JP7359390B2 - チクングニアウイルスに対する抗体またはその抗原結合断片、およびその用途 - Google Patents
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Description
CDRH1が、下記(H1-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRH2が、下記(H2-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRH3が、下記(H3-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドである重鎖可変領域
(H1-A)下記(H1-A1)、(H1-A2)または(H1-A3)のアミノ酸配列
(H1-A1)配列番号1(GYTFTSYW)のアミノ酸配列
(H1-A2)配列番号1のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H1-A3)配列番号1のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H2-A)下記(H2-A1)、(H2-A2)または(H2-A3)のアミノ酸配列
(H2-A1)配列番号2(IYPGDGDTRYT)のアミノ酸配列
(H2-A2)配列番号2のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H2-A3)配列番号2のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H3-A)下記(H3-A1)、(H3-A2)または(H3-A3)のアミノ酸配列
(H3-A1)配列番号3(SYDPFDY)のアミノ酸配列
(H3-A2)配列番号3のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H3-A3)配列番号3のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
CDRH1が、下記(H1-B)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRH2が、下記(H2-B)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRH3が、下記(H3-B)のアミノ酸配列を含むポリペプチドである重鎖可変領域
(H1-B)下記(H1-B1)、(H1-B2)または(H1-B3)のアミノ酸配列
(H1-B1)配列番号4(GYAFSTSW)のアミノ酸配列
(H1-B2)配列番号4のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H1-B3)配列番号4のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H2-B)下記(H2-B1)、(H2-B2)または(H2-B3)のアミノ酸配列
(H2-B1)配列番号5(IYPGDGDT)のアミノ酸配列
(H2-B2)配列番号5のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H2-B3)配列番号5のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H3-B)下記(H3-B1)、(H3-B2)または(H3-B3)のアミノ酸配列
(H3-B1)配列番号6(SNDGYYVGY)のアミノ酸配列
(H3-B2)配列番号6のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H3-B3)配列番号6のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
CDRH1が、下記(H1-C)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRH2が、下記(H2-C)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRH3が、下記(H3-C)のアミノ酸配列を含むポリペプチドである重鎖可変領域
(H1-C)下記(H1-C1)、(H1-C2)または(H1-C3)のアミノ酸配列
(H1-C1)配列番号7(GYTFTSYY)のアミノ酸配列
(H1-C2)配列番号7のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H1-C3)配列番号7のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H2-C)下記(H2-C1)、(H2-C2)または(H2-C3)のアミノ酸配列
(H2-C1)配列番号8(INPSNGGT)のアミノ酸配列
(H2-C2)配列番号8のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H2-C3)配列番号8のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H3-C)下記(H3-C1)、(H3-C2)または(H3-C3)のアミノ酸配列
(H3-C1)配列番号9(GYYGNPFFAY)のアミノ酸配列
(H3-C2)配列番号9のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H3-C3)配列番号9のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
CDRL1が、下記(L1-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRL2が、下記(L2-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRL3が、下記(L3-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドである軽鎖可変領域
(L1-A)下記(L1-A1)、(L1-A2)または(L1-A3)のアミノ酸配列
(L1-A1)配列番号10(ENVVTY)のアミノ酸配列
