CN101323611B - 适于精氨酸残基标记的极性敏感荧光探针化合物及其制备方法与应用 - Google Patents
适于精氨酸残基标记的极性敏感荧光探针化合物及其制备方法与应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN101323611B CN101323611B CN2007101003863A CN200710100386A CN101323611B CN 101323611 B CN101323611 B CN 101323611B CN 2007101003863 A CN2007101003863 A CN 2007101003863A CN 200710100386 A CN200710100386 A CN 200710100386A CN 101323611 B CN101323611 B CN 101323611B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- preparation
- fluorescent probe
- cgtdp
- toluphenazine
- arginine residue
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
Images
Landscapes
- Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Abstract
本发明公开了适于精氨酸残基标记的极性敏感荧光探针化合物及其制备方法与应用。该荧光探针为3-(4-氯-6-对甲酰甲醛基苯氧基-1，3，5-三嗪氨基)-7-二甲胺基-2-甲基吩嗪，其结构如式I。本发明制备出一种能够用于含有精氨酸残基的化合物的选择性标记的极性敏感探针，该探针由于苯乙二醛基团的引入，可以用于含有精氨酸残基的生物大分子的标记及其附近区域极性变化情况的测定和研究，特别是蛋白质中精氨酸残基的选择性标记和精氨酸残基附近极性变化情况的研究。
Description
技术领域
本发明涉及了一种适于精氨酸残基标记的新型极性敏感荧光探针化合物——3-(4-氯-6-对甲酰甲醛基苯氧基-1，3，5-三嗪氨基)-7-二甲胺基-2-甲基吩嗪，及其制备方法与应用，特别是涉及该化合物在标记蛋白质中精氨酸残基及检测许多酶的活性位点附近的极性的应用。
背景技术
蛋白质分子的结构与功能紧密相关，它的局部错误折叠即可引起与之相关的疾病。因此，发展蛋白质分子的区域结构分析与研究方法(诸如局部信息的获取、折叠或局部构象变化研究等)，将有助于分子水平上认识生命的本质和疾病发生的机理。在研究酶的结构和功能中，活性位点性质和结构的检测也是比较关键的问题。目前，荧光光谱法因具有简便、高灵敏度和高时空分辨能力而成为这一研究领域应用最广泛、最有效的手段之一，构筑和发展各种性能优良的荧光探针及如何实现蛋白特定部位的定位标记则是开展此种研究的前提与基础。
精氨酸残基含有一个强碱性的胍基，在结合带有阴离子的酶活性部位中起着重要的作用，对精氨酸的专一性修饰研究具有重要的应用价值，精氨酸的选择性标记及其用于检测酶活性位点附近结构和性质的研究也是蛋白组学研究中的重要课题之一。目前，精氨酸的选择性标记大多数利用的是二羰基化合物，如苯乙二醛、乙二醛、丁二酮等，文献报道，这些试剂对结合阴离子的活性位点上的精氨酸残基具有高度的选择性(European Journal of Biochemistry，1980，105：387-393)。但这些试剂本身没有荧光，所以不能使用荧光方法对其进行检测。因此，发展用来标记精氨酸残基的荧光试剂非常重要。
发明内容
本发明的目的是提供一种能够用于含有精氨酸残基的化合物选择性标记的极性敏感荧光探针及其制备方法与应用。
该荧光探针为3-(4-氯-6-对甲酰甲醛基苯氧基-1，3，5-三嗪氨基)-7-二甲胺基-2-甲基吩嗪，其结构如式I，
该极性敏感荧光探针从功能上分，由三部分组成：中性红作为极性敏感基团；三聚氰氯作为桥联剂；苯乙二醛作为标记精氨酸的基团。
该极性敏感荧光探针的制备是利用三聚氰氯分子中的三个氯原子在不同温度下反应活性的差别而实现的：在0～5℃下先取代三聚氰氯的第一个氯原子，在50～70℃下取代第二个氯原子，得到目标产物。具体的，包括如下步骤：
步骤a)：将三聚氰氯与中性红在碱性条件于0～5℃进行反应，得到中间体DTDP；
步骤b)：中间体DTDP与对羟基苯乙二醛在碱性条件于50～70℃进行反应，得到产物3-(4-氯-6-对甲酰甲醛基苯氧基-1，3，5-三嗪氨基)-7-二甲胺基-2-甲基吩嗪。
其中，步骤a)的条件为：pH为8～9，溶剂为丙酮；步骤b)的条件为：pH为8～9，溶剂为四氢呋喃。
