CN101253404A - 对生物样本和其它物体的操纵和/或检测 - Google Patents
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Abstract
用于生物材料或其它材料的操纵、检测、成像、表征、分类和/或装配的方法和设备,涉及CMOS或其它基于半导体的工艺与微流学的结合。在一个实施方案中,与电场和/或磁场的生成有关的各种部件在通过使用标准协议被制作的IC芯片上被实施。所生成的电场和/或磁场被使用来操纵和/或检测一个或多个介电粒子和/或磁粒子,以及区分不同类型的粒子。微流***被直接制作在IC芯片的顶部,或被制作为分离的实体,然后被适当地接合到IC芯片上,以便于在生物可兼容的环境下的细胞的引入和去除,或悬浮在流体中的感兴趣的其它粒子/物体的引入和去除。由IC芯片生成的、图案化的电场和/或磁场可以收集和移动在微流***内的生物细胞或其它物体。电场和/或磁场生成部件也可以通过使用各种频率的信号被控制,以便通过测量同在样本与一个或多个场生成装置之间的相互作用有关的共振特性而检测一个或多个细胞、感兴趣的粒子或物体,以及甚至感兴趣的粒子或物体的类型。这样的***可以在各种各样的生物与医学有关的应用中被利用,包括细胞分类和组织装配。
Description
技术领域
本发明一般地涉及用于经由电磁场操纵、检测、成像和/或识别粒子或物体的方法和设备。在各种例子中,公开了集成微***方法和设备,包括通过使用传统的半导体技术(例如,Si,SiGe,CMOS,GaAs,InP)制造的、和被配置成经由电场和/或磁场相互作用来引导、感测、成像和/或识别感兴趣的粒子或物体的电场和/或磁场生成装置。在某些例子中,这样的场生成装置与微流***合并在一起,进一步使得感兴趣的粒子或物体的运动、感测、成像和/或识别变得容易。
背景技术
在生物和医学科学中,能够沿规定的路径操纵(例如,移动或引导)生物样本(例如,一个或多个细胞)常常是有用的。基于磁场的生物***的操纵是一种传统上使用的、完成这种任务的方法。在牵涉到磁场的一种传统的实施方案中,具有化学修正表面的小的磁珠(magneticbead)可被耦合到目标生物***,诸如特定的细胞或微组织。根据给定的磁珠的涂覆的类型以及磁珠的相对大小和目标细胞或微组织,磁珠可被粘附到细胞或微组织的表面(外部耦合),或被细胞或微组织摄取(内部耦合)。这样的“磁珠粘合”样本然后可以悬浮在主液(host liquid)中,构成“微流体”,在微流体中的悬浮的样本然后可以通过使用外部磁场而操纵。基于这种原理的装置常常被称为“磁镊”,在传统上被使用来收集悬浮在液体中的小的粒子(例如,DNA)供研究用。
因为磁场和磁珠本身典型地是生物可兼容的,所以这个过程是非侵入性的并且通常不损坏样本。然而,传统的磁镊无法提供多个磁珠的分别控制,因为这些装置典型地只产生可以移动的单个场峰值;因此传统上在微流体内仅仅可以控制单个磁珠,或同时控制紧密地在一起的一组磁珠。
与悬浮在液体中的生物样本、粒子或其它物体的运动和操纵有关的另一个领域涉及被称为介电电泳的现象。当非均匀电场在悬浮在液体中的粒子上感应出偶极子时,发生介电电泳。在偶极子上的随后的力将粒子拉到电场的最小值或最大值处。几乎任何粒子,没有任何专门的准备,当被暴露到适当的本地电场时,都可以通过使用介电电泳被收集或移动。这是基于电场的操作超过上述的基于磁场的操作的优点,因为后者要求用磁珠标记生物样本或其它感兴趣的物体。然而,介电电泳的潜在的缺点在于,相对较强的电场在某些环境下可能损坏细胞、粒子或其它感兴趣的物体。
能够在医疗诊断和生命科学中实现各种应用的、与生物样本的运动和操纵有关的又一个领域被称为“微流学”。微流学通过提供支持和维持细胞和组织的生理体内平衡的微尺度生物兼容的环境来针对小的生物样本的抑制和/或流动。微流***可被配置成用于保持包含感兴趣的细胞/生物样本的液体的相对较简单的腔室或蓄液池(“浴盆”);可替换地,这样的***可以具有复杂得多的、包括多个管道或通道的装置,在其中细胞、粒子或其它感兴趣的物体可以流动。通过控制流体在微尺度通道中的流动,少量的样本可以在微流***内被以想要的路径导引。诸如阀门、过滤器、混合器、和配量器那样的各种微流装置,与在更复杂的微流***中的微流通道相结合,可使得微尺度上的精巧的生物分析变得容易。由于为批量制造允许进行许多复制的软平版印刷技术,即使某些复杂的传统的微流***的制造通常也认为是成本经济的。
然而,一旦被制作,传统的微流***(特别是更复杂的***)不提供明显的灵活度,并且特别没有足够的可编程性和可控制性。特别地,被使用于诸如细胞分类那样的分析操作的传统的微流***被制造成具有特定的数目和设置的固定的通道和阀门。阀门的操作控制细胞流动到通道中,由此将它们分类。***的功能通常是基于在相对较大数目的细胞之间进行区分的统计方法,而不是一次分类一个细胞。因为通道和阀门的设置是在微流***制造期间确定的,每个***被设计成用于特定的操作,并且典型地不修改它的基本结构则无法使用于不同的过程。
集成电路(IC)技术是上一个世纪的最重大的使能技术之一。I C技术是基于使用各种各样的半导体材料(例如,硅Si、硅锗SiGe、砷化镓GaAs、磷化铟InP等等)来实施各种各样的电子部件和电路。或许IC技术的最流行的例子之一是用来制造硅集成电路的CMOS(互补型金属氧化物半导体)技术。
CMOS工艺使得现在已成为日常生活的常规部分的、举一些例子来说诸如个人计算机、蜂窝电话和无线网络等等的先进的计算和通信应用成为可能。计算机和通信工业的成长大大地依靠电子与在硅集成电路的减小的尺寸和提高的速度方面相关的技术的不断的进步,它的趋势通常由Moore定律量化。当前,硅CMOS芯片可以在小到90纳米的结构中包含超过1亿个晶体管并且以几个GHz的速度运行。CMOS微制造技术在近几十年大大地成熟,使得硅集成电路非常便宜。然而,尽管有多个优点,CMOS或任何其它基于半导体的IC技术都没有广泛使用于(即,超出常规的数据处理功能)实施用于诸如样本操纵和表征那样的生物应用的结构。
发明内容
本申请人认识到和看到集成电路基于半导体的技术(例如,Si,SiGe,GaAs,InP等等)、特别是CMOS工艺,提供了用于实现操纵和表征生物材料和感兴趣的其它物体的***和方法的可行的基础。而且,本申请人认识到和看到,通过把CMOS或其它基于半导体的技术与微流学相组合,可以实现各种各样有用的和有力的、与生物材料和其它材料相关的方法和设备。
鉴于上述内容,本公开内容的各种实施例包括CMOS或其它基于半导体的技术与微流学的结合,涉及在微尺度上用于生物材料或其它材料的操纵、检测、成像、表征、分类和装配中的一项或多项的方法和设备。
例如,一个实施例针对把集成电路芯片的能力与微流***的生物兼容性相组合的IC/微流混合***。在本实施例的一个方面,涉及这样的混合***的电场和/或磁场生成的各种部件在芯片制造厂使用标准协议(例如,CMOS)制造的IC芯片上被实施。另一方面,场生成部件本身可以通过使用标准CMOS协议被形成,因此不需要任何微机械加工技术(例如在微电子机械结构或MEMS实施方案中那样)。从这样的IC芯片生成的电场和/或磁场可被使用来操纵和/或检测一个或多个介质粒子和/或磁粒子,并且区分不同类型的粒子。
特别地,在一个实施例中,微电磁体或“微线圈”的阵列在IC芯片上被实施,并被配置来产生可控制的、带有空间和/或时间的图案的磁场。一方面,IC芯片还可包括可编程的数字交换网络和一个或多个电流源,其被配置来独立地控制阵列的每个微线圈中的电流,以便创建带有空间和/或时间的图案的磁场。另一方面,IC芯片还可包括温度调节***,以实现混合***的生物兼容性。
在另一个实施例中,微电极或“微柱”的阵列在IC芯片上被实施,并被配置来产生可控制的、带有空间和/或时间的图案的电场,以便根据介电电泳原理操纵感兴趣的粒子。一方面,IC芯片还可包括可编程的数字交换网络和一个或多个电压源,其被配置来独立地控制在阵列的每个微柱上的电压,以便创建带有空间和/或时间的图案的电场。正如前面的实施例那样,另一方面,IC芯片还可包括温度调节***,以实现混合***的生物兼容性。
在再一个实施例中,IC芯片上实施的微线圈的阵列可被配置来产生可控制的、带有空间和/或时间的图案的电场和/或磁场。一方面,IC芯片还可包括可编程的数字交换网络,连同一个或多个电流源与一个或多个电压源一起,被配置来独立地控制在阵列的每个微线圈中的电流和电压,以便创建带有空间和/或时间的图案的磁场和电场。在本实施例的另一方面,当微线圈上被加上电压时,微线圈有效地起到微柱的作用,由此如以前的实施例那样用来根据介电电泳原理操纵感兴趣的粒子。再次地,按照本实施例的IC芯片还可包括温度调节***,以实现混合***的生物兼容性。
与任何上述的涉及电场和/或磁场生成的实施例相结合,按照本公开内容的再一个实施例,微流***可被直接制作在IC芯片的顶部,或作为分离的实体,即适当地结合在IC芯片上,以便在生物兼容的环境下引入和去除细胞,或悬浮在流体中的感兴趣的其它粒子/物体。这样,由IC芯片生成的、图案化的电场和/或磁场可以收集和移动在微流***内的生物细胞或其它物体。
本公开内容的其它实施例针对利用以上介绍的基于IC的磁场和/或电场生成阵列或磁场和/或电场生成装置的其它设置之一的感测/成像方法和设备。例如,在这些感测实施例的各个方面,微线圈阵列、微柱阵列或场生成装置的其它设置(例如,参阅在2002年11月5日提交的、题目为“System and Method for Capturing and PositioningParticles,”的PCT专利申请No.PCT/US02/36280,国际公布No.WO03/039753 A1中描述的各种结构)可以通过使用各种频率的信号被控制,以便能够通过测量与在样本和一个或多个场生成装置之间的相互作用关联的共振特性而检测一个或多个细胞、粒子或感兴趣的物体,以及甚至粒子或感兴趣的物体的类型。
在某些实施例中,射频(RF)信号被利用来便于检测、成像和/或识别。作为这些RF实施例的基础的原理之一是RF场能够几乎与在RF信号频率下导电的或可电或磁极化的任何(生物的或其它的)粒子相互作用。因此,在这些RF感测实施例中,RF场与RF场附近的物体之间的相互作用可被利用来确定一个或多个感兴趣的物体的位置,以便实现物体的成像。这样,如这里公开的、基于半导体/微流混合***和方法可被配置成通过使用RF信号纯经由电/磁装置来检测和成像生物细胞、粒子和感兴趣的物体,而不用依赖于化学制剂或光学技术。根据这样的RF成像技术,按照本公开内容的混合***的各种实施方案可以包括反馈控制机制,由此感兴趣的样本可以根据得到的样本图像来操纵。
在某些方面,这里公开的RF技术不单可被使用于检测和成像粒子,而且还可以用来识别不同类型的粒子/感兴趣的物体。这种类型的识别例如可以通过测量RF场的频谱响应/在广泛的频率范围上的粒子相互作用以及把这些响应与各种材料在电磁场中已知的依赖于频率的特性相比较而完成。另一方面,这里公开的RF技术还可被用于在被施加到样本或感兴趣的物体上的均匀磁场下进行磁共振(包括铁磁共振)的局部测量,由此根据自旋(例如,电子自旋共振或“ESR”)或磁域(例如,核磁共振或“NMR”)的特征振荡频率识别样本的材料。因此,按照本公开内容的各种实施例的方法和设备可被利用来在芯片上有效地实施磁共振成像(MRI)***。
鉴于以上讨论的和下面更详细地讨论的操纵、检测、成像和识别技术,本申请人认识到和看到,这里公开的基于半导体/微流混合***和方法使得各种各样新型的生物医药和***生物学的研究以及其它应用更加容易。
例如,本公开内容的另一个实施例针对通过利用IC/微流混合方法和设备以及如以上介绍的RF感测/成像方法和设备的细胞分类方法和设备。一方面,按照本实施例的细胞分类方法和设备使得分子程度地精确识别和快速、高精确度的细胞分类变得容易。特别地,生物细胞可以以特高的准确度和以分子程度的精确性的识别被各个地分类。这样精确性的分类便于了特定的(例如“稀少的”)细胞类型或病原体(例如用于癌症病人的骨髓重建手术的干细胞)的分离,用于临床应用。这样精确性的分类还便于了分析组织的统计和分离地估计每种细胞类型,而不是从不同的细胞类型的集合收集有关组织的基因表达数据。
本发明的再一个实施例是针对用于装配微尺度工程化组织(engineered tissues)的方法和设备。在本实施例的一个方面,基于IC/微流混合***的二维细胞收集阵列被配置成能够以精确的控制细胞群体和空间分布进行微尺度组织装配(例如,来自细胞的异型分布的人造组织可一次装配一个细胞)。按照本公开内容的一个实施例的这样的技术代表用来开发新颖的在体外的化验的新的方法,用于研究在不同的细胞类型之间的通信网络,药物功效,和以标准化的可重复的方式用于基础生理研究。
按照本公开内容的各种实施例的基于半导体的IC/微流混合***具有几个重要的技术优点。首先,基于半导体/微流的混合***可以通过使用成熟的CMOS工艺和用于形成微流***部分的便宜的平版印刷技术以适当的成本经济的方式以高产量被制造。这样的CMOS实施的***可被做成尺寸上相当小和被适当地封装成能对抗各种环境的危害。先进的低功率集成电路技术也便于了制造电池供电的装置。鉴于上述的内容,这样的***可被做成粗糙的一次性的装置,并且可被利用于各种各样的应用,包括在使用传统的方法和设备时要避免的、潜在地有害的和/或紧急的情形。例如,按照本公开内容的各种实施例的、小的、便宜的、电池供电的、粗糙的混合***可以容易地和有效地被利用于紧急医疗情形,通过使用唾液、呼吸、汗液或血液样本快速检查个人的健康。这样的***还可被利用于在给定的环境下检测生物上有害的物质。
另外,与使用简单的磁镊或外部磁体的传统的磁性操纵,或与传统的介电电泳技术相比较,按照本公开内容的基于半导体/微流的混合***和方法可以大量地并以容易的、精确的和快速控制的方式操纵单个或多个生物细胞、粒子或其他感兴趣的物体。而且,按照本公开内容的各种实施例的基于半导体的IC/微流混合***和方法比起传统的微流***提供显著的灵活性。特别地,略为更复杂的传统的微流***通过使用预定的阀门控制来控制固定的通道网络中的生物样本;因此,不同的操作需要不同的特定的微流***。相反,按照本公开内容的各种实施例的基于半导体/微流的混合***和方法能够执行各种和精巧的细胞/粒子操纵操作,而不一定需要复杂的微流***结构。
例如,在一个实施例中,按照本公开内容的可编程混合***可以通过使用与提供可编程的和可独立控制的电磁场的基于半导体的***合并的、只具有单个腔室(“浴盆”)的相对较简单的微流***来实施。在本实施方案中,细胞几乎可以在电磁场的计算机控制下沿任何路径移动通过腔室。这样,用于感兴趣的样本的“虚拟的微尺度管路***”的拓扑可以基于由计算机控制提供的可编程性,针对各种各样的操作而被灵活地改变。这对于在相对较简单的和更精巧的操作中为精确的细胞/物体操纵提供极其有力的工具。