(L1-A2)配列番号10のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(L1-A3)配列番号10のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(L2-A)下記(L2-A1)、(L2-A2)または(L2-A3)のアミノ酸配列
(L2-A1)配列番号11(GAS)のアミノ酸配列
(L2-A2)配列番号11のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(L2-A3)配列番号11のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(L3-A)下記(L3-A1)、(L3-A2)または(L3-A3)のアミノ酸配列
(L3-A1)配列番号12(GQGYSYPYT)のアミノ酸配列
(L3-A2)配列番号12のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(L3-A3)配列番号12のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H-A)下記(H-A1)、(H-A2)または(H-A3)のアミノ酸配列
(H-A1)配列番号13のアミノ酸配列
(H-A2)配列番号13のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H-A3)配列番号13のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H-B)下記(H-B1)、(H-B2)または(H-B3)のアミノ酸配列
(H-B1)配列番号14のアミノ酸配列
(H-B2)配列番号14のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H-B3)配列番号14のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H-C)下記(H-C1)、(H-C2)または(H-C3)のアミノ酸配列
(H-C1)配列番号15のアミノ酸配列
(H-C2)配列番号15のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H-C3)配列番号15のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(L-A)下記(L-A1)、(L-A2)または(L-A3)のアミノ酸配列
(L-A1)配列番号16のアミノ酸配列
(L-A2)配列番号16のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(L-A3)配列番号16のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(HA)下記(HA1)、(HA2)または(HA3)のアミノ酸配列
(HA1)配列番号17のアミノ酸配列
(HA2)配列番号17のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(HA3)配列番号17のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(HB)下記(HB1)、(HB2)または(HB3)のアミノ酸配列
(HB1)配列番号18のアミノ酸配列
(HB2)配列番号18のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(HB3)配列番号18のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(HC)下記(HC1)、(HC2)または(HC3)のアミノ酸配列
(HC1)配列番号19のアミノ酸配列
(HC2)配列番号19のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(HC3)配列番号19のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(LA)下記(LA1)、(LA2)または(LA3)のアミノ酸配列
(LA1)配列番号20のアミノ酸配列
(LA2)配列番号20のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(LA3)配列番号20のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
本発明のチクングニアウイルスに対する抗体またはその抗原結合断片は、前述のように、前記(1)、(2)、または(3)の重鎖可変領域または重鎖と、前記(4)の軽鎖可変領域または軽鎖とを含むことを特徴とする。本発明の抗体等は、前記(1)、(2)、または(3)の重鎖可変領域または重鎖と、前記(4)の軽鎖可変領域または軽鎖とを含むことが特徴であり、その他の構成および条件は、特に制限されない。本発明の抗体等は、ECSA型CHIKV、WA型CHIKV、およびAsian型CHIKVに結合する。また、本発明の抗体等は、例えば、シンドビスウイルスに結合しない。このため、本発明の抗体等は、例えば、後述のCHIKVの検出キット等に好適に使用できる。
参考文献1:Aekkachai Tuekprakhon et.al., “Variation at position 350 in the Chikungunya virus 6K-E1 protein determines the sensitivity of detection in a rapid E1-antigen test”, Scientific Report, vol.8, Article Number:1094, 2018
