猪、鸡、鸭、鹅、牛、羊等,同时考虑到大城市宠物行业的发展,在本实施例的数据库中还设置了宠物狗、猫,以供从事宠物行业人员参考应用。
(2)设置动物采样部位数据。包括耐药性检测常规采样部位:粪便、消化道、呼吸道、泌尿生殖道、肝、胆、***、关节、皮肤、泄殖腔拭子、***拭子及牛奶等。一般情况下,不同细菌在动物体上存在的部位有所不同,技术人员应根据细菌存在的部位来确定采样部位。确定采样部位是本领域技术人员所掌握的常识,在本发明范围内不再赘述。
(3)设置地区分类数据。参考中华人民共和国行政区域划分,将采样地区分为东北、华北、华东、中南、西南、西北六大地区,按省市划分又分为23个省4个直辖市和5个自治区。
(4)设置***条件。其中,根据后述的细菌耐药率确定药物使用效果,设定建议停用药物的耐药率数值和推荐使用的耐药率的数值。
二、录入数据库数据
(1)录入养殖场数据。根据我国养殖场目录,按照养殖场所在地(省、市、县)划分,录入养殖场的名称。
(2)录入采样表和相关数据。一个采样表只录入选择一种药敏实验方法获得的一种细菌数据,如果同一个样品分离获得多种细菌,则需建立多个采样表。采样表录入的项目包括:采样人、采样日期、采样地、养殖场、样品来源、动物健康状况、动物生长期、采样部位、样品数量、实验方法、细菌名称、细菌分离数量、测试用药、饲料添加用药、治疗用药、细菌的保存状态等。根据上述信息,数据库自动生成菌株编号。
(3)录入药敏实验数据和血清型数据。在本实施例中,药敏实验数据是依据现行的《动物源细菌抗微生物药物敏感性试验执行标准》(美国临床和实验室标准协会主编和出版,M31-A3,2008)和《抗微生物药物敏感性试验执行标准》(美国临床和实验室标准协会主编和出版,M100-S18,2008)所记载的方法获得的。具体包括细菌的抑菌圈的直径长度,和最小抑菌浓度。血清型数据可依据《兽医微生物学》(陆承平主编.兽医微生物学.第四版.中国农业出版社,2007)或不同细菌微生物学检验的国家标准所记载的方法获得,具体包括平板凝集试验或试管凝集试验所测定的大肠杆菌血清型和沙门氏菌血清型,根据监测项目的不断扩大,可根据需要增加其他细菌的血清型数据。
三、设置***管理
通过管理员登录数据库并对***进行设置,允许在服务器中添加用户组及其管理员名称,并对所添加的管理员的权限进行设置,方便各监测实验室的管理员使用自己的用户名对实验结果录入,并及时上报。在本实施例中,建立的实验室管理员用户包括国家级、省级兽药质量监督机构,及与其相关的科研、教学机构。
设置***日志功能,记录所有用户对动物源细菌耐药性监测数据库***的操作,并允许服务器端的管理员和用户组的管理员查看这些操作记录。日志中具体记录了操作者的用户名、操作类型、操作模块、操作时间、操作IP及详细操作内容,保证只有授权用户才可以访问,进一步提高***的安全防护。
四、设置数据分析功能
通过以上设置、录入获得的数据库,该数据库的数据可以满足动物源细菌耐药性各项指标分析的要求。所述耐药性指标分析包括细菌的分离率分析、耐药率分析、耐药谱分析、多重耐药率分析、血清型分布分析、数据溯源、用药提示(其中,用药提示的判断标准例如设置为细菌耐药率≥50%时建议停用此类药物,耐药率≤15%时建议使用该类药物。也可以不设置该项目,仅由本***获得耐药性数据,由医学领域工作人员参考耐药性数据结合具体情况具体用药。)等七大功能。在分析上述数据的同时,允许操作者通过***对细菌分离率分析、耐药率分析、多重耐药率分析、血清型分布分析等四项分析结果生成直方图并允许预览(如图3、4所示),使分析结果的比较显得更加直观。同时,***还允许分析结果以电子表格形式导出,便于工作人员分析总结。这些分析、演示功能的设置是现有的支持标准SQL的数据库能够实现的,本领域技术人员在掌握数据库技术的基础上可重复实现而无须经过创造性劳动,因此所涉及的数据库设置过程、具体使用的语句在此不做赘述。
上述涉及到的药物分类标准、质控菌株及药敏实验结果判断标准可参考《动物源细菌抗微生物药物敏感性试验执行标准》(美国临床和实验室标准协会主编和出版,M31-A3,2008)和《抗微生物药物敏感性试验执行标准》(美国临床和实验室标准协会主编和出版,M100-S18,2008)。该标准已被美国临床实验室标准化协会(CLSI)所批准,为国际公开公认的执行标准,数据库随着该两项标准的更新每年进行更新。细菌分类参考陆承平主编《兽医微生物学》第四版(中国农业出版社,2007.)。根据上述标准,药物一共分为16类48种,细菌分为13类21种,药敏实验方法设置为纸片扩散法和微量肉汤稀释法。
其中,细菌分离率即分离得到的菌株总数与采集样品总数之比,具体包括:不同动物分离率分析、不同养殖场分离率分析、不同地区分离率分析、不同年代分离率分析、不同年份分离率分析、不同血清型分离率分析、不同细菌分离率分析。数据库导出的2008年不同动物分离率电子表如表1和图3,其余6种分离率与该表类似,在此没有列出。
表1:2008年不同动物大肠杆菌分离率
动物 | 分离率(%) |
鸡 | 55.56% |
猪 | 63.20% |
