CN101629217A - 猪流感病毒rt-lamp检测试剂盒及其检测方法 - Google Patents

猪流感病毒rt-lamp检测试剂盒及其检测方法 Download PDF

Info

Publication number
CN101629217A
CN101629217A CN200910087563A CN200910087563A CN101629217A CN 101629217 A CN101629217 A CN 101629217A CN 200910087563 A CN200910087563 A CN 200910087563A CN 200910087563 A CN200910087563 A CN 200910087563A CN 101629217 A CN101629217 A CN 101629217A
Authority
CN
China
Prior art keywords
lamp
siv
reaction
rna
sample
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN200910087563A
Other languages
English (en)
Other versions
CN101629217B (zh
Inventor
刘业兵
张磊
宁宜宝
陈蕾
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
China Institute of Veterinary Drug Control
Original Assignee
China Institute of Veterinary Drug Control
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by China Institute of Veterinary Drug Control filed Critical China Institute of Veterinary Drug Control
Priority to CN 200910087563 priority Critical patent/CN101629217B/zh
Publication of CN101629217A publication Critical patent/CN101629217A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN101629217B publication Critical patent/CN101629217B/zh
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明涉及一种猪流感病毒RT-LAMP检测试剂盒及其检测方法。根据GenBank公布的SIV不同亚型的基因序列,针对PA序列相对保守区域设计了SIV RT-LAMP简并引物6条,以猪流感H1、H3、H5、H9亚型毒株为模板,建立了可以检测所有亚型猪流感毒的RT-LAMP方法。利用LA-320 LAMP Tubidimeter仪分析反应过程并判定结果,显示在LA-320 LAMP Tubidimeter仪中63℃反应45min,所有实验用的4种亚型SIV样品RNA均获得了高效的特异性扩增。通过敏感性试验证明:本方法可对100TCID50 SIV样品RNA进行10-4稀释后仍可高效扩增,显示出本方法高度的敏感性;通过特异性实验和19份临床样品的SIV病原的RT-LAMP检测,有5份样品检测到病料中SIV核酸为阳性,与RT-PCR、鸡胚分离结果一致,经基因芯片分型鉴定验证,综合结果符合率为100%。显示本方法特异、敏感、快速,适合用于各种试验条件下SIV的检测。