总之,按照本公开内容的一个实施例针对一个设备,包括:多个CMOS制造的场生成部件;在多个CMOS制造的场生成部件附近的、被配置成包含流体的微流***;以及至少一个控制器,被配置成控制多个CMOS制造的场生成部件,以生成至少一个具有足够的强度与悬浮在流体中的至少一个样本相互作用的电场或磁场。
按照本公开内容的另一个实施例针对一种方法,包括从多个CMOS制造的场生成部件生成至少一个电场或磁场的行为;所述至少一个电场或磁场具有足够的强度与悬浮在流体中的至少一个样本相互作用,该流体被包含在多个CMOS制造的场生成部件附近的微流***中。
应当理解,下面更详细地讨论的上述的概念和附加概念的所有的组合打算作为在此公开的本发明的主题的一部分。特别地,在本公开内容的末尾出现的要求保护的主题内容的所有的组合打算作为这里公开的本发明的主题内容的一部分。
附图说明
图1是示出按照本公开内容的一个实施例的基于半导体/微流的混合***的各种部件的总貌的框图;
图2示出按照本公开内容的一个实施例的、图1所示的混合***的部件的示例的物理设置;
图3(a)-(d)示出按照本公开内容的一个实施例的、提供可被包括在图1和2所示的混合***中的磁场生成部件的一个例子的微电磁体连线矩阵;
图4是按照本公开内容的一个实施例的、也可以被用作为图1和2所示的混合***中的磁场生成部件的“环形收集器”的示意图;
图5(a)和(b)是按照本公开内容的一个实施例的、提供可被包括在图1和2所示的混合***中的电场生成部件的一个例子的微柱阵列;
图6(a)是按照本公开内容的一个实施例的、可以用作在图1和2所示的混合***中的场生成部件的微线圈阵列的概念性透视图;
图6(b)是按照本公开内容的一个实施例的、图6(a)所示的阵列的一部分的(上部)顶视图的概念性视图,通过包含液体的微流通道的一部分向下观察阵列,其中在液体中悬浮着包括被附着到细胞上的磁珠的示例性样本;
图7(a)和7(b)分别示出按照本公开内容的一个实施例的、可以在图6(a)和6(b)的阵列中被利用的多层微线圈的透视图和分解图;
图8概念性地示出按照本公开内容的一个实施例的CMOS IC芯片的一部分的垂直层结构,其示出与芯片的其它特性和层有关的图7(a)和7(b)的多层微线圈结构;
图9示出按照本公开内容的一个实施例的、当电流流过微线圈时在类似于图7和8所示的那些多层微线圈上面的示例性磁场分布图;
图10概念性地示出按照本公开内容的一个实施例的、图6(a)和(b)所示的阵列的两个相邻的微线圈,其中基本上相等的电流流过微线圈,以生成两个基本上相等的磁场峰值;
图11(a)-(e)示出按照本公开内容的一个实施例的、针对图10的相邻的微线圈的五种示例性情形,在各个线圈中具有变化的电流大小和方向以及生成的最终得到的磁场;
图12是示出对于图11(a)-(e)所示的五种示例性情形的每种情形,在每个线圈中的电流大小和方向的图;
图13示出按照本公开内容的一个实施例的、类似于图6(a)所示的微线圈阵列和与该阵列关联的各种场控制部件;
图14示出按照本公开内容的一个实施例的、在图13的阵列的第一象限中部件的各种互联;
图15示出按照本公开内容的一个实施例的、被包括在图14所示的第一象限的微线圈单元中的微线圈交换单元的内容;
图16示出按照本公开内容的一个实施例的、提供电流到图14所示的第一象限的电流源的细节;
图17示出按照本公开内容的一个实施例的、用于便于样本检测的、形成“频率锁定环”的RF/检测部件的设置;
图18示出按照本公开内容的一个实施例的、在图17所示的频率锁定环中的鉴相器的进一步的细节;
图19示出按照本公开内容的一个实施例的、在图18所示的鉴相器的相位比较器的进一步的细节;
图20示出按照本公开内容的另一个实施例的、用于便于样本检测的RF/检测部件的替换的设置;
图21示出按照本公开内容的一个实施例的、温度调节部件的设置:
图22-26示出按照本公开内容的一个实施例的、在制造基于聚酰亚胺的微流***作为混合***的部分时包括的各种处理步骤;
图27-32示出按照本公开内容的一个实施例的、在基于可紫外线固化的环氧树脂的图案化制造微流***时牵涉的各种处理步骤;
图33-38示出按照本公开内容的一个实施例的、在基于软平版印刷技术制造微流***时包括的各种处理步骤;
图39(a)-(d)示出按照本公开内容的一个实施例的、经由如以上结合图17-20讨论的RF感测技术的细胞检测的示例性实施方案;
图40示出按照本公开内容的一个实施例的、基于图1和2的混合***的细胞分类设备;以及
图41-43示出按照本公开内容的一个实施例的、使用图1和2的混合***的组织装配方法。
具体实施方式
下面是用于操纵、检测、成像、表征、分类和装配生物或其它材料中的一项或多项的、按照本公开内容的方法和装置的实施例和与其有关的各种概念的更详细的说明。应当理解,以上介绍的和下面更详细地讨论的主题内容的各种方面可以以许多方式中的任何方式被实施,因为主题内容不限于实施例的任何具体的方式。具体的实施例和应用的例子主要被提供用于说明的目的。
I.***总貌
本公开内容的一个实施例针对把微电子装置的能力与微流***的生物兼容性相组合的、基于半导体/微流的混合***。在下面的某些例子中,为了说明起见,混合***的微电子装置部分在CMOS工艺中实施。然而,应当理解,本公开内容并不旨在限制在这方面,因为其它基于半导体的技术可被利用来实施这里讨论的***的微电子装置部分的各个方面。
图1是示出基于半导体/微流的混合***100的各种部件的总貌的框图,并且图2示出按照本公开内容的一个实施例的、用于这样的***的部件的示例性的物理设置。如图1和2所示,混合***100包括微流***300,用于保持包含感兴趣的物体(此后称为“样本”)的液体。混合***还包括多个其它部件,包括电场和/或磁场生成部件200、场控制部件400、和温度调节部件500。通常,这些其它部件可被利用来经由电场和/或磁场来便于样本的操纵(例如,收集和/或移动)、检测、成像和/或识别,其中包括需要调节环境条件(例如温度)的生物样本。
在本实施例的一个方面,如图2所示,混合***100的某些或所有的这些其它部件可以通过使用各种半导体制造技术被实施为一个或多个集成电路(IC)芯片102。例如,图2示出各种场生成部件200、场控制部件400、和温度部件500可以按照各种各样的半导体制造技术中的任何技术被制作在半导体基片104上,以形成IC芯片102。如在上面描述和在下面更详细地讨论的,这样的IC芯片的一个示例性实施方案可以通过使用标准CMOS协议来制作。IC芯片102进一步还可以被安装在封装基片110上,接合线106和接触部(例如,引脚)108可被利用来便于与IC芯片102的电连接。在下面进一步讨论的一个实施例中,场控制部件440还可包括各种部件,用来便于至IC芯片102和来自IC芯片102的数据和控制信号的无线通信。
图1和2还示出一个或多个处理器600,被配置以控制混合***100的各种部件,以便于对于被包含在(或流过)微流***300中的样本的操纵。一个或多个处理器600还可被配置以执行各种信号处理功能,以便于样本的一项或多项的检测、成像和识别。应当理解,在各种配置中,所述一个或多个处理器600可被实施为与混合***100分离的部件,并且任选地被放置成远离混合***,如图2所示(例如,各种各样的传统的计算设备经由一个或多个接触部108或经由无线通信被耦合到混合***)。替换地,某些或所有的处理器功能可以通过与在形成混合***100的一部分的一个或多个IC芯片102中的其它部件合并在一起的元件而实施。
在按照一个实施例的混合***100中,微流***300可被配置为用于保持包括感兴趣的样本的液体的相对较简单的腔室或蓄液池。例如,如在图1和2上一般地示出的,具有基本上矩形体积的微流蓄液池可包括接入管道302和304,以便于流体流入和流出蓄液池。替换地,微流***可以具有更复杂的设置,包括其中有包含样本的液体流动的多个管道或通道,以及用于引导流动的各种部件(例如阀门、混合器)。在各种实施例中,一旦完成半导体制造过程,就可以把微流***300制作在包含其它***部件的IC芯片102的顶部,以形成混合***100;替换地,微流***300可以被分离地制作(例如使用软平版印刷术技术),并且随后被附着到包含其它***部件的一个或多个IC芯片上,以形成混合***100。有关微流***300的进一步的细节在下面的第V节中讨论。
在图1所示的实施例的其它方面,混合***100的电场和/或磁场生成部件200可以相对于微流***300以各种各样的设置被放置,以便于在生成的场与被包含在(或流过)微流***中的样本之间的相互作用。在各种实施方案中,场生成部件200可以沿微流***的一个或多个物理边界被设置在微流***附近,并被设置成允许沿关于微流***的一个或多个空间维度的场-样本相互作用。
例如,在一个实施方案中,如图2所示,微流***300可被配置成在包含场生成部件200的二维阵列的IC芯片102上面的基本上矩形形状的蓄液池,其中场生成部件200被设置在蓄液池附近并基本上平行于蓄液池底面的平面中。这样的设置便于了通常沿限定平行于蓄液池底面的平面的两个维度(由图2的x-y轴表示)的样本的操作。在另一个实施方案中,场生成部件可以替换地或另外沿这种蓄液池的一个或多个侧被设置,以便于沿着横截于(例如,垂直于)蓄液池底面的第三维(由图2的z轴表示)的样本的操作。在再一个实施方案中,蓄液池可被“夹心”在分别被包含在被设置在蓄液池的上面和下面的IC芯片中的场生成部件的两个阵列之间。在这样的设置中,场生成部件的多个阵列可被控制成使得可以完成样本的三维操纵。另外,场生成部件相对于微流***的各种设置可以便于样本的旋转。
应当理解,上述的示例性设置主要被提供来用于说明,并且微流***和场生成部件的各种各样的设置(包括场生成部件的直线或二维阵列,或离散的场生成部件的其它设置)按照其它实施例,预期提供样本的多维操纵。总之,按照这里讨论的各种概念,在由场生成部件200生成的电场和/或磁场的计算机控制下,感兴趣的样本可以沿几乎任何路径移动通过微流***,被收集或被保持在特定的位置,以及在某些情形下被旋转。这样,用于感兴趣的样本的、“虚拟的微尺度管路***”的拓扑可以例如由处理器600根据可提供的可编程性和计算机控制被灵活地改变,用于各种各样的操作。这在相对较简单的和更精巧的操作中为精确的细胞/物体操纵提供极其有力的工具。
在图1和2所示的混合***100的各种实施例中,场生成部件200可被配置成生成电场、磁场或二者。例如,在一个实施例中,场生成部件被配置和***作,以产生延伸到微流***中的、可控制的、在空间和/或时间上变化的磁场。这样生成的磁场与悬浮在微流***中的磁样本相互作用,其中的样本包括但不限于,被附着到磁珠上的生物细胞(“结合磁珠的细胞(bead-bound cells)”)。相对于生物样本,值得注意的是,磁场不损坏细胞;而是,正如以上讨论的,经由磁场的细胞操纵和识别是通常使用的技术,其通过特定的、配基涂覆(ligand-coated)的磁珠而分子程度地识别生物细胞。正如下面进一步讨论的,在空间和/或时间上变化的磁场与结合磁珠的细胞或其它磁性样本之间的相互作用使能将单个或多个磁性样本收集、输送、检测和成像。
可被包括在图1和2所示的混合***100中的磁场生成部件200的例子包括但不限于如图3(a)-(d)所示的二维微电磁体连线矩阵,和如图4所示的一个或多个“环形收集器”。这些示例性部件在2002年11月5日提交的、题目为“System and Method for Capturing and PositioningParticles”的PCT专利申请No.PCT/US 02/36280,国际公布No.WO03/039753 A1中被详细讨论。
图3(a)是微电磁体连线矩阵200A的示意图。按照一个实施例,矩阵包括基本上直的导体(例如,金或其它金属线或轨)的顶层202和底层204,其中每层由绝缘层206(例如,聚酰亚胺)覆盖,相应层的导体以横切方式被设置(例如,顶层的导体垂直于底层的导体)。在不同的实施方案中,这种结构可被制作在各种各样的基片上,该基片的一个例子包括蓝宝石基片。图3(b)示出包括电连接引线的这样的制作的连线矩阵的显微图,其中针对示出的制作的器件的示例性尺度在图的右下角的图例中表示。图3(c)示出图3(b)所示的器件的放大的部分,它基本上相应于图3(a)的概念的说明。最后,图3(d)是器件的截面图的显微图,示出了垂直的二层导体/绝缘体结构。
在基于图3(a)-(d)所示的连线矩阵的一个实施例中,在连线矩阵中的每个导体(或替换地,预定的导体组)可被连接到可控制的电流源(下面进一步讨论),以使得所有的导体(或导体组)可以具有独立的电流。通过独立地调制导体中电流的幅度,在连线矩阵附近(例如上面)可以产生各种动态磁场图案。例如,电流可以被控制成使得连线矩阵可以创建连续地移动的单个磁场峰值、每个峰值被独立地控制的多个峰值,或变化磁场,以便旋转或扭转目标样本。
图4是也可以被用作图1和2所示的混合***中的磁场生成部件的“环形收集器”208的示意图。环形收集器是被设置在基片上的单个基本上圆形载送电流的导体(例如,被设置在蓝宝石或其它基片上的金线或轨),在顶部具有绝缘层。由于电流流过圆形导体,所以从环形收集器生成磁场;在一个例子中,在具有约5微米(μm)的直径的圆形环中,流过导体的30毫安(mA)电流可以产生约10高斯的磁场,相应于约10皮牛(pN)的磁力(例如,它超过足以吸引和收集附着磁珠的细菌的力)。这样的环形收集器可以相对于微流***以各种各样的配置来设置,包括环形收集器的一维或二维阵列。
可以被用作为图1和2所示的混合***中的磁场生成部件的装置的再一个例子包括微尺度的、被配置为线圈或“微线圈”的磁体。包括铁磁芯子和通过使用微机械加工技术制作的微线圈的一些例子在美国专利No.6,355,491和6,716,642以及国际专利申请公布No.WO 00/54882中给出。按照本发明的一个实施例的磁场生成部件的又一个例子包括CMOS微线圈阵列和相关的控制电路。这样的CMOS微线圈阵列的进一步的细节在下面的第II节讨论。
应当理解,对于按照本公开内容、基于被配置来生成在空间和/或时间上可控制的可变磁场的微电子装置部分的几乎任何混合***100,平行实施方案可以通过使用用于生成可控制的、在空间和/或时间上的可变电场或可变磁场与可变电场的组合的配置而被实现。
例如,在一个实施例中,图1和2所示的混合***的场生成部件200可以包括微电极或“微柱”的阵列,其被配置成生成可控制的电场,用于按照介电电泳的原理操纵感兴趣的物体。图5(a)和(b)示出这样的微柱阵列210的例子;图5(a)示出包括电连接引线的、这样的制作的微柱阵列的顶视图的显微图,其中15微米(μm)的、针对所绘出的制作的器件的示例性尺度在图的左边的图例中表示,并且图5(b)示出图5(a)的示例性阵列的放大的透视图,显示5列和5行微柱的二维排列。