耐药率分析包括:不同动物耐药率分析、不同养殖场耐药率分析、不同血清型耐药率分析、不同地区耐药率分析、不同年份耐药率分析、不同月份耐药率分析、不同细菌耐药率分析。13种药物的耐药率分析导出电子表格详细展示如表2-表9以及图4-图11。
耐药谱是指细菌所耐的各种药物的分布,耐药谱分析包括:不同动物耐药谱分析、不同养殖场耐药谱分析、不同血清型耐药谱分析、不同地区耐药谱分析、不同年代耐药谱分析、不同年份耐药谱分析、不同月份耐药谱分析。以东北地区2008年鸡源大肠杆菌耐药谱为例,数据库导出的电子表如表10。其他耐药谱分析类似该表。
表10:2008年东北地区鸡源大肠杆菌耐药谱
多重耐药率的分析包括:不同动物多重耐药率分析、不同养殖场多重耐药率分析、不同血清型多重耐药率分析、不同地区多重耐药率分析、不同年代多重耐药率分析、不同年份多重耐药率分析、不同月份多重耐药率分析、不同耐药重数的分析。以2008年东北地区不同动物多重耐药率分析为例,数据库导出的电子表如表11。其他几种多重耐药率分析类似该表。
表11:东北地区不同动物大肠杆菌多重耐药率
注:表11中“1,2,3……13”表示“细菌耐1,2,3……13种药”。
上述分离率分析、耐药率分析、多重耐药率分析、血清型分布分析等四项分析结果生成直方图并允许预览,以耐药率分析生成的直方图为例,如图3-图13所示。
血清型分布分析包括:不同动物的某一细菌血清型分布分析、不同养殖场某一细菌血清型分布分析、不同地区某一细菌血清型分布分析、不同年代某一细菌血清型分布分析、不同年份某一细菌血清型分布分析。
数据溯源通过数据库的检索功能,实现根据样品编号、菌株编号、血清型、细菌、地区、养殖场、时间其中任一条件进行数据查找细菌的来源的功能。
通过以上数据获得用药提示,本发明的***可以有选择地实现了用药指导功能。例如,在***中设定判断标准为:当细菌耐药率≥50%,判断为“建议停用此类药物”;当耐药率≤15%,判断为“建议使用该类药物”。这样,可以准确、及时地指导养殖户正确用药,使抗生素的滥用现象有所缓解,并减少了由于抗生素滥用所造成的药物残留、交叉耐药等问题。也可以不设定用药指导功能,而由医学领域的专业人员根据本发明的***获得的耐药性数据作具体的用药判断。
五、设置网络***
通过Java EE平台技术,采用B/S(Browser/Web Server)结构,其优点是开发工具强大,非常易于信息组织,易于用户操作,且易于与其他***集成。对于结构化和非结构化数据均具有良好的支持能力,同时,***也具备良好的安全性控制手段。基于流行的B/S软件结构,基于WEB操作,配置简单,维护的技术要求不高,完全实现客户端零配置。数据可以集中管理,降低了使用、维护的成本和实施远程教学的技术要求;***采用统一的用户界面,使用户使用方便。
六、具体使用过程
各监测实验室的管理员通过浏览器登录到服务器后,点击数据库栏目中的耐药性监测数据库。然后再点击进入“数据录入”,依次录入养殖场、采样表、细菌的血清型、药敏试验结果,也可点击“导入”后直接将统计好的excel文档导入。接着再点击“上报采样表”、“审核药敏试验结果”,审核药敏试验结果可有监测实验室安排专人审核。如果通过审核,则该数据就能作为数据分析的来源;如果没有通过审核,则返回采样表上报模块,修改不正确数据直到通过审核。在数据分析模块,分别点击不同的功能按扭,然后输入一定的查询条件后点击“开始分析”,则***可分别得出分离率分析、血清型分布分析、耐药率分析、耐药谱分析、多重耐药率分析、数据溯源、用药提示等分析结果。在结果页面再点击“导出”会展示出分析结果的office excel文档。点击“预览直方图”则会展示出对应的直方图。本数据库的应用流程可参考附图2。
Claims (6)
1.动物源细菌耐药性的分析方法,其特征在于所述分析方法包括以下步骤:
(1)采集动物源细菌,获得采集数据,所述细菌包括在不同时间从不同地区、不同养殖场、不同动物种类身上获得的不同的动物源细菌;
(2)对步骤(1)所得的动物源细菌进行耐药性测试,获得所述动物源细菌对药物的耐药性数据,所述耐药性测试包括:①纸片扩散法药敏试验;②肉汤稀释法药敏试验;所述耐药性数据包括:①用纸片扩散法药敏试验测得的所述动物源细菌的抑菌圈直径;②用肉汤稀释法药敏试验测得的所述动物源细菌的最小抑菌浓度;
(3)建立动物源细菌耐药性数据库,所述数据库包括所述动物源细菌的采集数据和耐药性数据;
(4)当需要对外来动物源细菌耐药性数据进行分析时,首先获取所述外来动物源细菌的采集数据,然后在步骤(3)所述数据库中进行检索,得到对应的动物源细菌,输出检索结果的其它数据部分,所述其它数据部分包括该动物源细菌的耐药性数据和检索条件以外的采集数据;
(5)对于步骤(4)的输出结果,
若:耐药性数据数值≥肉汤稀释法判断标准的耐药折点或耐药性数据数值≤纸片扩散法判断标准的耐药折点,判断该外来的动物源细菌的耐药性为耐药;
若:耐药性数据数值≤肉汤稀释法判断标准的敏感折点或耐药性数据数值≥纸片扩散法判断标准的敏感折点,判断该外来的动物源细菌的耐药性为敏感;
若:耐药性数据数值在肉汤稀释法或纸片扩散法判断标准的中介范围内,判断该外来的动物源细菌的耐药性为中介。