Description

猪流感病毒RT-LAMP检测试剂盒及其检测方法
技术领域
本发明涉及一种猪流感病毒RT-LAMP检测试剂盒及其检测方法,属于兽用生物制品领域中疫病诊断技术。
背景技术
猪流感病毒(Swine influenza virus,SIV)属正黏病毒科,它可引起猪的一种急性、高度接触性呼吸道传染病——猪流感。猪在禽-猪-人的流感病毒跨种属障碍而感染新宿主的过程流感种间传播过程中,起着中间宿主及多重宿主的作用。由于猪上皮细胞具有唾液酸α-2,3半乳糖苷(SAα-2,3-Gal)和唾液酸α-2,6半乳糖苷(SAα-2,6-Gal),人流感病毒可与前者结合,而禽流感病毒与后者结合。因此,猪上皮细胞就能够被人流感病毒和禽流感病毒感染,而成为毒株间基因重排的活载体。由于流感病毒可直接感染人,导致人类患病或死亡,其公共卫生意义日渐显著。
在临床中,猪流感病毒常见以H1、H3亚型为主(李海燕等.部分省市猪群猪流感的血清学调查及猪流感病毒的分离与鉴定[J]动物医学进展,2003,03),后来又有从猪体分离到H5N1、H9N2亚型流感毒株的报道(李海燕等.***源H5N1和H9N2亚型流感病毒的分离鉴定[J]中国预防兽医学报,)。在SIV的检测工作当中,目前多使用病毒分离、HI、ELASA和RT-PCR方法。由于这些方法检测周期长、特异性与敏感性方面存在一定局限性,限制了在基层的推广使用。
环介导的等温核酸扩增技术(LAMP)是由T.Notomi等发明的一种新型核酸扩增技术(Notomi,T.,et al.,Loop-mediated isothermal amplification of DNA.Nucleic Acids Res.2000,28,e63.),该技术依赖4条特异设计的引物和一种具有链置换特性的DNA聚合酶,在等温条件下可以高效、高特异地扩增靶序列。近年来,国外已将该技术广泛应用于病原体检测。Masaki Imai等人(2007)针对四种香酒酵母的ITS序列设计了LAMP特异性引物,建立了高效的LAMP检测体系。LAMP还可以检测其他与人类相关的病毒,如病毒性出血性败血病(VHS)、巨细胞病毒(CMV)、埃博拉病毒(EBOV)、慢性伯基特淋巴瘤病毒(EBV)、彩虹病毒、人类疱疹病毒8型、造血组织坏死病毒(IHHNV)、番茄斑萎病毒、番茄黄化曲叶病毒等。目前国内外均未见有用于检测猪流感病毒的RT-LAMP试剂盒及RT-LAMP方法在猪流感病毒检测中的应用的报道。
发明内容
本发明的目的是建立检测猪流感病毒的RT-LAMP检测方法,并提供一种用于以上目的的RT-LAMP试剂盒。
本发明的技术方案
本发明的原理及技术路线
新型的核酸扩增(LAMP)技术在检测工作中具有速度快、特异性强、敏感度高的优势,但是由于猪流感病毒不同亚型间的基因序列差异比较大,难以设计猪流感病毒不同亚型通用的RT-LAMP检测引物,对LAMP技术在SIV的检测中应用造成了很大的困难。
本发明人为解决RT-LAMP在猪流感通用检测上存在的困难,在猪流感病毒PA基因上截取长300bp相对保守的序列基因设计SIV RT-LAMP的工作引物,并进行了简并处理,增加了引物对不同亚型SIV中存在的目的序列扩增的敏感性。建立针对SIV的环介导等温扩增技术(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法,本方法具有多引物同时扩增,并在两端形成了带有引物功能的环状结构,这种多引物结合和可自产生引物的原理使其具有了灵敏度高、特异性强等特点,由于RT和LAMP反应在同管中同时进行简化了操作步骤,同时因为RT-LAMP反应的产物中包含大量核酸和焦磷酸镁的沉淀,可以用荧光剂显色肉眼来判定,适用于各种实验条件下检测工作的使用。
本发明的方法具体实施
1SIV RT-LAMP检测方法的建立和验证
(1)反应用试剂的制备
1)SIV RT-LAMP引物设计根据GenBank公布的SIV包括多种亚型HA和NA序列共54株,利用DNAMAN5.9和DNAstar5.0进行序列分析。在54株SIV毒株的比对中发现其PA序列中550nt~780nt之间的突变较少,其长度适合RT-LAMP实验要求。参考H1N1型SIV序列设计引物。将设计的引物和54株SIV的序列再次进行比对,将引物靠近5’端和3’处各亚型SIV中存在差异的序列采取简并处理(图1),按照RNA LAMP kit的说明建立SIV RT-LAMP的反应体系对各套引物进行试验筛选,通过试验筛选结果的分析,确定以下这套引物为本方法的工作引物,序列1、2、3、4、5和6如下:
序列1(F3-PA):AGGGGTCTATGGGATTCCTT
序列2(B3-PA):GAAAGCTTGCCCTCAATG
序列3(FIP-PA):WCGCATGGTTCCTGCGATTTCATCGTCAGTCCGAAAGAGGC
序列4(BIP-PA):RRCTTGCCGACCAAAGTCTCTCGGTTCGAATCCATCCACA
序列5(LF-PA):AATCTTTCTTCAATTGTGTC
序列6(LB-PA):CCGAACTTCTCCAGCCTTGA
2)RT-LAMP反应体系中试剂的配制(50个反应量)
①引物混合液PM:取100pmol/μl F3-PA 2.5μl、100pmol/μl B3-PA 2.5μl、100pmol/μlFIP-PA 20.0μl,100pmol/μl BIP-PA 20.0μl、100pmol/μl LF-PA 10.0μl、100pmol/μlLB-PA 10.0μl混合,灭菌去离子水定容至总体系75.0μl。每个反应需取1.5μl PM。