正如以上讨论的,当非均匀电场感应悬浮在液体中的粒子上的偶极子时发生介电电泳。随后加到偶极子的力把粒子拉到电场的最小值或最大值处。不用任何专门的准备,几乎任何粒子,当它被暴露在适当的局部电场中时,就可通过使用介电电泳被收集或被移动。这样,按照一个实施例,通过操作微柱阵列210以生成适用于这个任务的电场,可以操纵在微流***300中悬浮在液体中的一个或多个感兴趣的样本。
更特别地,在基于图5(a)和(b)所示的微柱阵列210的一个实施例中,在阵列中的每个微柱(或替换地,预定的微柱组)可被连接到可控制的电压源(下面进一步讨论),这样,所有的微柱(或微柱组)在其上可以具有独立的电压电位。通过独立地调制在相应微柱上的电压的幅度,可以在微柱阵列210附近(例如,在上面)产生各种电场图案,以便于操纵被包含在微流***中的一个或多个感兴趣的样本。为了提供用于各个微柱电位的地,一个示例性几何结构包括在微柱阵列旁边和上面(例如,在微流腔室的底部表面上)制作接地面,这样,几乎所有的生成的电力线指向同一个方向。替换地,通过把不同的电压电位(例如,正的和负的连接)施加到在阵列内不同的(例如,相邻的)微柱可以生成电场最大值,由此回避接地面。
在再一个实施例中,微线圈阵列可被配置成产生可控制的、在空间和/或时间上具有图案的电场和/或磁场。更特别地,在下面的第II节中进一步讨论的一个实施方案中,各个可独立地控制的电压可以施加到微线圈阵列的微线圈上,这样,各个微线圈结构性能基本上像图5(a)和(b)所示的微柱阵列210的微柱,即,通过生成能够与被包含在微流***中的样本相互作用的电场。按照本实施例的一个方面,相应独立地可控制的电流也可以施加到微线圈阵列的微线圈上,以便附加地生成能够与被包含在微流***中的磁样本相互作用的磁场。这些和其它类型的、基于电场或基于电场/磁场的实施方案可被利用于涉及到合并了微电子学和微流学的操纵、感测和成像***的各种各样的应用。
如上所述和图1所示的,按照本发明的某些实施例,混合***100的场控制部件400可包括一个或多个电流源420,以便于由磁场生成部件生成磁场。同样地,按照本发明的其它的实施例,场控制部件还可以-或替换地-包括一个或多个电压源440,以便于由电场生成部件生成电场。
一般地,无论场控制部件400包括一个或多个电流源420、一个或多个电压源440,还是二者,按照一个实施例,场控制部件还包括各种交换或复接部件460,以便于将电流和/或电压适当地施加到各个场生成部件或场生成部件组上。在下面更详细地讨论的各种实施方案中,交换或复接部件460可被配置成可编程数字交换网(例如,在一个或多个处理器600的控制下),这样,一个或多个电流和/或电压源的输出以规定的独立可控的方式被施加到场生成部件上,以便建立便于样本操纵的、在空间和/或时间上具有图案的电场和/或磁场。
还如图1所示,按照本公开内容的各种实施例,场控制部件400还可包括被耦合在场生成部件200与一个或多个处理器600之间的射频(RF)部件和其它检测部件480,用于便于一项或多项的检测、成像和表征被包含在微流***300中的样本。在不同的方面,这样的RF/检测部件480的例子可包括但不限于振荡器、混频器和/或滤波器,它们(例如,经由交换或复接部件460,在一个或多个处理器600的控制下)被运行,以从场生成部件生成RF场以及测量表示在所生成的RF场与一个或多个感兴趣的样本之间的相互作用的某种类型的信号。用于RF/检测部件480的示例性电路实施方案的具体的细节在下面的第III节进一步讨论。
在各个方面,RF/检测部件480都提供用于纯粹基于电磁场的样本检测、成像和表征技术,而不需要可能有害的于感兴趣的样本的化学元素,或笨重的光学显微镜。无论如何,应当理解,根据包括这里公开的各种概念的某些技术,样本检测和成像可以以化学地处理/对准特定类型的样本来辅助。
一般地,正如根据麦克斯韦方程所熟知的,RF场能够与在RF信号频率下导电的或可电或磁极化的几乎任何(生物的或其它)粒子相互作用。因此,在本公开内容的各种实施例中,在RF电场和/或磁场与感兴趣的样本之间的相互作用不单可被利用来移动样本,还可以确定样本的位置(例如,用于便于成像)。而且,从RF场/样本相互作用引起的频谱响应在某些情形下可被使用来识别或表征不同的类型或类别的样本。
例如,导电样本具有由RF场感应的环形电流,这些电流又产生它们自己的磁场,并且与被施加的场强烈地相互作用。这是传统的电动机的运行的基础(例如,不带有电接触部的“鼠笼式”转子)。这种相互作用可被使用来移动样本,并且检测它们的存在。在下面更详细地讨论的一个机制中,样本的磁极化改变在样本附近的线圈(例如,阵列的微线圈)的电感;因此,磁极化的振荡的衰减造成在包括微线圈的电路中可检测的损耗。在再一个例子中,样本的电极化引起造成介电电泳(DEP)的力。这种极化可以经由在样本与电场生成装置的电极(具有施加的电压的微柱或微线圈)之间的电容的改变,无耗散地被检测,或通过由于样本中振荡的电极化造成的衰减的改变被检测。上述的例子提供可以用来检测样本的位置和从而成像的各种机制。
基于这样的RF成像技术,按照本公开内容的混合***的各种实施方案可以引入反馈控制机制,由此感兴趣的样本可以根据获得的样本的图像***纵。例如,在一个实施例中,混合***可以(例如经由一个或多个处理器600)被可编程地配置成首先得到被包含在微流***中的样本的分布的图像。此后,根据成像的分布,一个或多个特定样本可以基于规定的算法***纵。
与RF场有关的、这里公开的各种概念同样地可被利用来识别和表征感兴趣的样本。例如,在样本的电极化或磁极化中依赖于频率的改变可被使用来识别样本的类型,其中使用了来自传统的固体物理学的有关各种材料在电磁场中的行为的知识。这些改变可以在宽广的频率范围内被表征。因此,在一个实施例中,通过扫描被施加到场生成部件上的信号的RF频率(或使用更精巧的信号处理技术),样本的频率响应(例如,吸收谱)可以在特定的位置处被测量,并且根据所测量的响应,可以识别或表征样本。
在关于在RF/检测部件480的控制下的RF场的施加和场/样本相互作用的感测的再一个实施例中,RF场可被使用来局部测量被施加到样本上的均匀磁场中的磁共振。特别地,给定的样本的自旋或磁域以特征频率振荡,这可被使用来识别自旋类型或样本本身的类型。磁共振类型包括铁磁共振(FMR)(小的YIG球可被用作为磁珠,其中YIG球具有单个磁域,在GHz频率上自由旋转,因为磁珠是球形的)。另外,电子自旋共振(ESR)技术可被使用来识别被包含来表征它们的起源(即样本)的自旋的g因子,以及核磁共振(NMR),用来识别核自旋的g因子。因此,按照这里讨论的原理,磁共振成像(MRI)***可以在芯片上被实施。
虽然图1和2上未明显示出,但按照各个实施例,场控制部件400也可包括一个或多个模拟-数字(A/D)和数字-模拟(D/A)转换器,以便于在其它场控制部件之间以及到和来自IC芯片102的各种数据和信号的通信。场控制部件还可包括数字信号处理部件和信号放大部件,以便于信号的处理和输送。而且,场控制部件还可包括无线收发机和天线,以便于到和来自IC芯片102的无线通信。在一个示例性无线实施方案中,ISM无线电频段(免费的,非商业无线电频段,允许用于工业、科研和医疗用途)可被利用于在IC芯片102与远端用户或控制接口(例如,一个或多个处理器600)之间的无线通信。当前的无线收发机技术允许微型化的、低功率的收发机以高数据速率(例如,每秒几kbit或Mbit)发送和接收,这足以可靠地传送信息到IC芯片102和从IC芯片102传送信息。
最后,图1和2还示出,混合***100可包括温度调节部件500,以便于混合***的生物兼容性。例如,按照一个实施例,***的温度可以被调整到或接近特定的温度,以便于***与所研究的样本的生物兼容性。在一个示例性实施方案中,温度调节部件可包括一个或多个“单片(on chip)”温度传感器500A(例如,在微流***300附近,如图2所示)和“片外(off chip)”温度控制器500B(例如,被附着到封装基片110的热电冷却器或“TE”冷却器)。一方面,该一个或多个单片温度传感器500A感测在微流***300附近的IC芯片的温度,并且所述一个或多个处理器600将所测量的温度与参考温度(例如,37℃)比较。所述一个或多个处理器又把适当的反馈控制信号依次发送到片外温度控制器500B,它相应地加热或冷却整个基片。温度调节部件500在下面的第IV节进一步讨论。
在提供按照本公开内容的通过使用电磁场操纵、检测、成像和表征样本的混合***的总貌后,下面阐述涉及混合***的不同的部分以及某些示例性应用的各种概念的更详细的说明。
II.微线圈阵列
图6(a)是按照本公开内容的一个实施例的、可以用作为在图1和2所示的混合***100中的场生成部件200的微线圈阵列200B的概念性透视图。在图6(a)的例子中,阵列200B包括五列和五行基本上相同的微线圈212。虽然图6(a)示出5×5微线圈阵列,但应当理解,按照本发明的各种实施例的微线圈阵列不限于此,而是可以具有不同的数目的微线圈和不同的几何排列。
像以上结合图3(a)-(d)讨论的微电磁体连线矩阵200A那样,类似于图6(a)所示的那样的微线圈阵列200B可被配置和被控制以操纵被包含在微流***300中的磁性样本,包括被耦合到磁珠上的细胞。图6(b)示出图6(a)所示的阵列200B的一部分的顶(上部)视图的概念性说明,通过包含液体306的微流***300的一部分(例如,通道)向下观察阵列,其中在液体中悬浮着包括被附着到细胞114上的磁珠112的示例性样本116(即,附着磁珠的细胞)。液体306还可包含一个或多个没有被附着以磁珠的细胞114。在一个实施例中,为了操纵附着磁珠的细胞116(或其它类型的磁性样本),阵列200B的每个微线圈212独立地可连接到(经由交换部件和复接部件,正如下面结合图13进一步讨论的)可控制的电流的源。因此,通过独立地控制流过每个微线圈的电流的幅度,可以在微线圈阵列200B附近生成各个磁场图案,这些磁场图案被利用来收集或操纵磁性样本。
与微电磁体连线矩阵200A相比较,由于至少某些以下的示例性原因,微线圈阵列200B通常是更有效的。首先,在微线圈阵列中生成的场,与在微电磁体连线矩阵中的那些相比较,被更高地局部化,由此对于收集的和输送的样本提供相对更高的空间分辨率。其次,微线圈阵列比起微电磁体连线矩阵,具有更精细的磁场控制程度,因此可以同时处理更大数目的样本;特别地,N×N微线圈阵列可以有效地提供N2个独立的同时的局部磁场(基于N2个独立的电流),而N×N连线矩阵只能提供2N个独立的同时的场(基于2N个独立的电流)。第三,正如下面更详细地讨论的,微线圈由于它的明确定义的电感而提供了用于RF检测的更好的平台。第四,由于电引线造成的寄生磁场通常在微线圈阵列中比起在微电磁体连线矩阵中是更小的。
按照本公开内容的一个实施例的二维微线圈阵列200B的设计中的一个问题涉及到在紧接在阵列上方和平行于阵列的平面上会生成的磁力。这个平面在图2和6(a)上一般地由x轴和y轴表示。特别地,由阵列的相应微线圈生成的磁力的x-y分量必须足够大,以便在合理的范围内(例如,在两个相邻的微线圈中心之间的距离,或阵列的“间距”,如在图6(a)上由标号216表示的)和在合理的时间内(例如,1秒或更小)克服表面摩擦力和流体粘度移动悬浮在流体中的磁性样本(例如附着到磁珠上的生物细胞)。另一个设计问题涉及到磁势能;为了保持磁性样本的足够强的收集而同时抑制由于样本的热能造成的热抖动(例如,布朗运动)和扩散,由相应微线圈生成的磁势能必须充分地大于样本的热能(即,3/2kT,其中k是波尔茨曼常数而T是样本温度)。再一个设计问题涉及到在垂直于阵列的平面的方向上的、沿图2和6(a)所示的z轴的磁力(图6(a)所示的z轴是在透视图中,实际上是指向图的平面向外的方向)。根据被使用来制作微线圈阵列的技术和方法,在阵列上方可以有一个或多个材料层(例如,绝缘、保护和/或生物兼容的材料层等等),这些层在阵列上方沿平行于z轴的方向延伸可观的距离,超过该距离,所生成的磁场会快速衰落。
记住上述的问题,本公开内容的一个实施例针对通过使用传统的CMOS处理工艺被制作在半导体(例如,Si)基片上的微线圈阵列。在本实施例的一个方面,包括用于微线圈阵列的控制电子装置的各个场控制部件与微线圈阵列被合并在一起并被制作为CMOS IC芯片,以便用于生成用于样本操纵的空间和/或时间上可变的磁场,以及RF场,以便于样本检测、成像和表征。特别地,在示例性实施方案中,微线圈本身通过使用标准CMOS协议被形成,因此无需任何微机械加工技术(例如,如在微电机械结构或MEMS实施方案中那样)。
更特别地,为了解决以上指出的设计问题,按照一个实施例,在CMOS制作过程中可得到的多金属层在微线圈配置中被利用来允许生成足够的磁场强度,足以有效地收集和输送样本。图7(a)和7(b)分别示出按照本实施例的示例性三层微线圈212的透视图和分解图,并且图8概念性地示出CMOS IC芯片102的一部分的垂直层结构,其中示出与总的芯片结构的其它特性以及层有关的三层微线圈。相应于图2和6(a)所示的那样的z轴也在图7和8上表示。应当理解,图7和8所示的示例性三层微线圈结构主要被提供用于说明的用途,按照其它实施例的微线圈可包括不同数目的层(例如,两个或多个)和/或具有不同的总体形状或几何关系。一般地,按照各种实施例,类似于图7和8所示的那样的微线圈可包括导体圈的至少两个轴向同心的空间分离的部分(例如层)。
如图7和8所示,示例性的微线圈212包括三个盘绕的导体部分或层,即:上面部分212A、中间部分212B和下面部分212C。为了便于精确地空间地控制被包含在微线圈阵列212上方的微流***中的各个磁性样本,每个微线圈被设计成在微线圈的上方生成单个磁场峰值,以与样本相互作用。例如,如图8概念性地示出的,当适当的电流流过微线圈时,被悬浮在被包含在微流***300的液体中的磁性样本(例如,附着磁珠的细胞,如图6(b)所示)被吸引到在微线圈212的上方生成的磁场峰值处。在图8中,在微线圈的上面部分212A(如被制作在IC芯片102的总体上分层的结构上)与微流***300的底部或底面之间的距离用参考标号120表示。
正如以上一般地讨论的,用于磁性样本操纵的微线圈阵列200B的工作的原理是通过调制在阵列的各个微线圈212中的电流而创建和移动一个或多个磁场峰值。例如,首先考虑只“接通”(即,电流流过)阵列的一个微线圈212(即,图8所示的微线圈);如图8所示,磁性样本116被吸引到由微线圈212生成的磁场峰值处,因此在IC芯片102的表面上方的微线圈的中心处被收集。在所生成的磁场峰值附近,“收集力”由下式给出:
其中V是磁珠112的体积,χ是磁珠的有效磁化率,μ0是真空导磁率,以及B是所生成的磁场大小。如果这个微线圈随后被“关断”而同时阵列的相邻的微线圈被接通,则磁场峰值移到相邻的微线圈的中心,由此把磁珠输送到新的峰值位置。