2.根据权利要求1所述的动物源细菌耐药性的分析方法,其特征在于步骤(1)所述动物源细菌包括从猪、鸡、鸭、牛、羊、猫或狗身上采集的13类21种细菌,包括肠道杆菌:大肠杆菌、沙门氏菌、猪霍乱沙门氏菌;巴氏杆菌:多杀性巴氏杆菌、溶血曼海姆菌;放射杆菌属:胸膜肺炎放射杆菌;链球菌:α溶血性链球菌、β溶血性链球菌、无乳链球菌、缺乳链球菌、***炎链球菌;葡萄球菌:金黄色葡萄球菌、中间葡萄球菌;肠球菌:粪肠球菌;嗜血杆菌:睡眠嗜组织菌、流感嗜血杆菌;李斯特菌属;假单胞菌属:绿脓杆菌;变形杆菌属:奇异变形杆菌;肺炎链球菌;博德特菌属:支气管炎博德特菌;弯曲杆菌属:空肠弯曲菌、结肠弯曲菌。
3.根据权利要求1所述的动物源细菌耐药性的分析方法,其特征在于步骤(1)所述的采集数据包括动物源细菌的采样人、采样日期、采样地点、来源的动物品种、养殖场、样品来源、动物健康状况、动物生长期、采样部位、样品数量、测试方法、细菌名称、测试用药、饲料添加用药、治疗用药和/或细菌的保存状态。
4.根据权利要求1所述的动物源细菌耐药性的分析方法,其特征在于步骤(2)所述药物包括16类共48种药,包括氨基糖苷类:阿米卡星、庆大霉素、大观霉素、卡那霉素、链霉素;安沙霉素类:利福平;β-内酰胺/β-内酰胺酶抑制剂复合物:阿莫西林/克拉维酸、替卡西林/克拉维酸;β-内酰胺类/青霉素类:氨苄西林、苯唑西林、青霉素、替卡西林;β-内酰胺/其他类复合物:青霉素/新生霉素;碳氢霉烯类:亚胺培南;头孢菌素类:头孢噻吩、头孢唑林、头孢泊肟、头孢噻呋、头孢西丁、头孢曲松;氟喹诺酮类:达氟沙星、恩诺沙星、二氟沙星、马波沙星、奥比沙星、氧氟沙星、环丙沙星、萘啶酸、诺氟沙星;叶酸代谢途径抑制剂:复方新诺明、磺胺异恶唑、甲氧苄啶;糖肽类:万古霉素;可林胺类:克林霉素、吡利霉素;大环内酯类:红霉素、替米考星、土拉霉素、阿奇霉素、克拉霉素、替利霉素;氯霉素类:氯霉素、氟苯尼考;截短側耳素类:泰妙菌素;四环素类:四环素、强力霉素;多粘菌素类:多粘菌素B、多粘菌素E。
5.实现权利要求1所述的动物源细菌耐药性的分析方法的***,包括互联网、能够实现B/S架构的客户端和服务器,其特征在于所述服务器包括:
动物源细菌耐药性数据库,所述数据库存储了在不同时间从不同地区、不同养殖场、不同动物种类身上获得的不同动物源细菌的采集数据和所述动物源细菌的耐药性数据;
用于录入所述数据库的数据的装置;
用于接收通过互联网传送的来自客户端的动物源细菌的采集数据和检索请求的装置;
用于将所述来自客户端的动物源细菌的采集数据和所述数据库中的数据进行检索匹配的装置;
用于读取检索结果的装置;
通过检索结果,判断所述来自客户端的动物源细菌是否具有耐药性的装置,其中判断依据为:
①耐药性数据数值≥肉汤稀释法判断标准的耐药折点或耐药性数据数值≤纸片扩散法判断标准的耐药折点,判断该外来的动物源细菌的耐药性为耐药;
②耐药性数据数值≤肉汤稀释法判断标准的敏感折点或耐药性数据数值≥纸片扩散法判断标准的敏感折点,判断该外来的动物源细菌的耐药性为敏感;
③耐药性数据数值在肉汤稀释法或纸片扩散法判断标准的中介范围内,判断该外来的动物源细菌的耐药性为中介;
用于将所述判断结果通过互联网输出至所述客户端的装置。
6.根据权利要求5所述的***,其特征在于所述服务器包括用于记录每一个客户端的检索请求的历史记录的装置。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN 200910236970 CN101792790B (zh) | 2009-10-29 | 2009-10-29 | 动物源细菌耐药性的分析方法及实现所述分析方法的*** |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN 200910236970 CN101792790B (zh) | 2009-10-29 | 2009-10-29 | 动物源细菌耐药性的分析方法及实现所述分析方法的*** |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN101792790A true CN101792790A (zh) | 2010-08-04 |
CN101792790B CN101792790B (zh) | 2013-08-14 |
Family
ID=42585704
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN 200910236970 Expired - Fee Related CN101792790B (zh) | 2009-10-29 | 2009-10-29 | 动物源细菌耐药性的分析方法及实现所述分析方法的*** |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN101792790B (zh) |
Cited By (13)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102880670A (zh) * | 2012-09-06 | 2013-01-16 | 上海交通大学 | 木霉菌菌种鉴定自动检索的方法及*** |