②反应缓冲混合液RM:取4mmol/μl硫酸镁取50μl、1.6mol/μl甜菜碱50μl、10mmol/μldNTPs 50μl,溶于475μl PCR级水中定溶至625μl。每个反应需取12.5μl RM。
③反应酶混合液EM:取16U/μl Bst大片段DNA聚合酶24μl,400U/μl AMV反转录酶24μl,1μmol/μl DTT 2μl。每个反应需要取1μl EM。
④显色剂:,取1μlSYBRgreenI(购自Invitrogen公司)溶于49μl PCR级水。每个反应加1μl。
(2)样品RNA的制备
1)RNA提取试剂(LBBII-RNA)
RA:取1%2-巯基乙醇0.60ml、1%Tris-HCL(pH 8.0)0.60ml、10mmol/ml EDTA 1ml溶于5.0ml灭菌双蒸水中。
RB:6mmol/ml异硫氰酸胍35ml.
RC:无水乙醇15ml。
RD:100u/μl DNAse A 20μl溶于10ml DEPC H2O。
2)样品RNA的提取
取100μl细胞培养物(或鼻腔拭子浸出样品),经反复冻融3次后,按如下步骤进行操作:
样品中加入样品等体积RA,涡旋15s,12000g离心1min,取上清置于新管中;
在1中上清液中加入3倍的RB溶液,涡旋或剧烈震荡90s,静置3min;
加入1/3体积的RC溶液,涡旋1min,12000g离心1min。弃去上清液;放置5min后样品干燥,再加入11μl RD,溶解沉淀,即为样品RNA,作为扩增用的RNA模板。
(3)样品检测
1)本发明的反应体系为20μl
①配制RT-LAMP反应液:RM 12.5μl,EM 1.0μl,PM 1.5μl;
②取5.0μl样品RNA加到①项配制的RT-LAMP反应液中;
③混和后在63℃恒温水浴锅中作用45min。
④结果判定:反应结束后在SIV RT-LAMP反应产物中加入1μL的显色剂,肉眼观察反应液颜色变化。阴性反应的反应液呈现橘红色,阳性样品的反应液呈绿色。
(4)反应结果的验证
1)SIV RT-LAMP产物的Tubidimeter real-time的鉴定按照以上本发明确定的引物及建立的反应体系,对不同亚型SIV毒株的RT-LAMP产物进行Tubidimeter real-time吸光度鉴定,图2为SIV RT-LAMP产物的Tubidimeter real-time吸光度鉴定曲线图和柱形图。其中CH1为阴性对照,2~7分别为各亚型SIV毒株,CH8水为模版扩增对照,图2显示结果与预期相符。CH2~7各亚型SIV毒株RNA模版SIV RT-LAMP反应达到阳性判定值时最快耗时23min,全部反应结束共用时45min。
2)SIV RT-LAMP特异性试验图3为Tubidimeter LA-320LAMP反应的柱形结果图,横轴数字表示1~8为样品,纵轴为反应产物吸光度值。图3表明:以SIV参考株H1N1、H3N2作为阳性对照,DEPC处理的水作为阴性对照,检测按本发明提出的方法提取的RRSV、CHLV、PRV、PPV、PCV2核酸模板,验证所建立LAMP方法的特异性,结果阳性、阴性对照成立,SIV两个亚型参考毒株RNA模版RT-LAMP反应呈阳性,其它试验样品呈阴性,说明该引物及建立的SIV RT-LAMP方法具有很高的特异性
3)SIV-RT-LAMP敏感性试验用建立的SIV RT-LAMP方法扩增按本发明提出的提取SIV参考毒株(H1N1)的RNA模板(10ng/μl),稀释成1~10-5稀释度,用TubidimeterLA-320分析结果。结果见图4,表明:按照45分钟作为判定时限,100TCID50的SIV病毒RNA模板稀释到10-4时仍能快速有效的扩增。通过敏感性试验的曲线分析图(图5)发现,随着模版的稀释度增加只反应起点时间延长,而反应的速率和峰值变化很小。
4)SIV-RT-LAMP检测应用实验结果对临床采集19份疑似SIV的发病猪病料,按照本发明提出的方法抽提样品的总RNA,用建立的SIV RT-LAMP方法检测同RT-PCR、鸡胚分离鉴定进行比较,其中的阳性样品用基因芯片分型鉴定(委托韩雪清博士鉴定HanXueqing,Lin Xiangmei,et al..Simutaneously subtyping of all influenza A viruses using DNAmicroarrays.Journal of Virological Methods,2008,152117-121),结果见表3。
表3.几种方法对19份病料部分检测结果比较(阳性+/阴性-)
  样品名称   RT-LAMP   RT-PCR   病毒分离   基因芯片分型鉴定
  H1N1(参考株)H3N2(参考株)SD12SX4223TJ2231HB2325HN14HN33GD1092   +++-++-++   +++-++-++   +++--+-+-   H1N1H3N2H1N1-H3N2H1N1-H5N1H9N2
采用SIV RT-AMP方法对19份疑似SIV的发病猪病料检测,结果显示:其中检测出有5份样品检测到病料中SIV核酸为阳性,与RT-PCR、鸡胚分离综合结果一致,经基因芯片分型鉴定结果为4中不同亚型,验证结果符合率为100%。
2试剂盒的制备(50个反应量/盒)
(1)提取样品RNA的所需试剂LBBII-RNA的配制:
RA:取1%2-巯基乙醇0.6ml、pH 8.0 1%Tris-HCL 0.6ml、10mmol/ml EDTA 1ml溶于5.0ml灭菌双蒸水中,装至无核酶的塑料容器中。
RB:6mmol/ml异硫氰酸胍35ml,装至无核酶的塑料容器中。
RC:无水乙醇15ml,装至无核酶的塑料容器中。
RD:100u/μl DNAse A 20μl溶于10ml DEPC H2O,装至无核酶的塑料容器中。
(2)反应用试剂的制备
1)SIV RT-LAMP引物的扩增将本发明设计的如下序列引物分别扩增后备用:
F3-PA:AGGGGTCTATGGGATTCCTT
B3-PA:GAAAGCTTGCCCTCAATG
FIP-PA:WCGCATGGTTCCTGCGATTTCATCGTCAGTCCGAAAGAGGC
BIP-PA:RRCTTGCCGACCAAAGTCTCTCGGTTCGAATCCATCCACA
LF-PA:AATCTTTCTTCAATTGTGTC
LB-PA:CCGAACTTCTCCAGCCTTGA
2)RT-LAMP反应体系中试剂的配制
①PM:取100pmol/μl F3-PA 2.5μl、100pmol/μl B3-PA 2.5μl、100pmol/μl FIP-PA20.0μl,100pmol/μl BIP-PA 20.0μl、100pmol/μl LF-PA 10.0μl、100pmol/μl LB-PA10.0μl,加灭菌去离子水定容至总体系75.0μl。每个反应需取1.5μl PM。
②RM:取4mmol/μl硫酸镁取50μl、1.6mol/μl甜菜碱50μl、10mmol/μl dNTPs 50μl,溶于475μl PCR级水中定溶至625μl,装至无核酶的塑料容器中。
③EM:取16U/μl Bst大片段DNA聚合酶24μl,400U/μl AMV反转录酶24μl,1μmol/μlDTT 2μl,装至无核酶的塑料容器中。
④显色剂:取1μlSYBRgreenI(购自Invitrogen公司)溶于49μl PCR级水,装至无核酶的塑料容器中。
3.试剂盒的使用
1)使用LBBII-RNA提取样品RNA
取100μl细胞培养物(或血清、组织研磨样品),经反复冻融3次后,按如下步骤操作:
样品中加入样品等体积RA,涡旋15s,12000g离心1min,取上清置于小管中;在上清液中加入3倍的RB溶液,涡旋或剧烈震荡90s,静置3min;加入1/3体积的RC溶液,涡旋1min,12000g离心1min。弃去上清液;待样品干燥后加入11μl RD,溶解沉淀,即为样品RNA。
2)RT-LAMP反应
①配制RT-LAMP反应液:RM 12.5μl,EM 1.0μl,PM 1.5μl;
②取5.0μl样品RNA加到①项配制的反应液中
③混和后在63℃恒温水浴锅中作用45min。
3)结果判定:反应后在SIV RT-LAMP反应产物中加入1μL的显色剂,肉眼观察反应液颜色变化。阴性反应的反应液呈现橘红色,阳性样品的反应液呈绿色。
附图说明
图1:简并引物设计图示R=A/G,W=A/T
图2:为SIV RT-LAMP产物的Tubidimeter real-time吸光度鉴定曲线图(2-1)和柱形图(2-2)其中CH1为阴性对照,CH 2~7分别为各亚型SIV毒株,CH8水为模版扩增对照,。
图3:特异性试验SIV RT-LAMP Tubidimeter LA-320柱形图 CH1:SIV H1N1,CH2:PRRSV,CH3:SIV H3N2,CH4:CHLV,CH5:PRV,CH6:PPV,CH7:PCV2,CH8:DEPCH2O(横轴数字表示1~8为样品,纵轴为反应产物吸光度值)。
图4:SIV H1N1参考毒株的敏感度试验Tubidimeter LA-320结果分析柱形图其中CH1为水对照,CH2为10-1,CH3为10-2,CH4为10-3,CH5为10-4,CH6为10-5
图5:SIV H1N1参考毒株的敏感度试验Tubidimeter LA-320结果分析曲线图其中:LINE1为10-1,LINE2为10-2,LINE3为10-3,LINE4为10-4
图6:SIV-RT-LAMP反应产物混合显色剂后显色图例。1:阳性样品,2:阴性样品
本发明的积极意义
本发明涉及一种猪流感病毒RT-LAMP检测试剂盒及其检测方法。根据GenBank公布的SIV不同亚型的基因序列,针对PA序列相对保守区域设计了SIV RT-LAMP简并引物6条,以猪流感H1、H3、H5、H9亚型毒株为模板,建立了可以检测所有亚型猪流感毒的RT-LAMP方法。利用LA-320LAMP Tubidimeter仪分析反应过程并判定结果,显示在LA-320LAMPTubidimeter仪中63℃反应45min,所有实验用的4种亚型SIV样品RNA均获得了高效的特异性扩增。通过敏感性试验证明:本方法可对100TCID50SIV样品RNA进行10-4稀释后仍可高效扩增,显示出本方法高度的敏感性;通过特异性实验和19份临床样品的SIV病原的RT-LAMP检测,有5份样品检测到病料中SIV核酸为阳性,与RT-PCR、鸡胚分离结果一致,经基因芯片分型鉴定验证,综合结果符合率为100%。显示本方法特异、敏感、快速,适合用于各种试验条件下SIV的检测。
实施例
以下实施例进一步说明本发明,但不作为对本发明的限制。
实施例1
SIV RT-LAMP引物设计与筛选