对于生成特定的收集力F所需要的磁场B与流过微线圈的电流及微线圈的电感值成比例;微线圈的电感值又与微线圈的圈数及微线圈的尺寸(直径)成比例。因此,提供相对较高的电感值的微线圈设计通常是所希望的,以提供足够强度的磁场来收集样本。同时,为了保持阵列的微线圈之间的精细的空间分辨率以及便于在相邻的微线圈之间的样本输送,通常希望的是,具有微线圈的上面部分212A的相对较小的线圈间的间隔或间距216和相对小的直径214,如图6(a)所示。
因此,在本实施例的各个方面,微线圈的总的圈数和每个盘绕部分的直径被适当地选择,以提供适当的阵列间距以及适当的微线圈电感值,以生成足够的磁场来便于样本收集和在微线圈之间的输送。为此,图7和8所示的多层微线圈结构使用在分层的CMOS芯片设计中的垂直空间来得到每个微线圈的更大圈数,以提供更高的电感值。同时,在微线圈的不同的水平和部分之间分布圈数,允许在在微线圈的不同的水平/部分上不同的直径,这便于了在相邻的线圈之间的小的线圈间的间隔或间距,而同时提供有效的微线圈电感值。
更特别地,在图7和8所示的示例性微线圈中,最靠近IC芯片的表面并从而最靠近微流腔室中的样本的上面部分212A可被制作为具有相对较小的直径214的单圈金属导体,它的尺寸可以由要被收集的样本的平均尺寸来确定。在一个示例性实施方案中,上面部分212A的直径214可以是约为10-11μm;应当理解,由于现在的CMOS制造技术的限制,通常这个直径大于约5μm。上面部分212A的直径214也可以至少部分根据微线圈阵列200B的总体上想要的尺寸和想要的间距216来选择。通常,为了确保在相邻的磁场之间的适当的分辨率,在相邻的微线圈的上面部分之间的间隔应当不小于大约每个上面部分的直径214;这导致间距216约为直径214的两倍(再次地,应当理解,阵列的提高的分辨率主要受制造过程的分辨率限制)。根据这个一般的关系,在各种实施方案中,直径214和间距216范围可以是从几微米到几十微米,取决于所考虑的样本的类型和所牵涉到的应用。
如图7(a)和7(b)所示,微线圈的中间部分212B和下面部分212C可以比起上面部分具有更大的直径。一方面,中间部分和下面部分的较大的直径是可能的,因为在阵列的相邻的微线圈的相邻中间部分和下面部分之间的间隔可小于在相邻的上面部分之间的间隔,而不牺牲所生成的磁场的分辨率(即,所生成的磁场的分辨率很大地由顶部金属层确定)。因此,中间部分和下面部分通常比起上面部分可包括更大的数目的圈数和/或更大的直径,由此,提供相对较高的微线圈电感值。另外,如图7(a)和7(b)所示,下面部分212C可包括焊盘(pad)228,以便于微线圈212与电流(或电压)源的连接,正如下面进一步讨论的。在一个示例性实施方案中,每个中间部分和下面部分可包括三个导体圈,其中中间部分212B的直径220可以是约为20-25μm的量级,并且下面部分212C的直径218可以是约为15-20μm的量级(下面部分的相对较小的直径允许包含焊盘228)。在其它实施方案中,不同的导体圈数和/或不同的尺度可被使用于相应的线圈部分,它们可以经验地或根据针对不同应用的想要的磁场的数字仿真来确定。
现在参照如图8所示的IC垂直层结构,IC芯片102包括半导体基片层104,在该基片层上面顺序地制作微线圈212的三个层/部分212C、212B和212A。每个层/部分212C、212B和212A可以通过诸如铜、金或铝的导电金属的沉积和图案化来形成。多个金属层通过例如包括硅氧化物(SiO2)或另外的合适的电介材料的绝缘材料112互相分隔开并且与IC芯片的其它层分隔开。三个层/部分212C、212B和212A被电耦合在一起,以便通过延伸穿过绝缘材料112的通孔114(例如,由钨制成)创建连续的多层导电回路(通孔114也被表示在图7(a)的透视图上)。
在一个实施例中,被利用来制作图8所示的垂直层结构的CMOS处理技术(例如,台湾半导体制造公司的CMOS 0.18μm工艺)产生上部金属层/部分212A的约1-3μm的厚度222。上部金属层也可以被图案化,以使得金属导体的x-y面(即,垂直于图8的平面)的线宽度也约为1-3μm,以使得上面部分212A的金属导体截面是从约1×1μm2到约3×3μm2(应当理解,根据TSMC 0.18μm设计法则,上部金属层的线宽度-金属6-可以是小到0.44μm)。
对于中间和下面部分212B和212C,CMOS处理技术可以产生下部和中间层/部分的约0.5到1μm的厚度224。这些层也可以被图案化,以使得在x-y面的线宽度也约为0.5到1μm,产生约0.5×0.5μm2到约1×1μm2的下部和中间部分的金属导体截面。在金属层之间的距离226可以是约为1μm的量级(应当理解,根据TSMC 0.18μm设计法则,在金属层之间的距离可以是小到0.46μm)。
根据上述的总体尺度,可以得到约1纳亨(1nH)量级或更高的微线圈电感值。通过总体地减小与金属导体有关的各种尺度,线圈圈数可以增加,导致高达60到100纳亨(60-100nH)的电感值。然而,应当理解,当金属导体的宽度变得更小时,线圈的寄生电阻通常增加,最大允许流过线圈的电流通常减小,这最终限制可以生成的磁场的强度;因此,在线圈尺寸与场强之间会有实际的折衷。
更一般地,应当理解,图8所示的垂直层结构不限于上述的尺度,或三个金属层;根据现在的CMOS制作工艺,高达约七个金属层也是可能的。因此,再次地,三层微线圈结构仅仅作为按照本公开内容的多种可能的微线圈配置的一个例子给出。
如图8的垂直层结构所示出的,在绝缘材料112的上面沉积钝化层116,它例如可包括氮化硅或聚酰亚胺。最后,为了确保生物兼容性,把聚二甲基硅氧烷(PDMS)层118沉积在钝化层116上,用作与微流***300的接口。在各种实施方案中,在微线圈的上部金属层/部分212A与在PDMS层118和微流***300的接口之间的距离可以是约为3-4μm的量级。
根据如上概述的CMOS微线圈的一般结构,可以在阵列200B的每个微线圈上面生成显著的局部磁场,以便操纵样本。为了提供磁场强度和样本收集力的说明性数值范围,考虑具有约20μm的总的直径和每层4个线圈圈数的二层的微线圈结构。示例性微线圈包括具有1×1μm2的平均导体截面的铝导体,其中线宽是1μm,在给定的层的相邻的导体截面之间的间隙是1μm,以及在两层之间的距离是1μm。铝导体的最大电流密度约为200mA/μm2;因此,所考虑的示例性微线圈能够支持流过它的、约200mA的最大电流。图9示出在靠近其中会有样本的微流***的底面的、在这样的微线圈上面约1μm处的x-y平面中的磁场分布。正如在图9上看到的,根据流过微线圈的200mA的最大电流,生成约300高斯量级的显著的磁场峰值。
如果感兴趣的样本包括被耦合到传统地可得到的、具有约4-5μm的直径和约0.25的磁化率χ的磁珠(例如,Dynabead)的细胞,则按照以上的公式(1),由图9所示的约300高斯的峰值磁场作用在样本上的力F约为1纳牛顿(nN)的量级。这个力足以有效地操纵这样的附着磁珠的样本。换句话说,根据这样的力,收集的样本可以承受的最大流体速度约为1厘米/秒的量级。另外,在37℃的生物可兼容的温度(T=310K)下,由具有200mA电流的微线圈生成的磁势能是这样的附着磁珠的样本的热能大约3×106倍的量级,显示了微线圈的强的收集能力。
虽然上述的例子是基于流过微线圈的示例的最大电流,但应当理解,小得多的电流(例如,约20mA的量级)仍然提供足够的峰值磁场并引起用于有效地操纵各种各样的磁性样本的力(例如,约10皮牛顿的量级)。通常,由微线圈生成的磁力的大小随流过微线圈的电流而增加。在某些情形下,当电流增加趋于最大电流时,在延长的时期上微线圈中的高的电流密度会导致电迁移,这是其中在窄导体中的大电流逐渐导致金属空隙(metal void)故障的一种现象。虽然电迁移通常在较高的温度下是更显著的。因此,在这里描述的混合***中(其中工作温度典型地低于50℃,并且在某些情形下为生物兼容性而被调整到37℃),生成足以用于有效的样本操纵的磁力的电流密度通常不会引起显著的电迁移。
此外,虽然上述的例子示出,类似于图7和8所示的那些微线圈可以提供用于样本操纵的明显的磁力,但某些具体的应用可能需要甚至大于上述的磁力。因此,在另一个实施例中,坡莫合金(Permalloy),一种传统上已知的、包含约20%铁和80%镍的镍合金可以容易地被磁化和去磁化,取决于围绕它的增强磁力的电流,该合金可以在微线圈设计中被利用。特别地,在一个示例性制作过程中,坡莫合金可以通过使用光刻技术或电子束平版印刷技术适当地被沉积(例如,电镀)在多层微线圈结构上(即,具有亚微米尺度分辨率)。
按照再一个实施例,“垂直的”微线圈可被制作和可被使用于操纵和成像磁化的样本,类似于上述的多层微线圈。当前可得到的CMOS工艺主要支持平面金属层,因此以上讨论的微线圈实际上是“平的”,因为它们沿平行于在各种图上表示的x-y轴的平面被设置,并且生成垂直于IC芯片102的表面的磁场(即,基本上沿z轴)。然而,在另一个实施例中,通过利用微机械加工和/或其它三维装配过程作为后制作步骤,有可能将平面微线圈倾斜离开基片表面(在去除氧化物后),产生垂直微线圈。这样的垂直微线圈产生平行于IC芯片102的表面(即,基本上在平行于x-y轴的平面上)的磁场。通过在按照本公开内容的一个实施方案中利用垂直和平面微线圈,三维样本操纵是可能的,除了直线输送以外还包括旋转。在下面更详细地讨论的RF检测和成像的上下文中,垂直微线圈可以允许用于成像的大信号的RF扰动,而平面微线圈提供直流场来操纵样本,由此增强合并了垂直和平面微线圈的混合***的能力。
在讨论基于传统的半导体制作过程的、按照本公开内容的示例性微线圈的结构和制作的各种方面后,现在关于生成磁场用于操纵样本,更详细地考虑在一个阵列中的相邻的微线圈之间的的相互作用。正如以上讨论的,图6(a)和(b)示出的微线圈阵列200B的工作原理是通过调制阵列的相应的微线圈212中的电流而创建和移动一个或多个磁场峰值,以便移动和/或收集磁性样本。由阵列的给定的微线圈生成的磁场的大小是基于流过微线圈的电流的大小,在阵列中每个微线圈都能够生成在微线圈上面的局部磁场峰值。在这种意义下,阵列200B通常可被认为是“磁像素”,其中N×N的微线圈阵列能够产生至少N×N个磁场峰值,或“像素”,每个都能够吸引和收集样本。图10概念性地示出阵列200B的两个相邻的微线圈212-1和212-2,其中基本上相等的电流230流过微线圈,以生成在线圈上的两个基本上相等的磁场峰值232-1和232-2。在图10中,在两个磁场峰值之间的距离通常相应于阵列200B的间距216,如图6(a)和10上表示的。
在一个实施例中,不仅仅流过每个微线圈的电流的大小可以被调制以便于样本操纵,而且流过给定的线圈的电流的方向还可以改变,以便逐个像素地对样本进行更平滑的转移,或有效地提高样本操纵的空间分辨率(即,有效地减小阵列的间距216)。图11(a)-(e)示出对于图10的相邻的微线圈212-1和212-2的五种示例性情形,在相应线圈中具有变化的电流大小和方向以及生成最终得到的磁场。图12示出对于图11(a)-(e)所示的五种示例性情形的每种情形,在每个线圈中的电流大小和方向的图。在图12的水平轴上,阶段1-5分别相应于图11(a)-(e)所示的五种情形。图12上的上面的曲线表示在每种情形下流过“左边”微线圈212-1的电流230-1,下面的曲线表示在每种情形下流过“右边”微线圈212-2的电流230-2。
特别地,在图11(a)中,如图12的曲线图的阶段1表示的,左边微线圈212-1没有流过它的电流,而右边微线圈212-2具有-20mA流过它的电流。结果,在右边微线圈212-2上生成磁场峰值232-2。在基于以上结合图7-9讨论的微线圈结构的一个示例性实施方案中,这样生成的磁场峰值232-2的大小可以是约30高斯的量级。在图11(b)中,如图12的阶段2表示的,左边微线圈的电流230-1增加到约12-13mA,而右边微线圈的电流230-2减小到约-19mA。如图11(b)所示,磁场开始稍微在两个微线圈上面展宽,因为现在有来自左边和右边微线圈的一些场贡献。
在图11(c)中,如图12的曲线图的阶段3表示的,左边和右边微线具有流过它们的相等大小但方向相反的电流(约17-18mA);结果,生成宽的磁场峰,其中心大致在相应线圈的中心之间的中点。在图11(d)中,左边微线圈212-1中的电流230-1进一步增加,而右边微线圈212-2中的电流230-2进一步减小,在图11(e),电流230-1最后增加到20mA,而电流230-2最后减小到零;结果,在左边微线圈212-1上保持单个磁场峰值232-1。应当理解,在图11(a)和11(e)上所生成的各个磁场大小相等但方向相反。因此,通过逐渐改变流过线圈的不同方向的电流,磁场峰值可以在两个相邻的线圈之间连续地移动,因此有效地增强阵列的分辨率,便于精确的定位以及样本在阵列200B上平滑的转移。
正如以上结合图1和2讨论的,在一个实施例中,用于控制和分配至阵列200B的微线圈上的电流(和/或电压)的各种场控制部件400可以与IC芯片102中的阵列合并。在一个实施方案中,这些场控制部件包括一个或多个电流源(和/或电压源)以及各种交换或复接部件,以便于由阵列200B生成的场的数字(和计算机可编程的)控制。
图13是示出按照本公开内容的一个实施例的微线圈阵列200B和与该阵列200B关联的各种场控制部件。在图13的例子中,阵列200B包括8行和8列的“微线圈单元”250,其中每个微线圈单元包括微线圈212,以及开关和逻辑电路,正如下面结合图14和15进一步讨论的。为了把电流(和/或电压)分布到微线圈单元250上,本实施例的阵列200B被划分成四个象限200B-1、200B-2、200B-3和200B-4,每个象限具有16个微线圈单元250(即,每个象限4行和4列)。然而,应当理解,按照本公开内容的微线圈阵列和相关的控制部件不限于这个方面,并且图13所示的具体的配置主要被提供来用于说明。
如图13所示,在本实施例中与阵列200B关联的各种场控制部件包括:行译码器460-1,其提供行使能信号(row enable signal)R0-R7给阵列200B的相应行;列译码器460-2,其提供列使能信号C0-C7给阵列的相应列。行译码器接收以二进制编码的三个数字行选择信号466(Row Select[0:2])作为输入,以便在任何给定的时间生成想要的一个行使能信号R0-R7。同样地,列译码器接收以二进制编码的三个数字列选择信号464(Column Select[0:2])作为输入,以便在任何给定的时间生成想要的一个列使能信号C0-C7。行译码器460-1和列译码器460-2都接收共同的时钟信号462(Clk),用来将给定的行使能信号与给定的列使能信号的生成同步,以便在给定的时间选择特定的一个微线圈单元250。在一个示例性实施方案中,时钟信号462、行选择信号466和列选择信号464由一个或多个处理器600提供,正如以上结合图1和2讨论的,这样,这些信号可以按照可编程和/或用户选择的计算机控制被生成。