本发明荧光探针CGTDP具有以下特点：1)在绝大多数溶剂中荧光性质稳定；2)具有长的荧光发射波长(>550nm)，有利于避免来自普通生物大分子的小于500nm背景荧光的干扰；3)最大荧光发射峰位对环境极性十分敏感，极性增加导致发射波长发生红移，更重要的是，这种漂移只对极性敏感，而不受环境的温度和pH值的影响。因而，该CGTDP探针能在热和酸的变化下对极性进行准确的测定。
CGTDP由于具有上述性质，而且具有适于精氨酸标记的选择性基团—苯乙二醛基团，因此，可广泛应用于含精氨酸残基的化合物分析，特别是，用于含精氨酸残基的蛋白质的分析，这也属于本发明的保护范围。通过对蛋白质上精氨酸残基的选择性标记，从而可以检测被标记基团附近的极性及在不同条件下被标记基团附近区域极性变化情况的测定。
本发明制备出一种能够用于含有精氨酸残基的化合物的选择性标记的极性敏感探针，该探针由于苯乙二醛基团的引入，可以用于含有精氨酸残基的生物大分子的标记及其附近区域极性变化情况的测定和研究，特别是蛋白质中精氨酸残基的选择性标记和精氨酸残基附近极性变化情况的研究。
附图说明
图1为CGTDP在不同溶剂中的荧光发射光谱图；
图2为CGTDP的最大发射波长位移值与溶剂介电常数线性关系图；
图3为CGTDP在不同pH下的荧光发射光谱图；
图4为CGTDP在不同温度下的荧光发射光谱图；
图5为CGTDP、蛋白和CGTDP标记蛋白的紫外吸收光谱比较；
图6为在室温下CGTDP、蛋白和CGTDP标记蛋白的荧光发射光谱的比较图。
具体实施方式
实施例1：3-(4-氯-6-对甲酰甲醛基苯氧基-1，3，5-三嗪氨基)-7-二甲胺基-2-甲基吩嗪(CGTDP)的制备
本发明3-(4-氯-6-对甲酰甲醛基苯氧基-1，3，5-三嗪氨基)-7-二甲胺基-2-甲基吩嗪由三部分构成：中性红作为极性敏感基团，三聚氰氯作为桥联剂，苯乙二醛作为精氨酸标记基团，其合成路线如下：
具体的合成过程如下：
步骤a)：将280mg(1.5mmo1)三聚氰氯溶解于约10ml冰丙酮中，缓缓加入约40ml中性红(288mg，1mmol)的冰丙酮溶液和4ml碳酸钠(106mg，1mmol)水溶液，使反应液的pH为8～9之间，滴加时间约为20min，并在0～5℃搅拌反应。反应1.5h后，加冰块停止反应，过滤生成的沉淀产物，并用冷丙酮洗涤。用柱层析分离(硅胶G，200-300目)，乙酸乙酯作洗脱剂提纯得到中间产物棕红色固体DTDP。
步骤b)：在搅拌下，向约20ml DTDP(92mg，0.23mmol)的THF溶液中，逐滴加入10ml对羟基苯乙二醛(56mg，0.33mmol)的THF溶液和3ml碳酸氢钠(0.23mmol)水溶液，使反应液的pH为8～9之间，滴加时间约为20min。在回流温度下反应3h后，加水停止反应，过滤生成的沉淀产物，并用水洗涤三次。用柱层析分离(硅胶G，200-300目)，乙酸乙酯/石油醚(2：1，V/V)作洗脱剂提纯得到最后产物3-(4-氯-6-对甲酰甲醛基苯氧基-1，3，5-三嗪氨基)-7-二甲胺基-2-甲基吩嗪。
其中，对羟基苯乙二醛(p-Hydroxyphenylglyoxal)可按照文献(Journal of theAmerican Chemical Society，1949，71：1045-1048)进行合成：将4.08g二氧化硒加于30ml1，4二氧六环和1ml水的混合液中，在60℃下加热溶解，之后加入5g对羟基苯甲酮，加热煮沸回流4.5h，溶液由黄色变为红色，有单质硒析出。将反应产生的单质硒过滤出，滤液浓缩成小体积，颜色为橙黄色，加入30ml水，加热煮沸回流3h，再加入1g活性炭脱色，回流15min，有黄色针状固体析出。用水重结晶得到浅黄色针状固体对羟基苯乙二醛。
实施例2、CGTDP的光谱性质
将CGTDP溶解在不同溶剂中(浓度为10μM)，测定其荧光发射光谱，结果如图1所示。荧光发射光谱测定时以相应的最大激发波长去激发；激发和发射的狭缝宽度为10nm。图中，(a)水(0.1M NaHCO3，pH8.6)；(b)二甲基亚砜；(c)乙腈；(d)丙酮；(e)四氢呋喃。
CGTDP(10μM)在不同溶剂的光谱数据如表1，其最大发射波长位移值(Δλem)与溶剂介电常数(D)线性关系图如图2所示，荧光最大发射波长位移值与介电常数间的线性方程：Δλem＝40.6-0.54×D。
表1.CGTDP在不同溶剂中的荧光光谱性质
图3为在不同pH值下的CGTDP荧光发射光谱。CGTDP的浓度为10μM(0.1M NaCl)图中，(a)pH4.0，(b)pH6.0，(c)pH7.1，(d)pH8.4，(e)pH9.1和(f)pH10.0。激发波长λex＝507nm，激发和发射的狭缝宽度为10nm，激发电压700V。
图4为在不同温度下的CGTDP荧光发射光谱。CGTDP的浓度为10μM(0.1MNaHCO3，pH8.6)，图中，(a)15℃，(b)30℃，(c)50℃，(d)60℃，(e)70℃。激发波长λex＝507nm，激发和发射的狭缝宽度为10nm，激发电压700V。