根据GenBank公布的SIV包括多种亚型HA和NA序列共54株,利用DNAMAN5.9和DNAstar5.0进行序列分析。在54株SIV毒株的比对中发现其PA序列中550nt~780nt之间的突变较少,长度适合RT-LAMP实验的要求。参考H1N1型SIV序列设计引物。将设计的引物和54株SIV的序列再次进行比对,将引物靠近5’端和3’处各亚型SIV中存在差异的序列采取简并处理(图1),按照RNA LAMP kit的说明建立SIV RT-LAMP的反应体系对各套引物进行试验筛选,通过试验筛选结果的分析,确定以下这套引物为本方法的工作引物,序列如下:
F3-PA:AGGGGTCTATGGGATTCCTT
B3-PA:GAAAGCTTGCCCTCAATG
FIP-PA:WCGCATGGTTCCTGCGATTTCATCGTCAGTCCGAAAGAGGC
BIP-PA:RRCTTGCCGACCAAAGTCTCTCGGTTCGAATCCATCCACA
LF-PA:AATCTTTCTTCAATTGTGTC
LB-PA:CCGAACTTCTCCAGCCTTGA
并确定以上引物在引物混合液(PrimerMix,PM)各成分的比例:
取100pmol/μl F3-PA  2.5μl、100pmol/μl B3-PA  2.5μl、100pmol/μl FIP-PA  20.0μl,100pmol/μl BIP-PA  20.0μl、100pmol/μl LF-PA  10.0μl、100pmol/μl LB-PA  10.0μl混合,总体系75.0μl。每个反应需取1.5μl PM。
实施例2
试剂盒内组分的配制:
按以下各种组分的配方(50个反应量)配制成各种组分并分装到玻璃或塑料小容器中并用相应的塞子密封:
1.LBB II-RNA,本试剂组由RA、RB、RC、RD四部分构成:
RA:取1%2-巯基乙醇0.6ml、pH 8.01%Tris-HCL 0.6ml、10mmol/ml EDTA 1ml溶于5.0ml灭菌双蒸水中。
RB:6mmol/ml异硫氰酸胍35ml。
RC:无水乙醇15ml。
RD:100u/μl DNAse A 20μl溶于10ml DEPC H2O,
2.RT-LAMP反应试剂
1)PM:取100pmol/μl F3-PA 2.5μl、100pmol/μl B3-PA 2.5μl、100pmol/μl FIP-PA20.0μl,100pmol/μl BIP-PA 20.0μl、100pmol/μl LF-PA 10.0μl、100pmol/μl LB-PA10.0μl,加灭菌去离子水定容至总体系75.0μl。每个反应需取1.5μl PM。
2)RM:取4mmol/μl硫酸镁取50μl、1.6mol/μl甜菜碱50μl、10mmol/μl dNTPs 50μl,溶于475μl PCR级水中定溶至625μl。每个反应需取12.5μl RB。
3)EM:取16U/μl Bst大片段DNA聚合酶24μl,400U/μlAMV反转录酶24μl,1μmol/μlDTT 2μl。每个反应需要取1μl EB。
4)显色剂:取1μlSYBRgreenI(购自Invitrogen公司)溶于49μl PCR级水。每个反应加1μl。
实施例3
SIV RT-LAMP试剂盒的使用
1.使用LBBII-RNA提取样品RNA
取100μl细胞培养物(或拭子、组织研磨样品),经反复冻融3次后,按如下步骤操作:
样品中加入样品等体积RA,涡旋15s,12000g离心1min,取上清置于小管中;在上清液中加入3倍的RB溶液,涡旋或剧烈震荡90s,静置3min;加入1/3体积的RC溶液,涡旋1min,12000g离心1min。弃去上清液;待样品干燥后加入11μl RD,溶解沉淀,即为样品RNA。
2.SIV RT-LAMP反应
①配制RT-LAMP反应液:将RM 12.5μl,EM 1.0μl,PM 1.5μl加到反应管中;
②取5.0μl样品RNA加到①项配制的反应液的管中;
③混和后将反应管置于63℃恒温水浴锅中作用45min。
3结果判定:反应后在SIV RT-LAMP反应产物中加入1μL的显色剂,肉眼观察反应液颜色变化。阴性反应的反应液呈现橘红色,阳性样品的反应液呈绿色。
序列表
<110>中国兽医药品监察所
<120>猪流感病毒RT-LAMP检测试剂盒及其检测方法
<160>4
<210>1
<211>20
<212>DNA
<213>引物F3-PA
<223>人工序列
<400>1
AGGGGTCTAT GGGATTCCTT  20
<210>2
<211>18
<212>DNA
<213>引物B3-PA:
<223>人工序列
<400>2
GAAAGCTTGC CCTCAATG  18
<210>3
<211>42
<212>DNA
<213>引物FIP-PA:
<223>人工序列
<400>3
AWCGCATGGT TCCTGCGATT TCATCGTCAG TCCGAAAGAG GC  42
<210>4
<211>41
<212>DNA
<213>引物BIP-PA
<223>人工序列
<400>4
ARRCTTGCCG ACCAAAGTCT CTCGGTTCGA ATCCATCCAC A  41
<210>5
<211>20
<212>DNA
<213>引物LF-PA:
<223>人工序列
<400>5
AATCTTTCTT CAATTGTGTC  20
<210>6
<211>20
<212>DNA
<213>引物LB-PA
<223>人工序列
<400>6
CCGAACTTCT CCAGCCTTGA  20