CN104749180A (zh) * | 2015-03-25 | 2015-07-01 | 北京浩辰星月科技有限公司 | 视觉鉴定分析及药敏鉴定***,药敏检测方法 |
CN104862217A (zh) * | 2015-06-15 | 2015-08-26 | 杨亮 | 细菌耐药性快速预测***及其预测方法 |
CN106803014A (zh) * | 2016-12-29 | 2017-06-06 | 中国农业科学院特产研究所 | 一种计算血清中和抗体效价的***及方法 |
CN107063976A (zh) * | 2017-03-30 | 2017-08-18 | 中国农业科学院特产研究所 | 一种半数细胞培养物感染量的计算***及方法 |
CN109616177A (zh) * | 2018-12-13 | 2019-04-12 | 平安医疗健康管理股份有限公司 | 医疗机构的药品监控管理方法、装置、设备和存储介质 |
CN110004205A (zh) * | 2019-03-01 | 2019-07-12 | 昆明金域医学检验所有限公司 | 微生物药敏测试自动审核预警方法、装置及可读存储介质 |
CN110141569A (zh) * | 2019-06-13 | 2019-08-20 | 吉林大学 | 抗牛多杀性巴氏杆菌的药物组合物 |
CN110172523A (zh) * | 2019-06-05 | 2019-08-27 | 华中农业大学 | 猪源沙门氏菌对安普霉素的耐药判定标准试验方法 |
CN113234789A (zh) * | 2021-06-07 | 2021-08-10 | 东莞市人民医院 | 一种菌群耐药性临床应用的监测评估***及其方法 |
CN113362965A (zh) * | 2021-06-28 | 2021-09-07 | 中国人民解放军疾病预防控制中心 | 用于医院病原菌耐药性监测***及方法 |
CN114774262A (zh) * | 2022-06-21 | 2022-07-22 | 山东省饲料兽药质量检验中心 | 一种动物源细菌耐药性监测溯源*** |
CN115410653A (zh) * | 2022-08-31 | 2022-11-29 | 吉林金域医学检验所有限公司 | 细菌耐药性监测方法、装置、计算机设备及存储介质 |
-
2009
- 2009-10-29 CN CN 200910236970 patent/CN101792790B/zh not_active Expired - Fee Related
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
周来新等: "计算机网络***在细菌耐药检测中的应用", 《中华医院感染学杂志》 * |
韩雪玲等: "利用计算机网络技术提高抗菌药物监管成效", 《医学信息》 * |
颜学军等: "纸片扩散法药敏检测结果的计算机处理", 《长沙医学院》 * |
Cited By (19)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102880670A (zh) * | 2012-09-06 | 2013-01-16 | 上海交通大学 | 木霉菌菌种鉴定自动检索的方法及*** |
CN102880670B (zh) * | 2012-09-06 | 2017-05-10 | 上海交通大学 | 木霉菌菌种鉴定自动检索的方法及*** |
CN104749180A (zh) * | 2015-03-25 | 2015-07-01 | 北京浩辰星月科技有限公司 | 视觉鉴定分析及药敏鉴定***,药敏检测方法 |
CN104749180B (zh) * | 2015-03-25 | 2017-09-01 | 北京浩辰星月科技有限公司 | 机器视觉鉴定分析及药敏鉴定*** |
CN104862217A (zh) * | 2015-06-15 | 2015-08-26 | 杨亮 | 细菌耐药性快速预测***及其预测方法 |
CN106803014A (zh) * | 2016-12-29 | 2017-06-06 | 中国农业科学院特产研究所 | 一种计算血清中和抗体效价的***及方法 |
CN107063976A (zh) * | 2017-03-30 | 2017-08-18 | 中国农业科学院特产研究所 | 一种半数细胞培养物感染量的计算***及方法 |
CN109616177A (zh) * | 2018-12-13 | 2019-04-12 | 平安医疗健康管理股份有限公司 | 医疗机构的药品监控管理方法、装置、设备和存储介质 |
CN110004205A (zh) * | 2019-03-01 | 2019-07-12 | 昆明金域医学检验所有限公司 | 微生物药敏测试自动审核预警方法、装置及可读存储介质 |
CN110172523A (zh) * | 2019-06-05 | 2019-08-27 | 华中农业大学 | 猪源沙门氏菌对安普霉素的耐药判定标准试验方法 |
CN110172523B (zh) * | 2019-06-05 | 2021-06-11 | 华中农业大学 | 猪源沙门氏菌对安普霉素的耐药判定标准试验方法 |