MCLLANTTFPCSQPPCTPCCYEKEPEETLRMLEDNVMRPGYYQLLQASLTCSPHRQRRSTKDNFNVYKATRPYLAHCPDCGEGHSCHSPVALERIRNEATDGTLKIQVSLQIGIKTDDSHDWTKLRYMDNHMPADAERAGLFVRTSAPCTITGTMGHFILARCPKGETLTVGFTDSRKISHSCTHPFHHDPPVIGREKFHSRPQHGKELPCSTYVQSTAATTEEIEVHMPPDTPDRTLMSQQSGNVKITVNGQTVRYKCNCGGSNEGLTTTDKVINNCKVDQCHAAVTNHKKWQYNSPLVPRNAELGDRQGKIHIPFPLANVTCRVPKARNPTVTYGKNQVIMLLYPDHPTLLSYRNMGEEPNYQEEWVMHKKEVVLTVPTEGLEVTWGNNEPYKYWPQLSTNGTAHGHPHEIILYYYELYPTMTVVVVSVATFILLSMVGMAAGMCMCARRRCITPYELTPGATVPFLLSLICCIRTAKAATYQEAAIYLWNEQQPLFWLQALIPLAALIVLCNCLRLLPCCCKTLAFLAVMSVGAHTVSAYEHVTVIPNTVGVPYKTLVNRPGYSPMVLEMELLSVTLEPTLSLDYITCEYKTVIPSPYVKCCGTAECKDKNLPDYSCKVFTGVYPFMWGGAYCFCDAENTQLSEAHVEKSESCKTEFASAYRAHTASASAKLRVLYQGNNITVTAYANGDHAVTVKDAKFIVGPMSSAWTPFDNKIVVYKGDVYNMDYPPFGAGRPGQFGDIQSRTPESKDVYANTQLVLQRPAVGTVHVPYSQAPSGFKYWLKERGASLQHTAPFGCQIATNPVRAVNCAVGNMPISIDIPEAAFTRVVDAPSLTDMSCEVPACTHSSDFGGVAIIKYAASKKGKCAVHSMTNAVTIREAEIEVEGNSQLQISFSTALASAEFRVQVCSTQVHCAAECHPPKDHIVNYPASHTTLGVQDISATAMSWVQKITGGVGLVVAVAALILIVVLCVSFSRH
LCLLANTTFPCSQPPCTPCCYEKEPESTLRMLEDNVMRPGYYQLLKASLTCSPHRQRRSTKDNFNVYKATRPYLAHCPDCGEGHSCHSPIALERIRNEATDGTLKIQVSLQIGIKTDDSHDWTKLRYMDSHTPADAERAGLLVRTSAPCTITGTMGHFILARCPKGETLTVGFTDSRKISHTCTHPFHHEPPVIGRERFHSRPQHGKELPCSTYVQSTAATAEEIEVHMPPDTPDRTLMTQQSGNVKITVNGQTVRYKCNCGGSNEGLTTTDKVINNCKIDQCHAAVTNHKNWQYNSPLVPRNAELGDRKGKIHIPFPLANVTCRVPKARNPTVTYGKNQVTMLLYPDHPTLLSYRNMGQEPNYHEEWVTHKKEVTLTVPTEGLEVTWGNNEPYKYWPQMSTNGTAHGHPHEIILYYYELYPTMTVVIVSVASFVLLSMVGTAVGMCVCARRRCITPYELTPGATVPFLLSLLCCVRTTKAATYYEAAAYLWNEQQPLFWLQALIPLAALIVLCNCLKLLPCCCKTLAFLAVMSIGAHTVSAYEHVTVIPNTVGVPYKTLVNRPGYSPMVLEMELQSVTLEPTLSLDYITCEYKTVIPSPYVKCCGTAECKDKSLPDYSCKVFTGVYPFMWGGAYCFCDAENTQLSEAHVEKSESCKTEFASAYRAHTASASAKLRVLYQGNNITVAAYANGDHAVTVKDAKFVVGPMSSAWTPFDNKIVVYKGDVYNMDYPPFGAGRPGQFGDIQSRTPESKDVYANTQLVLQRPAAGTVHVPYSQAPSGFKYWLKERGASLQHTAPFGCQIATNPVRAVNCAVGNIPISIDIPDAAFTRVVDAPSVTDMSCEVPACTHSSDFGGVAIIKYTASKKGKCAVHSMTNAVTIREADVEVEGNSQLQISFSTALASAEFRVQVCSTQVHCAAACHPPKDHIVNYPASHTTLGVQDISTTAMSWVQKITGGVGLIVAVAALILIVVLCVSFSRH
MCLLANTTFPCSQPPCTPCCYEKEPEKTLRMLEDNVMSPGYYQLLQASLTCSPRRQRRSIKDNFNVYKATRPYLAHCPDCGEGHSCHSPVALERIRNEATDGTLKIQVSLQIGIKTDDSHDWTKLRYMDNHMPADAERAGLFVRTSAPCTITGTMGHFILARCPKGETLTVGFTDGRKISHSCTHPFHHDPPVIGREKFHSRPQHGRELPCSTYAQSTAATAEEIEVHMPPDTPDRTLMSQQSGNVKITVNSQTVRYKCNCGDSNEGLTTTDKVINNCKVDQCHAAVTNHKKWQYNSPLVPRNAELGDRKGKVHIPFPLANVTCRVPKARNPTVTYGKNQVIMLLYPDHPTLLSYRNMGEEPNYQEEWVTHKKEIRLTVPTEGLEVTWGNNEPYKYWPQLSTNGTAHGHPHEIILYYYELYPTMTVVVVSVASFVLLSMVGVAVGMCMCARRRCITPYELTPGATVPFLLSLICCIRTAKAATYQEAAVYLWNEQQPLFWLQALIPLAALIVLCNCLRLLPCCCKTLTFLAVLSVGAHTVSAYEHVTVIPNTVGVPYKTLVNRPGYSPMVLEMELLSVTLEPTLSLDYITCEYKTVIPSPYVKCCGTAECKDKSLPDYSCKVFTGVYPFMWGGAYCFCDTENTQLSEAHVEKSESCKTEFASAYRAHTASASAKLRVLYQGNNVTVSAYANGDHAVTVKDAKFIVGPMSSAWTPFDNKIVVYKGDVYNMDYPPFGAGRPGQFGDIQSRTPESEDVYANTQLVLQRPSAGTVHVPYSQAPSGFKYWLKERGASLQHTAPFGCQIATNPVRAMNCAVGNMPISIDIPDAAFTRVVDAPSLTDMSCEVSACTHSSDFGGVAIIKYAASKKGKCAVHSMTNAVTIREAEIEVEGNSQLQISFSTALASAEFRVQVCSTQVHCAAECHPPKDHIVNYPASHTTLGVQDISATAMSWVQKITGGVGLVVAVAALILIVVLCVSFSRH
組合せ(1)および(4)の抗体等は、例えば、抗体3D11群ともいう。前記組合せ(1)および(4)において、前記(1)の重鎖可変領域は、重鎖相補性決定領域(CDRH)1、CDRH2、およびCDRH3を含み、CDRH1が、下記(H1-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、CDRH2が、下記(H2-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、CDRH3が、下記(H3-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドである。また、前記(4)の軽鎖可変領域は、軽鎖相補性決定領域(CDRL)1、CDRL2、およびCDRL3を含み、CDRL1が、下記(L1-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、CDRL2が、下記(L2-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、CDRL3が、下記(L3-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドである。