Claims (5)

1.一种检测猪流感病毒的RT-LAMP检测试剂盒,其特征包含提取RNA试剂LBB II-RNA;含有序列1、2、3、4、5和6三对引物配制成引物混合液的RT-LAMP反应试剂两个组分。
2.如权利要求1所述的一种检测猪流感病毒的RT-LAMP试剂盒,其特征在于所述的提取RNA试剂LBB II-RNA含有以下溶液组成:
RA:取1%2-巯基乙醇0.6ml、pH 8.01%Tris-HCL 0.6ml、10mmol/ml EDTA 1ml灭菌双蒸水5.0ml;
RB:6mmol/ml异硫氰酸胍35ml;
RC:无水乙醇15ml;
RD:100u/μl DNAseA  20μl、10ml DEPC H2O。
3.如权利要求1所述的一种检测猪流感病毒的RT-LAMP试剂盒,其特征在于所述的反应试剂含有引物混合液PM、反应缓冲混合液RM、反应酶混合液EM及显色剂,其中引物混合液所用的引物序列1、2、3、4、5和6及其在混合液中各自的浓度为:
F3-PA:AGGGGTCTATGGGATTCCTT
B3-PA:GAAAGCTTGCCCTCAATG
FIP-PA:WCGCATGGTTCCTGCGATTTCATCGTCAGTCCGAAAGAGGC
BIP-PA:RRCTTGCCGACCAAAGTCTCTCGGTTCGAATCCATCCACA
LF-PA:AATCTTTCTTCAATTGTGTC
LB-PA:CCGAACTTCTCCAGCCTTGA
按总体系75.0μl含:100pmol/μl F3-PA  2.5μl、100pmol/μl B3-PA  2.5μl、100pmol/μlFIP-PA 20.0μl,100pmol/μl BIP-PA 20.0μl、100pmol/μl LF-PA 10.0μl、100pmol/μlLB-PA 10.0μl,灭菌去离子水定容至75.0μl。
4.一种检测猪流感病毒的RT-LAMP试剂盒的检测方法,其特征是包括以下步骤:
1)提取待测样品中的核酸;
2)配制RT-LAMP反应液:RM 12.5μl,EM 1.0μl,PM 1.5μl;
3)取5.0μl样品RNA加到①项配制的RT-LAMP反应液中;
4)混和后在63℃恒温水浴锅中作用45min;
5)结果判定:反应结束后在SIV RT-LAMP反应产物中加入1μL的显色剂,肉眼观察反应液颜色变化。阴性反应的反应液呈现橘红色,阳性样品的反应液呈绿色。
5.一种检测猪繁殖与呼吸综合征病毒的RT-LAMP试剂盒的检测方法,其特征是用LBB II-RNA提取样品RNA包括以下步骤:
取100μl细胞培养物或鼻腔拭子浸出样品,经反复冻融3次后,样品中加入样品等体积RA,涡旋15s,12000g离心1min,取上清置于新管中;在上清液中加入3倍的RB溶液,涡旋或剧烈震荡90s,静置3min;加入1/3体积的RC溶液,涡旋1min,12000g离心1min,弃去上清液放置5min后样品干燥,再加入11μl RD,溶解沉淀,即为样品RNA。
CN 200910087563 2009-06-30 2009-06-30 猪流感病毒rt-lamp检测试剂盒及其检测方法 Expired - Fee Related CN101629217B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN 200910087563 CN101629217B (zh) 2009-06-30 2009-06-30 猪流感病毒rt-lamp检测试剂盒及其检测方法