CN110141569A (zh) * | 2019-06-13 | 2019-08-20 | 吉林大学 | 抗牛多杀性巴氏杆菌的药物组合物 |
CN110141569B (zh) * | 2019-06-13 | 2021-09-24 | 吉林大学 | 抗牛多杀性巴氏杆菌的药物组合物 |
CN113234789A (zh) * | 2021-06-07 | 2021-08-10 | 东莞市人民医院 | 一种菌群耐药性临床应用的监测评估***及其方法 |
CN113362965A (zh) * | 2021-06-28 | 2021-09-07 | 中国人民解放军疾病预防控制中心 | 用于医院病原菌耐药性监测***及方法 |
CN113362965B (zh) * | 2021-06-28 | 2023-09-15 | 中国人民解放军疾病预防控制中心 | 用于医院病原菌耐药性监测***及方法 |
CN114774262A (zh) * | 2022-06-21 | 2022-07-22 | 山东省饲料兽药质量检验中心 | 一种动物源细菌耐药性监测溯源*** |
CN115410653A (zh) * | 2022-08-31 | 2022-11-29 | 吉林金域医学检验所有限公司 | 细菌耐药性监测方法、装置、计算机设备及存储介质 |
CN115410653B (zh) * | 2022-08-31 | 2023-10-17 | 吉林金域医学检验所有限公司 | 细菌耐药性监测方法、装置、计算机设备及存储介质 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN101792790B (zh) | 2013-08-14 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN101792790B (zh) | 动物源细菌耐药性的分析方法及实现所述分析方法的*** | |
Hall et al. | Prevalence and antimicrobial resistance of canine urinary tract pathogens | |
Donnan et al. | Presence of bacteriuria caused by trimethoprim resistant bacteria in patients prescribed antibiotics: multilevel model with practice and individual patient data | |
Anderson | The pandemic of antibiotic resistance | |
Jenkins et al. | Decreased antibiotic utilization after implementation of a guideline for inpatient cellulitis and cutaneous abscess | |
Stelling et al. | Surveillance of antimicrobial resistance: the WHONET program | |
Bakhit et al. | Resistance decay in individuals after antibiotic exposure in primary care: a systematic review and meta-analysis | |
Brown et al. | Meta-analysis of antibiotics and the risk of community-associated Clostridium difficile infection | |
CN105893725B (zh) | 一种医院感染预防与控制全流程管理***及其方法 | |
Marcy et al. | Management of acute otitis media | |
Noyes et al. | Mannheimia haemolytica in feedlot cattle: prevalence of recovery and associations with antimicrobial use, resistance, and health outcomes | |
Turner et al. | Epidemiologic trends in Clostridioides difficile infections in a regional community hospital network | |
Gontjes et al. | Association of exposure to high-risk antibiotics in acute care hospitals with multidrug-resistant organism burden in nursing homes | |