(H1-A1)配列番号1(GYTFTSYW)のアミノ酸配列
(H1-A2)配列番号1のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H1-A3)配列番号1のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H2-A1)配列番号2(IYPGDGDTRYT)のアミノ酸配列
(H2-A2)配列番号2のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H2-A3)配列番号2のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H3-A1)配列番号3(SYDPFDY)のアミノ酸配列
(H3-A2)配列番号3のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H3-A3)配列番号3のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(L1-A1)配列番号10(ENVVTY)のアミノ酸配列
(L1-A2)配列番号10のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(L1-A3)配列番号10のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(L2-A1)配列番号11(GAS)のアミノ酸配列
(L2-A2)配列番号11のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(L2-A3)配列番号11のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(L3-A1)配列番号12(GQGYSYPYT)のアミノ酸配列
(L3-A2)配列番号12のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(L3-A3)配列番号12のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H-A1)配列番号13のアミノ酸配列
配列番号13:QVQLQQSGAELARPGASVKLSCKASGYTFTSYWMQWVKQRPGQGLEWIGAIYPGDGDTRYTQKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSSLASEDSAVYYCARSYDPFDYWGQGTTLTVSS
(H-A2)配列番号13のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H-A3)配列番号13のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(L-A1)配列番号16のアミノ酸配列
配列番号16:NIVMTQSPKSMSMSVGERVTLTCKASENVVTYVSWYQQKPEQSPKLLIYGASNRYTGVPDRFTGSGSATDFTLTISSVQAEDLADYHCGQGYSYPYTFGGGTKLEI
(L-A2)配列番号16のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(L-A3)配列番号16のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(HA)下記(HA1)、(HA2)または(HA3)のアミノ酸配列
(HA1)配列番号17のアミノ酸配列
(HA2)配列番号17のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(HA3)配列番号17のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(LA)下記(LA1)、(LA2)または(LA3)のアミノ酸配列
(LA1)配列番号20のアミノ酸配列
(LA2)配列番号20のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(LA3)配列番号20のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
組合せ(2)および(4)の抗体等は、例えば、抗体13H11群ともいう。前記組合せ(2)および(4)において、前記(2)の重鎖可変領域は、CDRH1、CDRH2、およびCDRH3を含み、CDRH1が、下記(H1-B)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、CDRH2が、下記(H2-B)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、CDRH3が、下記(H3-B)のアミノ酸配列を含むポリペプチドである。また、前記(4)の軽鎖可変領域は、前述のように、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含み、CDRL1が、前記(L1-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、CDRL2が、前記(L2-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、CDRL3が、前記(L3-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドである。
(H1-B1)配列番号4(GYAFSTSW)のアミノ酸配列
(H1-B2)配列番号4のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H1-B3)配列番号4のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H2-B1)配列番号5(IYPGDGDT)のアミノ酸配列
(H2-B2)配列番号5のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H2-B3)配列番号5のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H3-B1)配列番号6(SNDGYYVGY)のアミノ酸配列
(H3-B2)配列番号6のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H3-B3)配列番号6のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H-B1)配列番号14のアミノ酸配列
配列番号14:QVQLQQSGPELVKPGASVKISCKASGYAFSTSWMNWVKQRPGQGLEWIGRIYPGDGDTNYNGKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSSLTSVDSAVYFCARSNDGYYVGYWGQGTTLTVSS
(H-B2)配列番号14のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H-B3)配列番号14のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(HB)下記(HB1)、(HB2)または(HB3)のアミノ酸配列
(HB1)配列番号18のアミノ酸配列
(HB2)配列番号18のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(HB3)配列番号18のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
組合せ(3)および(4)の抗体等は、例えば、抗体15B2群ともいう。前記組合せ(3)および(4)において、前記(3)の重鎖可変領域は、CDRH1、CDRH2、およびCDRH3を含み、CDRH1が、下記(H1-C)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、CDRH2が、下記(H2-C)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、CDRH3が、下記(H3-C)のアミノ酸配列を含むポリペプチドである。また、前記(4)の軽鎖可変領域は、前述のように、CDRL1、CDRL2、およびCDRL3を含み、CDRL1が、前記(L1-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、CDRL2が、前記(L2-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、CDRL3が、前記(L3-A)のアミノ酸配列を含むポリペプチドである。
(H1-C1)配列番号7(GYTFTSYY)のアミノ酸配列
(H1-C2)配列番号7のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H1-C3)配列番号7のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H2-C1)配列番号8(INPSNGGT)のアミノ酸配列
(H2-C2)配列番号8のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H2-C3)配列番号8のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H3-C1)配列番号9(GYYGNPFFAY)のアミノ酸配列
(H3-C2)配列番号9のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H3-C3)配列番号9のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(H-C1)配列番号15のアミノ酸配列
配列番号15:QVQLQQSGAELVKPGASVKLSCKASGYTFTSYYMYWVKQRPGQGLEWIGEINPSNGGTNFNEKFKNKATLTVDKSSNTAYMQLNSLTSEDSAVYYCTRGYYGNPFFAYWGQGTLVTVSA
(H-C2)配列番号15のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H-C3)配列番号15のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(HC)下記(HC1)、(HC2)または(HC3)のアミノ酸配列
(HC1)配列番号19のアミノ酸配列
(HC2)配列番号19のアミノ酸配列に対して、80%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(HC3)配列番号19のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
本発明のコード遺伝子は、チクングニアウイルスに対する抗体またはその抗原結合断片のコード遺伝子であり、前記本発明の抗体または抗原結合断片のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含むことを特徴とする。
本発明のチクングニアウイルスの検出キットは、前述のように、前記本発明の抗体またはその抗原結合断片を含むことを特徴とする。本発明の検出キットは、前記本発明の抗体等を含むことが特徴であり、その他の構成および条件は、特に制限されない。本発明のキットによれば、例えば、後述の本発明の検出方法を簡便に実施できる。本発明の検出キットは、例えば、前記本発明の抗体等の説明を援用できる。
本発明のチクングニアウイルスの検出方法は、前述のように、試料と、前記本発明の抗体またはその抗原結合断片とを接触させ、前記試料中のチクングニアウイルスと、前記抗体またはその抗原結合断片とを結合させることにより、前記試料中のチクングニアウイルスを検出する検出工程を含むことを特徴とする。本発明の検出方法は、前記本発明の抗体またはその抗原結合断片を用いることが特徴であり、その他の工程および条件は、特に制限されない。本発明の検出方法は、前記本発明の抗体等、検出キット等の説明を援用できる。