图13还概念性地示出四个可变电流源420-1、420-2、420-3和420-4,它们提供可控制的可变电流给阵列200B的微线圈单元250。该四个电流源的示例的一个电流源,即可变电流源420-1,被示出为被配置来接收三个数字电流电平信号468-1(Current Level[0:2])和控制电压469(VCTRL),并提供可控制的可变电流470-1(I1)作为到阵列的输出。正如下面结合图16进一步讨论的,在一个实施例中,可变电流源420-1被配置成根据数字二进制编码的电流电平信号468-1和控制电压VCTRL的电压来提供八个不同的电流之一。在图13的配置中,虽然图上未明显的表示,另外的电流源420-2、420-3和420-4的每个电流源也接收三个二进制编码的数字电流电平信号和控制电压VCTRL作为输入,并提供具有八个不同的可能电流电平的、相应的可变电流输出。在本实施例的一个方面,每个可变电流源的数字电流电平信号可以由一个或多个处理器600提供,正如以上结合图1和2讨论的,这样,这些信号可以按照可编程和/或用户选择的计算机控制被生成。
最后,图13还示出,本实施例的阵列200B接收对于阵列的所有的微线圈单元250共同的直流电源电压Vdd,以及接收对于所有的微线圈单元250也是共同的、确定了流过每个微线圈单元250的微线圈的电流的方向(极性)的“方向”信号472(Dir)。这个方向信号472在下面结合图14和15进一步讨论。
在图13的实施例的一个方面,可变电流源相对于微线圈单元被配置成使得每个电流源提供电流给阵列的一个象限中所有的微线圈。例如,在一个实施例中,电流源420-1提供电流给第一象限200B-1的微线圈,电流源420-2提供电流到第二象限200B-2,电流源420-3提供电流到第三象限200B-3,以及电流源420-4提供电流到第四象限200B-4。在这种配置中,阵列200B的每个象限以基本上相同的方式工作;因此,现在更详细地讨论阵列的一个象限。
图14示出按照本公开内容的一个实施例的、在图13所示的阵列200B的第一象限200B-1中部件的各种互联。由图13的行译码器460-1提供的行使能信号R0-R3被显示在图14的左边,由图13的列译码器460-2提供的列使能信号C0-C3被显示在图14的顶部。第一象限200B-1包括排列成4行和4列、并被耦合到行使能信号与列使能信号上的16个相同的微线圈单元250。每个微线圈单元250还被耦合到方向信号472(该信号由阵列的所有象限共享),以及可变电流源420-1,它提供可控的可变电流470-1(I1)到象限200B-1的所有的微线圈单元上。正也如图14所示,每个微线圈单元250包括逻辑与(AND)门460-3,它在与单元对应的行使能信号与列使能信号都存在时提供线圈使能信号474。线圈使能信号474被加到微线圈交换单元460-4,它包括微线圈212和用于在施加线圈使能信号474后控制流过微线圈的电流的各种开关。
图15示出图14所示的微线圈交换单元464-4的内容。每个微线圈交换单元包括被连接到电流方向(极性)开关460-5(S1)和线圈使能开关460-6(S2)的微线圈212(例如,类似于以上结合图7-12讨论的那些)。电源电压Vdd被加到极性开关S1,并提供可变电流源(在图15中被表示为C)到线圈使能开关S2的连接,以便当开关S2闭合时允许电流470-1流过线圈。极性开关S1由方向信号472控制,而线圈使能开关S2由线圈使能信号474控制;特别地,当相应于包括微线圈的微线圈单元的行使能信号和列使能信号都存在时,线圈使能信号474使得开关S2闭合,以允许电流470-1流过微线圈212。在本实施例的一个方面,方向信号472可以由一个或多个处理器600提供,正如以上结合图1和2讨论的,这样,这个信号可以按照可编程和/或用户选择的计算机控制被生成。
图16示出提供可控制的可变电流470-1到阵列的第一象限200B-1的可变电流源420-1的细节。再次地,在图13上,另外的电流源420-2、420-3和420-4可以与电流源420-1相同地实施。按照一个实施例,电流源420-1包括电流电平译码器422-1,它接收数字二进制编码电流电平信号468-1并提供8个使能输出,以选择地闭合8个开关424-1A到424-1H中的一个开关(在一个示例性实施方案中,电流电平译码器422-1可以利用“温度计码(thermometer code)”)。每个开关的一侧被连接到“基本”电流源,这样,有8个不同的基本电流源426-1A到426-1H。每个开关424-1A到424-1H的另一侧共同地被连接,以提供可控制的可变电流470-1(I1),该可变电流在任何给定的时间具有8个不同的可能的电流电平之一(即,I1是由给定的基本电流源提供的电流的某个倍数)。
在本实施例的一个方面,每个基本电流源426-1A到426-1H可以通过使用MOS晶体管以传统的方式被实施,其中由每个基本源提供的电流由控制电压469(VCTRL)确定。例如,在一个示例性实施方案中,控制电压VCTRL可被加到所有的基本电流源,这样,一个特定的控制电压提供来自每个基本源的相应的电流(例如,0.7到3.3伏的控制电压生成从0到1.3毫安的每个基本源中的相应的电流)。应当理解,在不同的实施方案中,控制信号VCTRL可被改变,以便提供可变的基本电流,或替换地,可被保持为恒定的(例如,连接到Vdd)。
此外,应当理解,虽然图16所示的可变电流源420-1被配置成提供8个不同的电流电平,但在这个方面本公开内容不限于此;即,类似于图16所示的那种的一般的配置可被实施来根据多个基本电流源提供不同数值的电流电平,该数值可以经由类似于图16所示的译码器根据要被提供的电流电平的数目通过具有适当的比特数目的数字信号而是可选择的。在再一个实施例中,脉冲宽度调制技术可被利用来通过使用单个基本电流源提供可变电流470-1。在这样的实施例中,由单个源提供的固定电流被脉冲宽度调制成具有不同的占空因数,其中相对较低的占空因数代表较低的平均电流,而相对较高的占空因数代表较高的平均电流。在一个方面,用来提供不同的平均电流电平的可能的占空因数的数值可以以类似于在图16的配置中采用的那种的方式被确定,其中被加到译码器的数字二进制编码信号提供多个不同可能的占空因数,从而提供不同的电流。
在以上结合图13-16讨论的实施例中,包括可变电流源、交换与复接部件、逻辑门等等的各种场控制部件被利用作为有效地控制和分配微线圈阵列200B中的电流的“数字交换网”。在这些实施例的一个方面,这样的数字交换网使得阵列200B的控制是更可行的,特别是在其中微线圈单元250的数目(N2)可能是相当大的实施方案中;更特别地,电流可以在多个微线圈之间以复接的方式在时间上共享,并且相对较小的数目的数字信号输入可被利用来控制整个微线圈阵列。再次参照图13,在本实施例中所需要的、提供阵列控制和便于样本操纵的信号包括时钟信号462、3个列选择信号464、3个行选择信号462、12个电流电平信号(即,用于四个可变电流源的每个电流源的3个信号,如由用于电流源之一的信号468-1表示的)、用于电流源的控制电压469(VCTRL)和方向(极性)信号472。正如上面讨论的,任何一个或所有的上述的信号可以由一个或多个处理器600提供,正如以上图1和2中所示的,这样,这些信号可以按照可编程和/或用户选择的计算机控制被生成。
在图13-16上,各种控制信号通常被提供来使得阵列的一个微线圈能够在任何给定的时间根据流过微线圈的可变电流生成具有不同可能的场强的磁场。因此,在本实施例的一个方面,为了生成多个磁场以便“同时地”有效地收集或移动多个样本,在比起样本对于存在磁场或不存在磁场的“反应时间”快得多的时间尺度上,将阵列的不同的微线圈顺序地使能(即,将至微线圈的电流复接)。这样,顺序生成的磁场可能对于所讨论的样本而言看起来似乎是同时生成的。阵列的多个线圈可以按照各种各样的“扫描协议”中的任一项协议在适当的时间尺度上被顺序地使能(例如,在计算机控制下);例如,在一个示例性实施方案中,传统的“光栅扫描(raster scanning)”协议可被利用来逐行地将阵列的每个微线圈顺序使能,从图13所示的阵列的左上角开始,沿第一行进行到右边,然后到第二行等等。
为了提供用于样本操纵的适当的扫描时间尺度的一些示例性说明,在液态水环境下考虑具有约4-5μm的直径的、市面上可买到的磁珠(例如Dynabead)作为代表的磁性样本。通常,悬浮在液体中的样本在它们在液体中移动时经受粘滞阻力;这种粘滞阻力通常影响样本对于外部磁场反应的速度(并因此影响样本的“响应时间”)。对于悬浮在液体中的磁性样本,响应时间τcutoff被给出为:
τcutoff≈O(μμo/χB2),(2)
其中μ是液体的动态粘度。因此,如果样本暴露到具有显著地大于样本的“截止频率”(即,样本的响应时间的倒数)的频率的脉冲磁场中,脉冲磁场呈现对于样本施加基本上连续的平均磁力。这样,一个电流源可以在阵列的多个微线圈之间以适当的速率被复接(即,在时间上顺序地施加),以便从所讨论的样本方面来看,生成看上去连续的磁力。从磁场得到的磁力在上面结合公式(1)一般地讨论过。对于在约30高斯量级的磁场下,具有约5μm的直径的、在水中的Dynabead,响应时间τcutoff约为10-2秒的量级。通过使用具有大于样本的响应时间的倒数的频率的脉冲磁场(例如,大于约100Hz),最终得到的力等于占空因数与由公式(1)给出的力的乘积。
一旦样本被吸引到局部磁场,就必须保持足够的磁势能来收集在场中的样本。特别地,悬浮在液体中的样本由于样本与周围的液体分子的随机碰撞而无序地运动,这是一种被称为布朗运动的现象。这样的布朗运动会导致样本的扩散;由于布朗运动,样本会在任何给定的时间以随机速度在随机路径上(例如,以折弯的来回方式)移动,离开它的位置。正如上面讨论的,与这种运动有关的动能与温度成比例(即,3/2kT)。因此,为了保持收集,生成的场的平均磁势能必须充分大于样本的热能。
鉴于上述的内容,一旦样本初始地基于脉冲磁场被收集,只要在让样本显著地扩散到远离在给定的微线圈上面的“收集区域”的时期内磁场没有中断,样本就可保持被收集在脉冲磁场中。对于磁场中断时间的上限τoff由τoff<d2/D近似给出,其中d是微线圈的直径,D是样本的扩散常数(从D的定义,对于给定的时间t,粒子行进平均距离d=(Dt)1/2)。样本的扩散常数D(平方米每秒)由下式给出:
D=kT/3πηa(3)
其中η是液体的粘度(kg/m.s)以及α是样本的直径。在所考虑的示例性情形下,水的粘度η约为10-3kg/m.s并且Dynabead样本的直径是5μm;因此,假设约300K的温度T(即室温),对于水中的Dynabead样本的扩散常数D约为8.5×10-14m2/s。如果假设微线圈直径为20μm,τoff应当小于约5000秒。从实际的观点来看,上述的例子说明,10,000Hz或更高的频率(即,τoff<10-4秒)的加到微线圈的复接电流实际上不允许由于布朗运动造成的样本的明显的扩散;对于中断时间τoff<10-4秒,5μm的Dynabead扩散仅仅约3纳米。
通常,应当理解,图13-16所示的电流源和微线圈的配置以及上述的复接技术作为示例性实施方案被提供,按照本公开内容的其它的配置也是可能的。例如,在替换的配置中,阵列200B可被再划分成或大或小的子部分(例如,每个子部分4个微线圈单元,而不是16个),其中针对每个子部分的、具有预定数值的不同的电流电平的可变电流由对于该子部分专用的一个电流源提供。替换地,在另一个实施方案中,只有一个这样的电流源可以以顺序的时间共享的(例如,复接的)方式提供电流到阵列200B的所有的微线圈单元。在再一个配置中,每个微线圈单元可以配备有它自己的可变电流源,这样,不需要在多个微线圈之间复接一个电流源。通常,通过使用一个电流源提供电流到多个微线圈而利用电流共享机制的任何实施方案降低了***的直流功耗。
还应当理解,虽然以上结合图13-16讨论的示例性概念集中在由电流源驱动的微线圈上,但基于图13-16概述的一般的交换与复接结构的、用于样本操纵的场生成阵列的替换的实施方案也可以基于使用由电压源驱动的微线圈或微柱的电场生成和介电电泳原理。
例如,首先考虑图13的微线圈阵列200B和相关的控制部件,用一个或多个可变(或固定的)电压源替换可变电流源。在一个这样的示例性实施方案中,阵列的相应微线圈单元250以上面结合图13-15讨论的相同的方式被选择/使能。然而,不是让可变电流流过被选择的/使能的微线圈,而是可变电压(根据方向信号472而具有可选择的极性)可被连接到被选择的/使能的微线圈,以便从微线圈生成相应的电场(例如,可变电压源可以代替图14所示的可变电流源420-1,并且在经由信号472选择/使能给定的微线圈和微线圈极性后,可变电压实际上与加到微线圈上的电源电压Vdd串联)。这样的替换实施方案的一个或多个可变电压源可以由适用于各种集成电路制作过程的任何数目的传统的配置(例如,数字-模拟转换器)被实现。
在基于电场生成的另一个例子中,图13的微线圈阵列200B可以由类似于以上结合图5(a)和(b)讨论的那样的适当尺寸的微柱阵列替换,再次地,可变电流源由一个或多个可变(或固定的)电压源替换。在再一个例子中,图13的微线圈阵列200B可以结合可变电流源和可变电压源而被利用来提供子***,该子***能够根据电场和磁场进行样本操纵。这些和其它类型的、基于电场或基于电场/磁场的实施方案可被利用于涉及到合并微电子学与微流学的操纵、感测和成像***的各种各样的应用。
III.样本检测、成像和表征
正如以上在第I节中讨论的,再次参照图1,按照本公开内容的各种实施例,基于半导体/微流的混合***的场控制部件400还可包括被耦合在场生成部件200与一个或多个处理器600之间的射频(RF)和其它检测部件480,用于便于被包含在微流***300中的样本的检测、成像和表征的一项或多项。在不同的方面,RF/检测部件480被配置成便于基于相对较高的频率(例如,RF,微波)的电信号(电压或电流)从场生成部件生成电磁场,以及便于测量表示在生成的RF场与一个或多个感兴趣的样本之间的某种类型的相互作用的信号。
通常,正如根据麦克斯韦方程所公知的,RF场能够几乎与在RF信号频率下导电的或在可电或磁极化的任何(生物的或其它)粒子相互作用。因此,在本公开内容的各种实施例中,在RF电场和/或磁场与感兴趣的样本之间的相互作用可不单如以上在第II节中讨论的那样被利用来移动样本,而且还可以确定样本的位置(例如,便于成像)。
例如,导电样本具有由RF场感应的环形电流,它又产生它们自己的磁场,并且与加上的场强烈地相互作用。这种相互作用可被使用来移动样本以及检测它们的存在。在下面更详细地讨论的一个机制中,样本的磁极化改变在样本附近的线圈(例如,阵列的微线圈)的电感,并且这个电感值变化又可以通过使用高频信号被检测。在再一个例子中,样本的电极化引起造成介电电泳(DEP)的力。这种极化可以经由在样本与电场生成装置的电极(例如,具有施加的电压的微柱或微线圈)之间的电容值的改变,无耗散地,或通过由于样本中振荡的电极化造成的衰减的改变被检测。
上述的例子提供可以用来检测样本位置的各种机制。基于检测样本相对于给定的场生成部件的位置的能力,在一个实施例中,每个场生成部件200类似于提供用来构建悬浮在微流***中的样本分布的综合图像的重要信息的成像像素(例如,考虑二维CCD阵列)。在另一个实施例中,样本分布的图像又可被用作为反馈,以按照规定的算法操纵一个或多个样本。
在基于附着磁珠的样本的一个实施例中,磁珠的磁性对微线圈的电感值的影响被利用来便于样本检测。例如,给定的微线圈的电感值L与有效导磁率μeff成比例。在微线圈附近没有任何磁性粒子时,μeff等于真空导磁率μ0,但在存在具有某个导磁率μbead的磁珠(例如,顺磁性粒子或PMP)时,与微线圈关联的有效导磁率是μeff=(1-α)μ0+αμbead(其中α<<1),由此将微线圈的电感值改变某个量ΔL。因此,通过被施加到微线圈上的高频信号监视微线圈的电感值L,微线圈的电感值的这样的改变ΔL可被检测,由此指示在微线圈附近存在附着磁珠的样本。
取决于尺寸和从而取决于微线圈的电感值和磁珠的导磁率,电感值的改变ΔL的范围可以从L的约0.1%到L的1%(例如,具有约4.5到5微米的直径和约1.25μ0的导磁率μbead的磁珠Dynabead可以引起L的约0.1%量级的电感值的改变ΔL)。另外,也应当考虑磁珠导磁率的频率响应;特别地,对于Dynabead例子,μbead对于低于约100MHz的频率具有实数值。因此,在一个示例性实施方案中,低于或接近于100MHz的RF信号被利用于检测方案。
图17是示出按照本公开内容的一个实施例的、用于便于样本检测的、形成“频率锁定环”的RF/检测部件480的设置。在图17的实施例中,示例性微线圈212通过它的可变电感L(它在存在磁性样本时发生改变)和它的相关的线圈电阻RL被表示。在本实施例的一个方面,可变电感L和线圈电阻RL形成电桥电路485的一部分,该电桥电路还包括已知的预定的电容CRF(具有寄生电阻RC)和两个已知的电阻R1和R2。
为了易于说明和为了便于以下的讨论,图17中的其余部件被示出为直接连接到微线圈212;然而,应当理解,在其它实施例中,图17所示的其余的RF/检测部件480可以在微线圈阵列的多个微线圈之间连同将直流电流提供到微线圈的其它电路一起以复接的方式被共享,用于如上所讨论的样本操纵。例如,可以使用类似于方向信号472的另一个信号,(如果合适的话)连同行和列选择信号以及附加开关一起(例如,以类似于如以上结合图13-15讨论的那样的方式),以便使用复接的RF和DC信号来进行用于操纵和检测目的的微线圈操作。
如上所述,在图17的实施例中,“频率锁定环”由电桥电路485、鉴相器482、低通滤波器484和压控振荡器(VCO)486组成。一般地说,鉴相器、低通滤波器、和压控振荡器类似于传统上在锁相环配置中找到的公知的部件。然而,组合以包括微线圈212的独特地设置的电桥电路,连同其它示出的部件,一起导致基于频率而不是相位的锁定电路,其中锁定频率与电感L的改变直接关联地变化,其中电感L由于样本的存在而变化。因此,通过监视图17所示的电路的锁定频率的改变,可以检测在微线圈附近样本的存在。
为了说明图17所示的电路的工作,我们首先考虑一个示例性实施方案,其中VCO 486的输出V(ω)是作为输入到VCO的控制电压Vc的函数的、具有角频率ω的正弦变化的电压。通过使用相位复向量符号Aejθ来表示正弦电压(其中A代表幅度和θ代表相位),并表示所有关于VCO486的输出的相位,从电桥电路485得到的电压V1(ω)和V2(ω)可被表示为V1ejθ1和V2ejθ2,其中
以及
正如下面更详细地讨论的,频率锁定环被配置成使得当θ1=θ2时控制电压Vc稳定在某个DC值。因此,从以上的公式(4)和(5),用于频率锁定环的“锁定频率”ωlock可被表示为:
从上述内容,可以理解,锁定频率ωlock实质上是微线圈电感L的变化的函数,因为CRF,RL,RC,R1和R2是已知的固定数值。在一个示例性实施方案中,考虑约1nH量级的标称微线圈电感L,以及约50Ω的标称线圈电阻RL。为了确保ωlock低于或接近于100MHz,CRF被选择为1pF,以及约1kΩ量级的典型的RC,R1被选择为约50Ω且R2被选择为约10kΩ。
为了测量由于在微线圈附近磁性样本的存在而造成的电感改变ΔL,测量瞬时锁定频率ωlock并把它与代表磁性样本不存在的标称锁定频率相比较。在其中ωlock在磁性样本不存在时标称地约为100MHz的示例性实施方案中,由于在磁性样本的存在造成的锁定频率的改变Δωlock可以是约为50到100kHz的量级。在图17中,缓冲放大器488被利用来把V(ω)变换成方波,为此可以利用边沿计数器490(例如,一系列触发器)来确定频率ω的改变。特别地,在一个实施方案中,边沿计数器490可被配置成对在给定的时间间隔期间的方波沿计数,以及把代表这样的计数值的数字输出提供到图1和2所示的一个或多个处理器600,由此可以确定代表样本存在的频率ω的改变。
在图17所示的电路设置中,鉴相器482的功能是输出一个电流I=Kθ(θ2-θ1),其中Kθ是某个常数。这个电流I被加到低通滤波器484,该滤波器在Laplace域具有转移函数
其中z是转移函数的零点而p是极点。从以上内容,可以看到,由于电容器484A的存在,转移函数Z(s)包括在分母中s=0的极点。在Laplace域中,针对控制电压Vc的表达式可被给出为:
VC(s)=IZ(s)=Kθ(θ2-θ1)Z(s).(8)
从以上内容,可以看到,在稳定状态(s=0),Z(s)趋于无限大,由此,为了确保稳定的控制电压Vc,值(θ2-θ1)在稳定状态下必须趋于零。因此,在低通滤波器484中的电容器484A实质上保证,当θ1=θ2时,频率锁定环稳定,由此提供以上给出的针对ωlock的表达式。
图18示出按照本公开内容的一个实施例的、在图17中所示的频率锁定环中的鉴相器482的进一步的细节。如图18所示,鉴相器包括两个相位比较器4821和4822,各被设计来根据在加到比较器的两个信号之间的相位关系输出“加(up)”信号或“减(down)”信号。例如,取信号V(ω)作为施加到每个比较器的参考信号,如果加到比较器的另一个输入信号领先于参考信号,则给定的比较器输出脉冲宽度调制的“加”信号;替换地,如果另一个输入信号滞后于参考信号,则比较器输出脉冲宽度调制的“减”信号。相应的加和减信号的占空因数与相应的领先或滞后的量成比例。
根据图17所示的电桥电路485的配置,可以观察到,在图18所示的鉴相器482中,信号V2(ω)总是领先于参考信号V(ω)一个相位θ2,而信号V1(ω)总是滞后于参考信号V(ω)一个相位θ1。因此,在图18所示的实施方案中,相位比较器4821的“加”信号从不是激活的,因此保持为不连接在电路中;同样地,相位比较器4822的“减”信号从不是激活的,因此保持为不连接在电路中。图19示出在图18所示的鉴相器482的相位比较器4821的进一步的细节(相位比较器4822被配置成类似于比较器4821)。如图19所示,相位比较器4821包括两个D触发器和被耦合在触发器的相应Q输出端与复位输入端(R)之间的逻辑与门(AND gate)。
在图18的实施例的一个方面,来自比较器4822的加信号根据在V2(ω)与V(ω)之间的相位领先量周期地激活晶体管4824,以允许由电流源4823发源电流I;这样,再次参照图17,低通滤波器484的电容器根据在V2(ω)与V(ω)之间的相位领先量被“泵入”以电流。类似地,来自比较器4821的减信号基于在V1(ω)与V(ω)之间的相位滞后量周期地激活晶体管4825,以基于在V1(ω)与V(ω)之间的相位滞后量从低通滤波器的电容器抽取电流(到地)。在稳定状态,电流的泵入和抽取的组合活动导致净电流I等于零,相应于条件θ2=θ1。
图20示出按照本公开内容的另一个实施例的、用于便于样本检测的RF/检测部件480A的一种替换的设置。图20的设置代表一种零差检测***,其中频率合成器4802的两个压控振荡器VCO(I)和VCO(Q)分别生成sinωt(同相,或I)和cosωt(正交相,或Q)信号。同相(sin)RF信号激励微线圈212,它然后改变激励信号的相位和幅度。微线圈的响应(低噪声放大器的输出,或LNA)然后乘以混频器1中的原先的同相信号,和被乘以混频器2中的正交相信号。混频器1的直流输出(OUT 1)与微线圈的寄生电阻RL成比例,而混频器2的直流输出(OUT 2)与微线圈的电感L成比例。因此,通过监视OUT 2,可以确定由于磁性样本(例如,附着磁珠的细胞)造成的微线圈电感的改变,由此指示样本的存在。
在图20所示的实施例的一个方面,假定如上所讨论的、由于单个磁珠造成的微线圈的电感改变ΔL在某些示例性情形下可以低到0.1-1%,低噪声设计对于实现高精度RF样本感测会是极为有利的。因此,在一个示例性实施方案中,频率合成器4802可以通过使用基于共面带线(coplanar striplines)的很低噪声的高频振荡器来实施,类似于在2004年7月19提交的、题目为“Methods and Apparatus Based onCoplanar Striplines”的美国非临时专利申请No.10/894,674和2004年7月19提交的、题目为“Methods and Apparatus Based on CoplanarStriplines”的美国非临时专利申请No.10/894,717中讨论的那些。
在讨论磁性样本的检测后,这里公开的、有关RF场的各种概念同样地可被利用于识别和表征感兴趣的样本。例如,通过使用来自传统的固体物理学的各种材料在电磁场中的行为的知识,样本的电极化或磁极化的依赖于频率的改变可以被使用来识别样本的类型。这些改变可以在很宽的频率范围上被表征。因此,在一个实施例中,通过扫描加到场生成部件上的信号的RF频率(或使用更精巧的信号处理技术),样本的频率响应(例如,吸收谱)可以在特定的位置被测量,并且可以基于测量到的响应识别或表征样本。
在有关RF场的施加和在RF/检测部件480的控制下感测场/样本的相互作用的再一个实施例中,RF场可被使用来局部测量被施加到样本上的均匀磁场中的磁共振。特别地,给定的样本的自旋或磁域以特征频率振荡,这可被使用来识别自旋类型或样本本身的类型。磁共振类型包括铁磁共振(FMR)(小的YIG球可被用作为磁珠,每个YIG球具有单个磁域,其在GHz频率上自由旋转,因为磁珠是球形的)。另外,电子自旋共振(ESR)技术可被使用来识别涉及表征它们的起源(即,样本)的自旋的g因子,以及核磁共振(NMR),用来识别核自旋的g因子。因此,按照这里讨论的原理,磁共振成像(MRI)***可以在芯片上被实施。
IV.温度调节
正如以上结合图1和2提到的,按照一个实施例,混合***100可包括温度调节部件500。在包括很大数目的场生成部件200和伴随的场控制部件400的示例性实施方案中,***的功耗会是明显的,并且这些部件的工作会提高***内和***周围的温度。鉴于上述的内容,***的温度可被调节到或接近特定的温度,以便于***与所研究的细胞/样本的生物兼容性,并且还降低如前所述的、电迁移故障的风险。
更特别地,按照如图21所示的一个实施例,温度调节部件500可包括一个或多个单片温度传感器500A和片外温度控制器500B。这时再次参照图2,在不同的实施方案中,多个单片温度传感器500A可被设置在IC芯片102内和周围的各种各样位置;在图21中,一个示例性温度传感器500A被一般地显示为处在IC芯片102的环境中,芯片又被耦合到封装基片110。在本实施例的一个方面,一个或多个片上传感器500A提供一个或多个温度信号Tchip到处理器600,为了说明起见,处理器在图21上被示出为比较器,将该信号Tchip与参考温度信号Tref进行比较(在一个示例性实施方案中,Tref可以代表37℃的温度)。
在各种实施方案中,处理器600可被配置成从相应的不同的片上传感器接收多个温度信号,并且按照一个或多个预定的算法处理多个信号(例如,平均、基于芯片位置的加权平均等等),以提供某个合计的感测的温度值,然后将它与参考温度进行比较。基于一个或多个感测的温度与参考温度的比较结果,控制信号被提供到片外温度控制器500B,该控制器相应地加热或冷却封装基片110(例如,在一个示例性实施方案中,热电冷却器或“TE”冷却器可被用作为芯片外控制器500B)。在本实施例的另一方面,IC芯片102的穿过所有层的和每层内的热传导性是这样的,其使得可以假设整个***处在相同的温度。因此,调节环路是足以保持总体***的温度为恒定值。
在图21的实施例中,示例性片上温度传感器500A包括寄生pnp双极型晶体管5002和参考电流源5004(在任何标准CMOS过程中可得到)。如果晶体管的发射极电流保持恒定为参考电流Iref,则晶体管的发射极-基极电压被给出为:
其中对数的底是e,Is是晶体管的漏电流,k是波尔茨曼常数,q是电子电荷,以及T是绝对温度。以上的公式表示发射极电压可被用作为芯片温度(Tchip)的直接度量。在一个实施例中,处理器600通过使用1比特比较器将这个发射极电压与代表参考温度(例如,Tref=37℃)的校准的电压相比较。如果Tchip>Tref,则由处理器提供的控制信号操作温度控制器500B以便冷却芯片,以及反之亦然。
在各种实施方案中,温度调节器的精度和长期稳定性可能受集成部件的失配、部件参数的漂移、I/f(闪烁)噪声和机械应力等影响。为了提高温度调节器环路的精度,在某些实施例中,可以利用各种传统的模拟集成电路设计技术,诸如自动调零、自适应校准和动态元件匹配,以及信号斩波与平均。
V.微流***
再次参照图1和2,一旦包括场生成部件200、场控制部件400和温度调节部件500中的一项或多项的IC芯片102被制作,微流***300就可被耦合到IC芯片102上以形成混合***100。正如以上在第I节中讨论的,按照一个实施例,微流***300可被配置成相对较简单的腔室或蓄液池,用于保持包含感兴趣的样本的液体。例如,正如一般地在图1和2上示出的,具有基本上矩形体积的微流蓄液池可包括接入管道302和304,以便流体流入和流出蓄液池。替换地,微流***可以具有更复杂的、包括多个管道或通道的设置,在其中包含样本的液体可以流动,以及各种部件(例如,阀门,混合器),用于引导流动。在不同的实施例中,一旦完成半导体制作过程,微流***300就可被制作在包含其它***部件的IC芯片102的顶部,以形成混合***100;替换地,微流***300可以分离地制作(例如,使用软平版印刷技术),随后附着到包含其它***部件的一个或多个IC芯片上,以形成混合***100。
在图1所示的实施例的其它方面,混合***100的电场和/或磁场生成部件200可以相对于微流***300以各种各样的布置来设置,以便于在所生成的场与被包含在(或流过)微流***中的样本之间相互作用。在各种实施方案中,场生成部件200可以沿微流***的一个或多个物理边界被设置在微流***附近,并且这样布置以允许相对于微流***沿一个或多个空间维度的场-样本相互作用。一般地,按照这里讨论的各种概念,在由场生成部件200生成的电场和/或磁场的计算机控制下,感兴趣的样本可以沿几乎任何路径移动通过微流***,在特定的位置处被收集或被保持,并且在某些情形下被旋转。这样,针对感兴趣的样本的“虚拟的微尺度管路***”的拓扑可以基于例如由处理器600可提供的可编程性和计算机控制而被灵活地改变,用于各种各样的操作。这对于在相对较简单的和更精巧的操作中的精确的细胞/物体操纵提供极其有力的工具。
通常,CMOS芯片的顶部层包括氮化硅或聚酰亚胺钝化层,其目的是防止诸如钠那样的化学元素渗透到芯片中。按照一个实施例,微流***300还可被进一步制作在CMOS芯片钝化层的顶部,其中微流***包括具有想要的形状的微图案化的聚酰亚胺侧壁,以便形成导引样本的通道,或“迷你沟道”。图22-26示出按照本公开内容的一个实施例的、在制造作为混合***的一部分的、基于聚酰亚胺的微流***时涉及到的各种处理步骤。
特别地,图22示出包括单个芯片102的半导体基片104的一部分。在一个方面,图22所示的基片104的一部分从其上制作了多个芯片102的较大的半导体晶片被切割;在一个示例性实施方案中,每个芯片102具有约2mm×5mm量级的尺度,并且晶片基片可被切割成具有具有约15mm×25mm量级的尺度的多个部分。
一旦被切割,各包括单个芯片102的相应基片部分104可被旋涂以聚酰亚胺,然后通过使用传统的平版印刷术技术图案化。由于CMOS芯片表面层通常包括聚酰亚胺钝化层,可以制作微图案化的、良好地粘附到类似材料的钝化层的聚酰亚胺侧壁。图23示出在基片104的顶部的聚酰亚胺层310的例子,其中聚酰亚胺层包括通过使用传统的平版印刷术图案化的流体通道316和两个孔320。在不同的示例性实施方案中,用于聚酰亚胺层的涂覆和图案化过程可被配置以根据给定的应用的要求形成流体通道的从几微米到几千微米范围的高度和宽度。
在聚酰亚胺层310中制作流体通道316后,按照一个实施例,流体通道的表面可以任选地涂覆(例如,旋涂)以薄的聚二甲基硅氧烷或PDMS层。PDMS是生物兼容性材料,它的表面可被功能化,以便促进或阻止细胞粘附。例如,在本实施例的一个方面,用纤维粘连蛋白(FN)处理聚合的PDMS的氧化表面使得可受影响地将细胞外基质蛋白微图案化,以便于细胞粘附和扩展。另一方面,用Pluronic F127处理PDMS的表面可以阻挡蛋白质吸收,因此阻止细胞粘附。这些相应的特性可以便于按照本公开内容的一个实施例的、导引生物样本向下到细胞分类器的微流体通道(下面在第VI节中进一步讨论)和用于按照本公开内容的另一个实施例的、在二维微尺度组织装配期间引导细胞到特定的位置(下面在第VII节中进一步讨论)的不同的方面。在各种实施方案中,PDMS可被旋涂到流体通道表面上的微米厚度层,而不牺牲样本操纵或成像。
如图24所示,适当的成形的盖片312(例如,玻璃盖片)可被耦合到聚酰亚胺层310,形成微流腔室或通道。一方面,要与聚酰亚胺层结合的盖片的表面可被涂覆以负性光刻胶或可紫外线固化的环氧树脂314(例如,SU-8,可以从Microchem,Inc.of Newt on,Massachusetts购买),以便于盖片与聚酰亚胺层之间的密封(例如经由以紫外光对组件的固化)。图25示出被附着到聚酰亚胺层310的盖片312的完成的组件,用来封入流体通道316,并因此形成微流***300。
最后,如图26所示,接入管道302和304经由管道配件305被耦合到组件的孔320,以完成微流***300。在一个实施方案中,可UV固化的光刻胶或环氧树脂再次可被使用来把管道配件和管道接合到组件上。在图26中,管道304的一部分在截面图上被切割开,以显示通过混合***100的微流***的流体流动。
图27-32示出按照本公开内容的另一个实施例的、在基于将可紫外线固化的环氧树脂图案化的制造微流***300时包括的各种处理步骤。在本实施例中,首先参照图27,各个IC芯片102(例如,具有约2mm×5mm量级的尺度,和约270微米的厚度)被粘贴到硅基片1040上,该硅基片不同于用于制作IC芯片的基片。换句话说,在本实施例中,IC芯片从较大的晶片被切割,在该晶片上这些IC芯片被制作成基本上等于它们在晶片上的制作底面积(footprint)的尺寸(即,在芯片区域的周围没有额外的基片)。这样地切割的芯片然后被粘附到另一个较大的硅基片1040(例如,具有约25mm×25mm量级的尺度)上,其中较大的晶片可包括被制作在其上的电极,以便于与IC芯片的电连接。在一个方面,基片1040可以用作为混合***的封装基片110(见图2)。
如图28所示,在本实施例中,IC芯片102与基片1040的组件然后被旋涂以可紫外线固化的环氧树脂(例如,SU-8)的第一层318,其厚度稍微厚于IC芯片102的厚度(例如,约300微米)。经由传统的光学平版印刷技术,多个孔320被图案化到第一层中,并且图案化的层被烘烤(例如,在95℃下曝光后烘烤30分钟),但不显影。随后,如图29所示,可紫外线固化的环氧树脂的第二层322被旋涂(例如,到约100微米的厚度),并经由光学平版印刷技术被图案化,以形成流体通道316的侧壁和孔320。和第一层318一样,第二层322被曝光后烘烤,然后第二层被显影,以形成流体通道316。第二层的显影使得第一层318的孔图案曝光,该孔然后液被显影,以完成孔320的形成,如图30所示。
接着,如图31所示,玻璃或塑料盖片312被涂覆以可紫外线固化的环氧树脂的薄层(例如,50微米),切割成适当的形状,并放置在图案化的组件的顶部。装配的混合***100(去掉接入管道),如图32所示,在75℃下加热约10分钟,以便软化被涂覆在盖片312上的环氧树脂并密封在盖片与第二环氧树脂层的连接处的缝隙。随后,装配的器件被以紫外光来空白曝光(blank-expose),并被曝光后烘烤,以固化在盖片与流体通道侧壁之间的接合。然后,接入管道以与以上结合图26讨论的类似的方式被连接到组件上。
按照另一个实施例,图1和2所示的混合***100可以通过使用PDMS和软平版印刷术技术分离地制作微流***300并随后把微流***附着到IC芯片102来实施(适用于这个实施例的软平版印刷技术的细节在以下参考文献中讨论:Younan Xia和George M.Whitesides所著的,在Annual Review of Material Science,1998,Vol.28,pp.153-184上发表的“Soft Lithography”,和George M.Whitesides,EmanueleOstuni,Shuichi Takayama,Xingyu Jiang和Donald E.Ingber所著的,在Annual Review of Biomedical Engineering,2001,Vol.3,pp.335-373上发表的“Soft Lithography in Biology andBiochemistry”)。图33-38示出了在基于这样的软平版印刷技术制造微流***时包括的各种处理步骤。
如图33和34所示,硅基片被旋涂以可紫外线固化的环氧树脂332,并使用光掩膜经由传统的光学平版印刷技术被图案化,以产生流体通道模具334。在图35中,PDMS层336被铸涂(cast coat)到模具上,并被热固化。如图36所示,固化的PDMS层然后被从模具剥离,而流体通道316的印记在其中形成。PDMS层被切割成想要的形状,并被钻出孔320,以形成微流***300。在图37中,其上附着有IC芯片102的基片1040被涂覆以二氧化硅的薄层338(例如,50到100纳米),以促进在芯片/基片组件与PDMS微流***300之间的接合。PDMS微流***和芯片/基片组件的要被接合的表面用氧等离子体来处理,以便在施加压力时“激活”用于接合的表面,在图38上,激活的表面被接合在一起,以形成混合***100(接入管道除外)。
总之,按照以上讨论的各种实施例,用于CMOS/微流混合***的总的制作过程可根据所使用的具体的技术以适当的次序包括以下步骤:1)包括微线圈阵列、数字交换网络、成像(例如,RF)电子装置和相关电路以及温度调节电子装置的CMOS芯片的硅铸造制作;2)在适当的微线圈上任选的坡莫合金沉积,以增大磁场强度;3)(例如,在芯片上,直接经由基于聚酰亚胺或基于紫外线环氧树脂的技术,或以软石版印刷技术PDMS模具分离地)制作微流***;4)具有各种为了生物兼容性的制剂的CMOS芯片表面的PMDS涂覆;5)施加盖片,以形成(多个)流体通道/腔室;以及6)将CMOS/微流混合***与电板(electricalboard)(例如,封装基片)和温度控制器(例如,热电冷却器)装配。
VI.样本计数和分类
按照另一个实施例,如以上在第III节中讨论的包括样本检测与成像部件的微流***100以及如以上在第V节中讨论的微流***的各种配置可被用于多种细胞计数、分类和识别应用。
例如,图39(a)-(d)示出经由如以上结合图17-20讨论的RF感测技术的细胞检测的各种示例性实施方案。在39(a)中,单个窄的微流体通道一次只可以允许一个附着磁珠的样本越过给定的微线圈(即,悬浮液包含被粘合到流过通道300的感兴趣的样本上的磁珠112,该通道300在被耦合到RF/检测部件480的微线圈212(线圈3)的上方,该微线圈逐个地感测磁珠)。细胞计数可以基于变化的流体流动速率和悬浮在流体中的磁珠的特性来完成。在某些情形下,如果流体流动太快,磁珠可能没有足够的时间在感测线圈(线圈3)中磁化,因此不能被RF/检测部件480正确地检测。在这样的情形下,可以利用图39(a)所示的直线微线圈阵列中的其它微线圈(例如,除了线圈3以外的线圈1和2),来生成直流磁场,以在磁珠到达感测线圈(线圈3)之前磁化磁珠,由此便于磁珠的检测。
在另一个例子中,如图39(b)所示,宽的微流体通道300可被实施,在被耦合到RF/检测部件480的微线圈212上方,该通道一次传送几个磁珠112,在此期间,微线圈212可以以一个磁珠的计数分辨率同时感测多个磁珠。其它计数例子在图39(c)上给出,其中利用复接的流体通道300A、300B和300C,并且在图39(d)中示出经由微线圈阵列200B和单个蓄液池微流***300的磁珠分布的二维成像。正如以上讨论的,借助能够激励二维阵列的每个微线圈的RF/检测部件480,微线圈阵列200B类似于传统的CCD成像***的像素设置。
按照本公开内容的另一个实施例针对基于按照以上讨论的各种实施例的、包括RF/检测部件的CMOS/微流混合***的精确细胞分类方法和装置。以高精度将均匀细胞群体与分解的器官或组织,或与成批的汇集的血液隔离开,对于进行基因表达分析、对于需要纯细胞线的细胞和组织工程化验、或对于临床应用(例如用于癌症病人的骨髓重建过程的干细胞)都是重要的。由于独特的细胞表面受体的表达式,许多细胞可被识别。在传统的方法中,被涂覆以针对这些受体的配合体的磁珠被使用来以磁镊和磁扭转血细胞计数术来啮合(engage)细胞。这种技术也被使用于细胞分类/分离,但传统的磁分离技术利用简单的固定磁体,该磁体一次全部统计地分类一大组附着磁珠的细胞,缺乏可控制性和精度。与传统的方法相反,本公开内容的一个实施例将CMOS电子装置的高度可控制性与微线圈阵列的微尺度操纵和检测能力组合,以实现对于在非均匀悬浮液内被附着到磁珠上的各个生物细胞的超精确的、高通过量和自动化的细胞分类方法和设备。
在本实施例的一个示例性实施方案中,如图40所示,包括附着磁珠的细胞116和非磁化细胞114的细胞溶液被悬浮在流过微流体通道300的流体中(例如,在一个示例性实施方案中,毛细血管内皮细胞和NIH 3T3成纤维细胞可以悬浮在具有被涂覆以针对血小板内皮细胞粘附分子(PECAM)的抗体(一种除了内皮细胞以外的细胞表面受体)的2.8微米的磁珠的媒介物中;仅仅被附着到内皮细胞上的涂覆以配合体的磁珠)。微流体通道通过RF传感器212-1或212-2(即,被耦合到RF/检测部件480的线圈)上方,无论何时附着磁珠的细胞116通过传感器上方时,传感器记录和计数附着磁珠的细胞,在图40所示的实施例的一个方面,无论何时第一RF传感器212-1检测附着磁珠的细胞116时,在第一直线微线圈阵列2000-1中的微线圈都顺序激活,以像“传送带”那样拉动附着磁珠的细胞116,由此把它从组合的细胞流体流中去除,并从总的细胞群体中有效地分离出附着磁珠的细胞。在一个实施例中,直线微线圈阵列2000-1不需要总是被接通的,以使得功耗最小化,它可以用表示附着磁珠的细胞116存在的、前面的RF传感器212-1的信号而被接通。
在图40中,在某些情形下,一些附着磁珠的细胞116可以通过第一直线微线圈阵列2000-1,而不会从流液的主流中被拉出。然而,在图40的实施例的一个方面,多传感器-直线微线圈阵列块可以被顺序地利用,每个具有相同的操作协议(例如,指出微线圈212-2用作为第二“RF传感器”和第二直线微线圈阵列2000-1)。具有单独的细胞选择的这样的冗余***实质地增加细胞分类产量和精度,而不牺牲速度。RF传感器212-1和212-2通过感测附着磁珠的样本116的存在而定量地实时监视分类精度。在传送通过这个***后,分离的附着磁珠的细胞和未附着的细胞被分别收集,其中未附着的细胞群体可通过同一个协议用于进一步分类,以去除可能留在这个群体中的任何附着磁珠的细胞(估计可能很少)。
在图40的设置中示例说明的细胞分类方法和装置比起现有技术提供了几个重要的优点。例如,一方面,各个附着磁珠的细胞可以以非常低的错误率从非均匀细胞群体中分离出,其中精度通过使用RF/检测部件实时地定量监视。而且,结合图40讨论的细胞分类方法和装置的精度比起被开发和被临床使用来把特定的血液细胞类型或病原体与成批的汇集的血液隔离开(例如用于癌症病人的骨髓重建过程的干细胞)的传统的磁分离技术高得多。在传统的方法中,通过使用被填充以由固定的磁体包围的钢毛的管子,将一大组附着磁珠的细胞一次全部统计地从剩余的血液内容中拉出。这个方法是劳动强度很高的和缺乏精度的,特别是当某种类型的细胞需要“完全”被清除时。
另外,以上讨论的细胞分类方法和设备便于了用复接的微流体通道和CMOS电路的并行的流体处理。CMOS电子装置还使得细胞分类自动化成为可能。与荧光激活细胞分类器(FACS)相比较,按照这里讨论的概念的***可以以小得多和更便宜的方式被实施。而且,按照本公开内容的细胞分类***需要最小的用于分类的细胞准备(例如,不用荧光蛋白质的转染)。另外,另一方面,可论证用微流***比起任何大体积设备更容易保持生理体内平衡。