Halstead et al. | Reality of developing a community-wide antibiogram | |
O’Connor et al. | Improving the quality of antibiotic prescribing through an educational intervention delivered through the out-of-hours general practice service in Ireland | |
Aysert-Yildiz et al. | Efficacy and safety of intravenous fosfomycin for the treatment of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae | |
Wall et al. | Assessment of hypersensitivity reactions in patients receiving carbapenem antibiotics who report a history of penicillin allergy | |
Rihani et al. | Over-treatment of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae | |
Dahlman et al. | Opioid and amphetamine dependence is associated with methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA): An epidemiological register study with 73,201 Swedish in-and outpatients 1997–2013 | |
Narayanan et al. | Relationship between multidrug-resistant enterobacterales and obesity in older adults | |
Nymoen Aasbrenn et al. | Compliance to antibiotic guidelines leads to more appropriate use of antibiotics in skin and soft tissue infections in injecting drug users | |
Walker et al. | The effect of inoculum volume on the microbiologic detection of naturally occurring Staphylococcus aureus intramammary infections | |
Bokshan et al. | Reduced time to positive Cutibacterium acnes culture utilizing a novel incubation technique: a retrospective cohort study | |
Shigemura et al. | Comparison of antibiotics use, urinary tract infection (UTI)-causative bacteria and their antibiotic susceptibilities among 4 hospitals with different backgrounds and regions in Japan | |
Burns et al. | Developing an evidence-based approach for antimicrobial resistance reporting for British Columbia diagnostic animal health laboratory data |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
C06 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
C10 | Entry into substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
C14 | Grant of patent or utility model | ||
GR01 | Patent grant | ||
CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee |
Granted publication date: 20130814 Termination date: 20151029 |
|
EXPY | Termination of patent right or utility model |