本発明のチクングニアウイルスの診断方法は、試料と、前記本発明の抗体またはその抗原結合断片とを接触させ、前記試料中のチクングニアウイルスと、前記抗体またはその抗原結合断片とを結合させることにより、前記試料中のチクングニアウイルスを検出する検出工程を含むことを特徴とする。また、本発明のチクングニアウイルスの診断キットは、前記本発明の抗体またはその抗原結合断片を含むことを特徴とする。本発明は、前記本発明の抗体等、検出キット、検出方法等の説明を援用できる。
本発明の抗CHIKV抗体を作製した。特に示さない限り、一般的な方法を採用した。
[QVQLQQSGAELARPGASVKLSCKASGYTFTSYWMQWVKQRPGQGLEWIGAIYPGDGDTRYTQKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSSLASEDSAVYYCARSYDPFDYWGQGTTLTVSS]AKTTAPSVYPLAPVCGDTTGSSVTLGCLVKGYFPEPVTLTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVTSSTWPSQSITCNVAHPASSTKVDKKIEPRGPTIKPCPPCKCPAPNLLGGPSVFIFPPKIKDVLMISLSPIVTCVVVDVSEDDPDVQISWFVNNVEVHTAQTQTHREDYNSTLRVVSALPIQHQDWMSGKEFKCKVNNKDLPAPIERTISKPKGSVRAPQVYVLPPPEEEMTKKQVTLTCMVTDFMPEDIYVEWTNNGKTELNYKNTEPVLDSDGSYFMYSKLRVEKKNWVERNSYSCSVVHEGLHNHHTTKSFSRTPGK
[QVQLQQSGPELVKPGASVKISCKASGYAFSTSWMNWVKQRPGQGLEWIGRIYPGDGDTNYNGKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSSLTSVDSAVYFCARSNDGYYVGYWGQGTTLTVSS]AKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKGYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSTWPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVPRDCGCKPCICTVPEVSSVFIFPPKPKDVLTITLTPKVTCVVVDISKDDPEVQFSWFVDDVEVHTAQTQPREEQFNSTFRSVSELPIMHQDWLNGKEFKCRVNSAAFPAPIEKTISKTKGRPKAPQVYTIPPPKEQMAKDKVSLTCMITDFFPEDITVEWQWNGQPAENYKNTQPIMDTDGSYFVYSKLNVQKSNWEAGNTFTCSVLHEGLHNHHTEKSLSHSPGK
[QVQLQQSGAELVKPGASVKLSCKASGYTFTSYYMYWVKQRPGQGLEWIGEINPSNGGTNFNEKFKNKATLTVDKSSNTAYMQLNSLTSEDSAVYYCTRGYYGNPFFAYWGQGTLVTVSA]AKTTPPSVYPLAPGCGDTTGSSVTLGCLVKGYFPESVTVTWNSGSLSSSVHTFPALLQSGLYTMSSSVTVPSSTWPSQTVTCSVAHPASSTTVDKKLEPSGPISTINPCPPCKECHKCPAPNLEGGPSVFIFPPNIKDVLMISLTPKVTCVVVDVSEDDPDVQISWFVNNVEVHTAQTQTHREDYNSTIRVVSTLPIQHQDWMSGKEFKCKVNNKDLPSPIERTISKIKGLVRAPQVYILPPPAEQLSRKDVSLTCLVVGFNPGDISVEWTSNGHTEENYKDTAPVLDSDGSYFIYSKLNMKTSKWEKTDSFSCNVRHEGLKNYYLKKTISRSPGK
[NIVMTQSPKSMSMSVGERVTLTCKASENVVTYVSWYQQKPEQSPKLLIYGASNRYTGVPDRFTGSGSATDFTLTISSVQAEDLADYHCGQGYSYPYTFGGGTKLEI]KRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC
本発明の抗体が各遺伝子型のCHIKVのEnvタンパク質に結合することを、間接蛍光抗体法(免疫染色法)により確認した。
CHIKVのEnvタンパク質またはキャプシドタンパク質を含む発現ベクターは、以下の手順で調製した。具体的には、CHIKVのキャプシドタンパク質、またはECSA型(CP10株)、WA型(37997株)、もしくはAsian型(CK12-686株)のEnvタンパク質をコードするcDNAについて、それぞれをコドン最適化したcDNAを調製した。Envタンパク質をコードするcDNAについては、NCBIに登録されている核酸配列情報を参照した。具体的には、ECSA型(CP10株)のEnvタンパク質は、NCBIアクセッション番号AB857761.1で登録されている核酸配列情報を参照した。WA型(37997株)のEnvタンパク質は、NCBIアクセッション番号AY726732で登録されているゲノム情報を参照した。Asian型(CK12-686株)のEnvタンパク質は、NCBIアクセッション番号CWIH01000001.1で登録されているゲノム情報を参照した。CHIKVのキャプシドタンパク質またはEnvタンパク質をコードするcDNAカセットは、pCAGGS MSIIプラスミドに導入した。また、変異Envタンパク質(E350D)または変異Envタンパク質(D350E)を含む発現ベクターは、オーバラッププライマーを用いて作製した。CP10株のEnvタンパク質については、グルタミン酸(E)をアスパラギン酸(D)に置換した。また、CK12-686株および37997株のEnvタンパク質については、アスパラギン酸(D)をグルタミン酸(E)に置換した。
96ウェルプレートにHEK293T細胞を、2×104細胞/100μL/ウェルとなるように播種した。培養液は、10%(v/v)熱不活化胎児牛血清(FBS、Life Technologies社製)を含むDMEM培地(Dulbecco’s Modified Eagle Medium、Life technologies社製)とした。培養条件は、37℃、5%CO2とした(以下、同様)。前記播種20時間において、前記発現ベクターおよびトランスフェクション試薬(Lipofectamine(登録商標)2000、Invitrogen社製)を用い、添付のプロトコルにしたがって、HEK293T細胞にトランスフェクションした。
