CA2530382A1 - Procede de dosage d'un echantillon biologique ou chimique - Google Patents
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Abstract
L'invention concerne un procédé de dosage d'un échantillon biologique ou chimique comportant les étapes suivantes éclairement de l'échantillon (10) a u moyen d'un faisceau lumineux (17) issu d'une source (11), réalisation d'une image comprenant l'image du faisceau (18) diffusé par l'échantillon (10), analyse de l'image selon des critères de référence, extraction d'une information spécifique à l'interaction faisceau lumineux/échantillon, calcul du dosage.
Description
B 14352.3 D8 PROCEDE DE DOSAGE D'UN ECHANTILLON BIOLOGIQUE OU
CHIMIQUE
DESCRIPTION
DOMAINE TECHNIQUE
La présente invention concerne un procédé
de dosage d'un échantillon biologique ou chimique, Le domaine de l'invention est notamment celui des mesures de concentration de molécules fluorescentes appelées fluorochromes contenues dans des solutions. De telles molécules sont utilisées pour doser la quantité d'une espèce biologique donnëe. La quantité de molécules de cette espèce biologique est alors liée à la quantité de molécules fluorescentes.
Une mesure de l'intensité émise lors de l'excitation de ces molécules fluorescentes permet, par calibrage de l'appareil de mesure utilisé, de déduire la quantité ou la concentration de molécules biologiques. De telles mesures sont couramment utilisées en biologie, en chimie et, en physique.
Dans la suite de la description, pour des raisons de simplification d'exposé, l'invention est décrite dans ce domaine de mesures de fluorescence d'échantillons.
ETAT DE LA TECHNIQûE ANTERIEURE
De nombreux appareils de commerce, tels que les fluorimètres et les spectro-fluorimètres, permettent de mesurer la fluorescence d'une solution.
Ces appareils permettent d'effectuer une mesure dans B 14352.3 DB
CHIMIQUE
DESCRIPTION
DOMAINE TECHNIQUE
La présente invention concerne un procédé
de dosage d'un échantillon biologique ou chimique, Le domaine de l'invention est notamment celui des mesures de concentration de molécules fluorescentes appelées fluorochromes contenues dans des solutions. De telles molécules sont utilisées pour doser la quantité d'une espèce biologique donnëe. La quantité de molécules de cette espèce biologique est alors liée à la quantité de molécules fluorescentes.
Une mesure de l'intensité émise lors de l'excitation de ces molécules fluorescentes permet, par calibrage de l'appareil de mesure utilisé, de déduire la quantité ou la concentration de molécules biologiques. De telles mesures sont couramment utilisées en biologie, en chimie et, en physique.
Dans la suite de la description, pour des raisons de simplification d'exposé, l'invention est décrite dans ce domaine de mesures de fluorescence d'échantillons.
ETAT DE LA TECHNIQûE ANTERIEURE
De nombreux appareils de commerce, tels que les fluorimètres et les spectro-fluorimètres, permettent de mesurer la fluorescence d'une solution.
Ces appareils permettent d'effectuer une mesure dans B 14352.3 DB
2 une cuve dont la géométrie est variable et fonction de l'application.
D'autres appareils de mesure en solution utilisent des capillaires comme cuve. Ce sont par exemple les systèmes de mesures pour appareil d'électrophorèse.
Dans tous ces appareils on mesure un échantillon placé dans une cuve, auquel on associe un détecteur unique.
Dans certaines applications de spectro-fluorimétrie on utilise des détecteurs multiples. Le spectre d'émission des molécules fluorescentes est alors dispersé sur un capteur d'image afin de mesurer simultanément l'ênergie dans toutes les longueurs d'onde, ce qui revient à associer un détecteur unique pour chaque intervalle spectral. Plusieurs pixels sont parfois associés dans la direction orthogonale à celle de la dispersion afin de réaliser une opération appelée « binning » qui permet d'augmenter le rapport signal sur bruit de chaque mesure spectrale en réduisant le bruit de lecture des détecteurs devant le flux de photons. Des détecteurs multiples sont également utilisés dans certains appareils multi-échantillons. La présence de plusieurs échantillons impose alors l'emploi de plusieurs cuves et la mesure pour chaque échantillon est faite via un capteur d'image.
La sensibilité de détection de tels appareils est insuffisante pour doser de faibles quantités de molécules, typiquement de l'ordre du picoMolaire, soit pour faire un diagnostic de maladie, soit pour étudier la pureté d'une solution. Certains B 143â2.3 DB
D'autres appareils de mesure en solution utilisent des capillaires comme cuve. Ce sont par exemple les systèmes de mesures pour appareil d'électrophorèse.
Dans tous ces appareils on mesure un échantillon placé dans une cuve, auquel on associe un détecteur unique.
Dans certaines applications de spectro-fluorimétrie on utilise des détecteurs multiples. Le spectre d'émission des molécules fluorescentes est alors dispersé sur un capteur d'image afin de mesurer simultanément l'ênergie dans toutes les longueurs d'onde, ce qui revient à associer un détecteur unique pour chaque intervalle spectral. Plusieurs pixels sont parfois associés dans la direction orthogonale à celle de la dispersion afin de réaliser une opération appelée « binning » qui permet d'augmenter le rapport signal sur bruit de chaque mesure spectrale en réduisant le bruit de lecture des détecteurs devant le flux de photons. Des détecteurs multiples sont également utilisés dans certains appareils multi-échantillons. La présence de plusieurs échantillons impose alors l'emploi de plusieurs cuves et la mesure pour chaque échantillon est faite via un capteur d'image.
La sensibilité de détection de tels appareils est insuffisante pour doser de faibles quantités de molécules, typiquement de l'ordre du picoMolaire, soit pour faire un diagnostic de maladie, soit pour étudier la pureté d'une solution. Certains B 143â2.3 DB
3 types de dosages sont méme impossibles à faire en dessous d'une certaine concentration : dans le domaine des immuno-analyses (dosage des antigènes), le seuil de détection statistique de l'art connu, exprimé en concentration de cibles, le plus bas obtenu pour une mesure en solution est de l'ordre de la centaine de picoMolaire. Typiquement, les appareils de commerce en cuve ne permettent pas de mesurer une fluorescence en dessous d'une concentration de cibles de 1nM
(nanoMolaire) .
Pour diminuer la limite de détection on peut focaliser la lumière d'une source laser dans un très petit volume, comme cela est réalisé en électrophorèse capillaire. L'échantillon passe alors dans un capillaire de quelques centaines de micromètres de diamètre. La limite de détection obtenue est de l'ordre du nM, comme décrit dans le document référencé
[1] en fin de description.
On retrouve une telle limite de détection en marqueurs dans un système complexe comportant une optique confocale intégrëe scrutant l'intérieur d'un capillaire, comme décrit dans le document référencé
[2] .
Les systèmes de mesure utilisant des capillaires ne permettent pas un débit d'échantillon très grand, par exemple d'une dizaine à une centaine de microlitre/minute. Une mesure sur un échantillon de grand volume est donc impossible. Le prélèvement qui s'ensuit réduit l'échantillonnage moléculaire et augmente le seuil de détection. Par exemple, s'il est possible de détecter la présence d'une molécule unique B 14352.3 D8
(nanoMolaire) .
Pour diminuer la limite de détection on peut focaliser la lumière d'une source laser dans un très petit volume, comme cela est réalisé en électrophorèse capillaire. L'échantillon passe alors dans un capillaire de quelques centaines de micromètres de diamètre. La limite de détection obtenue est de l'ordre du nM, comme décrit dans le document référencé
[1] en fin de description.
On retrouve une telle limite de détection en marqueurs dans un système complexe comportant une optique confocale intégrëe scrutant l'intérieur d'un capillaire, comme décrit dans le document référencé
[2] .
Les systèmes de mesure utilisant des capillaires ne permettent pas un débit d'échantillon très grand, par exemple d'une dizaine à une centaine de microlitre/minute. Une mesure sur un échantillon de grand volume est donc impossible. Le prélèvement qui s'ensuit réduit l'échantillonnage moléculaire et augmente le seuil de détection. Par exemple, s'il est possible de détecter la présence d'une molécule unique B 14352.3 D8
4 par des techniques de corrélation de fluorescence, comme décrit dans document référencé [3], le volume sondé est très faible, de l'ordre du femtolitre.
Détecter une molécule dans un tel volume donne une limite de dëtection de l'ordre du nM.
Pour augmenter la densité de puissance dans le volume excité on peut focaliser la lumière d'excitation. Comme l'ëmission de fluorescence est quasi proportionnelle à la quantitê d'énergie reçue lors de l'excitation, l'augmentation dë la densitê de puissance permet d'augmenter le nombre de photons émis en fluorescence. Pour un système de mesure bien conçu, comme c'est le cas de la plupart des instruments du commerce, plus le nombre de photons mesurés est grand et plus l'incertitude relative de cette mesure est faible. Cette incertitude varie comme ~~ où N est le nombre de photons transformés en électrons lors de la conversion par le détecteur. Ceci justifie le choix d'une augmentation de la densité de puissance dans le volume excité. Cependant, une forte densité de puissance s'accompagne d'une photo-extinction d'autant plus rapide que l'énergie lumineuse est grande. Pour la mesure d'une très faible concentration de molécules fluorescentes, il faut alors exposer ce vo lame pendant un temps supërieur au temps de photo-blanchiment, qui correspond à une propriété des molécules fluorescentes consistant à. s' arrêter d' émettre de la lumière au bout d'un certain temps. I1 est alors impossible de collecter suffisamment de photons pour atteindre le seuil de détection requis.
8 14352.3 DB
Des facteurs de limitation du seuil de détection résident dans l'auto-fluorescence des liquides, qui est une fluorescence intrinsèque de ces milieux, et dans la diffusion Raman. Le niveau de
Détecter une molécule dans un tel volume donne une limite de dëtection de l'ordre du nM.
Pour augmenter la densité de puissance dans le volume excité on peut focaliser la lumière d'excitation. Comme l'ëmission de fluorescence est quasi proportionnelle à la quantitê d'énergie reçue lors de l'excitation, l'augmentation dë la densitê de puissance permet d'augmenter le nombre de photons émis en fluorescence. Pour un système de mesure bien conçu, comme c'est le cas de la plupart des instruments du commerce, plus le nombre de photons mesurés est grand et plus l'incertitude relative de cette mesure est faible. Cette incertitude varie comme ~~ où N est le nombre de photons transformés en électrons lors de la conversion par le détecteur. Ceci justifie le choix d'une augmentation de la densité de puissance dans le volume excité. Cependant, une forte densité de puissance s'accompagne d'une photo-extinction d'autant plus rapide que l'énergie lumineuse est grande. Pour la mesure d'une très faible concentration de molécules fluorescentes, il faut alors exposer ce vo lame pendant un temps supërieur au temps de photo-blanchiment, qui correspond à une propriété des molécules fluorescentes consistant à. s' arrêter d' émettre de la lumière au bout d'un certain temps. I1 est alors impossible de collecter suffisamment de photons pour atteindre le seuil de détection requis.
8 14352.3 DB
Des facteurs de limitation du seuil de détection résident dans l'auto-fluorescence des liquides, qui est une fluorescence intrinsèque de ces milieux, et dans la diffusion Raman. Le niveau de
5 lumière émis réduit, en effet, les performances de détection car 1'« offset » de photoluminescence du tampon utilisé est de même nature que le signal, dit « spécifique », que l'on veut détecter. Si le système de mesure est seulement limité par le « bruit de grenaille », dit également « bruit de photons », alors le plus petit signal mesurable au sens statistique Smin est égal à 3x Offset , où « Offset » est une mesure exprimée en électrons primaires (électrons résultants directement de la conversion des photons par une photo-cathode dans le cas d'un photomultiplicateur ou d'une surface semi-conductrice) et 3 est un facteur arbitraire qui permet de garantir une discrimination à
99% entre Sn,in et Offset. Pour résoudre un tel problème Les solutions de l'art connu réalisent .
1) un choix judicieux des liquides, 2) un choix du marqueur, 3) une augmentation du temps de mesure pour accumuler des photons, 4) une augmentation de la puissance d'excitation pour collecter plus de photons.
Mais le principal facteur de limitation du seuil de détection est la non-reproductibilité des mesures, qui, pour de faibles niveaux de signaux, devient très vite dominante. Cette non reproductibilité
provient essentiellement d'un mauvais repositionnement mêcanique de la cuve de mesure et de la lumière qui est B 14352.3 DB
99% entre Sn,in et Offset. Pour résoudre un tel problème Les solutions de l'art connu réalisent .
1) un choix judicieux des liquides, 2) un choix du marqueur, 3) une augmentation du temps de mesure pour accumuler des photons, 4) une augmentation de la puissance d'excitation pour collecter plus de photons.
Mais le principal facteur de limitation du seuil de détection est la non-reproductibilité des mesures, qui, pour de faibles niveaux de signaux, devient très vite dominante. Cette non reproductibilité
provient essentiellement d'un mauvais repositionnement mêcanique de la cuve de mesure et de la lumière qui est B 14352.3 DB
6 collectée par le ménisque liquide dans cette cuve et qui est dirigée dans l'espace de façon aléatoire.
Une solution pour réduire de telles non reproductibilités consiste à réaliser l'injection dans la cuve d'un plus grand volume de solution. Mais une telle injection est insuffisante pour obtenir une bonne sensibilité. De plus il n'est pas toujours possible ou souhaitable de travailler avec des grands volumes, Le positionnement mécanique n'est pas améliorable facilement. De plus dans une telle solution on ne traite pas, alors, des variations provoquées, par exemple, par Z' éclairage ambiant et la variation de la forme du ménisque.
Une autre solution pour réduire de telles non-reproductibilités consiste à utiliser des cuves comprenant une fenêtre transparente en verre ee noir », qui corresponde à la zone considérée pour la mesure.
Mais cette solution réduit le flux de photons collecté
par le système de mesure, et donc élève la limite de détection. De plus, elle ne permet pas de connaître les variations de 1'« offset », qui peuvent être causées par une modification de la lumière ambiante, par un mauvais état de surface des faces de la cuve (salissures, rayures eto.), par une diffusion provenant du ménisque et des parois.
Ainsi ces différentes solutions de l'art connu ne permettent ni une bonne sensibilité, ni une bonne reproductibilitê des mesures.
L'invention a pour objet de pallier ces inconvénients en proposant un nouveau procédé de dosage d'un échantillon biologique ou chimique qui utilise un B 14352.3 DB
Une solution pour réduire de telles non reproductibilités consiste à réaliser l'injection dans la cuve d'un plus grand volume de solution. Mais une telle injection est insuffisante pour obtenir une bonne sensibilité. De plus il n'est pas toujours possible ou souhaitable de travailler avec des grands volumes, Le positionnement mécanique n'est pas améliorable facilement. De plus dans une telle solution on ne traite pas, alors, des variations provoquées, par exemple, par Z' éclairage ambiant et la variation de la forme du ménisque.
Une autre solution pour réduire de telles non-reproductibilités consiste à utiliser des cuves comprenant une fenêtre transparente en verre ee noir », qui corresponde à la zone considérée pour la mesure.
Mais cette solution réduit le flux de photons collecté
par le système de mesure, et donc élève la limite de détection. De plus, elle ne permet pas de connaître les variations de 1'« offset », qui peuvent être causées par une modification de la lumière ambiante, par un mauvais état de surface des faces de la cuve (salissures, rayures eto.), par une diffusion provenant du ménisque et des parois.
Ainsi ces différentes solutions de l'art connu ne permettent ni une bonne sensibilité, ni une bonne reproductibilitê des mesures.
L'invention a pour objet de pallier ces inconvénients en proposant un nouveau procédé de dosage d'un échantillon biologique ou chimique qui utilise un B 14352.3 DB
7 dispositif d'enregistrement spatial de l'image de l'interaction entre la lumière issue d'une source et de cet échantillon comme moyen pour sélectionner les informations utiles.
EXPOSÉ DE D'INVENTION
L'invention concerne un procédé de dosage d'un échantillon biologique ou chimique, comportant les étapes suivantes .
- introduction éventuelle de l'échantillon dans une cuve dont toutes les faces sont transparentes, - éclairement de l'échantillon au moyen d'un faisceau lumineux issu d'une source, caractérisé en ce qu'il comporte, en outre, les étapes suivantes .
. - réalisation d'une image comprenant l'image de la lumière diffusée par l'échantillon, - analyse de l'image selon des critères de référence, - extraction d'une information spécifique à
l'interaction faisceau lumineux/échantillon, - calcul du dosage.
Dans ce procédé la diffusion peut étre une diffusion Raman, une diffusion par fluorescence, une dîffusion moléculaire ou particulaire. L'analyse peut consister en l'étude de la structure spatiale de l'image et de la distribution de l'énergie lumineuse dans cette image. Le calcul du dosage peut se faire par rapport â un étalonnage entre la mesure d'énergie lumineuse et~ la concentration ou la quantité
d'échantillon. Le calcul du dosage peut également se B 14352,3 DB
EXPOSÉ DE D'INVENTION
L'invention concerne un procédé de dosage d'un échantillon biologique ou chimique, comportant les étapes suivantes .
- introduction éventuelle de l'échantillon dans une cuve dont toutes les faces sont transparentes, - éclairement de l'échantillon au moyen d'un faisceau lumineux issu d'une source, caractérisé en ce qu'il comporte, en outre, les étapes suivantes .
. - réalisation d'une image comprenant l'image de la lumière diffusée par l'échantillon, - analyse de l'image selon des critères de référence, - extraction d'une information spécifique à
l'interaction faisceau lumineux/échantillon, - calcul du dosage.
Dans ce procédé la diffusion peut étre une diffusion Raman, une diffusion par fluorescence, une dîffusion moléculaire ou particulaire. L'analyse peut consister en l'étude de la structure spatiale de l'image et de la distribution de l'énergie lumineuse dans cette image. Le calcul du dosage peut se faire par rapport â un étalonnage entre la mesure d'énergie lumineuse et~ la concentration ou la quantité
d'échantillon. Le calcul du dosage peut également se B 14352,3 DB
8 faire par rapport à l'analyse de la cinétique de la réaction biologique ou chimique.
Dans ce procédé, avantageusement, on définit une première zone d'intérêt autour de la zone de volume excité, et une seconde zone d'intérêt disposée à côté de cette première zone, et on mesure le signal spécifique en réalisant la soustraction entre la somme de tous les pixels de la première zone et la somme de tous les pixels de la seconde zone.
suivants .
L'invention présente les avantages - Elle permet d'atteindre une limite de détection expérimentale beaucoup plus faible que celle l5 des systèmes conventionnels.
- Elle permet de réaliser un dosage en utilisant un grand volume de solution avec un grand débit, et donc d'envisager des applications comme une analyse des eaux de rivière, des systèmes d'aération dans des immeubles.
- Elle n'impose pas de focaliser la lumière dans un petit volume. Le photo-blanchiment des molécules fluorescentes est donc très faible.
- Elle permet, du fait de la géométrie de la cuve, d'exciter simultanêment un grand nombre de molêcules, ce qui permet de collecter de nombreux photons.
- Ni l'auto -fluorescence, ni la diffusion Raman du milieu liquide ne sont une limitation à la sensibilité de l'invention. Elle permet donc de
Dans ce procédé, avantageusement, on définit une première zone d'intérêt autour de la zone de volume excité, et une seconde zone d'intérêt disposée à côté de cette première zone, et on mesure le signal spécifique en réalisant la soustraction entre la somme de tous les pixels de la première zone et la somme de tous les pixels de la seconde zone.
suivants .
L'invention présente les avantages - Elle permet d'atteindre une limite de détection expérimentale beaucoup plus faible que celle l5 des systèmes conventionnels.
- Elle permet de réaliser un dosage en utilisant un grand volume de solution avec un grand débit, et donc d'envisager des applications comme une analyse des eaux de rivière, des systèmes d'aération dans des immeubles.
- Elle n'impose pas de focaliser la lumière dans un petit volume. Le photo-blanchiment des molécules fluorescentes est donc très faible.
- Elle permet, du fait de la géométrie de la cuve, d'exciter simultanêment un grand nombre de molêcules, ce qui permet de collecter de nombreux photons.
- Ni l'auto -fluorescence, ni la diffusion Raman du milieu liquide ne sont une limitation à la sensibilité de l'invention. Elle permet donc de
9 PCT/FR2004/050289 B 14352.3 DB
travailler avec tous les marqueurs du commerce, ce qui réduit les contraintes de marquage.
- Zes non-reproductibilités dues à la mécanique de la cuve, le nettoyage ou l'altération de faces optiques de la cuve, et la présence d'artefacts (bulles, poussières) ne sont plus une contrainte.
L'invention permet, par analyse d'image, de les réduire voire de les supprimer. Un décalage de la position de la cuve devant le système de mesure de l'invention ou une translation de la lumière d'excitation du milieu peut être totalement corrigé après mesure de la position de la trace fluorescente dans l'image enregistrée. De même, des poussières présentes dans le volume excité, qui pourraient modifier de façon significative la mesure, sont de petite taille devant le volume excité, et peuvent ain si être repérées et retirées de la mesure sans perdre celle-ci, ce qui est impossible à réaliser avec un mono-détecteur. En cas d'altération des faces optiques de la cuve, qui peut entraîner une modification de la quantité de lumière qui excite effectivement l'échantillon, l'invention permet de connaître les variations de la puissance effective et de corriger la mesure.
- Les variations de lumière ambiante causées soit par l'échantillon soit par l'environnement sont compensées, par une mesure dans l'image, puis un retrait des « offsets » possibles, - L'analyse de l'information dans une image peut être conduite à partir d'éléments déterminés à.
l'avance (fonction d'éclairement, positions prédéterminées des différentes zones utiles), ou de B 14352.3 DB
façon dynamique pour faire face à des perturbations aléatoires et/ou imprévues par application de méthodes de traitement des images (maximisation de l'entropie, réseau de neurones).
5 - La dynamique de dosage de l'invention, qui, pour un certain type de mesures, permet d'atteindre expérimentalement une dynamique de dosage biologique de 2 200, est très supérieure à celle de l'art connu, qui, pour un même type de mesures, est
travailler avec tous les marqueurs du commerce, ce qui réduit les contraintes de marquage.
- Zes non-reproductibilités dues à la mécanique de la cuve, le nettoyage ou l'altération de faces optiques de la cuve, et la présence d'artefacts (bulles, poussières) ne sont plus une contrainte.
L'invention permet, par analyse d'image, de les réduire voire de les supprimer. Un décalage de la position de la cuve devant le système de mesure de l'invention ou une translation de la lumière d'excitation du milieu peut être totalement corrigé après mesure de la position de la trace fluorescente dans l'image enregistrée. De même, des poussières présentes dans le volume excité, qui pourraient modifier de façon significative la mesure, sont de petite taille devant le volume excité, et peuvent ain si être repérées et retirées de la mesure sans perdre celle-ci, ce qui est impossible à réaliser avec un mono-détecteur. En cas d'altération des faces optiques de la cuve, qui peut entraîner une modification de la quantité de lumière qui excite effectivement l'échantillon, l'invention permet de connaître les variations de la puissance effective et de corriger la mesure.
- Les variations de lumière ambiante causées soit par l'échantillon soit par l'environnement sont compensées, par une mesure dans l'image, puis un retrait des « offsets » possibles, - L'analyse de l'information dans une image peut être conduite à partir d'éléments déterminés à.
l'avance (fonction d'éclairement, positions prédéterminées des différentes zones utiles), ou de B 14352.3 DB
façon dynamique pour faire face à des perturbations aléatoires et/ou imprévues par application de méthodes de traitement des images (maximisation de l'entropie, réseau de neurones).
5 - La dynamique de dosage de l'invention, qui, pour un certain type de mesures, permet d'atteindre expérimentalement une dynamique de dosage biologique de 2 200, est très supérieure à celle de l'art connu, qui, pour un même type de mesures, est
10 comprise typiquement entre 5 et 10.
L'invention est applicable dans de nombreux domaines, et notamment .
- dans tous les domaines où il est utile de faire la mesure d'une solution fluorescente, l5 - en biologie, plus particulièrement pour le dosage de molécules biologiques ou d'intérêt biologique . antigènes, anticorps, peptides, ADN, cellules, bactéries..., pour le diagnostic clinique, - en chimie (dosage), - en pharmacie . dosage d'activité, contamination..., - en physique . recherche de traces de produits, fluidique, analyse de mélange....
BR~VE DESCRIPTION DES DESSINS
La figure 1 illustre une vue de dessus d'un premier mode de réalisation d'un dïspositif mettant en aeuvre le procédé de l'invention.
Les figures 2 et 3 illustrent une image de la cuve obtenue avec le dispositif d'enregistrement d'image représenté sur la figure 1.
B 143â2.3 DB
L'invention est applicable dans de nombreux domaines, et notamment .
- dans tous les domaines où il est utile de faire la mesure d'une solution fluorescente, l5 - en biologie, plus particulièrement pour le dosage de molécules biologiques ou d'intérêt biologique . antigènes, anticorps, peptides, ADN, cellules, bactéries..., pour le diagnostic clinique, - en chimie (dosage), - en pharmacie . dosage d'activité, contamination..., - en physique . recherche de traces de produits, fluidique, analyse de mélange....
BR~VE DESCRIPTION DES DESSINS
La figure 1 illustre une vue de dessus d'un premier mode de réalisation d'un dïspositif mettant en aeuvre le procédé de l'invention.
Les figures 2 et 3 illustrent une image de la cuve obtenue avec le dispositif d'enregistrement d'image représenté sur la figure 1.
B 143â2.3 DB
11 Les figures 4 à 6 illustrent un second mode de réalisation d'un dispositif mettant en oeuvre le procédé de l'invention.
La figure 7 illustre un troisième mode de réalisation d'un dispositif mettant en aeuvre le procédé
de l'invention.
Les figures 8 à 10 illustrent trois exemples de réalisation d'un dispositif mettant en ouvre le procédé de l'invention.
7.0 EXPOS~ DÉTAILL~ DE MODES DE RÉALISATION PARTICULIERS
Le procédé de l'invention est un procédé de dosage (mesure d'une concentration ou d'une quantité) d'un échantillon biologique ou d'intérêt biologique (antigènes, anticorps, peptides, ADN, cellules, bactéries, toxines) ou chimique (solvant, gaz dissous, formulation, activitë chimique), qui peut être un solide, un liquide; un gel...
Dans un premier mode de réalisation illustrë sur la figure 1, un échantillon 10 est éclairé
par un faisceau lumineux 17 .issu d'une source 11 accordée avec le fluorochrorne employé. On peut utiliser par exemple un laser Argon 488 nm pour de la fluorescéine ou un laser Hélium-Néon à 633 nm pour du Cy5. L'échantillon 10 est placé dans une cuve 12, par exemple de section rectangulaire dont toutes les faces sont transparentes. La section de cette cuve 12 peut, en effet, être rectangulaire, carrée, cylindrique ou elliptique. Un système d'objectif 13, équipé d'un fïltre d'arrét 14, est monté devant un dispositif d'enregistrement de la structure spatiale d' une image B 14352.3 DB
La figure 7 illustre un troisième mode de réalisation d'un dispositif mettant en aeuvre le procédé
de l'invention.
Les figures 8 à 10 illustrent trois exemples de réalisation d'un dispositif mettant en ouvre le procédé de l'invention.
7.0 EXPOS~ DÉTAILL~ DE MODES DE RÉALISATION PARTICULIERS
Le procédé de l'invention est un procédé de dosage (mesure d'une concentration ou d'une quantité) d'un échantillon biologique ou d'intérêt biologique (antigènes, anticorps, peptides, ADN, cellules, bactéries, toxines) ou chimique (solvant, gaz dissous, formulation, activitë chimique), qui peut être un solide, un liquide; un gel...
Dans un premier mode de réalisation illustrë sur la figure 1, un échantillon 10 est éclairé
par un faisceau lumineux 17 .issu d'une source 11 accordée avec le fluorochrorne employé. On peut utiliser par exemple un laser Argon 488 nm pour de la fluorescéine ou un laser Hélium-Néon à 633 nm pour du Cy5. L'échantillon 10 est placé dans une cuve 12, par exemple de section rectangulaire dont toutes les faces sont transparentes. La section de cette cuve 12 peut, en effet, être rectangulaire, carrée, cylindrique ou elliptique. Un système d'objectif 13, équipé d'un fïltre d'arrét 14, est monté devant un dispositif d'enregistrement de la structure spatiale d' une image B 14352.3 DB
12 15, par exemple une camêra CCD ou un système à
balayage, relié à un organe de traitement 16. Le dispositif 15 qui reçoit le faisceau 18 diffusé par l'échantillon 10, permet l'enregistrement d'une image de laquelle peut être extraite un signal spécifique de mesure.
Ze procëdë de l'invention comprend les étapes suivantes .
- éclairement de l'échantillon 10 au moyen du faisceau lumineux 17 issu de la source 11, qui peut être un laser à gaz, un laser solide, une diode laser, une diode électroluminescente, une diode organique, une lampe spectrale comme une lampe halogène, à mercure, à
xénon, à deutérium, - réalisation d'une image du faisceau lumineux 18 diffusë par l'échantillon 10, l'origine de la diffusion pouvant être une diffusion Raman, une diffusion par fluorescence, une diffusion moléculaire (diffusion Rayleight) ou particulaire (utïlïsation de nano-particules), - analyse de l'image par rapport à des références, cette analyse consistant alors en l'étude de la structure spatiale de l'image et de la distribution de l'énergie lumineuse dans cette image, ces réfêrences étant constituées, par exemple, par l'expérience d'un utilisateur ou par des critères morphologiques (forme et position d'une trace lumineuse), photométrique (fréquences des variations spatiales de la lumière dans l'image), statistiques (variation d'estimateurs de mesures, d'entropie dans l'image), s 1435a.3 ns
balayage, relié à un organe de traitement 16. Le dispositif 15 qui reçoit le faisceau 18 diffusé par l'échantillon 10, permet l'enregistrement d'une image de laquelle peut être extraite un signal spécifique de mesure.
Ze procëdë de l'invention comprend les étapes suivantes .
- éclairement de l'échantillon 10 au moyen du faisceau lumineux 17 issu de la source 11, qui peut être un laser à gaz, un laser solide, une diode laser, une diode électroluminescente, une diode organique, une lampe spectrale comme une lampe halogène, à mercure, à
xénon, à deutérium, - réalisation d'une image du faisceau lumineux 18 diffusë par l'échantillon 10, l'origine de la diffusion pouvant être une diffusion Raman, une diffusion par fluorescence, une diffusion moléculaire (diffusion Rayleight) ou particulaire (utïlïsation de nano-particules), - analyse de l'image par rapport à des références, cette analyse consistant alors en l'étude de la structure spatiale de l'image et de la distribution de l'énergie lumineuse dans cette image, ces réfêrences étant constituées, par exemple, par l'expérience d'un utilisateur ou par des critères morphologiques (forme et position d'une trace lumineuse), photométrique (fréquences des variations spatiales de la lumière dans l'image), statistiques (variation d'estimateurs de mesures, d'entropie dans l'image), s 1435a.3 ns
13 - extraction de l'information spécifique à
l'interaction entre le faisceau 17 et l'échantillon 10, cette extraction consistant, par exemple, en des opérations arithmétiques entre l'image et d'autres images ou des constantes (par exemple, des soustractions, additions, divisions, multiplications), morphologiques (érosion, dilatation, binarisation, détourage, segmentations, correction de décalage) ou photométriques (corrections polynomiales, convolutions, filtres, seuillages), - calcul du dosage, ce calcul se faisant par rapport à un étalonnage entre la mesure d'énergie lumineuse et la concentration ou la quantité de l'échantillon biologique ou chimique. Ce calcul peut aussi être effectué en enregistrant la cinétique de la réaction biologique ou chimique et en analysant cette cinétique par des méthodes connues de l'homme de l'art.
Dans le procédé de l'invention la mesure est faite dans une image obtenue par le dispositif d'enregistrement de la structure spatiale d'une image 15. L'invention ne rëside pas dans l'emploi d'un tel dispositif 15 mais principalement dans .
- le fait d'enregistrer le faisceau 18 diffusé par l'échantillon 10 sous la forme d'une image, - le fait d'extraire l'information de cette image, - le côté adaptatif obtenu par l'application d'une analyse de l'image.
La figure 2 illustre l' image de la cuve 12 obtenue avec le dispositif d'enregistrement de la structure spatiale d'une image 15. La cuve peut avoir B 14352.3 DB
l'interaction entre le faisceau 17 et l'échantillon 10, cette extraction consistant, par exemple, en des opérations arithmétiques entre l'image et d'autres images ou des constantes (par exemple, des soustractions, additions, divisions, multiplications), morphologiques (érosion, dilatation, binarisation, détourage, segmentations, correction de décalage) ou photométriques (corrections polynomiales, convolutions, filtres, seuillages), - calcul du dosage, ce calcul se faisant par rapport à un étalonnage entre la mesure d'énergie lumineuse et la concentration ou la quantité de l'échantillon biologique ou chimique. Ce calcul peut aussi être effectué en enregistrant la cinétique de la réaction biologique ou chimique et en analysant cette cinétique par des méthodes connues de l'homme de l'art.
Dans le procédé de l'invention la mesure est faite dans une image obtenue par le dispositif d'enregistrement de la structure spatiale d'une image 15. L'invention ne rëside pas dans l'emploi d'un tel dispositif 15 mais principalement dans .
- le fait d'enregistrer le faisceau 18 diffusé par l'échantillon 10 sous la forme d'une image, - le fait d'extraire l'information de cette image, - le côté adaptatif obtenu par l'application d'une analyse de l'image.
La figure 2 illustre l' image de la cuve 12 obtenue avec le dispositif d'enregistrement de la structure spatiale d'une image 15. La cuve peut avoir B 14352.3 DB
14 des dimensions plus petites que celles de l'image. Elle peut par exemple être remplacée par un ou plusieurs capillaires.
De plus, le faisceau lumineux peut être indifféremment plus petit ou plus grand que la cuve.
Dans cette image on peut distinguer plusieurs zones .
- une zone 20 de volume éclairé, qui correspond au volume de la cuve 12 excité par le faisceau 17, - la zone 21 d'entrée de ce faisceau 17 dans la cuve 12, - la zone 22 de sortie de ce faisceau 17 de la cuve 12, - une zone 23 de ménisque, - une zone 24 d'artefact.
On peut ainsi, comme illustré sur la figure 3, définir une première région d°intérêt 25 autour de la zone 20 de volume éclairé et une deuxième région d'intérét 26 disposée à côté de cette zone 25. La mesure du signal spêcifique est alors donné par le calcul , ERIi-ERI2 ; c'est-à-dire la soustraction entre la somme de tous les pixels de la première région d'intérêt 25 et la somme de tous les pixels de la seconde région d' ixltérêt 2 6 , Sur la figure 3 les deux régions d'intérêt 25 et 26 ont la même taille, ce qui n'est pas indispensable, Lorsque ces régions n'ont pas la même taille, il suffit soit de réaliser un moyennage des niveaux de gris de chaque région, soit une pondération des valeurs par le nombre de pixels.
B 14352.3 DB
L'analyse de l'image ainsi représentée conduit à certaines observations .
- La trace fluorescente du faisceau lumineux (zone 20) donne le signal spécifique.
5 - Le ménisque (zone 23), délimitant le liquide de l'air, est fortement lumineux. Son origine provient de ladite trace. La forme de ce ménisque est fortement aléatoire. L'amplitude du signal provenant de ce ménisque est donc très variable.
10 - Un artefact (zone 24) peut être, pour un montage donné, une rondelle ressort destinée à assurer un bon positionnement mécanique de la cuve 12.
- Les zones 21 et 22 correspondent respectivement aux points d'entrée et de sortie du
De plus, le faisceau lumineux peut être indifféremment plus petit ou plus grand que la cuve.
Dans cette image on peut distinguer plusieurs zones .
- une zone 20 de volume éclairé, qui correspond au volume de la cuve 12 excité par le faisceau 17, - la zone 21 d'entrée de ce faisceau 17 dans la cuve 12, - la zone 22 de sortie de ce faisceau 17 de la cuve 12, - une zone 23 de ménisque, - une zone 24 d'artefact.
On peut ainsi, comme illustré sur la figure 3, définir une première région d°intérêt 25 autour de la zone 20 de volume éclairé et une deuxième région d'intérét 26 disposée à côté de cette zone 25. La mesure du signal spêcifique est alors donné par le calcul , ERIi-ERI2 ; c'est-à-dire la soustraction entre la somme de tous les pixels de la première région d'intérêt 25 et la somme de tous les pixels de la seconde région d' ixltérêt 2 6 , Sur la figure 3 les deux régions d'intérêt 25 et 26 ont la même taille, ce qui n'est pas indispensable, Lorsque ces régions n'ont pas la même taille, il suffit soit de réaliser un moyennage des niveaux de gris de chaque région, soit une pondération des valeurs par le nombre de pixels.
B 14352.3 DB
L'analyse de l'image ainsi représentée conduit à certaines observations .
- La trace fluorescente du faisceau lumineux (zone 20) donne le signal spécifique.
5 - Le ménisque (zone 23), délimitant le liquide de l'air, est fortement lumineux. Son origine provient de ladite trace. La forme de ce ménisque est fortement aléatoire. L'amplitude du signal provenant de ce ménisque est donc très variable.
10 - Un artefact (zone 24) peut être, pour un montage donné, une rondelle ressort destinée à assurer un bon positionnement mécanique de la cuve 12.
- Les zones 21 et 22 correspondent respectivement aux points d'entrée et de sortie du
15 faisceau lumineux dans la cuve 12.
Avec un autre réglage des seuils d'affichage, on peut mieux mettre en évidence les niveaux de lumière les plus faibles.
Le procédé de l'invention permet d'améliorer le coefficient de variation CV (écart type/moyenne). En effet le coefficient CV obtenu avec le procédé de l'invention est bien inférieur au coefficient CV calculé en faisant la somme de tous les pixels d'une caméra CCD, qui correspond à une mesure faite avec un mono-détecteur. Le coefficient CV obtenu avec le procédé de l'invention est d'ailleurs du même ordre de grandeur que celui obtenu avec un grand volume de solution, comme envisagé précédemment dans l'introduction de ladite demande. Ce coefficient CV
obtenu avec le procédé de l'invention est plus faible que celui obtenu par la mesure dans chacune des zones B 14352.3 DB
Avec un autre réglage des seuils d'affichage, on peut mieux mettre en évidence les niveaux de lumière les plus faibles.
Le procédé de l'invention permet d'améliorer le coefficient de variation CV (écart type/moyenne). En effet le coefficient CV obtenu avec le procédé de l'invention est bien inférieur au coefficient CV calculé en faisant la somme de tous les pixels d'une caméra CCD, qui correspond à une mesure faite avec un mono-détecteur. Le coefficient CV obtenu avec le procédé de l'invention est d'ailleurs du même ordre de grandeur que celui obtenu avec un grand volume de solution, comme envisagé précédemment dans l'introduction de ladite demande. Ce coefficient CV
obtenu avec le procédé de l'invention est plus faible que celui obtenu par la mesure dans chacune des zones B 14352.3 DB
16 d'intérêt 25 et 26. La soustraction des mesures effectuées dans ces deux zones d'intérêt permet de corriger des variations d'éclairage qui affectent toutes les régions. L'invention permet d'effectuer ainsi un filtrage spatial dans le plan qui permet d'extraire le signal contenant l'information spécifique du phénomène de fluorescence. De plus l'invention permet d'extraire les régions d'intérêt qui sont vraiment pertinentes dans une image ou une pseudo-1.0 image, alors qu' un système de mesure utilisant un seul détecteur mono-pixel ne peut pas réaliser une telle fonction.
Dans un second mode de réalisation, un mono-détecteur associé à une matrice de pixels à
transparence programmable 30 telle qu"une matrice de cristaux liquides ou de micro-miroirs ou tout autre système êquivalent est disposé devant la cuve, 12 illustrée sur la figure 4. Cette matrice 30 est intercalée entre la cuve 12 et le détecteur via un système de formation des images ou non. On réalise alors une première mesure en « ouvrant » les pixels correspondant à la première zone d'intërêt 25, comme illustré sur la figure 5, puis une deuxième mesure en ouvrant les pixels correspondant à la seconde zone d'intérêt 26, comme illustré sur la figure 6.
L'emploi d'une telle matrice 30 à
transparence variable permet d'éviter l'enregistrement systématique d' une image, en réalisant par exemple les étapes suivantes .
- enregistrement de l'image du faisceau diffusé par l'ouverture/fermeture successives de tous B 14352.3 DB
les pixels de la matrice 30 en synchronisation avec la mesure effectuée par le mono-détecteur, - analyse de l'image et définition de la ou des zones d'intérêt permettant d'extraire l'information spécifique, - enregistrement de tels paramètres pour une utilisation ultérieure, - lors de l'analyse d'un échantillon donné, ouvertures successives des régions définies lors de l0 l'étape d'analyse et enregistrement des résultats de mesures pour chacune de ces zones, - extraction de l'information utile, - calcul du dosage.
Dans un troisième mode der réalisation illustré sur la figure 7, deux détecteurs mono-pixel 35 et 36 observent chacun une région d'intérêt 25 ou 26.
Deux moyens de formation d'image 37 et 38 sont placés respectivement devant chacun de ces deux détecteurs 35 et 36. La mesure du signal provenant de la première rêgion d'intérêt 25 est faite avec le détecteur 35, celle pour la seconde région d'intérêt 26 est faite avec le détecteur 36. La zone 39 représente la trace fluorescente en vue de face, L'invention permet d'adapter l'extraction du signal spécifique aux conditions d'expériences. Par exemple, si la cuve a bougé entre deux séries de mesures, il est possible, par analyse automatique de l'image, de repositionner les régions d'intérêt de manière automatique, opération impossible à effectuer avec un système statique.
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Exemples de réalisation de 1°invention Les trois exemples de réalisation décrits ci-dessous correspondent respectivement aux trois modes de réalisation définis précédemment.
Dans un premier exemple de rëalisation illustré sur la figure 8, une source lumineuse 40, par exemple un laser ou une diode électroluminescente, excite, dans une cuve 41, le liquide contenant des molécules fluorescentes au travers d'optiques de mise en forme non représentées, et de divers accessoires tels qu'un obturateur 42, et un diaphragme 43. Un premier objectif 44, disposé par exemple perpendiculairement à la direction principale du faisceau lumineux, collecte une partie de ce faisceau lumineux, émis par les molécules fluorescentes dans la cuve 41. Un filtre d'arrêt 45 est disposé derrière le premier objectif 44, juste devant un second objectif 46. L'association des objectifs 44 et 46 permet de former une image de la cuve 41 sur le détecteur d'image 47 qui est relié à un système de commande et de contrôle 49. Pour une cuve 41 d' une largeur intérieure de 1 cm, ce détecteur 47 peut être un détecteur de 512 x 512 pixels de 10 um de côté. Le premier objectif 44 peut avoir une focale 50 mm et le second objectif 46 une focale 25 mm.
Dans un second exemple de réalisation, illustré sur la figure 9, dont la configuration est la même que celle de la figure 8 pour l'excitation, on n'utilise qu'un seul détecteur. Une matrice à
transparence variable 56, qui peut être une matrice à
cristaux liquide ou une matrice de micro-miroirs, joue B 14352.3 DB
le rôle d'un diaphragme de champ. Za matrice 56 peut être remplacée par une fente mobile actionnée par un actuateur mécanique ou électro-mécanique, par exemple, un électro-aimant ou un moteur électrique.
Dans un troisième exemple de réalisation illustré sur la figure 10, la configuration pour exciter l'intérieur de la cuve 41 est la même que pour la figure 8 et la configuration pour la collection de lumière est la même que pour celle de la figure 9. Deux l0 mono-détecteurs 50 et 51, par exemple des photo-multiplicateurs décalés, permettent d'observer deux régions différents de la cuve 41. Devant chaque détecteur 50 et 51, une optique de reprise 52 et 53 permet de former l'image de la rêgion d°intérêt sur un diaphragme de champ 54 et 55 qui limite la région observée. Un filtre d'arrêt peut être disposé avant, dans ou derrière le diaphragme. La zone 56 représente la trace fluorescente.
B 14352.3 DB
REFERENCES
[1] "Some applications of near-ultraviolet laser-induced fluorescence detection in nanomolar- and 5 subnanomolar-range high-performance liquid chromatography or micro-high performance liquid chromatography" de N. Siméon, R. Myers, C. Bayle, M.
Hertz, J.K. Stewart, F. Couderc (2001, Journal of Chromatography A, Vol 913, I 1-2, pages 253-259).
[2] "Performance of an integrated microoptical system for fluorescence detection in microfluidic systems" de J,C. Roulet, R. Volkel, H.P. Herzig, E. Verpoorte, N.F.
Rooij, R. Dandliker (2002 , Anal ytical Chem istry, Vol.
74 (14), pages 3400-3407).
[3] "Single molecule detection of specific nucleic acid sequences in unamplified genomic DNA" de A. Castro, et J.G. Wîlliams (1997, Analytical chemistry, Vol. 69 (19) , pages 3915-3920) .
Dans un second mode de réalisation, un mono-détecteur associé à une matrice de pixels à
transparence programmable 30 telle qu"une matrice de cristaux liquides ou de micro-miroirs ou tout autre système êquivalent est disposé devant la cuve, 12 illustrée sur la figure 4. Cette matrice 30 est intercalée entre la cuve 12 et le détecteur via un système de formation des images ou non. On réalise alors une première mesure en « ouvrant » les pixels correspondant à la première zone d'intërêt 25, comme illustré sur la figure 5, puis une deuxième mesure en ouvrant les pixels correspondant à la seconde zone d'intérêt 26, comme illustré sur la figure 6.
L'emploi d'une telle matrice 30 à
transparence variable permet d'éviter l'enregistrement systématique d' une image, en réalisant par exemple les étapes suivantes .
- enregistrement de l'image du faisceau diffusé par l'ouverture/fermeture successives de tous B 14352.3 DB
les pixels de la matrice 30 en synchronisation avec la mesure effectuée par le mono-détecteur, - analyse de l'image et définition de la ou des zones d'intérêt permettant d'extraire l'information spécifique, - enregistrement de tels paramètres pour une utilisation ultérieure, - lors de l'analyse d'un échantillon donné, ouvertures successives des régions définies lors de l0 l'étape d'analyse et enregistrement des résultats de mesures pour chacune de ces zones, - extraction de l'information utile, - calcul du dosage.
Dans un troisième mode der réalisation illustré sur la figure 7, deux détecteurs mono-pixel 35 et 36 observent chacun une région d'intérêt 25 ou 26.
Deux moyens de formation d'image 37 et 38 sont placés respectivement devant chacun de ces deux détecteurs 35 et 36. La mesure du signal provenant de la première rêgion d'intérêt 25 est faite avec le détecteur 35, celle pour la seconde région d'intérêt 26 est faite avec le détecteur 36. La zone 39 représente la trace fluorescente en vue de face, L'invention permet d'adapter l'extraction du signal spécifique aux conditions d'expériences. Par exemple, si la cuve a bougé entre deux séries de mesures, il est possible, par analyse automatique de l'image, de repositionner les régions d'intérêt de manière automatique, opération impossible à effectuer avec un système statique.
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Exemples de réalisation de 1°invention Les trois exemples de réalisation décrits ci-dessous correspondent respectivement aux trois modes de réalisation définis précédemment.
Dans un premier exemple de rëalisation illustré sur la figure 8, une source lumineuse 40, par exemple un laser ou une diode électroluminescente, excite, dans une cuve 41, le liquide contenant des molécules fluorescentes au travers d'optiques de mise en forme non représentées, et de divers accessoires tels qu'un obturateur 42, et un diaphragme 43. Un premier objectif 44, disposé par exemple perpendiculairement à la direction principale du faisceau lumineux, collecte une partie de ce faisceau lumineux, émis par les molécules fluorescentes dans la cuve 41. Un filtre d'arrêt 45 est disposé derrière le premier objectif 44, juste devant un second objectif 46. L'association des objectifs 44 et 46 permet de former une image de la cuve 41 sur le détecteur d'image 47 qui est relié à un système de commande et de contrôle 49. Pour une cuve 41 d' une largeur intérieure de 1 cm, ce détecteur 47 peut être un détecteur de 512 x 512 pixels de 10 um de côté. Le premier objectif 44 peut avoir une focale 50 mm et le second objectif 46 une focale 25 mm.
Dans un second exemple de réalisation, illustré sur la figure 9, dont la configuration est la même que celle de la figure 8 pour l'excitation, on n'utilise qu'un seul détecteur. Une matrice à
transparence variable 56, qui peut être une matrice à
cristaux liquide ou une matrice de micro-miroirs, joue B 14352.3 DB
le rôle d'un diaphragme de champ. Za matrice 56 peut être remplacée par une fente mobile actionnée par un actuateur mécanique ou électro-mécanique, par exemple, un électro-aimant ou un moteur électrique.
Dans un troisième exemple de réalisation illustré sur la figure 10, la configuration pour exciter l'intérieur de la cuve 41 est la même que pour la figure 8 et la configuration pour la collection de lumière est la même que pour celle de la figure 9. Deux l0 mono-détecteurs 50 et 51, par exemple des photo-multiplicateurs décalés, permettent d'observer deux régions différents de la cuve 41. Devant chaque détecteur 50 et 51, une optique de reprise 52 et 53 permet de former l'image de la rêgion d°intérêt sur un diaphragme de champ 54 et 55 qui limite la région observée. Un filtre d'arrêt peut être disposé avant, dans ou derrière le diaphragme. La zone 56 représente la trace fluorescente.
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REFERENCES
[1] "Some applications of near-ultraviolet laser-induced fluorescence detection in nanomolar- and 5 subnanomolar-range high-performance liquid chromatography or micro-high performance liquid chromatography" de N. Siméon, R. Myers, C. Bayle, M.
Hertz, J.K. Stewart, F. Couderc (2001, Journal of Chromatography A, Vol 913, I 1-2, pages 253-259).
[2] "Performance of an integrated microoptical system for fluorescence detection in microfluidic systems" de J,C. Roulet, R. Volkel, H.P. Herzig, E. Verpoorte, N.F.
Rooij, R. Dandliker (2002 , Anal ytical Chem istry, Vol.
74 (14), pages 3400-3407).
[3] "Single molecule detection of specific nucleic acid sequences in unamplified genomic DNA" de A. Castro, et J.G. Wîlliams (1997, Analytical chemistry, Vol. 69 (19) , pages 3915-3920) .
Claims (7)
1. Procédé de dosage d'un échantillon biologique ou chimique, comportant une étape d'éclairement de l'échantillon (10) au moyen d'un faisceau lumineux (17) issu d'une source (11), caractérisé en ce qu'il comporte, en outre, les étapes suivantes :
- réalisation d'une image comprenant l'image du faisceau (18) diffusé par l'échantillon (10), - analyse de l'image selon des critères de référence, - extraction d'une information spécifique à
l'interaction faisceau lumineux/échantillon, - calcul du dosage, et en ce que l'analyse consiste en l'étude de la structure spatiale de l'image et de la distribution de l'énergie lumineuse dans cette image.
- réalisation d'une image comprenant l'image du faisceau (18) diffusé par l'échantillon (10), - analyse de l'image selon des critères de référence, - extraction d'une information spécifique à
l'interaction faisceau lumineux/échantillon, - calcul du dosage, et en ce que l'analyse consiste en l'étude de la structure spatiale de l'image et de la distribution de l'énergie lumineuse dans cette image.
2. Procédé selon la revendication 1, qui comporte une étape préalable d'introduction de l'échantillon (10) dans une cuve (12) dont toutes les faces sont transparentes.
3. Procédé selon la revendication 1, dans lequel la diffusion est une diffusion Raman, une diffusion par fluorescence, une diffusion moléculaire ou particulaire.
4. Procédé selon la revendication 1, dans lequel le calcul du dosage se fait par rapport à un étalonnage entre la mesure d'énergie lumineuse et la concentration ou la quantité d'échantillon.
5. Procédé selon la revendication 1, dans lequel le calcul du dosage se fait par rapport à
l'analyse de la cinétique de la réaction biologique ou chimique.
l'analyse de la cinétique de la réaction biologique ou chimique.
6. Procédé selon la revendication 1, dans lequel on définit une première zone d'intérêt (25) autour de la zone de volume excité, et une seconde zone d'intérêt (26) disposée à côté de cette première zone, et on mesure le signal spécifique en réalisant la soustraction entre la somme de tous les pixels de la première zone (25) et la somme de tous les pixels de la seconde zone (26).
7. Application du procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes à la fluorescence.
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JP2799191B2 (ja) * | 1989-08-24 | 1998-09-17 | オリンパス光学工業株式会社 | 細胞内イオンの2次元濃度分布像を形成する方法 |
US5323010A (en) * | 1992-12-01 | 1994-06-21 | I.S.S. (Usa) Inc. | Time resolved optical array detectors and CCD cameras for frequency domain fluorometry and/or phosphorimetry |
JP3224640B2 (ja) * | 1993-07-30 | 2001-11-05 | 三菱重工業株式会社 | Lifによる濃度計測装置及び方法 |
JP3290786B2 (ja) * | 1993-11-26 | 2002-06-10 | シスメックス株式会社 | 粒子分析装置 |
JPH0933441A (ja) * | 1995-07-19 | 1997-02-07 | Toray Ind Inc | 反応パターンの判定方法及び反応パターン判定装置 |
US5827660A (en) * | 1996-08-09 | 1998-10-27 | University Of Massachusetts | Caged fluorochrome-labeled probes and subtraction of autoflourescence background |
JPH1078398A (ja) * | 1996-09-02 | 1998-03-24 | Bunshi Bio Photonics Kenkyusho:Kk | 蛍光寿命測定装置および方法 |
DE19915310A1 (de) * | 1999-04-03 | 2000-10-05 | Bayer Ag | Diffusionskontrollierende Sensorschicht |
JP2001083092A (ja) * | 1999-09-17 | 2001-03-30 | Kowa Co | 蛍光粒子撮像装置 |
JP3576523B2 (ja) * | 2000-12-26 | 2004-10-13 | オリンパス株式会社 | 蛍光輝度測定方法及び装置 |
JP3715248B2 (ja) * | 2001-03-21 | 2005-11-09 | オリンパス株式会社 | 生化学的検査方法 |
-
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