按照图40中所示的实施例的各种方面,多个实际的考虑可能影响细胞分类过程。例如,会影响细胞分类的某些变量包括,但不一定限于:1)配合体-受体结合到目标细胞上的效率;2)磁珠的非特异性结合到非目标细胞上的出现率;3)溶液中细胞类型的数目;4)悬浮的密度或每升的细胞数;以及5)细胞从收获的组织或器官被分解的效率。第一和第二变量可以通过选择对于由目标细胞类型独特地表示的细胞表面受体特定的配合体而被解决。
例如,在一个示例性实施方案中在对准内皮细胞时,PECAM是细胞表面分子的理想的选择,因为它在内皮细胞中的独特的表示和因为它在细胞活动性和细胞粘附中的作用;结果,在转移期间所附着的磁珠的分离的可能性减小。在另一个实施方案中,内皮细胞可以从也包含不表现PECAM的NIH 3T3成纤维细胞的细胞悬浮液中被分类。细胞悬浮液的通过速率和密度可以被校准,以便达到最佳分类性能。
另外,在其它实施方案中,可以利用重复过程,其中在第一分类过程中被优化的实验参数作为用于一个或多个以后的分类过程的初始条件,这样,细胞可以从包含多种细胞类型的悬浮液中被分类。例如,在牵涉到新生儿的心脏的一个过程中,内皮细胞可以与心肌细胞、成纤维细胞、在收获之前溢出的免疫细胞以及神经组织分离开。由这种混合的细胞群体造成的“嘈杂”的环境在某些情形下确定细胞分类性能的边界。一方面,稀释细胞悬浮液会增加用于分类所需要的时间,但可以提高分类精度。另一方面,为了确保足够的分解,悬浮液可以传送通过过滤器,过滤器选择性地过滤避开了被胰蛋白酶与胶原酶溶解的大的细胞群。
VII.组织装配
在按照本公开内容的再一个实施例中,所设计的组织的微尺度装配可以通过使用这里讨论的各种方法和设备来实现。例如,在一个实施例中,从异型细胞群体装配微尺度的所设计的心脏组织可以通过利用这里讨论的CMOS/微流混合***100而完成。
在通过每个发育性步骤重新组织的、紧密地限制的空间中的多种细胞类型之间的复杂的信令对话作为组织形态形成的媒介。在成熟的组织中,这些细胞群体的空间和群体控制被尽全力保持,但其损失以可识别的方式标志疾病过程的开始。未知的是,看起来受控的细胞群体的细微的相互作用会如何加强发病事件。这方面的极好的例子是心脏中在毛细管与心脏肌肉纤维之间的细胞-细胞相互作用,它改变活动的潜在传播,导致影响心律失常。这是重要的问题,因为当前在临床上没有用药物治疗心脏的心律失常的可靠的措施。而且,药物和生物技术公司的抗心律失常药物流水线是空白的,部分由于缺乏支持新的药物目标的识别的实验性试样。因此,设计非均匀细胞群体的微尺度心脏组织的能力提供了用于发现新的药物目标的心脏心律失常的可靠的、有效的试样,并且阐明了对于心脏电生理学中的基础问题的回答。
更一般地,在不同的细胞群体之间的异型信令定义了肿瘤、心脏和肝脏中的组织微环境改变。所以,微尺度组织组件对于研究在不同的细胞类型、药物效能之间的通信网络和用于以标准化的、可重复的方式进行基本生理研究是重要的。然而,在微尺度上精确地设计模型组织被证明是困难的。
存在有用于通过群体控制进行异型细胞培养的几种技术。Transwell板在传统上被使用来研究在两种不同的细胞群体之间的paracine信令。用于在体外模仿组织微环境的新的技术依靠光刻技术。一个已知的策略是基于使用图案化的光刻胶或掩膜,以允许细胞附着,以便选择表面的区域。随后的将光刻胶或掩膜去除暴露出便于第二细胞类型的粘附的区域。第二策略利用介电电泳,在微电极阵列上图案化和把***细胞与白血球和红血球分隔开。其它策略包括:把细胞悬浮液引导到表面上不同的位置的微流通道;允许种植第二种细胞类型到被电激活以允许附着的表面区域的电激活掩膜;和重力加强的组织组件。这些技术证明是劳动力强度大的,缺乏精确的群体控制和缓慢的。基于介电电泳的技术是令人感兴趣的,因为它代表用于细胞分类和微尺度组织重建的策略;然而,它缺乏对于进行定量研究所需要的精确的细胞群体控制、由微图案化工艺提供的空间控制,并且依赖于具有不同的极化特性以便被有效地收集和图案化的细胞。这阻碍了均匀的细胞群体的保证,其中该均匀的细胞群体仅仅可通过分子专一性来确保。
鉴于上述的内容,按照本公开内容的一个实施例针对二维组织的装配,如图41-43所示。在一个示例性实施方案中,考虑毛细血管内皮细胞,其中细胞通过在磁珠上涂覆以抗体成PECAM以及把磁珠悬浮在具有被离解的内皮细胞的溶液中而被装配。如图41所示。通过使用IC芯片102的微线圈阵列202B,附着到磁珠上的细胞可以被分离开,然后被导引成为在涂覆以纤维粘连蛋白(FN)的芯片表面上的构造。特别地,如图41(a)所示,二维内皮细胞层通过使用微线圈阵列200B被精确地装配,其中微图案化的纤维粘连蛋白(FN)用粗黑线表示。在图41(b)中,内皮细胞占据由深色的微线圈表示的区域,这些微线圈具有非零直流电流,由此产生磁场。一旦在合适的位置,就允许细胞被粘附和被散布到芯片表面,形成定义的几何结构的汇合的单层。
随后,这个内皮组织被装配成在预先存在的心脏肌肉组织内的“嵌入的组织”。在一个实施例中,二维心脏组织可以通过在微图案化的纤维粘连蛋白上培养新生老鼠心室肌细胞而被构建。离解的心肌细胞在微图案化的FN线中进行培养,如图42(a)所示。心肌细胞粘附到FN线上并对准FN线,自身装配成汇合的、各向异性的单层,该单层能够传导动作电位波前。图42(b)示出心脏组织构建,模拟平行(顶部)和垂直(底部)于心脏纤维的毛细管。图42(c)示出粘附斑(focal-adhesion)大小的FN岛的间隔。
通过使用微线圈阵列,毛细血管内皮细胞可以关于所设计的心脏组织的纤维取向而被嵌入到精确的构造中,如图43所示。在图43(a)中,由磁珠标记的毛细血管内皮细胞(见图43(b))通过使用微线圈阵列被导引到在以前培养的心肌细胞之间的位置。当处在适当的位置时,它们保持得足够长,以便整体附着到微图案化的FN上。如图43(c)和(d)所示,内皮细胞粘合FN,并且将足突(Lamellipodia)延伸以附着到其它岛和其上附着心肌细胞的FN线的边缘。
粘附斑尺寸的FN岛可能不利于肌细胞粘附和扩散,因为这些肌细胞的自发收缩使得在它们能充分粘附之前把它们从单个小FN岛撕下。然而,毛细血管内皮细胞粘合这些岛并将足突延伸到扩展成同时占据几个。因此,被微图案化有小FN岛的区域能够选择性地操纵内皮细胞而不是心肌细胞(见图42)。被附着到磁珠上的内皮细胞通过微线圈阵列一次一个地加上,如图43所示,因为在肌细胞被附着到基片上之后把它们放置在溶液中,会导致沿微图案化的FN线的混合的、未控制的群体。在24小时或更短时间的培养中允许构建的内皮包埋物(embeds)扩散。免疫组织化学可被使用来标记细胞,以跟踪在基于微线圈阵列构建后在特定的时间点时它们的生长。特别地,组织可以针对横纹α辅肌动蛋白(sarcomericα-actinin)、PECAM和核DNA(DAPI)被三重染色,以便精确地定位在内皮细胞与心肌细胞之间的分界线,以及检验内皮细胞的可能的迁徙和增殖。一方面,改善的媒介条件使得内皮细胞增殖最小化,但支持内皮细胞扩展和肌细胞搏动。
按照上述的方法论,可以完成内皮细胞嵌入的均匀性和几何结构精确度,以及阻止在心脏肌肉纤维之间内皮细胞的入侵。本申请人认识到和理解,在装配内皮嵌入之前把心肌细胞放置在微图案化的表面上是处理过程中重要的步骤。特别地,比起其它细胞类型,心肌细胞需要更多的时间来附着到和适应于细胞外基质***物。另外,毛细血管内皮细胞是相当迁移的,而心肌细胞不是。因此,通过预先放置心肌细胞,内皮嵌入的细胞可以在装配后被有效地牵制在它们指定的区域中。
结论
这里讨论的混合***的各种实施例合并电磁学、微流学、半导体物理学、平版印刷技术、高频(例如,RF)电子学、模拟/数字集成电路、互补***中的反馈控制和生物学。在各种示例性实施方案中,这样的混合***可被配置为“生物芯片”,提供可以在亚微尺度上执行各种各样的生物实验的通用可编程装置,由此很大地有利于实现工业、科学和军事上感兴趣的“片上实验室”的开发。
在这样地描述几种说明性实施例后,应当理解,本领域技术人员容易作出各种改变、修改和改进。这样的改变、修改和改进旨在作为本公开内容的一部分,并旨在属于本公开内容的精神和范围中。虽然这里给出的某些例子涉及到功能或结构单元的特定的组合,但应当理解,这些功能和单元可以按照本发明以其它方式被组合以完成相同的和不同的目的。特别地,结合一个实施例讨论的步骤、单元、和特性不打算被排除在其它实施例中类似的或其它的角色以外。因此,以上的说明和附图仅仅作为例子,而不旨在作为限制。
Claims (30)
1. 一种设备,包括:
多个CMOS制作的场生成部件;
微流***,其被配置成包含在多个CMOS制作的场生成部件附近的流体;以及
至少一个控制器,其被配置成控制多个CMOS制作的场生成部件,以生成至少一个具有足够的强度的电场或磁场,以便与悬浮在流体中的至少一个样本相互作用。
2. 根据权利要求1的设备,其中至少一个控制器被配置成控制多个CMOS制作的场生成部件,以生成多个具有足够的强度的、可编程的、空间上或时间上可变的电场或磁场,以便与悬浮在流体中的至少一个样本相互作用。
3. 根据权利要求2的设备,进一步包括被耦合到至少一个控制器的至少一个处理器,所述至少一个处理器被配置成控制所述至少一个控制器,以便经由所述多个电场或磁场来进行所述至少一个样本的操纵、检测、成像和表征中的至少一项。
4. 根据权利要求3的设备,其中所述至少一个处理器被配置成便于基于所述至少一个样本的检测来进行所述至少一个样本的可编程的自动化操纵。
5. 根据权利要求1的设备,其中所述至少一个控制器包括多个CMOS制作的场控制部件,这些部件与多个CMOS制作的场生成部件一同形成集成电路芯片。
6. 根据权利要求5的设备,其中所述微流***整体地与所述集成电路芯片相耦合,以形成CMOS/微流混合***。
7. 根据权利要求6的设备,其中微流***包括至少一个聚酰亚胺层,其被沉积在所述CMOS制作的场生成部件上,在该层中形成至少一个微流通道或蓄液池。
8. 根据权利要求6的设备,其中所述微流***包括至少一个环氧树脂层,其被沉积在所述CMOS制作的场生成部件上,在该层中形成至少一个微流通道或蓄液池。
9. 根据权利要求6的设备,其中所述微流***包括至少一个聚二甲基硅氧烷(PDMS)模,其被沉积在所述CMOS制作的场生成部件上,在该模中形成至少一个微流通道或蓄液池。
10. 根据权利要求5的设备,其中所述多个场控制部件包括:
多个可编程的交换或复接部件;以及
多个电流源或电压源。
11. 根据权利要求10的设备,其中所述多个场控制部件进一步包括多个高频检测部件,其被配置成便于经由所述生成的至少一个电场或磁场来进行对悬浮在流体中的所述至少一个样本的检测、成像和表征中的至少一项。
12. 根据权利要求11的设备,进一步包括至少一个CMOS制作的温度调节部件,其与所述多个CMOS制作的场控制部件和所述多个CMOS制作的场生成部件一同形成所述集成电路芯片。
13. 根据权利要求12的设备,进一步包括被耦合到所述至少一个控制器的至少一个处理器,所述至少一个处理器被配置成控制所述至少一个控制器,以便于经由所生成的至少一个电场或磁场进行所述至少一个样本的操纵、检测、成像和表征中的至少一项。
14. 根据权利要求13的设备,其中所述至少一个处理器被配置成便于基于所述至少一个样本的检测进行对于所述至少一个样本的可编程的自动化操纵。
15. 根据权利要求1的设备,其中所述多个CMOS制作的场生成部件包括多个微线圈。
16. 根据权利要求15的设备,其中所述多个微线圈被排列成二维阵列。
17. 根据权利要求15的设备,其中每个微线圈包括导体圈的至少两个在轴向上同心的、在空间上分离的部分。
18. 根据权利要求15的设备,其中所述至少一个控制器包括被耦合到所述多个微线圈的多个电流源或电压源以及多个交换或复接部件。
19. 根据权利要求18的设备,其中所述至少一个控制器进一步包括被耦合到所述多个微线圈的多个射频(RF)检测部件。
20. 根据权利要求19的设备,其中所述多个RF检测部件包括频率锁定环,其被配置成便于对于悬浮在流体中的所述至少一个样本进行检测、成像和表征的至少一项。
21. 根据权利要求20的设备,其中所述频率锁定环包括至少一个电桥电路,所述至少一个电桥电路包括所述多个微线圈的至少一个微线圈,所述至少一个电桥电路被配置以生成至少一个信号,该信号代表由于在所述至少一个微线圈附近存在所述至少一个样本而造成的所述至少一个微线圈的电感的改变。
22. 一种方法,包括以下步骤:
A)从多个CMOS制作的场生成部件生成至少一个电场或磁场,所述至少一个电场或磁场,具有足够的强度,以便与悬浮在流体中的至少一个样本相互作用,其中所述流体被包含在多个CMOS制作的场生成部件附近的微流***内。
23. 根据权利要求22的方法,其中所述步骤A)包括以下步骤:
A1)生成多个具有足够强度的可编程的、在空间上或时间上可变的电场或磁场,以便与悬浮在所述流体中的所述至少一个样本相互作用。
24. 根据权利要求23的方法,进一步包括以下步骤:
B)控制所述多个电场或磁场,以便对于所述至少一个样本进行操纵、检测、成像和表征中的至少一项。
25. 根据权利要求24的方法,其中所述步骤B)包括以下步骤:
控制所述多个电场或磁场,以便基于所述至少一个样本的检测对于所述至少一个样本进行自动化操纵。
26. 根据权利要求24的方法,其中所述步骤A1)包括以下步骤:
经由多个可编程的交换或复接部件把电压或电流施加到所述多个CMOS制作的场生成部件上。
27. 根据权利要求24的方法,其中所述步骤A1)包括以下步骤:
A2)施加至少一个高频信号到所述多个CMOS制作的场生成部件的至少一个场生成部件上,以便对于至少一个样本进行检测、成像和表征中的至少一项。
28. 根据权利要求27的方法,其中所述步骤A2)包括以下步骤:
监视所述至少一个高频信号的频率,其中所述频率指示在所述至少一个场生成部件附近存在或不存在所述至少一个样本。
29. 根据权利要求27的方法,还包括以下步骤:
C)调整所述至少一个样本的温度。
30. 根据权利要求22的方法,其中所述多个CMOS制作的场生成部件包括多个微线圈,每个微线圈包括导体圈的至少两个在轴向上同心的、在空间上分离的部分。
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PB01 | Publication | ||
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C02 | Deemed withdrawal of patent application after publication (patent law 2001) | ||
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