以上结果表明，本发明CGTDP荧光探针具有以下特点：1)在绝大多数溶剂中荧光性质稳定；2)具有长的荧光发射波长(>550nm)，有利于避免来自普通生物大分子的小于500nm背景荧光的干扰；3)最大荧光发射峰位对环境极性十分敏感，极性增加导致发射波长发生红移，更重要的是，这种漂移只对极性敏感，而不受环境的温度和pH值的影响。因而，该CGTDP探针能在热和酸的变化下对极性进行准确的测定。
实施例3：应用极性敏感荧光探针CGTDP对肌酸激酶(CK)的处于活性位点的精氨酸残基进行选择性标记及其活性位点附近极性的检测。
配置2ml肌酸激酶CK(5μM)的碳酸氢钠缓冲溶液(pH8.6)，加入100μlCGTDP(4mM)的DMSO溶液，在30℃下反应1.5h。用Sephadex G-25凝胶柱分离反应液中的蛋白标记产物与游离的荧光试剂，并用紫外—可见分光光度仪检测，收集在280nm和508nm处同时出现吸收的标记蛋白部分。
图5为CGTDP、肌酸激酶、CGTDP标记后的肌酸激酶的紫外吸收光谱，图中，(a)CGTDP(2.75μM)，(b)肌酸激酶(2.2μM)，(c)CGTDP标记后的肌酸激酶(2.3μM)。从图中可以看出，在280nm和508nm附近的吸收峰的同时出现，证明肌酸激酶已成功地被CGTDP所标记，CGTDP对肌酸激酶的标记率为60％。
图6为在室温下CGTDP、肌酸激酶以及CGTDP标记后的肌酸激酶的荧光发射光谱的比较，激发和发射的狭缝宽度为10nm，激发电压700V。图中，(a)肌酸激酶；(b)CGTDP；(c)CGTDP标记后的肌酸激酶。通过此图谱，可以发现肌酸激酶被CGTDP、肌酸激酶、CGTDP标记后的肌酸激酶标记后，CGTDP的荧光发射峰从607nm蓝移到591nm，按照得到的荧光最大发射波长位移值与介电常数间的线性方程：Δλem＝40.6-0.54×D，可以计算出肌酸激酶(CK)标记位点附近区域的介电常数为45.6。
应用本发明极性敏感荧光探针CGTDP，首次实现了对肌酸激酶标记位点附近极性的准确测定，在理论上和实际应用上具有很大的意义。
Claims (7)
1.式I结构的3-(4-氯-6-对甲酰甲醛基苯氧基-1，3，5-三嗪氨基)-7-二甲胺基-2-甲基吩嗪，
2.3-(4-氯-6-对甲酰甲醛基苯氧基-1，3，5-三嗪氨基)-7-二甲胺基-2-甲基吩嗪的制备方法，是按如下路线合成的：
3.根据权利要求2所述的制备方法，其特征在于：所述制备过程包括如下步骤：
步骤(a)：将三聚氰氯与中性红在碱性条件于0～5℃进行反应，得到中间体DTDP；
步骤(b)：中间体DTDP与对羟基苯乙二醛在碱性条件于50～70℃进行反应，得到产物3-(4-氯-6-对甲酰甲醛基苯氧基-1，3，5-三嗪氨基)-7-二甲胺基-2-甲基吩嗪。
4.根据权利要求3所述的制备方法，其特征在于：步骤(a)的条件为：pH为8～9，溶剂为丙酮。
5.根据权利要求3所述的制备方法，其特征在于：步骤(b)的条件为：pH为8～9，溶剂为四氢呋喃。
6.3-(4-氯-6-对甲酰甲醛基苯氧基-1，3，5-三嗪氨基)-7-二甲胺基-2-甲基吩嗪在精氨酸残基标记中的应用。
7.3-(4-氯-6-对甲酰甲醛基苯氧基-1，3，5-三嗪氨基)-7-二甲胺基-2-甲基吩嗪在精氨酸残基附近的极性变化情况测定中的应用。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN2007101003863A CN101323611B (zh) | 2007-06-11 | 2007-06-11 | 适于精氨酸残基标记的极性敏感荧光探针化合物及其制备方法与应用 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN2007101003863A CN101323611B (zh) | 2007-06-11 | 2007-06-11 | 适于精氨酸残基标记的极性敏感荧光探针化合物及其制备方法与应用 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN101323611A CN101323611A (zh) | 2008-12-17 |
| CN101323611B true CN101323611B (zh) | 2010-09-29 |
Family
ID=40187334