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN 200910087563 CN101629217B (zh) 2009-06-30 2009-06-30 猪流感病毒rt-lamp检测试剂盒及其检测方法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN101629217A true CN101629217A (zh) 2010-01-20
CN101629217B CN101629217B (zh) 2012-03-28

Family

ID=41574495

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN 200910087563 Expired - Fee Related CN101629217B (zh) 2009-06-30 2009-06-30 猪流感病毒rt-lamp检测试剂盒及其检测方法

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN101629217B (zh)

Cited By (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101914621A (zh) * 2010-08-18 2010-12-15 中国农业大学 一种猪肉肌纤维类型组成的mRNA定量检测方法
CN103484572A (zh) * 2013-10-16 2014-01-01 天津市畜牧兽医研究所 一种用于检测猪流感病毒的试剂盒及其应用
CN105177179A (zh) * 2015-08-11 2015-12-23 河北农业大学 用于猪流行性腹泻病毒检测的rt-lamp引物组、试剂盒及其应用
CN106435037A (zh) * 2016-12-13 2017-02-22 珠海出入境检验检疫局检验检疫技术中心 一种用于检测d型流感病毒的rt‑lamp引物及检测方法
CN109468416A (zh) * 2018-12-29 2019-03-15 博奥生物集团有限公司 特异检测猪流感病毒的rt-lamp检测引物及其应用、检测试剂和方法
CN110735005A (zh) * 2019-11-26 2020-01-31 广西大学 Siv和prrsv多重rt-pcr快速检测试剂盒及引物

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101323882B (zh) * 2007-06-14 2011-03-23 上海市农业科学院 一种检测猪流感病毒及血清亚型的引物集及其试剂盒