前記トランスフェクションの48時間後、各ウェルの細胞は、3.7%(v/v)ホルムアルデヒドを含むリン酸緩衝液(PBS)を用いて固定し、さらに、1% Triton(登録商標)X-100を用いて透過処理した。50μLの上清または2μg/mLとなるように、精製された3D11、13H11、または15B2を一次抗体として添加し、37℃で1時間インキュベートした。
本発明の抗体がSINVに結合しないことを、間接蛍光抗体法(免疫染色法)により確認した。
96ウェルプレートにBaby Hamster Kidney fibroblast cell line(BHK)細胞を、2×104細胞/100μL/ウェルとなるように播種した。SINV(R68株、山梨大学森石恆司教授より分与)をBHK細胞にMOI 0.01で感染させることにより、SINV感染細胞を調製した。BHK細胞は、SINV未感染時には、10%(v/v)熱不活化FBSを含むDMEM培地で培養した。また、BHK細胞は、SINV感染後には、2%(v/v)熱不活化FBSを含むDMEM培地で培養した。
SINV感染細胞の染色は、トランスフェクション後の細胞に代えて、SINV感染細胞を用いた以外は、前記実施例2(3)と同様にして染色し、前記蛍光顕微鏡を用いて各ウェルを観察した。この結果を図2に示す。
Claims (9)
- 下記(1)、(2)、または(3)の重鎖可変領域と、下記(4)の軽鎖可変領域とを含むことを特徴とする、チクングニアウイルスに対する抗体またはその抗原結合断片。
(1)重鎖相補性決定領域(CDRH)1、CDRH2、およびCDRH3を含み、
CDRH1が、下記(H1-A1)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRH2が、下記(H2-A1)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRH3が、下記(H3-A1)のアミノ酸配列を含むポリペプチドである重鎖可変領域
(H1-A1)配列番号1(GYTFTSYW)のアミノ酸配列
(H2-A1)配列番号2(IYPGDGDTRYT)のアミノ酸配列
(H3-A1)配列番号3(SYDPFDY)のアミノ酸配列
(2)CDRH1、CDRH2、およびCDRH3を含み、
CDRH1が、下記(H1-B1)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRH2が、下記(H2-B1)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRH3が、下記(H3-B1)のアミノ酸配列を含むポリペプチドである重鎖可変領域
(H1-B1)配列番号4(GYAFSTSW)のアミノ酸配列
(H2-B1)配列番号5(IYPGDGDT)のアミノ酸配列
(H3-B1)配列番号6(SNDGYYVGY)のアミノ酸配列
(3)CDRH1、CDRH2、およびCDRH3を含み、
CDRH1が、下記(H1-C1)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRH2が、下記(H2-C1)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRH3が、下記(H3-C1)のアミノ酸配列を含むポリペプチドである重鎖可変領域
(H1-C1)配列番号7(GYTFTSYY)のアミノ酸配列
(H2-C1)配列番号8(INPSNGGT)のアミノ酸配列
(H3-C1)配列番号9(GYYGNPFFAY)のアミノ酸配列
(4)軽鎖相補性決定領域(CDRL)1、CDRL2、およびCDRL3を含み、
CDRL1が、下記(L1-A1)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRL2が、下記(L2-A1)のアミノ酸配列を含むポリペプチドであり、
CDRL3が、下記(L3-A1)のアミノ酸配列を含むポリペプチドである軽鎖可変領域
(L1-A1)配列番号10(ENVVTY)のアミノ酸配列
(L2-A1)配列番号11(GAS)のアミノ酸配列
(L3-A1)配列番号12(GQGYSYPYT)のアミノ酸配列 - 下記(1)、(2)、または(3)の重鎖可変領域と、下記(4)の軽鎖可変領域とを含むことを特徴とする、チクングニアウイルスに対する抗体またはその抗原結合断片。
(1)下記(H-A)のアミノ酸配列からなるポリペプチドを含み、下記(H-A)のアミノ酸配列からなるポリペプチドが、配列番号1のアミノ酸配列からなるCDRH1、配列番号2のアミノ酸配列からなるCDRH2、及び配列番号3のアミノ酸配列からなるCDRH3を含み、前記CDRH1、前記CDRH2、及び前記CDRH3のアミノ酸配列が不変異である重鎖可変領域
(H-A)下記(H-A1)、(H-A2)または(H-A3)のアミノ酸配列
(H-A1)配列番号13のアミノ酸配列
(H-A2)配列番号13のアミノ酸配列に対して、90%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H-A3)配列番号13のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(2)下記(H-B)のアミノ酸配列からなるポリペプチドを含み、下記(H-B)のアミノ酸配列からなるポリペプチドが、配列番号4のアミノ酸配列からなるCDRH1、配列番号5のアミノ酸配列からなるCDRH2、及び配列番号6のアミノ酸配列からなるCDRH3を含み、前記CDRH1、前記CDRH2、及び前記CDRH3のアミノ酸配列が不変異である重鎖可変領域
(H-B)下記(H-B1)、(H-B2)または(H-B3)のアミノ酸配列
(H-B1)配列番号14のアミノ酸配列
(H-B2)配列番号14のアミノ酸配列に対して、90%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H-B3)配列番号14のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(3)下記(H-C)のアミノ酸配列からなるポリペプチドを含み、下記(H-C)のアミノ酸配列からなるポリペプチドが、配列番号7のアミノ酸配列からなるCDRH1、配列番号8のアミノ酸配列からなるCDRH2、及び配列番号9のアミノ酸配列からなるCDRH3を含み、前記CDRH1、前記CDRH2、及び前記CDRH3のアミノ酸配列が不変異である重鎖可変領域
(H-C)下記(H-C1)、(H-C2)または(H-C3)のアミノ酸配列
(H-C1)配列番号15のアミノ酸配列
(H-C2)配列番号15のアミノ酸配列に対して、90%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(H-C3)配列番号15のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(4)下記(L-A)のアミノ酸配列からなるポリペプチドを含み、下記(L-A)のアミノ酸配列からなるポリペプチドが、配列番号10のアミノ酸配列からなるCDRL1、配列番号11のアミノ酸配列からなるCDRL2、及び配列番号12のアミノ酸配列からなるCDRL3を含み、前記CDRL1、前記CDRL2、及び前記CDRL3のアミノ酸配列が不変異である軽鎖可変領域
(L-A)下記(L-A1)、(L-A2)または(L-A3)のアミノ酸配列
(L-A1)配列番号16のアミノ酸配列
(L-A2)配列番号16のアミノ酸配列に対して、90%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(L-A3)配列番号16のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列 - 下記(1)、(2)、または(3)の重鎖と、下記(4)の軽鎖とを含むことを特徴とする、チクングニアウイルスに対する抗体またはその抗原結合断片。
(1)下記(HA)のアミノ酸配列からなるポリペプチドを含み、下記(HA)のアミノ酸配列からなるポリペプチドが、配列番号1のアミノ酸配列からなるCDRH1、配列番号2のアミノ酸配列からなるCDRH2、及び配列番号3のアミノ酸配列からなるCDRH3を含み、前記CDRH1、前記CDRH2、及び前記CDRH3のアミノ酸配列が不変異である重鎖
(HA)下記(HA1)、(HA2)または(HA3)のアミノ酸配列
(HA1)配列番号17のアミノ酸配列
(HA2)配列番号17のアミノ酸配列に対して、90%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(HA3)配列番号17のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(2)下記(HB)のアミノ酸配列からなるポリペプチドを含み、下記(HB)のアミノ酸配列からなるポリペプチドが、配列番号4のアミノ酸配列からなるCDRH1、配列番号5のアミノ酸配列からなるCDRH2、及び配列番号6のアミノ酸配列からなるCDRH3を含み、前記CDRH1、前記CDRH2、及び前記CDRH3のアミノ酸配列が不変異である重鎖
(HB)下記(HB1)、(HB2)または(HB3)のアミノ酸配列
(HB1)配列番号18のアミノ酸配列
(HB2)配列番号18のアミノ酸配列に対して、90%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(HB3)配列番号18のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(3)下記(HC)のアミノ酸配列からなるポリペプチドを含み、下記(HC)のアミノ酸配列からなるポリペプチドが、配列番号7のアミノ酸配列からなるCDRH1、配列番号8のアミノ酸配列からなるCDRH2、及び配列番号9のアミノ酸配列からなるCDRH3を含み、前記CDRH1、前記CDRH2、及び前記CDRH3のアミノ酸配列が不変異である重鎖
(HC)下記(HC1)、(HC2)または(HC3)のアミノ酸配列
(HC1)配列番号19のアミノ酸配列
(HC2)配列番号19のアミノ酸配列に対して、90%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(HC3)配列番号19のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列
(4)下記(LA)のアミノ酸配列からなるポリペプチドを含み、下記(LA)のアミノ酸配列からなるポリペプチドが、配列番号10のアミノ酸配列からなるCDRL1、配列番号11のアミノ酸配列からなるCDRL2、及び配列番号12のアミノ酸配列からなるCDRL3を含み、前記CDRL1、前記CDRL2、及び前記CDRL3のアミノ酸配列が不変異である軽鎖
(LA)下記(LA1)、(LA2)または(LA3)のアミノ酸配列
(LA1)配列番号20のアミノ酸配列
(LA2)配列番号20のアミノ酸配列に対して、90%以上の同一性を有するアミノ酸配列
(LA3)配列番号20のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列 - 前記チクングニアウイルスは、チクングニアウイルスのエンベロープ糖タンパク質である、請求項1から3のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
- 請求項1から4のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片を含むことを特徴とする、チクングニアウイルスの検出キット。
- チクングニアウイルスと前記抗体またはその抗原結合断片との結合を検出する検出試薬を含む、請求項5記載の検出キット。
- 試料と、請求項1から4のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合断片とを接触させ、前記試料中のチクングニアウイルスと、前記抗体またはその抗原結合断片とを結合させることにより、前記試料中のチクングニアウイルスを検出する検出工程を含むことを特徴とする、チクングニアウイルスの検出方法。
- 前記検出工程は、前記試料と前記抗体またはその抗原結合断片とを接触させて、前記試料中のチクングニアウイルスと前記抗体またはその抗原結合断片とを結合させる接触工程と、前記チクングニアウイルスと前記抗体またはその抗原結合断片との結合を検出する結合検出工程とを含む、請求項7記載の検出方法。
- 前記試料は、体液または尿である、請求項7または8記載の検出方法。
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