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN2007101003863A Expired - Fee Related CN101323611B (zh) | 2007-06-11 | 2007-06-11 | 适于精氨酸残基标记的极性敏感荧光探针化合物及其制备方法与应用 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN101323611B (zh) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN106565697B (zh) * | 2016-10-20 | 2019-02-26 | 郑州大学 | 一种溶酶体定位荧光探针、制备方法及在近红外比率检测精氨酸中的应用 |
-
2007
- 2007-06-11 CN CN2007101003863A patent/CN101323611B/zh not_active Expired - Fee Related
Non-Patent Citations (8)
| Title |
|---|
| .三嗪类光学探针与标记分析.分析化学31 10.2003,31(10),1256-1260. |
| Laszlo PATTHY et al.Origin of the Selectivity of a-DicarbonylReagentsforArginylResidues of Anoin-BInding Sites.Eur.J.Biochem105.1980,105387-393. * |
| 梁树权 |
| 聂丽华 等.通过三嗪荧光探针的多氢键作用识别胸腺嘧啶.高等学校化学学报24 1.2003,24(1),37-39. |
| 聂丽华等.通过三嗪荧光探针的多氢键作用识别胸腺嘧啶.高等学校化学学报24 1.2003,24(1),37-39. * |
| 苏美红 |
| 马会民 |
| 马会民 苏美红 梁树权.三嗪类光学探针与标记分析.分析化学31 10.2003,31(10),1256-1260. * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN101323611A (zh) | 2008-12-17 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Hoelzel et al. | Visualizing and manipulating biological processes by using HaloTag and SNAP‐tag technologies | |
| Klymchenko et al. | Fluorescent environment-sensitive dyes as reporters of biomolecular interactions | |
| Xie et al. | A novel highly selective probe with both aggregation-induced emission enhancement and intramolecular charge transfer characteristics for CN− detection | |
| Tong et al. | A 1, 3‐Indandione‐Functionalized Tetraphenylethene: Aggregation‐Induced Emission, Solvatochromism, Mechanochromism, and Potential Application as a Multiresponsive Fluorescent Probe | |
| Xiang et al. | Highly sensitive and selective optical chemosensor for determination of Cu2+ in aqueous solution | |
| Svanvik et al. | Free-probe fluorescence of light-up probes | |
| Kim et al. | Synthesis of π‐Extended Coumarins and Evaluation of Their Precursors as Reactive Fluorescent Probes for Mercury Ions | |
| Johansson et al. | Time gating improves sensitivity in energy transfer assays with terbium chelate/dark quencher oligonucleotide probes | |
| Browne et al. | Simultaneous quantification of multiple nucleic acid targets using chemiluminescent probes | |
| JPH06510296A (ja) | 巨環状希土類錯体，それを用いた螢光分析における干渉低減方法およびそれを用いて螢光分析における干渉を低減させる使用方法 | |
| CA2627628A1 (en) | Novel fluorescent dyes and uses thereof | |
| Luo et al. | Molecular probe design via the “covalent-assembly” principle | |
| Sun et al. | A novel colorimetric and fluorometric probe for the detection of CN− with high selectivity in aqueous media | |
| Wakamatsu et al. | Photo‐triggered fluorometric hydrophobic benzyl alcohol for soluble tag‐assisted liquid‐phase peptide synthesis | |
| Tigreros et al. | Ecological and Economic Efforts in the Development of Molecular Sensors for the Optical Detection of Cyanide Ions | |
| Liu et al. | Cholic acid-based high sensitivity fluorescent sensor for α, ω-dicarboxylate: an intramolecular excimer emission quenched by complexation | |
| WO2020191339A1 (en) | Photoaffinity probes | |
| Cserép et al. | NIR Mega‐Stokes Fluorophores for Bioorthogonal Labeling and Energy Transfer Systems–An Efficient Quencher for Daunomycin | |
| US7790392B2 (en) | Homogeneous luminescence bioassay | |
| CN101323611B (zh) | 适于精氨酸残基标记的极性敏感荧光探针化合物及其制备方法与应用 | |
| JP2001002951A (ja) | 新規な蛍光色素およびその蛍光マーカーとしての使用 | |
| Wang et al. | Homogeneous time-resolved fluoroimmunoassay of bensulfuron-methyl by using terbium fluorescence energy transfer | |
| Yokoo et al. | Unique Properties of 1, 5‐Naphthyridin‐2 (1H)‐one Derivatives as Environment‐Polarity‐Sensitive Fluorescent Dyes | |
| Lee et al. | Synthesis and photophysical properties of a fluorescent cyanoquinoline probe for profiling ERBB2 kinase inhibitor response | |
| Nakamura et al. | Efficient Formation of Luminescent Lanthanide (III) Complexes by Solid‐Phase Synthesis and On‐Resin Screening |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| C06 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| C10 | Entry into substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| C14 | Grant of patent or utility model | ||
| GR01 | Patent grant | ||
| C17 | Cessation of patent right | ||
| CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee |
Granted publication date: 20100929 Termination date: 20130611 |