Cited By (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101914621A (zh) * 2010-08-18 2010-12-15 中国农业大学 一种猪肉肌纤维类型组成的mRNA定量检测方法
CN101914621B (zh) * 2010-08-18 2012-08-22 中国农业大学 一种猪肉肌纤维类型组成的mRNA定量检测方法
CN103484572A (zh) * 2013-10-16 2014-01-01 天津市畜牧兽医研究所 一种用于检测猪流感病毒的试剂盒及其应用
CN105177179A (zh) * 2015-08-11 2015-12-23 河北农业大学 用于猪流行性腹泻病毒检测的rt-lamp引物组、试剂盒及其应用
CN106435037A (zh) * 2016-12-13 2017-02-22 珠海出入境检验检疫局检验检疫技术中心 一种用于检测d型流感病毒的rt‑lamp引物及检测方法
CN106435037B (zh) * 2016-12-13 2020-07-10 拱北海关技术中心 一种用于检测d型流感病毒的rt-lamp引物及检测方法
CN109468416A (zh) * 2018-12-29 2019-03-15 博奥生物集团有限公司 特异检测猪流感病毒的rt-lamp检测引物及其应用、检测试剂和方法
CN110735005A (zh) * 2019-11-26 2020-01-31 广西大学 Siv和prrsv多重rt-pcr快速检测试剂盒及引物
CN110735005B (zh) * 2019-11-26 2023-01-10 广西大学 Siv和prrsv多重rt-pcr快速检测试剂盒及引物

Also Published As

Publication number Publication date
CN101629217B (zh) 2012-03-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Belák Molecular diagnosis of viral diseases, present trends and future aspects: A view from the OIE Collaborating Centre for the Application of Polymerase Chain Reaction Methods for Diagnosis of Viral Diseases in Veterinary Medicine
Das et al. Development of an internal positive control for rapid diagnosis of avian influenza virus infections by real-time reverse transcription-PCR with lyophilized reagents
CN106435024B (zh) 检测禽流感病毒亚型的荧光定量pcr引物、探针和试剂盒及检测方法
CN105483291B (zh) 猪德尔塔冠状病毒、猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒多重rt-pcr检测引物
CN101629217B (zh) 猪流感病毒rt-lamp检测试剂盒及其检测方法
CN102277454A (zh) 猪传染性胃肠炎病毒和猪流行性腹泻病毒检测用引物、探针及检测试剂盒
Borm et al. A universal avian endogenous real-time reverse transcriptase–polymerase chain reaction control and its application to avian influenza diagnosis and quantification
Collins et al. A NASBA method to detect high-and low-pathogenicity H5 avian influenza viruses
CN105441586A (zh) 一种a型h5n6亚型禽流感病毒双通道实时荧光pcr检测试剂盒和检测方法
Agüero et al. A fully automated procedure for the high-throughput detection of avian influenza virus by real-time reverse transcription–polymerase chain reaction
WO2016075277A1 (en) Novel fish virus and method for detection
CN105063760A (zh) 用于七种猪病病原鉴定的基因芯片及其检测方法
CN102071263B (zh) 禽流感病毒h5亚型套式荧光rt-pcr检测试剂及检测试剂盒
CN101724712B (zh) 动物虫媒病多重rt-pcr鉴别检测试剂及制备方法和应用
CN106636473B (zh) 检测h5亚型禽流感病毒与鸡细小病毒的成套试剂与方法
CN101392299B (zh) 一种马流感检测试剂盒和检测方法
CN108611438A (zh) 同时鉴别h9和h10亚型禽流感病毒二重rt-pcr检测引物组、试剂盒及其应用
CN102649985B (zh) H1n2亚型禽流感病毒rt-lamp可视化检测试剂盒
CN102321769A (zh) 鉴定新城疫病毒和多亚型禽流感病毒的引物对及其应用
Fereidouni et al. Sample preparation for avian and porcine influenza virus cDNA amplification simplified: Boiling vs. conventional RNA extraction
CN110669872A (zh) H9和h10亚型禽流感病毒三重rt-pcr检测引物组、试剂盒及方法
CN103215389B (zh) 猪繁殖与呼吸综合症和猪乙型脑炎双重一步法rt-pcr诊断试剂盒
CN102304591B (zh) 鉴定h3亚型禽流感病毒的pcr引物对及其应用
Kuriakose et al. Detection of avian influenza viruses and differentiation of H5, H7, N1, and N2 subtypes using a multiplex microsphere assay
CN108411042A (zh) 一种检测乙型脑炎病毒的荧光定量pcr引物及试剂盒

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C14 Grant of patent or utility model
GR01 Patent grant
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee

Granted publication date: 20120328

Termination date: 20180630

CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee